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Oryza sativa
cluster # 11259 cluster # 11259       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11259#0 length = 2225 sequences # 8  

consensusID : consensus_11259#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 2225
fasta sequence
                              [AAGCGCAACACCACCTCACCTCACTCCCCTTCTCACCTCTTCTCCCCTTCTCCACCTCCTCTTCTCTCCGCGTGGCGGTGGCATTGCCGGCCGCCGCATCGTCTCGGGATGGCCTCGCACGCGCTCCGCCTCCACCCGCTGCTCTTCTCCGCCGCCGCCGCGCGCCCGGCTCCGCTCGCGGCGCGGCCCGGTGGTGGTGCCCGCCGGGTCCACCGCCGCCACTCTCTCGCCGTCGTCCGGTGCTCCTCCTCCGCCGCCCAGGCGCTCAAGATCAAGTCGATTCCGACCAAGCCCGTTGAGGGGCAGAAGACCGGGACCAGTGGGTTGAGGAAGAAGGTGAAAGTGTTCCAGCAGGAGAATTACCTCGCTAATTGGATTCAGGCTCTGTTCAATTCATTGCCCCCGGAGGATTATGTTGGTGGAACCCTTGTGCTTGGTGGTGATGGCCGATACTTTAACAAGGATGCTGCTCAGATTATCACTAAAATTGCAGCTGGGAATGGTGTTGGGAAGATCCTAGTTGGCAGGAACGGTCTGCTGTCAACGCCTGCTGTATCTGCAGTAATTCGTAAAAGACAAGCCAATGGTGGCTTCATCATGAGTGCAAGCCATAATCCAGGTGGGCCAGATAATGATTGGGGTATCAAGTTCAACTATAGCAGTGGGCAGCCAGCACCAGAGACAATTACCGACCAAATATATGGAAACACACTTTCGATTTCTGAAATAAAAACGGCAGATATTCCTGATGTTGATTTGTCCTCTCTAGGAGTTGTAAGCTATGGTGATTTCACCGTTGAAGTGATAGACCCTGTCTTGGACTACCTTGAGCTAATGGAGAATGTGTTTGACTTCCAACTTATCAAGGGCTTGTTGTCTCGGCCAGATTTCAGGTTTGTATTTGATGCCATGCATGCTGTGACTGGTGCATATGCGGATCCTATTTTTGTTGAGAAACTTGGAGCTGATCCGGACTATATATTAAATGGTGTTCCACTTGAAGATTTTGGCAATGGTCACCCTGATCCTAATTTAACTTATGCCAAAGAGCTTGTGTTTACCATGTTTGGAAGCGGAGCACCTGACTTTGGTGCAGCAAGTGATGGTGATGGTGATCGAAACATGATTCTTGGAAGAAGGTTCTTTGTTACACCATCAGACTCTGTTGCAATAATTGCAGCGAATGCACAGGCAGCAATTCCTTATTTCCAATCTGGTCCAAAAGGTCTTGCTAGATCAATGCCAACGAGTGGTGCTCTTGATCGTGTAGCTGATAAATTGAATGTTCCGTTCTTTGAGGTACCAACAGGATGGAAATTTTTTGGAAACCTAATGGATGCAGGTAAATTGTCTATATGTGGAGA-GGAAAGTTTTGGGACAGGATCTGATCACATCAGGGAGAAGGATGGCATATGGGCTGTTCTAGCTTGGCTGTCCATACTTGCACACCGGAACAAGGATAAGAAGGCCGGGGAGAGATTAGTGTCAGTGGAAGATGTAGCTAGGGAACACTGGGCAACCTATGGAAGGAATTTCTTCTCCAGATATGATTATGAGGAGTGTGAATCTGAGAGTGCAAATAAGATGATGGAGCATCTTAGAGATGTGATCGCAAAAAGCAAGCCTGGAGAGAAATATGGAAACTATACCCTTCAGTTTGCCGATGATTTCAGTTACACTGATCCGGTGGATGGTAGCACTGTATCTAAACAAGGGCTTCGATTTGTATTCACCGATGGATCTAGGATTATCTTCCGCCTTTCGGGAACCGGATCTGCTGGAGCAACAATCCGTATATACATTGAGCAATTCGAGTCTGATGCCTCAAAGCATGATCTGGATGCACAAATAGCTTTGAAGCCTTTAATAGACCTAGCTCTATCTGTTTCAAAGTTGAAGGACTTCACTGGAAGAGATAAGCCTACTGTCATAACATAAACATACCGGTGACATTAGCAATG-TTACCACCTGTGTATTCTTTTATTTCTTTGTTTTTATAGCCCCTTCCAACCGATGAACCAATAATGTAATCTTAGGCCAAGTTTTGTACTGAGTTGATGGCAAACTGTATCTTGGAGGTACCTTTCATTGAACATAGTATGCAGGAATGAATAAGCTTTTAGAGCAATGGTACATATTTCAGAACAAACTGTATCTTGATGTTCTCGAATTTATCGAATTCATCTTGAGGATGTCATGTTTCTTTGAAAAACAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK064893             [AAGCGCAACACCACCTCACCTCACTCCCCTTCTCACCTCTTCTCCCCTTCTCCACCTCCTCTTCTCTCCGCGTGGCGGTGGCATTGCCGGCCGCCGCATCGTCTCGGGATGGCCTCGCACGCGCTCCGCCTCCACCCGCTGCTCTTCTCCGCCGCCGCCGCGCGCCCGGCTCCGCTCGCGGCGCGGCCCGGTGGTGGTGCCCGCCGGGTCCACCGCCGCCACTCTCTCGCCGTCGTCCGGTGCTCCTCCTCCGCCGCCCAGGCGCTCAAGATCAAGTCGATTCCGACCAAGCCCGTTGAGGGGCAGAAGACCGGGACCAGTGGGTTGAGGAAGAAGGTGAAAGTGTTCCAGCAGGAGAATTACCTCGCTAATTGGATTCAGGCTCTGTTCAATTCATTGCCCCCGGAGGATTATGTTGGTGGAACCCTTGTGCTTGGTGGTGATGGCCGATACTTTAACAAGGATGCTGCTCAGATTATCACTAAAATTGCAGCTGGGAATGGTGTTGGGAAGATCCTAGTTGGCAGGAACGGTCTGCTGTCAACGCCTGCTGTATCTGCAGTAATTCGTAAAAGACAAGCCAATGGTGGCTTCATCATGAGTGCAAGCCATAATCCAGGTGGGCCAGATAATGATTGGGGTATCAAGTTCAACTATAGCAGTGGGCAGCCAGCACCAGAGACAATTACCGACCAAATATATGGAAACACACTTTCGATTTCTGAAATAAAAACGGCAGATATTCCTGATGTTGATTTGTCCTCTCTAGGAGTTGTAAGCTATGGTGATTTCACCGTTGAAGTGATAGACCCTGTCTTGGACTACCTTGAGCTAATGGAGAATGTGTTTGACTTCCAACTTATCAAGGGCTTGTTGTCTCGGCCAGATTTCAGGTTTGTATTTGATGCCATGCATGCTGTGACTGGTGCATATGCGGATCCTATTTTTGTTGAGAAACTTGGAGCTGATCCGGACTATATATTAAATGGTGTTCCACTTGAAGATTTTGGCAATGGTCACCCTGATCCTAATTTAACTTATGCCAAAGAGCTTGTGTTTACCATGTTTGGAAGCGGAGCACCTGACTTTGGTGCAGCAAGTGATGGTGATGGTGATCGAAACATGATTCTTGGAAGAAGGTTCTTTGTTACACCATCAGACTCTGTTGCAATAATTGCAGCGAATGCACAGGCAGCAATTCCTTATTTCCAATCTGGTCCAAAAGGTCTTGCTAGATCAATGCCAACGAGTGGTGCTCTTGATCGTGTAGCTGATAAATTGAATGTTCCGTTCTTTGAGGTACCAACAGGATGGAAATTTTTTGGAAACCTAATGGATGCAGGTAAATTGTCTATATGTGGAGA GGAAAGTTTTGGGACAGGATCTGATCACATCAGGGAGAAGGATGGCATATGGGCTGTTCTAGCTTGGCTGTCCATACTTGCACACCGGAACAAGGATAAGAAGGCCGGGGAGAGATTAGTGTCAGTGGAAGATGTAGCTAGGGAACACTGGGCAACCTATGGAAGGAATTTCTTCTCCAGATATGATTATGAGGAGTGTGAATCTGAGAGTGCAAATAAGATGATGGAGCATCTTAGAGATGTGATCGCAAAAAGCAAGCCTGGAGAGAAATATGGAAACTATACCCTTCAGTTTGCCGATGATTTCAGTTACACTGATCCGGTGGATGGTAGCACTGTATCTAAACAAGGGCTTCGATTTGTATTCACCGATGGATCTAGGATTATCTTCCGCCTTTCGGGAACCGGATCTGCTGGAGCAACAATCCGTATATACATTGAGCAATTCGAGTCTGATGCCTCAAAGCATGATCTGGATGCACAAATAGCTTTGAAGCCTTTAATAGACCTAGCTCTATCTGTTTCAAAGTTGAAGGACTTCACTGGAAGAGATAAGCCTACTGTCATAACATAAACATACCGGTGACATTAGCAATG TTACCACCTGTGTATTCTTTTATTTCTTTGTTTTTATAGCCCCTTCCAACCGATGAACCAATAATGTAATCTTAGGCCAAGTTTTGTACTGAGTTGATGGCAAACTGTATCTTGGAGGTACCTTTCATTGAACATAGTATGCAGGAATGAAT                                                                                                                ]
[+] EMBL CB678225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCACCCCCGTTGAGGGGCAGAAGACCGGGACCAGTGGGTTGAGGAAGAAGGTGAAAGTGTTCCAGCAGGAGAATTACCTCGCTAATTGGATTCAGGCTCTGTTCAATTCATTGCCCCCGGAGGATTATGTTGGTGGAACCCTTGTGCTTGGTGGTGATGGCCGATACTTTAACAAGGATGCTGCTCAGATTATCACTAAAATTGCAGCTGGGAATGGTGTTGGGAAGATCCTAGTTGGCAGGAACGGTCTGCTGTCAACGCCTGCTGTATCTGCAGTAATTCGTAAAAGACAAGCCAATGGTGGCTTCATCATGAGTGCAAGCCATAATCCAGGTGGGCCAGATAATGATTGGGGTATCAAGTTCAACTATAGCAGTGGGCAGCCAGCACCAGAGACAATTACCGACCAAATATATGGAAACACACTTTCGATTTCTGAAATAAAAACGGCAGATATTCCTGATGTTGATTTGTCCTCTCTAGGAGTTGTAAGCTATGGTGATTTCACCGTTGAAGTGATAGACCCTGTCTTGGACTACCTTGAGCTAATGGAGAATGTGTTTGACTTCCAACTTATCAAGGGCTTGTTGTCTCGGCCAGATTTCAGGTTTGTATTTGATGCCATGCATGCTGTGACTGGTGCATATGCGGATCCTATTTTTGTTGAGAAACTTGGAGCTGATCCGGACTATATATTAAATGGTGTTCCACTTGAAGATTCTGGCAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CF323951             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGTGTTTGACTTCCAACTTATCAAGGGCTTGTTGTCTCGGCCAGATTTCAGGTTTGTATTTGATGCCATGCATGCTGTGACTGGTGCATATGCGGATCCTATTTTTGTTGAGAAACTTGGAGCTGATCCGGACTATATATTAAATGGTGTTCCACTTGAAGATTTTGGCAATGGTCACCCTGATCCTAATTTAACTTATGCCTAAGAGCTTGTGTTTACCATGTTTGGAAGCGGAGCACCTGACTTTGGTGCAGCAAGTGATGGTGATGGTGATCGAAACATGATTCTTGGAAGAAGGTTCTTTGTTACACCATCAGACTCTGTTGCAATAATTGCAGCGAATGCACAGGCAGCAATTCCTTATTTCCAATCTGGTCCAAAAGGTCTTGCTAGATCAATGCCAACGAGTGGTGCTCTTGATCGTGTAGCTGATAAATTGAATGTTCCGTTCTTTGAGGTACCAACAGGATGGAAATTTTTTGGAAACCTAATGGATGCAGGTAAATTGTCTATATGTGGAGAGGGAAAGTTTTGGGACAGGATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CB678226             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGATGGCATATGGGCTGTTCTAGCTTGGCTGTCCATACTTGCACACCGGAACAAGGATAAGAAGGCCGGGGAGAGATTAGTGTCAGTGGAAGATGTAGCTAGGGAACACTGGGCAACCTATGGAAGGAATTTCTTCTCCAGATATGATTATGAGGAGTGTGAATCTGAGAGTGCAAATAAGATGATGGAGCATCTTAGAGATGTGATCGCAAAAAGCAAGCCTGGAGAGAAATATGGAAACTATACCCTTCAGTTTGCCGATGATTTCAGTTACACTGATCCGGTGGATGGTAGCACTGTATCTAAACAAGGGCTTCGATTTGTATTCACCGATGGATCTAGGATTATCTTCCGCCTTTCGGGAACCGGATCTGCTGGAGCAACAATCCGTATATACATTGAGCAATTCGAGTCTGATGCCTCAAAGCATGATCTGGATGCACAAATAGCTTTGAAGCCTTTAATAGACCTAGCTCTATCTGTTTCAAAGTTGAAGGACTTCACTGGAAGAGATAAGCCTACTGTCATAACATAAACATACCGGTGACATTAGCAATG TTACCACCTGTGTATTCTTTTATTTCTTTGTTTTTATAGCCCCTTCCAACCGATGAACCAATAATGTAATCTTAGGCCAAGTTTTGTACTGAGTTGATGGCAAACTGTATCTTGGAGGTACCTTTCATTGAACATAGTATGCAGGAATGAATAAGCTTTTAGAGCAATGGTACATATTTCAGA                                                                                 ]
[-] EMBL CA305688             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCTCCAGATATGATTATGAGGAGTGTGAATCTGAGAGTTCAAATAAGATGATGGAGCATCTTAGAGATGTGATCGCAAAAAGCAAGCCTGGAGAGAAATATGGAAACTATACCCTTCAGTTTGCCGATGATTTCAGTTACACTGATCCGGTGGATGGTAGCACTGTATCTAAACAAGGGCTTCGATTTGTATTCACCGATGGATCTAGGATTATCTTCCGCCTTTCGGGAACCGGATCTGCTGGAGCAACAATCCGTATATACATTGAGCAATTCGAGTCTGATGCCTCAAAGCATGATCTGGATGCACAAATAGCTTTGAAGCCTTTAATAGACCTAGCTCTATCTGTTTCAAAGTTGAAGGACTTCACTGGAAGAGATAAGCCTACTGTCATAACATAAACATACCGGTGACATTAGCAATG TTACCACCTGTGTATTCTTTTATTTCTTTGTTTTTATAGCCCCTTCCAACCGATGAACCAATAATGTAATCTTAGGCC                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CA305614             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAAAGCAAGCCTGGAGAGAAATATGGAAACTATACCCTTCAGTTTGCCGATGATTTCAGTTACACTGATCCGGTGGATGGTAGCACTGTATCTAAACAAGGGCTTCGATTTGTATTCACCGATGGATCTAGGATTATCTTCCGCCTTTCGGGAACCGGATCTGCTGGAGCAACAATCCGTATATACATTGAGCAATTCGAGTCTGATGCCTCAAAGCATGATCTGGATGCACAAATAGCTTTGAAGCCTTTAATAGACCTAGCTCTATCTGTTTCAAAGTTGAAGGACTTCACTGGAAGAGATAAGCCTACTGTCATAACATAAACATACCGGTGACATTAGCAATG TTACCACCTGTGTATTCTTTTATTTCTTTGTTTTTATAGCCCCTTCCAACCGATGAACCAATAATGTAATCTTAGGCC                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AU174457             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GACCTAGCTCTATCTGTTTCAAAGTTGAAGGACTTCACTGGAAGAGATAAGCCTACTGTCATAACATAAACATACCGGTGACATTAGCAATG TTACCACCTGTGTATTCTTTTATTTCTTTGTTTTTATAGCCCCTTCCAACCGATGAACCAATAATGTAATCTTAGGCCAAGTTTTGTACTGAGTTGATGGCAAACTGTATCTTGGAGGTACCTTTCATTGAACATAGTATGCAGGAATGAATAAGCTTTTAGAGCAATGGTACATATTTCAGAACAAACTGTATCTTGATGTTCTCGAATTTATCGAATTCATCTTGAGGATGTCATGTTTCTTTGAAAAACAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CB681709             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CAATGCCTACCACCTGTGTATTCTTTTATTTCTTTGTTTTTATAGCCCCTTCCAACCGATGAACCAATAATGTAATCTTAGGCCAAGTTTTGTACTGAGTTGATGGCAAACTGTATCTTGGAGGTACCTTTCATTGAACATAGTATGCAGGAATGAATAAGCTTTTAGAGCAATGGTACATATTTCAGAACAAACTGTATCTTGATGTTCTCGAATTTATCGAATTCATCTTGAGGATGTCA                            ]


>consensus_11259#0 AAGCGCAACACCACCTCACCTCACTCCCCTTCTCACCTCTTCTCCCCTTCTCCACCTCCT CTTCTCTCCGCGTGGCGGTGGCATTGCCGGCCGCCGCATCGTCTCGGGATGGCCTCGCAC GCGCTCCGCCTCCACCCGCTGCTCTTCTCCGCCGCCGCCGCGCGCCCGGCTCCGCTCGCG GCGCGGCCCGGTGGTGGTGCCCGCCGGGTCCACCGCCGCCACTCTCTCGCCGTCGTCCGG TGCTCCTCCTCCGCCGCCCAGGCGCTCAAGATCAAGTCGATTCCGACCAAGCCCGTTGAG GGGCAGAAGACCGGGACCAGTGGGTTGAGGAAGAAGGTGAAAGTGTTCCAGCAGGAGAAT TACCTCGCTAATTGGATTCAGGCTCTGTTCAATTCATTGCCCCCGGAGGATTATGTTGGT GGAACCCTTGTGCTTGGTGGTGATGGCCGATACTTTAACAAGGATGCTGCTCAGATTATC ACTAAAATTGCAGCTGGGAATGGTGTTGGGAAGATCCTAGTTGGCAGGAACGGTCTGCTG TCAACGCCTGCTGTATCTGCAGTAATTCGTAAAAGACAAGCCAATGGTGGCTTCATCATG AGTGCAAGCCATAATCCAGGTGGGCCAGATAATGATTGGGGTATCAAGTTCAACTATAGC AGTGGGCAGCCAGCACCAGAGACAATTACCGACCAAATATATGGAAACACACTTTCGATT TCTGAAATAAAAACGGCAGATATTCCTGATGTTGATTTGTCCTCTCTAGGAGTTGTAAGC TATGGTGATTTCACCGTTGAAGTGATAGACCCTGTCTTGGACTACCTTGAGCTAATGGAG AATGTGTTTGACTTCCAACTTATCAAGGGCTTGTTGTCTCGGCCAGATTTCAGGTTTGTA TTTGATGCCATGCATGCTGTGACTGGTGCATATGCGGATCCTATTTTTGTTGAGAAACTT GGAGCTGATCCGGACTATATATTAAATGGTGTTCCACTTGAAGATTTTGGCAATGGTCAC CCTGATCCTAATTTAACTTATGCCAAAGAGCTTGTGTTTACCATGTTTGGAAGCGGAGCA CCTGACTTTGGTGCAGCAAGTGATGGTGATGGTGATCGAAACATGATTCTTGGAAGAAGG TTCTTTGTTACACCATCAGACTCTGTTGCAATAATTGCAGCGAATGCACAGGCAGCAATT CCTTATTTCCAATCTGGTCCAAAAGGTCTTGCTAGATCAATGCCAACGAGTGGTGCTCTT GATCGTGTAGCTGATAAATTGAATGTTCCGTTCTTTGAGGTACCAACAGGATGGAAATTT TTTGGAAACCTAATGGATGCAGGTAAATTGTCTATATGTGGAGAGGAAAGTTTTGGGACA GGATCTGATCACATCAGGGAGAAGGATGGCATATGGGCTGTTCTAGCTTGGCTGTCCATA CTTGCACACCGGAACAAGGATAAGAAGGCCGGGGAGAGATTAGTGTCAGTGGAAGATGTA GCTAGGGAACACTGGGCAACCTATGGAAGGAATTTCTTCTCCAGATATGATTATGAGGAG TGTGAATCTGAGAGTGCAAATAAGATGATGGAGCATCTTAGAGATGTGATCGCAAAAAGC AAGCCTGGAGAGAAATATGGAAACTATACCCTTCAGTTTGCCGATGATTTCAGTTACACT GATCCGGTGGATGGTAGCACTGTATCTAAACAAGGGCTTCGATTTGTATTCACCGATGGA TCTAGGATTATCTTCCGCCTTTCGGGAACCGGATCTGCTGGAGCAACAATCCGTATATAC ATTGAGCAATTCGAGTCTGATGCCTCAAAGCATGATCTGGATGCACAAATAGCTTTGAAG CCTTTAATAGACCTAGCTCTATCTGTTTCAAAGTTGAAGGACTTCACTGGAAGAGATAAG CCTACTGTCATAACATAAACATACCGGTGACATTAGCAATGTTACCACCTGTGTATTCTT TTATTTCTTTGTTTTTATAGCCCCTTCCAACCGATGAACCAATAATGTAATCTTAGGCCA AGTTTTGTACTGAGTTGATGGCAAACTGTATCTTGGAGGTACCTTTCATTGAACATAGTA TGCAGGAATGAATAAGCTTTTAGAGCAATGGTACATATTTCAGAACAAACTGTATCTTGA TGTTCTCGAATTTATCGAATTCATCTTGAGGATGTCATGTTTCTTTGAAAAACAAAAAAA AAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)