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Oryza sativa
cluster # 11868 cluster # 11868       Sequences # 9       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11868#0 length = 1304 sequences # 9  
consensusID : consensus_11868#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1304
fasta sequence 
                              [TTTTTTGGTGATATCCATAAAGGTAAAACATGCAGAGTCATACAGATTTGGTTGAAGCAAATTCTTGACAGAAGTGAAGTGAATCAGCTTCAAGTTATTGCAAATTTCAACATGAAGAACAGATACATCATAATGCAATGCCTCTACCAGGACTAAATCTATTTACAATCACCTATATTATGTTGCTAACATTCATTCATCTGTGCCTAAACTAGATGACAAATGCTCAACAAACTAACTAATTAATTAATTAATTAAATTTTCTTAAGGTGTTTCAACTTCAAAATTGAAACAATATTGTCCTAACTTCTTCCCGGAGCTTGAGCTCATTCCACTCCTTCACCCACAGGGAGTAGCTCGACTGTGGCGCAACGACATCAATGGAGACCTCCTTGTTCTCCACCAGCT-CGCTGGAATGGCGCTCAAACTTGTGCAAGTCCTCCAGCATCCTCGCCAGCGATGTCATGTCGCGTTCGCTCTTGGCACTCTCTGTCTGCTCGCGCGCTTCCTCCACCCTCGCCCAGAAGCACGGGTCCTGCGTTAGCCCAGCGAACTTGCTCCTCCTCGCTGTCGTGGTGGCAGAGGTGTCACCAGTGCTGGGATCTGTGCAGCCCTTCTGTTTCCACCACTTGTCGAACAGCTCATACCTTCTCTCCCGGCCATGGGTGATGTAAGAGCCGCGTGTGCGGTGTAGGTTGTTTCGGTGGTAGTCGGCAATGTCAAGTGGCTCAACAAGGAGCTGGTAGAAGTGGGCAGCGTTGACCCACTTGGCACGGCGGTGGAAGTCGTAGGGGAGCTGGCTGGTGTCAAGCATGGAGAGGACGCCATCCC-AGAACTGTGCGAGCTTGATGCGGTACATGTTGGCCTTGCTGAACTTCTTAGGTGATAGCCGCTGCTTGAATGCGTCGTAATACCCGGTGTTGGCATCGAACAATGCCTTGTACCACTCGATCTGCGCTCGGCACGGCGTGATCCGTCCCAACCGCGTTGCGAGGCTCGCACAGTTCAGGCTCGGGCTCCGGCCCACGCGCTTCGACGTCTTCAGCCACTGCCGTGCCGGTGCTGCCTCTGTAGCTTCACCGGTGATACCTGATGCCTCCAGTGCAATGGAGATGCCGACGTCGTAGTTGGACGCGGCAGGTGCGGTGACTGTGGCACCAAGGCGCCTCTTGAGCAGCAAGTGGTGCGGCATGCTCAGCACGAGGTCACCGTAGCAGGAGTGTGCAGCCTCAGGTGGCACCGCGCCTGTCTCTGGAGCACGCCTTGCAGCAAATGTTGCATATAGCATCTGATCCGAAGGTGTT]

[+] EMBL CF314889             [TTTTTTGGTGATATCCATAAAGGTAAAACATGCAGAGTCATACAGATTTGGTTGAAGCAAATTCTTGACAGAAGTGAAGTGAATCAGCTCCAAGTTATTGCAAATTTCAACATGAAGAACAGATACATCATAATGCAATGCCTCTACCAGGACTAAATCTATTTACGATCACCTATATTATGTTGCTAACATTCATTCATCTGTGCCTAAACTAGATGACAAATGCTCAACAAACTAACTAATTAATTAATTAATTAAATTTTCTTAAGGTGTTTCAATTTCAAAATTGAAACAATATTGTCCTAACTTCTTCCCGGAGCTTGAGCTCATTCCACTCCTTCACCCACAGGGAGTAGCTCGACTGTGGCGCAACGACATCAATGGAGACCTCCTTGTTCTCCACCAGCTACTCTGGAATGGCGCTCAAACTTGTGCAAGTCCTCCAGCATCCTCGCCAGCGATGTCATGTCGCGTTCGCTCTTGGCACTCTCTGTCTGCTCGCGCGCTTCCTCCACCCTCGCCCAGAAGCACGGGTCCTGCGTTAGCCCAGCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL AU029772             [                                       tttttttTTTGGTTGAAGCAAATTCTTGACAGAAGTGAAGTGAATCAGCTTCAAGTTATTGCAAATTTCAACATGAAGAACAGATACATCATAATGCAATGCCTCTACCAGGACTAAATCTATTTACAATCACCTATATTATGTTGCTAACATTCATTCATCTGTGCCTAAACTAGATGACAAATGCTCAACAAACTAACTAATTAATTAATTAATTAAATTTTCTTAAGGNGTTTCAACTTCAAAATTGAAACAATATTGTCCTAACTTCTTCCCGGAGCTTGAGCTCATTCCACTCCTTCACCCACAGGGAGTAGCTCGACTGTGGCGCAACGACATCAATGGAGACCTCCTTGTTCTCCACCAGCT CGCTGGAATGGNGCTCAAACTTGTGCAAGTCCTCCAGCATCCTCGCCAGCGATGTCATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CB663469             [                                                          AAATTCTTGACAGAAGTGAAGTGAATCAGCTTCAAGTTATTGCAAATTTCAACATGAAGAACAGATACATCATAATGCAATGCCTCTACCAGGACTAAATCTATTTACAATCACCTATATTATGTTGCTAACATTCATTCATCTGTGCCTAAACTAGATGACAAATGCTCAACAAACTAACTAATTAATTAATTAATTAAATTTTCTTAAGGGGTTTCAACTTCAAAATTGAAACAATATTGTCCTAACTTCTTCCCGGAGCTTGAGCTCATTCCACTCCTTCACCCACAGGGAGTAGCTCGACTGTGGCGCAACGACATCAATGGAGACCTCCTTGTTCTCCACCAGCT CGCTGGAATGGCGCTCAAACTTGTGCAAGTCCTCCAGCATCCTCGCCAGCGATGTCATGTCGCGTTCGCTCTTGGCACTCTCTGTCTGCTCGCGCGCTTCCTCCACCCTCGCCCAGAAGCACGGGTCCTGCGTTAGCCCAGCGAACTTGCTCCTCCTCGCTGTCGTGGTGGCAGAGGTGTCACCAGTGCTGGGATCTGTGCAGCCCTTCTGTTTCCACCACTTGTCGAACAGCTCATACCTTCTCTCCCGGCCATGGGTGATGTAAGAGCCGCGTGTGCGGTGTAGGTTGTTTCGGTGGTAGTCGGCAATGTCAAGTGGCTCAACAAGGAGCTGGTAGAAGTGGGCAGCGTTGACCCACTTGGCACGGCGGTGGAAGTCGTAGGGGAGCTGGCTGGTGTCAAGCATGGAGAGGACGCCATCCC AGAACTGTGCGAGCTTGATGCGGTACATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CB658867             [                                                        tctttTTTTTGACAGAAGTGAAGTGAATCAGCTTCAAGTTATTGCAAATTTCAACATGAAGAACAGATACATCATAATGCAATGCCTCTACCAGGACTAAATCTATTTACAATCACCTATATTATGTTGCTAACATTCATTCATCTGTGCCTAAACTAGATGACAAATGCTCAACAAACTAACTAATTAATTAATTAATTAAATTTTCTTAAGGTGTTTCAACTTCAAAATTGAAACAATATTGTCCTAACTTCTTCCCGGAGCTTGAGCTCATTCCACTCCTTCACCCACAGGGAGTAGCTCGACTGTGGCGCAACGACATCAATGGAGACCTCCTTGTTCTCCACCAGCT CGCTGGAATGGCGCTCAAACTTGTGCAAGTCCTCCAGCATCCTCGCCAGCGATGTCATGTCGCGTTCGCTCTTGGCACTCTCTGTCTGCTCGCGCGCTTCCTCCACCCTCGCCCAGAAGCACGGGTCCTGCGTTAGCCCAGCGAACTTGCTCCTCCTCGCTGTCGTGGTGGCAGAGGTGTCACCAGTGCTGGGATCTGTGCAGCCCTTCTGTTTCCACCACTTGTCGAACAGCTCATACCTTCTCTCCCGGCCATGGGTGATGTAAGAGCCGCGTGTGCGGTGTAGGTTGTTTCGGTGGTAGTCGGCAATGTCAAGTGGCTCAACAAGGAGCTGGTAGAAGTGGGCAGCGTTGACCCACTTGGCACGGCGGTGGAAGTCGTAAGGGAGCTGGCTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CF336088             [                                                             TTTTTGACAGAAGTGAAGTGAATCAGCTTCAAGTTATTGCAAATTTCAACATGAAGAACAGATACATCATAATGCAATGCCTCTATCAGGACTAAATCTATTTACAATCACCTATATTATGTTGCTAACATTCATTCATCTGTGCCTAAACTAGATGACAAATGCTCAACAAACTAACTAATTAATTAATTTATTAAATTTTCTTAAGGTGTTTCAACTTCAAAATTGAAACAATATTGTCCTAACTTCTTCCCGGTGCTTGAGCTCATTCCACTCCTTCACCCACAGGGAGTAGCTCGACTGTGGCGCAACGACATCAATGGAGACCTCCTTGTTCTCCACCAGCT CGCTGGAATGGCGCTCAAACTTGTGCAAGTCCTCCAGCATCCTCGCCAGCGATGTCATGTCGCGTTCGCTCTTGGCACTCTCTGTCTGCTCGCGCGCTTCCTCCACCCTCGCCCAGAAGCACGGGTCCTGCGTTAGCCCAGCGAACTTGCTCCTCCTCGCTGTCGTGGTGGCAGAGGTGTCACCAGTGCTGGGATCTGTGCAGCCCTTCTGTTTCCACCACTTGTCGAACAGCTCATACCTTCTCTCCCGGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CB652013             [                                                                                     AGCTTCAAGTTATTGCAAATCTTAA AAGAAGAACAGATACATCATAATGCAATGCCTCTACCAGGACTAAATCTATTTACAATCACCTATATTATGTTGCTAACATTCATTCATCTGTGCCTAAACTAGATGACAAATGCTCAACAAACTAACTAATTAATTAATTAATTAAATTTTCTTAAGGGGTTTCAACTTCAAAATTGAAACAATATTGTCCTAACTTTTTCCCGGAGCTTGAGCTCATTCCACTCCTTCACCCACAGGGAGTAGCTCGACTGTGGCGCAACGACATCAATGGAGACCTCCTTGTTCTCCACCAGCT CGCTGGAATGGCGCTCAAACTTGTGCAAGTCCTCCAGCATCCTCGCCAGCGATGTCATGTCGCGTTCGCTCTTGGCACTCTCTGTCTGCTCGCGCGCTTCCTCCACCCTCGCCCAGAAGCACGGGTCCTGCGTTAGCCCAGCGAACTTGCTCCTCCTCGCTGTCGTGGTGGCAGAGGTGTCACCAGTGCTGGGATCTGTGCAGCCCTTCTGTTTCCACCACTTGTCGAACAGCTCATACCTTCTCTCCCGGCCATGGGTGATGTAAGAGCCGCGTGTGCGGTGTAGGTTGTTTCGGTGGTAGTCGGCAATGTCAAGTGGCTCAACAAGGAGCTGGTAGAAGTGGGCAGCGTTGACCCACTTGGCACGGCGGTGGAAGTCGTAGGGGAGCTGGCTGGTGTCAAGCATGGAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CB652012             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGGGTCCTGCGTTAGCCCAGCGAACTTGCTCCTCCTCGCTGTCGTGGTGGCAGAGGTGTCACCAGTGCTGGGATCTGTGCAGCCCTTCTGTTTCCACCACTTGTCGAACAGCTCATACCTTCTCTCCCGGCCATGGGTGATGTAAGAGCCGCGTGTGCGGTGTAGGTTGTTTCGGTGGTAGTCGGCAATGTCAAGTGGCTCAACAAGGAGCTGGTAGAAGTGGGCAGCGTTGACCCACTTGGCACGGCGGTGGAAGTCGTAGGGGAGCTGGCTGGTGTCAAGCATGGAGAGGACGCCATCCC AGAACTGTGCGAGCTTGATGCGGTACATGTTGGCCTTGCTGAACTTCTTAGGTGATAGCCGCTGCTTGAATGCGTCGTAATACCCGGTGTTGGCATCGAACAATGCCTTGTACCACTCGATCTGCGCTCGGCACGGCGTGATCCGTCCCAACCGCGTTGCGAGGCTCGCACAGTTCAGGCTCGGGCTCCGGCCCACGCGCTTCGACGTCTTCAGCCACTGCCGTGCCGGTGCTGCCTCTGTAGCTTCACCGGTGATACCTGATGCCTCCAGTGCAATGGAGATGCCGACGTCGTAGTTGGACGCGGCAGGTGCGGTGACTGTGGCACCAAGGCGCCTCTTGAGCAGCAAGTGGTGCGGCATGCTCAGCACGAGGTCACCGTAGCAGGAGTGTGCAGCCTCAGGTGGCACCGCGCCTGTCTCTGGAGCACGCCTTGCAGCAAATGTTGCATATAGCATCTGATCCGAAGGTGTT]
[-] EMBL CF314888             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTTGCTCCTCCTCGCTGTCGTGGTGGCAGAGGTGTCACCAGTGCTGGGATCTGTGCAGCCCTTCTGTTTCCACCACTTGTCGAACAGCTCATACCTTCTCTCCCGGCCATGGGTGATGTAAGAGCCGCGTGTGCGGTGTAGGTTGTTTCGGTGGTAGTCGGCAATGTCAAGTGGCTCAACAAGGAGCTGGTAGAAGTGGGCAGCGTTGACCCACTTGGCACGGCGGTGGAAGTCGTAGGGGAGCTGGCTGGTGTCAAGCATGGAGAGGACGCCATCCC AGAACTGTGCGAGCTTGATGCGGTACATGTTGGCCTTGCTGAACTTCTTAGGTGATAGCCGCTGCTTGAATGCGTCGTAATACCCGGTGTTGGCATCGAACAATGCCTTGTACCACTCGATCTGCGCTCGGCACGGCGTGATCCGTCCCAACCGCGTTGCGAGGCTCGCACAGTTCAGGCTCGGGCTCCGGCCCACGCGCTTCGAC                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CF336087             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGTGGCAGAGGTGTCACCAGTGCTGGGATCTGTGCAGCCCTTCTGTTTCCACCACTTGTCGAACAGCTCATACCTTCTCTCCCGGCCATGGGTGATGTAAGAGCCGCGTGTGCGGTGTAGGTTGTTTCGGTGGTAGTCGGCAATGTCAAGTGGCTCAACAAGGAGCTGGTAGAAGTGGGCAGCGTTGACCCACTTGGCACGGCGGTGGAAGTCGTAGGGGAGCTGGCTGGTGTCAAGCATGGAGAGGACGCCATCCCAAGAACTGTGCGAGCTTGATGCGGTACATGTTGGCCTTGCTGAACTTCTTAGGTGATAGCCGCTGCTTGAATGCGCCGTAATACCCGGTGTTGGCATCGAACAATGCCTTGTACCACTCGATCTGCGCTCGGCACGGCGTGATCCGTCCCAACCGCGTTG GAGGCTCGCACAGTTCAGGCTCGGGCTCCGGCCCACGCGCTTCGAC                                                                                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_11868#0
TTTTTTGGTGATATCCATAAAGGTAAAACATGCAGAGTCATACAGATTTGGTTGAAGCAA
ATTCTTGACAGAAGTGAAGTGAATCAGCTTCAAGTTATTGCAAATTTCAACATGAAGAAC
AGATACATCATAATGCAATGCCTCTACCAGGACTAAATCTATTTACAATCACCTATATTA
TGTTGCTAACATTCATTCATCTGTGCCTAAACTAGATGACAAATGCTCAACAAACTAACT
AATTAATTAATTAATTAAATTTTCTTAAGGTGTTTCAACTTCAAAATTGAAACAATATTG
TCCTAACTTCTTCCCGGAGCTTGAGCTCATTCCACTCCTTCACCCACAGGGAGTAGCTCG
ACTGTGGCGCAACGACATCAATGGAGACCTCCTTGTTCTCCACCAGCTCGCTGGAATGGC
GCTCAAACTTGTGCAAGTCCTCCAGCATCCTCGCCAGCGATGTCATGTCGCGTTCGCTCT
TGGCACTCTCTGTCTGCTCGCGCGCTTCCTCCACCCTCGCCCAGAAGCACGGGTCCTGCG
TTAGCCCAGCGAACTTGCTCCTCCTCGCTGTCGTGGTGGCAGAGGTGTCACCAGTGCTGG
GATCTGTGCAGCCCTTCTGTTTCCACCACTTGTCGAACAGCTCATACCTTCTCTCCCGGC
CATGGGTGATGTAAGAGCCGCGTGTGCGGTGTAGGTTGTTTCGGTGGTAGTCGGCAATGT
CAAGTGGCTCAACAAGGAGCTGGTAGAAGTGGGCAGCGTTGACCCACTTGGCACGGCGGT
GGAAGTCGTAGGGGAGCTGGCTGGTGTCAAGCATGGAGAGGACGCCATCCCAGAACTGTG
CGAGCTTGATGCGGTACATGTTGGCCTTGCTGAACTTCTTAGGTGATAGCCGCTGCTTGA
ATGCGTCGTAATACCCGGTGTTGGCATCGAACAATGCCTTGTACCACTCGATCTGCGCTC
GGCACGGCGTGATCCGTCCCAACCGCGTTGCGAGGCTCGCACAGTTCAGGCTCGGGCTCC
GGCCCACGCGCTTCGACGTCTTCAGCCACTGCCGTGCCGGTGCTGCCTCTGTAGCTTCAC
CGGTGATACCTGATGCCTCCAGTGCAATGGAGATGCCGACGTCGTAGTTGGACGCGGCAG
GTGCGGTGACTGTGGCACCAAGGCGCCTCTTGAGCAGCAAGTGGTGCGGCATGCTCAGCA
CGAGGTCACCGTAGCAGGAGTGTGCAGCCTCAGGTGGCACCGCGCCTGTCTCTGGAGCAC
GCCTTGCAGCAAATGTTGCATATAGCATCTGATCCGAAGGTGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)