cluster # 12303

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 12303 cluster # 12303 Sequences # 10 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_12303#0 length = 1510 sequences # 10
consensusID : consensus_12303#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1510
fasta sequence
                              [TAGGCCGTGCTCAGGCTTCATCATCATACACATCAAGTAGTATACTCAGATCACTGATGGCAGCACTAGAAGAAATAGAGCTACATGCACATAATGAGACAGTGAGGTCAAGCTATTCACACATGTATCTGTGCATATTGAGAGTACAACAGTTGTTTGATCTTATACCATTTTCAAGAACGATTGATAATGTTGGTCAAGATGAAGCAACTGCATGTACGCTTTTGAAGAATATGGCTTTGAATATATATGAACATGTTGGGGTGAGGATGCATCGCCTTTCTGTGTGTCAGTGGGAAGTGAAGTTATGGTTGGATTGTGATGGACAAGCAAGCGGTGCTTGGAGAGTAGTTGTTACCAATGTAACTGGCCACACCTGCACTGTCGATATTTACCGAGAAGTGGAGGATTCTAATACACATAAACTTTTCTACCACTCTGTTACACCATCACTGGGTCCTTTGCATGGCATTGTGTTGGATGAACCATACAAGCCATTGGATGCTATTGACCTCAAACGTTACTCTGCTAGGAAGAACGAAACTACGTACTGCTATGACTTCCCGCTGGCTTTTGAAACAGCACTGAAGAGGTCATGGAAATCAACCCTCTCTGTTGTTGCTGAAGCTAATGAGCATAATAAGAGCTATGCTAAAGTGACAGAGCTTATGTTTGCTGATTCAACTGGATCATGGGGTACTCCTTTGGTTCCAGTTGAGCGTTCTCCAGGTATCAATGATATTGGCATTGTCGCTTGGATCATGAAGCTCTCCACACCAGAATTTCCAAGTGGCCGGGAGATTATTGTTGTTTCAAATGATGTGACATTTAAAGCTGGATCATTTGGTCCTAGGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGAAACTTCCTCTTATCTACTTGTCAGCAACTGCTGGTGCTAGGCTCGGTGTAGCTGAGGAAATAAAAGCATGCTTCAATGTTGGTTGGTCTGATGACGAGAGCCCTGAACGTGGTTTTCATTACATTTACCTCACTGAACAAGATTATTCGCGCCTGAGTTCTTCGGTTATAGCCCATGAACTGAAA-CTAGAAAGTGGAGAAACTAGATGGGTTGTTGATACCATTGTTGGAAAAGAGGATGGACTCGGTTGTGAGAACTTGCATGGAAGTGGTGCCATTGCCAGTGCCTATTCTAAAGCATACAAGGAGACCTTTACTCTGACATTCGTAACTGGACGAGCTGTTGGAATTGGTGCTTATCTTGCTCGGTTAAGCATGAGGTGTATACAGCGTCTTGATCAGCCAATTATTTTGACAGGATTTTCTGCGCTGAATAAGCTTCTGGGGCGGGAGGTATACAGCTCTCACATGCAACTAGGTGGCCCCAAAATCATGGCTACAAATGGTGTCGTCCATCTGACTGTGTCAGATGACCTTGAAGGTGTTTCTGCAATCTTGAAATGGCTCAGCTATGTTCCTCCTTATGTTGGTGGTCCTCTTCCTATCATGAA]

[+] EMBL CB637772             [TAGGCCGTGCTCAGGCTTCATCATCATACACATCAAGTAGTATACTCAGATCACTGATGGCAGCACTAGAAGAAATAGAGCTACATGCACATAATGAGACAGTGAGGTCAAGCTATTCACACATGTATCTGTGCATATTGAGAGTACAACAGTTGTTTGATCTTATACCATTTTCAAGAACGATTGATAATGTTGGTCAAGATGAAGCAACTGCATGTACGCTTTTGAAGAATATGGCTTTGAATATATATGAACATGTTGGGGTGAGGATGCATCGCCTTTCTGTGTGTCAGTGGGAAGTGAAGTTATGGTTGGATTGTGATGGACAAGCAAGCGGTGCTTGGAGAGTAGTTGTTACCAATGTAACTGGCCACACCTGCACTGTCGATATTTACCGAGAAGTGGAGGATTCTAATACACATAAACTTTTCTACCACTCTGTTACACCATCACTGGGTCCTTTGCATGGCATTGTGTTGGATGAACCATACAAGCCATTGGATGCTATTGACCTCAAACGTTACTCTGCTAGGAAGAACGAAACTACGTACTGCTATGACTTCCCGCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CB629532             [                                                                                                                                                                   TATACCCTTTTCAAGAACGATTGATAATGTTGGTCAAGATGAAGCAACTGCATGTACGCTTTTGAAGAATATGGCTTTGAATATATATGAACATGTTGGGGTGAGGATGCATCGCCTTTCTGTGTGTCAGTGGGAAGTGAAGTTATGGTTGGATTGTGATGGACAAGCAAGCGGTGCTTGGAGAGTAGTTGTTACCAATGTAACTGGCCACACCTGCACTGTCGATATTTACCGAGAAGTGGAGGATTCTAATACACATCAACTTTTCTACCACTCTGTTACACCATCACTGGGTCCTTTGCATGGCATTGCGTTGGATGAACCATACAAGCCATTGGATGCTATTGACCTCAAACGTTACTCTGCTAGGAAGAACGAAACTACGTACTGCTATGACTTCCCGCTGGCTTTTGAAACAGCACTGAAGAGGTCATGGAAATCAACCCTCTCTGTTGTTGCTGAAGCTAATGAGCATAATAAGAGCTATGCTAAAGTGACAGAGCTTATGTTTGCTGATTCAACTGGATCATGGGGTACTCCTTTGGTTCCAGTTGAGCGTTCTCCAGGTATCAATGATATTGGCATTGTCGCTTGGATCATGAAGCTCTCCACACCAGAATTTCCAAGTGGCCGGGAGATTATTGTTGTTTCAAATGATGTGACATTTAAAGCTGGATCATTTGGTCCTAGGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGAAACTTCCTCTTATCTACTTGTCAGCAACTGCTGGTGCTAGGCTCGGTGTAGCTGAag                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CB659853             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TACACCATCACTGGGTCCTTTGCATGGCATTGTGTTGGATGAACCATACAAGCCATTGGATGCTATTGACCTCAAACGTTACTCTGCTAGGAAGAACGAAACTACGTACTGCTATGACTTCCCGCTGGCTTTTGAAACAGCACTGAAGAGGTCATGGAAATCAACCCTCTCTGTTGTTGCTGAAGCTAATGAGCATAATAAGAGCTATGCTAAAGTGACAGAGCTTATGTTTGCTGATTCAACTGGATCATGGGGTACTCCTTTGGTTCCAGTTGAGCGTTCTCCAGGTATCAATGATATTGGCATTGTCGCTTGGATCATGAAGCTCTCCACACCAGAATTTCCAAGTGGCCGGGAGATTATTGTTGTTTCAAATGATGTGACATTTAAAGCTGGATCATTTGGTCCTAGGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGAAACTTCCTCTTATCTACTTGTCAGCAACTGCTGGTGCTAGGCTCGGTGTAGCTGAGGAAATAAAAGCATGCTTCAATGTTGGTTGGTCTGATGACGAGAGCCCTGAACGTGGTTTTCATTACATTTACCTCACTGAACAAGATTATTCGCGCCTGAGTTCTTCGGTTATAGCCCATGAACTGAAA CTAGAAAGTGGAGAAACTAGATGGGTTGTTGATACCATTGTTGGAAAAGAGGATGGACTCGGTTGTGAGAACTTGCATGGAAGTGGTGCCATTGCCAGTGCCTATTCTAAAGCATACAAGGAGACCTTTACTCTGACATTCGTAACTGGACGAGCTGTTGGAATTGGTGCTTATCTTGCTCGGTTAAGCATGAGGTGTATACA                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BF430541             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTACTCTGCTAGGAAGAACGAAACTACGTACTGCTATGACTTCCCGCTGGCTTTTGAAACAGCACTGAAGAGGTCATGGAAATCAACCCTCTCTGTTGTTGCTGAAGCTAATGAGCATAATAAGAGCTATGCTAAAGTGACAGAGCTTATGTTTGCTGATTCAACTGGATCATGGGGTACTCCTTTGGTTCCAGTTGAGCGTTCTCCAGGTATCAATGATATTGGCATTGTCGCTTGGATCATGAAGCTCTCCACACCAGAATTTCCAAGTGGCCGGGAGATTATTGTTGTTTCAAATGATGTGACATTTAAAGCTGGATCATTTGGTCCTAGGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGAAACTTCCTCTTATCTACTTGTCAGCAACTGCTGGTGCTAGGCTCGGTGTAGCTGAGGAAATAAAAGCATGCTTCAATGTTGGTTGGTCTGATGACGAGAGCCCTGAACGTGGTTTTCATTACATTTACCTCACTGAACAAGATTATTCGCGCCTGAGTTCTTCGGTTATAGCCCATGAACTGAAA CTAGAAAGTGGAGAAACTAGATGGGTTGGTGATACCATTGTTGGAAAAGAGGATGGACTCGGTTGTGAGAACTTGCATGGGAGTGGTGCCATTGCCAGTGCCTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CB637826             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACTTCCCGCTGGCTTTTGAAACAGCACTGAAGAGGTCATGGAAATCAACCCTCTCTGTTGTTGCTGAAGCTAATGAGCATAATAAGAGCTATGCTAAAGTGACAGAGCTTATGTTTGCTGATTCAACTGGATCATGGGGTACTCCTTTGGTTCCAGTTGAGCGTTCTCCAGGTATCAATGATATTGGCATTGTCGCTTGGATCATGAAGCTCTCCACACCAGAATTTCCAAGTGGCCGGGAGATTATTGTTGTTTCAAATGATGTGACATTTAAAGCTGGATCATTTGGTCCTAAGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGAAACTTCCTCTTATCTACTTGTCAACAACTGCTGGTGCTAAGCTCGGTGTAGCTGAGGAAATAAAAGCATGCTTCAATGTTGGTTGGTCTGATGACGAGAGCCCTGAACGTGGTTTTCATTACATTTACCTCACTGAACAAGATTATTCGCGCCTGAGTTCTTCGGTTATAGCCCATGAACTGAAA CTAGAAAGTGGAGAAACTAGATGGGTTGTTGATACCATTGTTGGAAAAGAGGATGGACTCGGTTGTGAGAACTTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CB637861             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATGCTAAAGTGACAGACCTTATGTTTGCTGATTCAACTGGATCATGGGGTACTCCTTTGGTTCCAGTTGAGCGTTCTCCACGTATCAATGATATTGGCATTGTCGCTTGGATCATGAAGCTCTCCACACCAGAATTTCCAAGTGGCCGGGAGATTATTGTTGTTTCAAATGATGTGACATTTAAAGCTGGATCATTTGGTCCTATGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGAAACTTCCTCTTATCTACTTGTCACCAACTGCTGGTGCTAGGCTCAGTGTCGCTGAGGAAATATAAGCATGCTTGAATGTTGGTTGGTCTGATGACGACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CB646502             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCAGAATTTCCAAGTGGCCGGGAGATTATTGTTGTTTCAAATGATGTGACATTTAAAGCTGGATCATTTGGTCCTAGGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGAAACTTCCTCTTATCTACTTGTCAGCAACTGCTGGTGCTAGGCTCGGTGTAGCTGAGGAAATAAAAGCATGCTTCAATGTTGGTTGGTCTGATGACGAGAGCCCTGAACGTGGTTTTCATTACATTTACCTCACTGAACAAGATTATTCGCGCCTGAGTTCTTCGGTTATAGCCCATGAACTGAAA CTAGAAAGTGGAGAAACTAGATGGGTTGTTGATACCATTGTTGGAAAAGAGGATGGACTCGGTTGTGAGAACTTGCATGGAAGTGGTGCCATTGCCAGTGCCTATTCTAAAGCATACAAGGAGACCTTTACTCTGACATTCGTAACTGGACGAGCTGTTGGAATTGGTGCTTATCTTGCTCGGTTAGGCATGAGGTGTATACAGCGTCTTGATCAGCCAATTATTTTGACAGGATTTTCTGCGCTGAATAAGCTTCTGGGGCGGGAGGTATACAGCTCTCACATGCAACTAGGTGGCCCCAAAATCATGGCTACAAATGGTGTCGTCCATCTGACTGTGTCAGATGACCTTGAAGGTGTTTCTGCAATCTTGAAATGGCTCAGCTATGTTCCTCCTTATGTTGGTGGTCCTCTTCCTATCATGAA]
[+] EMBL OSS10652A            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGAGATTATTGTTGTTTCAAATGATGTGACATTTAAAGCTGGATCATTTGGTCCTAGGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGAAACTTCCTCTTATCTACTTGTCAGCAACTNCTGGTGCTAGGCTCGGTGTAGCTGAGGAAATAAAAGCATGCTTCAATGTTGGTTGGTCTGATGACGAGAGCCCTGAACGTGGTTTTCATTACATTTACNTCACTGAACAAGATTATTCGCGCCTGAGTTCTTCGGTTATAGCCCATGNACTGAAACCTAGAAAGTGGAGAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB641371             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTAAAGCTGGATCATTTGGTCCTAGGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGAAACTTCCTCTTATCTACTTGTCAGCAACTGCTGGTGCTAGGCTCGGTGTAGCTGAGGAAATAAAAGCATGCTTCAATGTTGGTTGGTCTGATGACGAGAGCCCTGAACGTGGTTTTCATTACATTTACCTCACTGAACAAGATTATTCGCGCCTGAGTTCTTCGGTTATAGCCCATGAACTGAAA CTAGAAAGTGGAGAAACTAGATGGGTTGTTGATACCATTGTTGGAAAAGAGGATGGACTCGGTTGTGAGAACTTGCATGGAAGTGGTGCCATTGCCAGTGCCTATTCTAAAGCATACAAGGAGACCTTTACTCTGACATTCGTAACTGGACGAGCTGTTGGAATTGGTGCTTATCTTGCTCGGTTAGGCATGAGGTGTATACAGCGTCTTGATCAGCCAATTATTTTGACAGGATTTTCTGCGCTGAATAAGCTTCTGGGGCGGGAGGTATACAGCTCTCACATGCAACTAGGTGGCCCCAAAATCATGGCTACAAATGGTGTCGTCCATCTGACTGTGTCA                                                                                   ]
[+] EMBL CB640471             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAACTTCCTCTTATCTACTTGTCAGCAACTGCTGGTGCTAGGCTCGGTGTAGCTGAGGAAATAAAAGCATGCTTCAATGTTGGTTGGTCTGATGACGAGAGCCCTGAACGTGGTTTTCATTACATTTACCTCACTGAACAAGATTATTCGCGCCTGAGTTCTTCGGTTATAGCCCATGAACTGAAA CTAGAAAGTGGAGAAACTAGATGGGTTGTTGATACCATTGTTGGAAAAGAGGATGGACTCGGTTGTGAGAACTTGCATGGAAGTGGTGCCATTGCCAGTGCCTATTCTAAAGCATACAAGGAGACCTTTACTCTGACATTCGTAACTGGACGAGCTGTTGGAATTGGTGCTTATCTTGCTCGGTTAAGCATGAGGTGTATAC                                                                                                                                                                                                                               ]




>consensus_12303#0
TAGGCCGTGCTCAGGCTTCATCATCATACACATCAAGTAGTATACTCAGATCACTGATGG
CAGCACTAGAAGAAATAGAGCTACATGCACATAATGAGACAGTGAGGTCAAGCTATTCAC
ACATGTATCTGTGCATATTGAGAGTACAACAGTTGTTTGATCTTATACCATTTTCAAGAA
CGATTGATAATGTTGGTCAAGATGAAGCAACTGCATGTACGCTTTTGAAGAATATGGCTT
TGAATATATATGAACATGTTGGGGTGAGGATGCATCGCCTTTCTGTGTGTCAGTGGGAAG
TGAAGTTATGGTTGGATTGTGATGGACAAGCAAGCGGTGCTTGGAGAGTAGTTGTTACCA
ATGTAACTGGCCACACCTGCACTGTCGATATTTACCGAGAAGTGGAGGATTCTAATACAC
ATAAACTTTTCTACCACTCTGTTACACCATCACTGGGTCCTTTGCATGGCATTGTGTTGG
ATGAACCATACAAGCCATTGGATGCTATTGACCTCAAACGTTACTCTGCTAGGAAGAACG
AAACTACGTACTGCTATGACTTCCCGCTGGCTTTTGAAACAGCACTGAAGAGGTCATGGA
AATCAACCCTCTCTGTTGTTGCTGAAGCTAATGAGCATAATAAGAGCTATGCTAAAGTGA
CAGAGCTTATGTTTGCTGATTCAACTGGATCATGGGGTACTCCTTTGGTTCCAGTTGAGC
GTTCTCCAGGTATCAATGATATTGGCATTGTCGCTTGGATCATGAAGCTCTCCACACCAG
AATTTCCAAGTGGCCGGGAGATTATTGTTGTTTCAAATGATGTGACATTTAAAGCTGGAT
CATTTGGTCCTAGGGAAGATGCTTTCTTTGATGCGGTCACCAATCTTGCTTGTGAGAGGA
AACTTCCTCTTATCTACTTGTCAGCAACTGCTGGTGCTAGGCTCGGTGTAGCTGAGGAAA
TAAAAGCATGCTTCAATGTTGGTTGGTCTGATGACGAGAGCCCTGAACGTGGTTTTCATT
ACATTTACCTCACTGAACAAGATTATTCGCGCCTGAGTTCTTCGGTTATAGCCCATGAAC
TGAAACTAGAAAGTGGAGAAACTAGATGGGTTGTTGATACCATTGTTGGAAAAGAGGATG
GACTCGGTTGTGAGAACTTGCATGGAAGTGGTGCCATTGCCAGTGCCTATTCTAAAGCAT
ACAAGGAGACCTTTACTCTGACATTCGTAACTGGACGAGCTGTTGGAATTGGTGCTTATC
TTGCTCGGTTAAGCATGAGGTGTATACAGCGTCTTGATCAGCCAATTATTTTGACAGGAT
TTTCTGCGCTGAATAAGCTTCTGGGGCGGGAGGTATACAGCTCTCACATGCAACTAGGTG
GCCCCAAAATCATGGCTACAAATGGTGTCGTCCATCTGACTGTGTCAGATGACCTTGAAG
GTGTTTCTGCAATCTTGAAATGGCTCAGCTATGTTCCTCCTTATGTTGGTGGTCCTCTTC
CTATCATGAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case