These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11578#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1787 fasta sequence [CTGCAGCGCAAGGAGTCCGTCGAGTGGGTCAACATGGTGCTCGGCAAGCTCTGGAAGGTCTACCGCCCTGGCATCGAGAACTGGATCGTCGGCTTGCTCCAGCCCGTCATCGACAACCTCCACAAGCCCGATTACGTCAACCGCGTCGAGATCAGGCAGTTCTACCTCGGCGAGGAGCCCCTCTCCGTTAGGAACGTCGAGCGCCGCACCTCACGCCGGGCCAACGACCTCCAGTACCAAATTGGCCTCCGTTATACTGGTGGTGCACGCATGGCATTGGCCCTCTCCTTAAAGTTTAGTGCCGTACCTGTCGTTGTGCCAGTCTGGGTTCGAGATTTCGATATCGATGGGGAATTGTGGGTTAAACTAAGGCTTATACCGACAGAACCTTGGGTGGGAGCTGTATCTTGGGCATTTGTATCGCTCCCAAAGATTAAATTTGAGCTGTCTCTGTTCCGGCTTTTCAATCTTATGGCAATTCCTGTTCTGTCAATGTTTCTCACGAAACTTCTAACAGAAGATTTGCCACGTCTCTTTGTGCGGCCCAAGAAGATTGTCCTTGATTTTCAGCAGGGAAGATCTATGGGACCTGTTGCAGGAGATGTTGCAAGTGACGTAATCCAAAATGTTGCAAGTGGCATACTTCAAGATGTTGCAAGTGATGTAATTCAAGATGGGAATAAGGACTTCGTTGGAGAACTATCAGTGACATTAGTTGATGCCAGGAAGCTTAGCTTTGTCTTATTCGGGAAGACTGATCCATATGTTGTCATGATTCTTGGTGATCAAGAAATAAAGAGCAAGAAGAATAGTCAAACAACTGTAATTGGGCAACCAGGCGAACCAATCTGGAATCAAGACTTTCATATGCTAGTTGCAAACCCTCGCAAACAGAAGTTGTGCATTCAAGTAAAGGATTCAGTTGGTCTAACCGATGTCACTATTGGCACTGGAGAGGTTGAGTTAGGATCACTTAAAGACACAGTACCTACAGACAAAATTGTAACTTTATATGGAGGATGGGGCTTACTTGGGAAACGGTCAAAAGGGGAAGTACTCCTTCGCCTCACATACAAAGCATATGTCGAGGACGAGGAAGATGAAGGGGTAAAAAATGAGTTTGCTGCGGGCTATGTTTCAGACGAGGATGTGCTAGATTATGTCCAAGACAGTACAAGTAAGCAAAGTGACATGGATGGTAAAGAGAGAGAGACCTTCATGGATCTGCTGGCCGCGCTGCTTGTCAGCGAGGAATTTCAAGGCATTGTGTCGTCGTCTGAACCCGGAAGCTTGAGAGATAGTGAGCAGGCTGCTAAATCCAGAGATGGTGAAAATGCTGCAGCAGCTGCTGATACAGGGACTGTATCCAATAGCTCCACA-GATACTGCTCTAGTGTGGCTTGCTGCCATAACAAG-TGTGATGGTGCTGGTCTCATCCAACCTTGGTGGTTCAGGCTATTTCAACCCTTGAAGAGTTGATGC-ATGAAGAATCTGATCTGACTGGAGTATTTGGACGATCCATCTGTCTGAATCTGATCATCCGCAGCTAGTAGCAGAGGTCGTTTTGTTTTGATTTT-TTTTAACTTTATTTTTGCCGACAAGTGTATATTCCATTCCCATGTATCTAATGTTGCAGAGGAATCAAAGAATGGCTTGGCTTTTGGCGGCTGTCTCTCCTCCCTTTTTCTATTTCATACGATTGACATGATGTAGCATATCCTTTTTGTGCAACCATCCACGCACATGATTTAATTTGTGTGAATGGGAAATTTGGAGTTGCGTTCATCT] [+] EMBL AK070520 [CTGCAGCGCAAGGAGTCCGTCGAGTGGGTCAACATGGTGCTCGGCAAGCTCTGGAAGGTCTACCGCCCTGGCATCGAGAACTGGATCGTCGGCTTGCTCCAGCCCGTCATCGACAACCTCCACAAGCCCGATTACGTCAACCGCGTCGAGATCAGGCAGTTCTACCTCGGCGAGGAGCCCCTCTCCGTTAGGAACGTCGAGCGCCGCACCTCACGCCGGGCCAACGACCTCCAGTACCAAATTGGCCTCCGTTATACTGGTGGTGCACGCATGGCATTGGCCCTCTCCTTAAAGTTTAGTGCCGTACCTGTCGTTGTGCCAGTCTGGGTTCGAGATTTCGATATCGATGGGGAATTGTGGGTTAAACTAAGGCTTATACCGACAGAACCTTGGGTGGGAGCTGTATCTTGGGCATTTGTATCGCTCCCAAAGATTAAATTTGAGCTGTCTCTGTTCCGGCTTTTCAATCTTATGGCAATTCCTGTTCTGTCAATGTTTCTCACGAAACTTCTAACAGAAGATTTGCCACGTCTCTTTGTGCGGCCCAAGAAGATTGTCCTTGATTTTCAGCAGGGAAGATCTATGGGACCTGTTGCAGGAGATGTTGCAAGTGACGTAATCCAAAATGTTGCAAGTGGCATACTTCAAGATGTTGCAAGTGATGTAATTCAAGATGGGAATAAGGACTTCGTTGGAGAACTATCAGTGACATTAGTTGATGCCAGGAAGCTTAGCTTTGTCTTATTCGGGAAGACTGATCCATATGTTGTCATGATTCTTGGTGATCAAGAAATAAAGAGCAAGAAGAATAGTCAAACAACTGTAATTGGGCAACCAGGCGAACCAATCTGGAATCAAGACTTTCATATGCTAGTTGCAAACCCTCGCAAACAGAAGTTGTGCATTCAAGTAAAGGATTCAGTTGGTCTAACCGATGTCACTATTGGCACTGGAGAGGTTGAGTTAGGATCACTTAAAGACACAGTACCTACAGACAAAATTGTAACTTTATATGGAGGATGGGGCTTACTTGGGAAACGGTCAAAAGGGGAAGTACTCCTTCGCCTCACATACAAAGCATATGTCGAGGACGAGGAAGATGAAGGGGTAAAAAATGAGTTTGCTGCGGGCTATGTTTCAGACGAGGATGTGCTAGATTATGTCCAAGACAGTACAAGTAAGCAAAGTGACATGGATGGTAAAGAGAGAGAGACCTTCATGGATCTGCTGGCCGCGCTGCTTGTCAGCGAGGAATTTCAAGGCATTGTGTCGTCGTCTGAACCCGGAAGCTTGAGAGATAGTGAGCAGGCTGCTAAATCCAGAGATGGTGAAAATGCTGCAGCAGCTGCTGATACAGGGACTGTATCCAATAGCTCCACA GATACTGCTCTAGTGTGGCTTGCTGCCATAACAAG TGTGATGGTGCTGGTCTCATCCAACCTTGGTGGTTCAGGCTATTTCAACCCTTGAAGAGTTGATGC ATGAAGAATCTGATCTGACTGGAGTATTTGGACGATCCATCTGTCTGAATCTGATCATCCGCAGCTAGTAGCAGAGGTCGTTTTGTTTTGATTTT TTTTAACTTTATTTTTGCCGACAAGTGTATATTCCATTCCCATGTATCTAATGTTGCAGAGGAATCAAAGAATGGCTTGGCTTTTGGCGGCTGTCTCTCCTCCCTTTTTCTATTTCATACGATTGACATGATGTAGCATATCCTTTTTGTGCAACCATCCACGCACATGATTTAATTTGTGTGAATGGGAAATTTGGAGTTGCGTTCATCT] [+] EMBL CB630057 [ccGCTGCGCAAGGAGTCCGTCGAGTGGGTCAACATGGTGCTCCGCAAGCTCTGGAAGGTCTACCGCCCTGGCATCGAGAACTGGATCGTCGGCTTGCTCCAGCCCGTCATCGACAACCTCCACAAGCCCGATTACGTCAACCGCGTCGAGATCAGGCAGTTCTACCTCGGCGAGGAGCCCCTCTCCGTTAGGAACGTCGAGCGCCGCACCTCACGCCGGGCCAACGACCTCCAGTACCAAATTGGCCTCCGTTATACTGGTGGTGCACGCATGGCATTGGCCCTCTCCTTAAAGTTTAGTGCCGTACCTGTCGTTGTGCCAGTCTGGGTTCGAGATTTCGATATCGATGGGGAATTGTGGGTTAAACTAAGGCTTATACCGACAGAACCTTGGGTGGGAGCTGTATCTTGGGCATTTGTATCGCTCCCAAAGATTAAGTTTGAGCTGTCTCTGTTCCGGCTTTTCAATCTTATGGCAATTCCTGTTCTGTCAATGTTTCTCACGAAACTTCTAACAGAAGATTTGCCACGTCTCTTTGTGCGGCCCAAGAAGATTGTCCTTGATTTTCAGCAGGGAAGATCTATGGGACCTGTTGCAGGAGATGTTGCAAGTGACGTAATCCAAAATGTTGCAAGTGGCATACTTCAAGATGTTGCAAGTGATGTAATTCAAGATGGGAATAAGGACTTCGTTGGAGAACTATCAGTGACATTAGTTGATGCCAGGAAGCTTAGCTTTGTCTTATTCGGGAAGACTGATCCATATGTTGTCATGATTCTTGGTGATCAAGAAATAAAGAGCAAGAAGAATAGTCAAACAACTGTAATTGGGCAACCAG ] [+] EMBL CB644777 [ ATCGTCTTCTTGCTCCAGCCCGTCATCGACAACCTCCACAAGCCCGATTACGTCAACCGCGTCGAGATCAGGCAGTTCTACCTCGGCGAGGAGCCCCTCTCCGTTAGGAACGTCGAGCGCCGCACCTCACGCCGGGCCAACGACCTCCAGTACCAAATTGGCCTCCGTTATACTGGTGGTGCACGCATGGCATTGGCCCTCTCCTTAAAGTTTAGTGCCGTACCTGTCGTTGTGCCAGTCTGGGTTCGAGATTTCGATATCGATGGGGAATTGTGGGTTAAACTAAGGCTTATACCGACAGAACCTTGGGTGGGAGCTGTATCTTGGGCATTTGTATCGCTCCCAAAGATTAAATTTGAGCTGTCTCTGTTCCGGCTTTTCAATCTTATGGCAATTCCTGTTCTGTCAATGTTTCTCACGAAACTTCTAACAGAAGATTTGCCACGTCTCTTTGTGCGGCCCAAGAAGATTGTCCTTGATTTTCAGCAGGGAAGATCTATGGGACCTGTTGCAGGAGATGTTGCAAGTGACGTAATCCAAAATGTTGCAAGTGGCATACTTCAAGATGTTGCAAGTGATGTAATTCAAGATGGGAATAAGGACTTCGTTGGAGAACTATCAGTGACATTAGTTGATGCCAGGAAGCTTAGCTTTGTCTTATTCGGGAAGACTGATCCATATGTTGTCATGATTCTTGGTGATCAAGAAATAAAGAGCAAGAAGAATAGTCAAACAACTGTAATTGGGCAACCAGGCGAACCAATCTGGAATCAAGACTTTCATATGCTAGTTGCAAACCCTCGCAAACAGAAAGTGTGCATTC ] [+] EMBL CB652221 [ GATCAGGCTTTTCTACCTCGGCGAGGAGCCCCTCTCCGTTAGGAACGTCGAGCGCCGCACCTCACGCCGGGCCAACGACCTCCAGTACCAAATTGGCCTCCGTTATACTGGTGGTGCACGCATGGCATTGGCCCTCTCCTTAAAGTTTAGTGCCGTACCTGTCGTTGTGCCAGTCTGGGTTCGAGATTTCGATATCGATGGGGAATTGTGGGTTAAACTAAGGCTTATACCGACAGAACCTTGGGTGGGAGCTGTATCTTGGGCATTTGTATCGCTCCCAAAGATTAAATTTGAGCTGTCTCTGTTCCGGCTTTTCAATCTTATGGCAATTCCTGTTCTGTCAATGTTTCTCACGAAACTTCTAACAGAAGATTTGCCACGTCTCTTTGTGCGGCCCAAGAAGATTGTCCTTGATTTTCAGCAGGGAAGATCTATGGGACCTGTTGCAGGAGATGTTGCAAGTGACGTAATCCAAAATGTTGCAAGTGGCATACTTCAAGATGTTGCAAGTGATGTAATTCCAGATGGGAATAAGGACTTCGCTGGAGAACTATCAGTGACATTAGTTGATGCCAGGAAGCTTAGCTTTGTCTTATTCGGGAAGACTGATCCATATGTTGTCATGATTCTTGGTGATCAAGAAc ] [-] EMBL CB643344 [ CAGTTGGTCTAACCGATGTCACTATTGGCACTGGAGAGGTTGAGTTAGGATCACTTAAAGACACAGTACCTACAGACAAAATTGTAACTTTATATGGAGGATGGGGCTTACTTGGGAAACGGTCAAAAGGGGAAGTACTCCTTCGCCTCACATACAAAGCATATGTCGAGGACGAGGAAGATGAAGGGGTAAAAAATGAGTTTGCTGCGGGCTATGTTTCAGACGAGGATGTGCTAGATTATGTCCAAGACAGTACAAGTAAGCAAAGTGACATGGATGGTAAAGAGAGAGAGACCTTCATGGATCTGCTGGCCGCGCTGCTTGTCAGCGAGGAATTTCAAGGCATTGTGTCGTCGTCTGAACCCGGAAGCTTGAGAGATAGTGAGCAGGCTGCTAAATCCAGAGATGGTGAAAATGCTGCAGCAGCTGCTGATACAGGGACTGTATCCAATAGCTCCACA GATACTGCTTTAGTGTGGCTTGCTGCCATAACAAG TGTGATGGTGCTGGTTTCATCCAACCTTGGTGGTTCAGGCTATTTCAACCCTTGAAGAGTTGATGC ATGAAGAATCTGATCTGACTGGAGTATTTGGACGATCCATCTGTCTGAATCTGATCATCCGCAGCTAGTAGCAGAGGTCGTTTTGTTTTGATTTTGGTTTAACTTTATTTTTGCCGACAAGTGTATATTCCATTCCCATGTATCTAATGTTGCAGAGGAATCTAAAAGTGG ] [-] EMBL CB644778 [ GGGGCTTACTTGGGAAACGGTCAAAAGGGGAAGTACTCCTTCGCCTCACATACAAAGCATATGTCGAGGACGAGGAAGATGAAGGGGTAAAAAATGAGTTTGCTGCGGGCTATGTTTCAGACGAGGATGTGCTAGATTATGTCCAAGACAGTACAAGTAAGCAAAGTGACATGGATGGTAAAGAGAGAGAGACCTTCATGGATCTGCTGGCCGCGCTGCTTGTCAGCGAGGAATTTCAAGGCATTGTGTCGTCGTCTGAACCCGGAAGCTTGAGAGATAGTGAGCAGGCTGCTAAATCCAGAGATGGTGAAAATGCTGCAGCAGCTGCTGATACAGGGACTGTATCCAATAGCTCCACA GATACTGCTCTAGTGTGGCTTGCTGCCATAACAAG TGTGATGGTGCTGGTCTCATCCAACCTTGGTGGTTCAGGCTATTTCAACCCTTGAAGAGTTGATGC ATGAAGAATCTGATCTGACTGGAGTATTTGGACGATCCATCTGTCTGAATCTGATCATCCGCAGCTAGTAGCAGAGGTCGTTTTGTTTTGATTTT TTTTAACTTTATTTTTGCCGACAAGTGTATATTCCATTCCCATGTATCTAATGTTGCAGAGGAATCAAAGAATGGCTTGGCTTTTGGCGGCTGTCTCTCCTCCCTTTTTCTATTTCATACGATTGACATGATGTAGCATATCCTTTTTGTGCAACCATCCACGCACATGATTTAATTTGTGTGAATGGGAAATTTGGAGTTGCG ] [-] EMBL CB630056 [ AGGGGTGAAAAATGAGTTTGCTGCGGGCTATGTTTCAGACGAGGATGTGCTAGATTATGTCCAAGACAGTACAAGTAAGCAAAGTGACATGGATGGTAAAGAGAGAGAGACCTTCATGGATCTGTTGGCCGCGCTGCTTGTCAGCGAGGAATTTCAAGGCATTGTGTTGTCGTCTGAACCCGGAAGCTTGAGAGATAGTGAGCAGGCTGCTAAATCCAGAGATGGTGAAAATGCTGCAGCAGCTGCTGATACAGGGACTGTATCCAATAGCTCCACA GATACTGCTTTAGTGTGGCTTGCTGCCATAACAAG TGTGATGGTGGTGGTTTCATCCAACCTTGGTGGTTCAGGCTATTTCAACCCTTGAAGAGTTGATGC ATGAAGAATTTGATTTGACTGGAGTATTTGGACGATCCATCTGTCTGAATCTGATCATCCGCAGCTAGTAGCAGAGGTCGTTTTGTTTTGATTTT TTTTAACTTTATTTTTGCCGACTAGTGTATATTCCATTCCCAGGTATCTAATCTTGCAGAGGAATCAAAGAATGGCTTGGCTTTTGGGGGCTGTCTCTCCTCCCTTTTTTTATTTCATACGATTGACATGATGTAGCATATCCTTTTTGTGCAACCATCCACGCACATGATTTAATTTGTGTGAATGGGAAATTTGGA ] [+] EMBL C27937 [ GATGTGCTAGATTATGTCCAAGACAGTACAAGTAAGCAAAGTGACATGGATGGTAAAGAGAGAGAGACCTTCATGGNTCTNCTGGCCGCGCTGCTTGTCAG NAGGAATTTCAAGGCATTGTGTCGTCGTCTGAACCCGGAAGCTTGAGAGATAGTGAGCAGGCTGCTAAATCCAGAGATGGTGAAAATNCTGCAGCAGCTGCTGATACAGGGACTGTATCCAATAGCTCCACAGGATACTGCTCTAGTGTGGCTTGCTGCCATAACAAGTTGTGATGGTGCTGGTCTCATCCAACCTTGGTGGGTCAGNCTATNTCAACCCTTGANGAGTTGATGCAATGA ] [-] EMBL CK085305 [ AAAGAGAGAGAGACCTTCATGGATCTGCTGGCCGCGCTGCTTGTCAGCGAGGAATTTCAAGGCATTGTTTCGTCGTCTGAACCCGGAAGCTTGAGAGATAGTGAGCAGGCTGCTAAATCCAGAGATGGTGAAAATGCTGCAGCAGCTGCTGATACAGGGACTGTATCCAATAGCTCCACA GATACTGCTCTAGTGTGGCTTGCTGCCATAACAAG TGTGATGGTGCTGGTCTCATCCAACCTTGGTGGTTCAGGCTATTTCAACCCTTGAAGAGTTGATGC ATGAAGAATCTGATCTGACTGGAGTATTTGGACGATCCATCTGTCTGAATCTGATCATCCGCAGCTAGTAGCAGAGGTCGTTTTGTTTTGATTTT TTTTAACTTTATTTTTGCCGACAAGTGTATATTCCATTCCCATGTATCTAATGTTGCAGAGGAATCAAAGAATGGCTTGGCTTTTGGCGGCTGTCTCTCCTCCCTTTTTCTATTTCATACGATTGACATGATGTAGCATATCCTTTTTGTGCAACCATCCACGCACATGATTTAATTTGTGTGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||