These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11722#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1437 fasta sequence [GTTGGGTGCAAAACCACAACCGCCAACATCTTCTAACTCCCCTCACGGCTCTCCCTCTCCCCGCACGCACAACACCGGTGAACCCCTACGTACTACTGAGCTGAGCTGAGAGGACGAAGAAGAAGATCAAGCTCGAGGGGCTTGCGATCATGGGTGCCGCATTCTTGTCGTCGTGGCCATGGGATAACCTCGGCGCGTACAAGTATGTGTTGTACGCGCCGCTGGTGGGGAAGGCGGTGGCGGGGCGGGCGTGGGAGCGGGCGAGCCCCGACCACTGGCTGCTGCTGCTGCTCGTCCTCTTCGGCGTCAGGGCCTTGACCTACCAGCTCTGGAGCTCGTTCAGCAACATGCTCTTCGCCACCCGCCGCCGCCGCATCGTCCGCGACGGCGTCGACTTCGGCCAGATCGACAGGGAGTGGGACTGGGACAACTTCTTGATACTGCAGGTGCACATGGCGGCGGCGGCGTTCTACGCGTTCCCGTCGCTGCGGCACCTCCCGCTGTGGGACGCCAGGGGCCTCGCCGTCGCCGCGCTCCTCCACGTCGCCGCCACCGAGCCCCTGTTCTACGCCGCGCACAGGGCGTTCCACCGCGGCCACCTCTTCTCCTGCTACCACTTGCAACACCACTCCGCCAAGGTGCCCCAGCCATTCACAGCGGGGTTCGCGACGCCGCTGGAGCAGC-TGGTGCTGGGGGCGCTCATGGCGGTGCCGCTGGCGGCGGCGTGCGCGGCGGGGCACGGCTCCGTCGCGCTGGCCTTCGCCTACGTGCTGGGTTTCGACAACCTCCGCGCCATGGGCCACTGCAACGTCGAGGTGTTCCCCGGCGGCCTCTTCCAGTCGCTCCCCGTCCTCAAATACCTTATCTACACCCCAACGTACCACACGATCCATCACACCAAGGAGGATGCCAACTTCTGCCTGTTCATGCCGCTGTTCGACCTCATCGGTGGCACCCTCGACGCCCAGTCCTGGGAGATGCAGAAGAAAACCAGCGCAGGGGTGGACGAGGTGCCGGAGTTCGTGTTCCTGGCGCACGTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACCGCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCCTG-CCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACAAGATGGGCGCCAA-GGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTGGCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGTCGTCCACGGCA] [+] EMBL AK120227 [GTTGGGTGCAAAACCACAACCGCCAACATCTTCTAACTCCCCTCACGGCTCTCCCTCTCCCCGCACGCACAACACCGGTGAACCCCTACGTACTACTGAGCTGAGCTGAGAGGACGAAGAAGAAGATCAAGCTCGAGGGGCTTGCGATCATGGGTGCCGCATTCTTGTCGTCGTGGCCATGGGATAACCTCGGCGCGTACAAGTATGTGTTGTACGCGCCGCTGGTGGGGAAGGCGGTGGCGGGGCGGGCGTGGGAGCGGGCGAGCCCCGACCACTGGCTGCTGCTGCTGCTCGTCCTCTTCGGCGTCAGGGCCTTGACCTACCAGCTCTGGAGCTCGTTCAGCAACATGCTCTTCGCCACCCGCCGCCGCCGCATCGTCCGCGACGGCGTCGACTTCGGCCAGATCGACAGGGAGTGGGACTGGGACAACTTCTTGATACTGCAGGTGCACATGGCGGCGGCGGCGTTCTACGCGTTCCCGTCGCTGCGGCACCTCCCGCTGTGGGACGCCAGGGGCCTCGCCGTCGCCGCGCTCCTCCACGTCGCCGCCACCGAGCCCCTGTTCTACGCCGCGCACAGGGCGTTCCACCGCGGCCACCTCTTCTCCTGCTACCACTTGCAACACCACTCCGCCAAGGTGCCCCAGCCATTCACAGCGGGGTTCGCGACGCCGCTGGAGCAGC TGGTGCTGGGGGCGCTCATGGCGGTGCCGCTGGCGGCGGCGTGCGCGGCGGGGCACGGCTCCGTCGCGCTGGCCTTCGCCTACGTGCTGGGTTTCGACAACCTCCGCGCCATGGGCCACTGCAACGTCGAGGTGTTCCCCGGCGGNCTCTTCCAGTCGCTCCCCGTCCTCAAATACCTTATCTACACCCCAACGTACCACACGATCCATCACACCAAGGAGGATTGCAACTTCTGCCTGTTCATGCCGCTGTTCGACCTCATCGGTGGCACCCTCGACGCCCAGTCCTGGGAGATGCAGAAGAAAACCAGCGCAGGGGTGGACGAGGTGCCGGAGTTCGTGTTCCTGGCGCACGTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACCGCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCCTGCCCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACAAGATGGGCGCCAAGGGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTGGCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGT ] [+] EMBL AK060786 [GTTGGGTGCAAAACCACAACCGCCAACATCTTCTAACTCCCCTCACGGCTCTCCCTCTCCCCGCACGCACAACACCGGTGAACCCCTACGTACTACTGAGCTGAGCTGAGAGGACGAAGAAGAAGATCAAGCTCGAGGGGCTTGCGATCATGGGTGCCGCATTCTTGTCGTCGTGGCCATGGGATAACCTCGGCGCGTACAAGTATGTGTTGTACGCGCCGCTGGTGGGGAAGGCGGTGGCGGGGCGGGCGTGGGAGCGGGCGAGCCCCGACCACTGGCTGCTGCTGCTGCTCGTCCTCTTCGGCGTCAGGGCCTTGACCTACCAGCTCTGGAGCTCGTTCAGCAACATGCTCTTCGCCACCCGCCGCCGCCGCATCGTCCGCGACGGCGTCGACTTCGGCCAGATCGACAGGGAGTGGGACTGGGACAACTTCTTGATACTGCAGGTGCACATGGCGGCGGCGGCGTTCTACGCGTTCCCGTCGCTGCGGCACCTCCCGCTGTGGGACGCCAGGGGCCTCGCCGTCGCCGCGCTCCTCCACGTCGCCGCCACCGAGCCCCTGTTCTACGCCGCGCACAGGGCGTTCCACCGCGGCCACCTCTTCTCCTGCTACCACTTGCAACACCACTCCGCCAAGGTGCCCCAGCCATTCACAGCGGGGTTCGCGACGCCGCTGGAGCAGC TGGTGCTGGGGGCGCTCATGGCGGTGCCGCTGGCGGCGGCGTGCGCGGCGGGGCACGGCTCCGTCGCGCTGGCCTTCGCCTACGTGCTGGGTTTCGACAACCTCCGCGCCATGGGCCACTGCAACGTCGAGGTGTTCCCCGGCGGCCTCTTCCAGTCGCTCCCCGTCCTCAAATACCTTATCTACACCCCAACGTACCACACGATCCATCACACCAAGGAGGATGCCAACTTCTGCCTGTTCATGCCGCTGTTCGACCTCATCGGTGGCACCCTCGACGCCCAGTCCTGGGAGATGCAGAAGAAAACCAGCGCAGGGGTGGACGAGGTGCCGGAGTTCGTGTTCCTGGCGCACGTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACCGCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCCTG CCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACAAGATGGGCGCCAA GGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTGGCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGT ] [+] EMBL C72655 [ 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ACCTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACCGCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCCTG CCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACAAGATGGGCGCCAA GGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTGGCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||