cluster # 12246

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Oryza sativa
cluster # 12246 cluster # 12246 Sequences # 10 consensus # 3

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consensus_12246#0 length = 1348 sequences # 8

consensus_12246#1 length = 793 sequences # 1
consensus_12246#2 length = 742 sequences # 1

consensusID : consensus_12246#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1348
fasta sequence

                              [GCACCCTGTCGATTTCTATACAAAGGCATGACACGAGACATTATTTAGTGGCCTCTGTAAATTCAAATGATGTTAATTTCTGAGTTCAGTAAAACATGTAGCAGTTCATCTCTTATGCTGAAGAAAGATACCAGTTTTACTATGTCAGCTGTTGGTTTGTTTAGGTGGGTTTGCACGCGGTGTACTCAATCCTGAATGTTTAGGTTACTGATGAGATGCCATGTATATTGGTAATTTTGTGTCACAATTTCAGATTTCAGAACCGTGTCAGTACAAAAATCAGCTAAAAATGGTGAGTACCATATTAGTGAAACAATTCACTGTCAGTTCTTTGTGTTAAGCAAATCAAATACCGTTATTG-CCAGAATGCAAATTACAACAGTTCTAGCTTCCATCTCAAAATATGGGTGCTTGCAGAGTTGTTTCATTGGT-TTACCCTTAGTACTATTATCTTGGTGCTCATATCTTCTATGCAACAAAAAATTGTTCTAAACTCTATGTAATTGTAGATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGGACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATATTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTATCTTCTGAGATTTCTTCTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGCCAGCCTGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTACATGGTGATAAAATTAGGCTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAACTGCAAACA-TATCATTGTTGGTATGACTGCATGGATAATTTTGTTAACGGATGTGCTATGGTTCACACGTGCAGATGTCTGTGGCCCTTCTTCCTCGGACATTATTTTTATTATCATCATCTAGGTTAGGATAGAGGGCTTTTAAAAGAAAATACTCTCTTATTTGGTACGCAAAATCCTACAGATCTGAATGCTCTTTTATTTCATATGTAGTGCTTCCTGAATCGTTTGTATAATTGTATTTCCATAGAGCTAGACCCTTTCGTCT]

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[+] EMBL CB663673             [                                                                                                      AGTTCATCTCTTATGCTGAAGAAAGATACCAGTTTTACTATGTCAGCTGTTGGTTTGTTTAGGTGGGTTTGCACGCGGTGTACTCAATCCTGAATGTTTAGGTTACTGATGAGATGCCATGTATATTGGTAATTTTGTGTCACAATTTCAGATTTCAGAACCGTGTCAGTACAAAAATCAGCTAAAAATGGTGAGTACCATATTAGTGAAACAATTCACTGTCAGTTCTTTGTGTTAAGCAAATCAAATACCGTTATTG CCAGAATGCAAATTACAACAGTTCTAGCTTCCATCTCAAAATATGGGTGCTTGCAGAGTTGTTTCATTGGTGTTGGGGGGAGTACTATTATCTTGGTGCTCATATCTTCTATGCAACAAAAAATTGTTCTAAACTCTATGTAATTGTAGATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATACGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAAGACTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CB675329             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tnTCATGTA TTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGGACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATATTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTATCTTCTGAGATTTCTTCTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGCCAGCCTGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTACATGGTGATAAAATTAGGCTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAACTGCAAACA TATCATTGTTGGTATGACTGCATGGATAATTTTGTTAACGGATGTGCTATGGTTCACACGTGCAGATGTCTGTGGCCCTTCTTCCTCGGACATTATTTTTATTATCATCATCTAGGTTAGGATAGAGGGCTTTTAAAAGAAAATACTCTCTTATTTGGTACGCAAAATCCTACAGATCTGAATGCTCTTTTATTTCATATGTAGTGCTTCCTGAATCGTTTGTATAATTGTATTTCCATAGAGCTAGACCCTTTCGTCT]
[-] EMBL CB660398             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAACGATAGGGCTCCCCGAAGCACAAAAAAGGTAAATACGGAAAGATAAGTTCGGGCCCCTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCGGGACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTTTATTTTATTCATTCAGGCATATTTGCTTCATATTGTTCTGGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTATCTTTGGAGATTTTTTTTACCGGGGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGTTGGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGCCACCCTGAAAATTCCCTCCAGATTTGTTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTCCATGGGGATAAAATTAGGCTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAGCTGCAAAAAGGGGCATTGTTGGTATGCCTc                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CB675417             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taTTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCTCGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGGACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATATTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTATCTTCTGAGATTTCTTCTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGCCAGCCTGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTACATGGTGATAAAATTAGGCTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAACTGCAAACA TATCATTGTTGGTATGACTGCATGGATAATTTTGTTAACGGATGTGCTATGGTTCACACGTGCAGATGTCTGTGGCCCTTCTTCCTCGGACATTATTTTTATTATCATCATCTAGGTTAGGATAGAGGGCTTTTAAAAGAAAATACTCTCTTATTTGGTACGCAAAATCCTACAGATCTGAATGCTCTTTTATTTCATATGTAGTGCTTCCTGAATCGTTTGTAGAATTGTATTTCCATAGAGCTAGACCCTTTCGTCT]




>consensus_12246#0
GCACCCTGTCGATTTCTATACAAAGGCATGACACGAGACATTATTTAGTGGCCTCTGTAA
ATTCAAATGATGTTAATTTCTGAGTTCAGTAAAACATGTAGCAGTTCATCTCTTATGCTG
AAGAAAGATACCAGTTTTACTATGTCAGCTGTTGGTTTGTTTAGGTGGGTTTGCACGCGG
TGTACTCAATCCTGAATGTTTAGGTTACTGATGAGATGCCATGTATATTGGTAATTTTGT
GTCACAATTTCAGATTTCAGAACCGTGTCAGTACAAAAATCAGCTAAAAATGGTGAGTAC
CATATTAGTGAAACAATTCACTGTCAGTTCTTTGTGTTAAGCAAATCAAATACCGTTATT
GCCAGAATGCAAATTACAACAGTTCTAGCTTCCATCTCAAAATATGGGTGCTTGCAGAGT
TGTTTCATTGGTTTACCCTTAGTACTATTATCTTGGTGCTCATATCTTCTATGCAACAAA
AAATTGTTCTAAACTCTATGTAATTGTAGATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTT
TTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGG
TAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGG
ACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATA
TTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTA
TCTTCTGAGATTTCTTCTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATT
GCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGC
TGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGC
CAGCCTGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCC
AAATTTGCTCTTTACATGGTGATAAAATTAGGCTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAA
CTGCAAACATATCATTGTTGGTATGACTGCATGGATAATTTTGTTAACGGATGTGCTATG
GTTCACACGTGCAGATGTCTGTGGCCCTTCTTCCTCGGACATTATTTTTATTATCATCAT
CTAGGTTAGGATAGAGGGCTTTTAAAAGAAAATACTCTCTTATTTGGTACGCAAAATCCT
ACAGATCTGAATGCTCTTTTATTTCATATGTAGTGCTTCCTGAATCGTTTGTATAATTGT
ATTTCCATAGAGCTAGACCCTTTCGTCT

consensusID : consensus_12246#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 793
fasta sequence

                              [ATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGGACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATATTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTATCTTCTGAGATTTCTTTTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCATCAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGCCACCCCGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTACATGGTGATAAAATTAGGTTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAACTGCAAACATATCATTGTTGGTATGACTGCATGGATAATTTTGTTACCGGATGTGGTATGGTTCACACTTGCAGATGTGTGTGGCCCTTCTTCCTCGGACATTATTTTTATTATCATCATATAGGTTAGGATAGAGGGCTTTTAAAAGAAAATACTCTCTTATTTGGTACGCAAAATCCTACAGATATGAAAGCTCTTTTATTTCATACGTACAAAAAGGGA]

[-] EMBL CB665248             [ATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGGACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATATTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTATCTTCTGAGATTTCTTTTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCATCAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGCCACCCCGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTACATGGTGATAAAATTAGGTTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAACTGCAAACATATCATTGTTGGTATGACTGCATGGATAATTTTGTTACCGGATGTGGTATGGTTCACACTTGCAGATGTGTGTGGCCCTTCTTCCTCGGACATTATTTTTATTATCATCATATAGGTTAGGATAGAGGGCTTTTAAAAGAAAATACTCTCTTATTTGGTACGCAAAATCCTACAGATATGAAAGCTCTTTTATTTCATACGTACAAAAAGGGA]




>consensus_12246#1
ATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCA
AATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACT
TTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGGACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTCT
ATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATATTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTT
GAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTATCTTCTGAGATTTCTTTTAACCGTGCATG
TCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGAC
TGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGC
CATCAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGCCACCCCGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTG
CAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTACATGGTGATAAAATT
AGGTTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAACTGCAAACATATCATTGTTGGTATGACTG
CATGGATAATTTTGTTACCGGATGTGGTATGGTTCACACTTGCAGATGTGTGTGGCCCTT
CTTCCTCGGACATTATTTTTATTATCATCATATAGGTTAGGATAGAGGGCTTTTAAAAGA
AAATACTCTCTTATTTGGTACGCAAAATCCTACAGATATGAAAGCTCTTTTATTTCATAC
GTACAAAAAGGGA

consensusID : consensus_12246#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 742
fasta sequence

                              [AATCAAATACCGTTATTGCCAGAATGCAAATTACAACAGTTTTAGCTTCCATCTCAAAATATGGGTGCTTGCAGAGTTGTTTCATTGGTTTACCCTTAGTACTATTATCTTGGTGCTCATATCTTCTATGCAACAAAAAATTGTTCTAAACTCTATGTAATTGTAGATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGGACTTTTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATATTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTATTTTTTGAGATTTTTTTTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGCCAGCCTGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTACATGATGTGGGTGGCCCTTCTTCCTCGGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGG]

[-] EMBL CB642737             [AATCAAATACCGTTATTGCCAGAATGCAAATTACAACAGTTTTAGCTTCCATCTCAAAATATGGGTGCTTGCAGAGTTGTTTCATTGGTTTACCCTTAGTACTATTATCTTGGTGCTCATATCTTCTATGCAACAAAAAATTGTTCTAAACTCTATGTAATTGTAGATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGGACTTTTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATATTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTATTTTTTGAGATTTTTTTTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGCCAGCCTGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTACATGATGTGGGTGGCCCTTCTTCCTCGGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGG]




>consensus_12246#2
AATCAAATACCGTTATTGCCAGAATGCAAATTACAACAGTTTTAGCTTCCATCTCAAAAT
ATGGGTGCTTGCAGAGTTGTTTCATTGGTTTACCCTTAGTACTATTATCTTGGTGCTCAT
ATCTTCTATGCAACAAAAAATTGTTCTAAACTCTATGTAATTGTAGATGTGATATATAAT
CATTTTCATGTATTTTTTTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCC
ACGAAGCACAAAAAAGGTAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTT
CTTTCTTGGAACTCAGGACTTTTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCA
TGCATATTTGCTTCATATTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTG
ATAAATTGTATTTCCTATTTTTTGAGATTTTTTTTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTAT
GGCATAAAATCCATATTGCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACAT
TGTGAGGTGCTCGGCGCTGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATT
GCAGTGGCAGAGCAAGCCAGCCTGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAA
GCCTGAAAATTGCCTCCAAATTTGCTCTTTACATGATGTGGGTGGCCCTTCTTCCTCGGA
CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_12246#0      GCACCCTGTCGATTTCTATACAAAGGCATGACACGAGACATTATTTAGTGGCCTCTGTAA 60
consensus_12246#1      ------------------------------------------------------------
consensus_12246#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12246#0      ATTCAAATGATGTTAATTTCTGAGTTCAGTAAAACATGTAGCAGTTCATCTCTTATGCTG 120
consensus_12246#1      ------------------------------------------------------------
consensus_12246#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12246#0      AAGAAAGATACCAGTTTTACTATGTCAGCTGTTGGTTTGTTTAGGTGGGTTTGCACGCGG 180
consensus_12246#1      ------------------------------------------------------------
consensus_12246#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12246#0      TGTACTCAATCCTGAATGTTTAGGTTACTGATGAGATGCCATGTATATTGGTAATTTTGT 240
consensus_12246#1      ------------------------------------------------------------
consensus_12246#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12246#0      GTCACAATTTCAGATTTCAGAACCGTGTCAGTACAAAAATCAGCTAAAAATGGTGAGTAC 300
consensus_12246#1      ------------------------------------------------------------
consensus_12246#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12246#0      CATATTAGTGAAACAATTCACTGTCAGTTCTTTGTGTTAAGCAAATCAAATACCGTTATT 360
consensus_12246#1      ------------------------------------------------------------
consensus_12246#2      -------------------------------------------AATCAAATACCGTTATT 17
                                                                                   

consensus_12246#0      GCCAGAATGCAAATTACAACAGTTCTAGCTTCCATCTCAAAATATGGGTGCTTGCAGAGT 420
consensus_12246#1      ------------------------------------------------------------
consensus_12246#2      GCCAGAATGCAAATTACAACAGTTTTAGCTTCCATCTCAAAATATGGGTGCTTGCAGAGT 77
                                                                                   

consensus_12246#0      TGTTTCATTGGTTTACCCTTAGTACTATTATCTTGGTGCTCATATCTTCTATGCAACAAA 480
consensus_12246#1      ------------------------------------------------------------
consensus_12246#2      TGTTTCATTGGTTTACCCTTAGTACTATTATCTTGGTGCTCATATCTTCTATGCAACAAA 137
                                                                                   

consensus_12246#0      AAATTGTTCTAAACTCTATGTAATTGTAGATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTT 540
consensus_12246#1      -----------------------------ATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTT 31
consensus_12246#2      AAATTGTTCTAAACTCTATGTAATTGTAGATGTGATATATAATCATTTTCATGTATTTTT 197
                                                    *******************************

consensus_12246#0      TTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGG 600
consensus_12246#1      TTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGG 91
consensus_12246#2      TTAAAATTACGTAGTTTCTTAATTTATCAAATGATAGGGCTCCACGAAGCACAAAAAAGG 257
                       ************************************************************

consensus_12246#0      TAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGG 660
consensus_12246#1      TAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGG 151
consensus_12246#2      TAAATACTGAAAGATAAGTTCTGTGCACTTTGAGTTTTATTTTCTTTCTTGGAACTCAGG 317
                       ************************************************************

consensus_12246#0      ACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATA 720
consensus_12246#1      ACTTCTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATA 211
consensus_12246#2      ACTTTTGATGATGATAGATTGATAGCTCTATTTTATTCATTCATGCATATTTGCTTCATA 377
                       **** *******************************************************

consensus_12246#0      TTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTA 780
consensus_12246#1      TTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTA 271
consensus_12246#2      TTGTTCTTGATTCAGTAGCTAGGCTGGTTGAGAGGGATAATTGATAAATTGTATTTCCTA 437
                       ************************************************************

consensus_12246#0      TCTTCTGAGATTTCTTCTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATT 840
consensus_12246#1      TCTTCTGAGATTTCTTTTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATT 331
consensus_12246#2      TTTTTTGAGATTTTTTTTAACCGTGCATGTCAGCTAAAACTATGGCATAAAATCCATATT 497
                       * ** ******** ** *******************************************

consensus_12246#0      GCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGC 900
consensus_12246#1      GCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGC 391
consensus_12246#2      GCAAGTATGGAGCTGGTGAGGTGCTTGACTGATGGGGAGACATTGTGAGGTGCTCGGCGC 557
                       ************************************************************

consensus_12246#0      TGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGC 960
consensus_12246#1      TGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCATCAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGC 451
consensus_12246#2      TGTCGGCAAGCCTTTGCTGGTCATTAGGCCAACAAGGTGTATTGCAGTGGCAGAGCAAGC 617
                       ******************************* ****************************

consensus_12246#0      CAGCCTGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCC 1020
consensus_12246#1      CACCCCGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCC 511
consensus_12246#2      CAGCCTGAAAATTGCCTCCAGATTTGCTGCAGCGGCAGAGCAAGCCTGAAAATTGCCTCC 677
                       ** ** ******************************************************

consensus_12246#0      AAATTTGCTCTTTACATGGTGATAAAATTAGGCTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAA 1080
consensus_12246#1      AAATTTGCTCTTTACATGGTGATAAAATTAGGTTATAATGGTTGTATTTTTTAGGTTGAA 571
consensus_12246#2      AAATTTGCTCTTTACATGATG-------TGGG------TGGCCCTTCTTCCTCGGACAAA 724
                       ****************** **       * **      ***   *  **  * **   **

consensus_12246#0      CTGCAAACATATCATTGTTGGTATGACTGCATGGATAATTTTGTTAACGGATGTGCTATG 1140
consensus_12246#1      CTGCAAACATATCATTGTTGGTATGACTGCATGGATAATTTTGTTACCGGATGTGGTATG 631
consensus_12246#2      AAAAAAAAAAAAAAAAGG------------------------------------------ 742
                           *** * *  *  *                                           

consensus_12246#0      GTTCACACGTGCAGATGTCTGTGGCCCTTCTTCCTCGGACATTATTTTTATTATCATCAT 1200
consensus_12246#1      GTTCACACTTGCAGATGTGTGTGGCCCTTCTTCCTCGGACATTATTTTTATTATCATCAT 691
consensus_12246#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12246#0      CTAGGTTAGGATAGAGGGCTTTTAAAAGAAAATACTCTCTTATTTGGTACGCAAAATCCT 1260
consensus_12246#1      ATAGGTTAGGATAGAGGGCTTTTAAAAGAAAATACTCTCTTATTTGGTACGCAAAATCCT 751
consensus_12246#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12246#0      ACAGATCTGAATGCTCTTTTATTTCATATGTAGTGCTTCCTGAATCGTTTGTATAATTGT 1320
consensus_12246#1      ACAGATATGAAAGCTCTTTTATTTCATACGTA-CAAAAAGGGA----------------- 793
consensus_12246#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12246#0      ATTTCCATAGAGCTAGACCCTTTCGTCT 1348
consensus_12246#1      ----------------------------
consensus_12246#2      ----------------------------