cluster # 12554

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Oryza sativa
cluster # 12554 cluster # 12554 Sequences # 10 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_12554#0 length = 2874 sequences # 10
consensusID : consensus_12554#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
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fasta sequence
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[+] EMBL CB641322             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acTTGACATGCTGTTCTGGGCTATTGACAACCCTCCACCATCAAACTATTTGTTAATTTCTGGTGATCGGGATTTCTCTAATGCCCTTCATAAGCTTACAATGAGACGGTACAATATTCTACTAGCACAGCCTCCAAATGTGTCTCAAGCCCTTACTGCTGCAGCGAAAAGTGTTTGGCTCTGGAAAAGCCTTGTAGCTGGAGAACCACCTCTAGCAGAGTCGCCATATGTTAGTAGCACAGCAAGTGGCAATATGGTTGAGTTAGATAAGTCTAAGAACATTAATTCAGATTCTTCAGACACTACTACAGACACAAACCCTCAGAATGGTCTCCAGTCTGATCATCAAAAGGGTGGTAATGGCAAGGCAGATAAGCAATCTAAAGTGAAGCAACCTCGAAGAAACCAGTCAGACAATGTATCTAAACCAGCAAGCAACGAAGAAAATTCAGTTGAAGTTGCTGATAATTCTAAAGAATACACTACTGACCATCCAACTCAGTCTTCTATGCCATCGTCATCTTCATCATCAAGCTCTGAATCACAGGAT GGGGCAAAGGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CB675944             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAGTAAACCAAAAGTTCAGCCCTTTTCCCTGCCTAAAAAGCCTGCAAAATCTGCTCATTGCCATCAAAAGACTGCTCCACATGACTTCAATAGTAAGAAGTCTGGTGCCTCAGCGGAATCTGCTGCGAAGAATGGTACTCCTGACTCTGGCAACGGTGGTGGCTATAATCCAAAACATCATAAACCTCATACCTCCCAGTCTCCAAGACCACAAAATTCAATTACTCATCCTCATAGTGGATCTGAGATTTTTCATCATACATTGAGTTCACAAAGAACCAACTCATGCTCACCATCAGCTGGGCATAATGGCGCTCCTACTGCACCACTGCAATCCTGGCCAAGTGCCCCTCCCTATCACAGCCCACCAGTTAATTATCCTGATTTGAATCGGATAAATATTTCTGGATACCCCAGAGGAATTCATGACAACCAAGGTGTGAACATGAACTACCACCCTAACCATTCTGGCTCTCCTCATAATGTTCAGCCTGCTTATAATAGTTACAGACCTCCAACACCACCTAGTATGCCCAGCAACATGCAAAATGCTGGACAATGGGGAGTGAACCCAGGATATCCACAGCCATCTTCTGACCCTCAAGGTCTTATAAGAAATATATTAGGTGCTTTGGAAGTATTGAAGACAGAGAAGATTCCACCAATAGAACAGCATATTTCAGATTGTATACGTTATGGAGAAGCTAACTTACCAAATTTTGATGTTAAGAAGGCTCTTGAACTTGCCATTCAGCATCAAGCCATCGTCTTGAAAATGTTAGGTCCTATGTCATTCTATTTGGGGAAGAA CAAAATCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CB621590             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGTTCACAAAGAACCAACTCATGCTCACCATCAGCTGGGCATAATGGCGCTCCTACTGCACCACTGCAATCCTGGTCAAGTGCCCCTCCCTATCACAGCCCACCAGTTAATTATCCTGATTTGAATCAGATAAATATTTCTGGATACCCCAGAGGAATTCATGACAACCAAGGTGTGAACATGAACTACCACCCTAACCATTCTGGCTCTCCTCATAATGTTCAGCCTGCTTATAATAGTTACAGACCTCCAACACCACCTAGTATGCCCAGCAACATGCAAAATGCTGGACAATGGGGAGTGAACCCAGGATATCCACAGCCATCTTCTGACCCTCAAGGTCTTATAAGAAATATATTAGGTGCTTTGGAAGTATTGAAGACAGAGAAGATTCCACCAATAGAACAGCATATTTCAGATTGTATACGTTATGGAGAAGCTAGCTTACCAAATTTTGATGTTAAGAAGGCTCTTGAACTTGCCATTCAGCATCAAGCCATCGTCTTGAAAATGTTAGGTCCTATGTCATTCTATTTGGGGAAGAACCAAAATCTTTGGAAATGTGTGAATATAATGGATATAAATGCAAAATATCCGAAAGATACGTTTGATGCTGTTCATAGGTTCATATCTTCCACCTCTGGCAGCTCTGCTATAAAGAATTCTAGATCCAAGTATCAAGCTGCAATTGTCTTAAAGAATCAATGCTTGAAACATCTTGCCCTTGGTGAAGTTCTTCAGATTTTGTATATCATAATCAATACAAAGAAGTGGTTTGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AK062060             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTCCTATGTCATTCTATTTGGGGAAGAACCAAAATCTTTGGAAATGTGTGAATATAATGGATATAAATGCAAAATATCCAAAAGATACGTTTGATGCTGTTCATAGGTTCATATCTTCCACCTCTGGCAGCTCTGCTATAAAGAATTCTAGATCCAAGTATCAAGCTGCAATTGCCTTAAAGAATCAATGCTTGAAACATCTTGCCCTTGGTGAAGTTCTTCAGATTTTGTATATCATAATCAATACAAAGAAGTGGTTTGTGCCGCATTCTTCAGGGTGGCAGCCGTTGTCGTTTAACATTATAGTGGTTGATGCCACGACAGGTGCTGGTGGGAAAGCTTAGCCTTGGTACATTTGTCTGCTCATGTCAGATGGATAATTTGAGGCCCTGGTGGTTTCTTCAAATGCTATGCTCTGGTGAAAGTTATTAGTATGATGGTGCATCTACAGTATGCCAAACCTTTCTTCTAAAGATGAAATAGTTACTAGTTTAAGCTTAGTGGTTAGTTGGGAACTTGGGATCAAACTGTCACTGGTTTTTCTTCCAGTACTCCAGGAACAGCATAGGTGGTGGTTAATGGTATGATAAGGATAGTCCAGTGGTTCTTCAATCAGCAAAATGGATACAGAACAACGATCTTTTGTTCAGGCAGTATAATAGTGCCTGATATTGGGAGGTTATGATCTGCTCAAAATATTATTGTCTATTTTGTGGAAATCTGCCATAGTGGCACCAGAATATGCTAACTATTCAAGCTGTTCGGTTCAATGGAGTACCGAAGTTGAAGCCCCTTCGTCTTAACACGAATGGATCGATGAATGAACCATGTGATGTTCAGAGATCCTTTGCTGTCCATTTAATCAATGTGTCTGAGTCTTCG AGTGGATACAAGGCTACCCCTGCTATGGCTTGTGGTACATGTCAATATTGTCAGTAATGCATTAGAGGCTTAGAGCTGCCTTGGTAACCTTGCCAGCGTGCCATGGAACTATAAACTTGCTATGATTTATGTACATATTCGTT                  ]
[-] EMBL CB673901             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCATAATCAATACAAAGAAGTGGTTTGTGCCGCATTCTTCAGGGTGGCAGCCGTTGTCGTTTAACATTATAGTGGTTGATGCCACGACAGGTGCTGGTGGGAAAGCTTAGCCTTGGTACATTTGTCTGCTCATGTCAGATGGATAATTTGAGGCCCTGGTGGTTTCTTCAAATGCTATGCTCTGGTGAAAGTTATTAGTATGATGGTGCATCTACAGTATGCCAAACCTTTCTTTTAAAGATGAAATAGTTACTAGTTTAAGCTTAGTGGTTAGTTGGGAACTTGGGATCAAACTGTCACTGGTTTTTTTTCCAGTACTCCAGGAACAGCATAGGTGGTGGTTAATGGTATGATAAGGATAGTCCAGTGGTTTTTCAATCAGCAAAATGGATACAGAACAACGATCTTTTGTTCAGGCAGTATAATAGTGCCTGATATTGGGAGGTTATGATCTGCTCAAAATATTATTGTCTATTTTGTGGAAATCTGCCATAGTGGCACCAGAATATGCTAACTATTCAAGCTGTTCAGTTCAATGGAGTACCGAAGTTGAAGCCCCTTCGTCTTAACACGAATGGATCGATGAATGAACCATGTGATGTTCAGAGATCCTTTGCTGTCCATTTAATCAATGTGTCTGAGTCTTCG AGTGGATACAAAGCTACCCCTGCTATGGCTTGTGGTACATGTCAATATTGTCAGTAATGCATTAGAGGCTTAGAGCTGCCTTGGTAACCTTGCCAGCGTGCCATGGAACTATAAACTTGCTATGATTTATGTACATATTC                     ]
[-] EMBL CB675521             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCAATACAAAGAAGTGGTTTGTGCCGCATTCTTCAGGGTGGCAGCCGTTGTCGTTTAACATTATAGTGGTTGATGCCACGACAGGTGCTGGTGGGAAAGCTTAGCCTTGGTACATTTGTGTGTTCATGTCAGATGGATAATTTGAGGCCCTGGTGGTTTCTTCAAATGCTATGCTCTGGTGAAAGTTATTAGTATGATGGTGCATCTACAGTATGCCAAACCTTTCTTCTAAAGATGAAATAGTTACTAGTTTAAGCTTAGTGGTTAGTTGGGAACTTGGGATCAAACTGTCACTGGTTTTTCTTCCAGTACTCCAGGAACAGCATAGGTGGTGGTTAATGGTATGATAAGGATAGTCCAGTGGTTCTTCAATCAGCAAAATGGATACAGAACATCGATCTTTTGTTCAGGCAGTATAATAGTGCCTGATATTGGGAGGTTATGATCTGCTCAAAATATTATTGTCTATTTTGTGGAAATCTGCCATAGTGGCACCAGAATATGCTAACTATTCAAGCTGTTCAGTTCAATGGAGTACCGAAGTTGAAGCCCCTTTGTCTTAACACGAATGGATCGATGAATGAACCATGTGATGTTCAGAGATCCTTTGCTGTCCATTTAATCAATGTGTCTGAGTCTTCGTAGTGGATACAAAGCTACCCTTGCTATGGCTTGTGGTACATGTCAATATTGTCAGTAATGCATTAGAGGCTTAGAGCTGCCTTGGTAACCTTGCCAGCGTGCCATGGAACTATAAACTTGTTATGATTTATGTACATATTCGTTTTGTGCTGTTGTGTG   ]
[-] EMBL CB621591             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAATACAAAGAAGTGGTTTGTGCCGGATTCTTCAGGGTGGCAGCCGTTGTCGTTTAACATTATAGTGGTTGATGCCACGACAGGTGCTGGTGGGAAAGCTTAGCCTTGGTACATTTGTCTGTTCATGTCAGATGGATAATTTGAGGCCCTGGTGGTTTCTTCAAATGCTATGCTCTGGTGAAAGTTATTAGTATGATGGTGCATCTACAGTATGCCAAACCTTTCTTCTAAAGATGAAATAGTTACTAGTTTAAGCTTAGTGGTTAGTTGGGAACTTGGGATCAAACTGTCACTGGTTTTTCTTCCAGTACTCCAGGAACAGCATAGGTGGTGGTTAATGGTATGATAAGGATAGTCCAGTGGTTCTTCAATCAGCAAAATGGATACAGAACAACGATCTTTTGTTCAGGCAGTATAATAGTGCCTGATATTGGGAGGTTATGATCTGCTCAAAATATTATTGTCTATTTTGTGGAAATCTGCCATAGTGGCACCAGAATATGCTAACTATTCAAGCTGTTCAGTTCAATGGAGTACCGAAGTTGAAGCCCCTTCGTCTTAACACGAATGGATCGATGAATGAACCATGTGATGTTCAGAGATCCTTTGCTGTCCATTTAATCAATGTGTCTGAGTCTTCG AGTGGATACAAAGCTACCCCTGCTATGGCTTGTGGTACATGTCAATATTGTCAGTAATGCATTAGAGGCTTAGAGCTGCCTTGGTAACCTTGCCAGCGTGCCATGGAACTATAAACTAGGTATGATTTATGTACATATTCGTTTTGTGCaaaaaaaaaagg]
[-] EMBL CB675945             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAGTGGTTGATGCCACGACAGGTGCTGGTGGGAAAGCTTAGCCTTGGTACATTTGTCTGCTCATGTCAGATGGATAATTTGAGGCCCTGGTGGTTTCTTCAAATGCTATGCTCTGGTGAAAGTTATTAGTATGATGGTGCATCTACAGTATGCCAAACCTTTCTTCTAAAGATGAAATAGTTACTAGTTTAAGCTTAGTGGTTAGTTGGGAACTTGGGATCAAACTGTCACTGGTTTTTCTTCCAGTACTCCAGGAACAGCATAGGTGGTGGTTAATGGTATGATAAGGATAGTCCAGTGGTTCTTCAATCAGCAAAATGGATACAGAACAACGATCTTTTGTTCAGGCAGTATAATAGTGCCTGATATTGGGAGGTTATGATCTGCTCAAAATATTATTGTCTATTTTGTGGAAATCTGCCATAGTGGCACCAGAATATGCTAACTATTCAAGCTGTTCAGTTCAATGGAGTACCGAAGTTGAAGCCCCTTCGTCTTAACACGAATGGATCGATGAATGAACCATGTGATGTTCAGAGATCCTTTGCTGTCCATTTAATCAATGTGTCTGAGTCTTCG AGTGGATACAAAGCTACCCCTGCTATGGCTTGTGGTACATGTCAATATTGTCAGTAATGCATTAGAGGCTTAGAGCTGCCTTGGTAACCTTGCCAGCGTGCCATGGAACTATAAACTTGCTATGATTTATGTACATATTC                     ]




>consensus_12554#0
CATATACAAATATCGTCCTTAATTATATTTTTTTATCTAAAAAAAATCAAAAGAATAGCT
TCTCCTCGAGTCCACCTCGACGCCGCCGCCGTCGAAAACCAATAAAAAATCCTCTCCACG
CCCGCAAACCCCAGCCCCCCACTCCCCCCACCTCACCGCCGGCGAACCCTAGGGGGGGAT
CACCGGAGTCGGCGACCGGCGGCGGCGGCGGTGGCGATGGCGGAGTACGCGACGGCGAAG
ACGTCGGTGTGGTGGGACATCGAGAACTGCCAGGTCCCCCGCGCCTGCGACCCCAACCTC
ATCGCCCAGAACATGAGCTCCGCCCTCGCCGCCGCCGGCTACACCGGCCCCGTCTCCATC
TCCGCCTACGGCGACATCGGCCGCATCGGCAACGCCGTCACCCACGCCCTCTCCAGCACC
GGCATCTCCCTCAACCACGTCCCCGCCGGTATTAAAGATGCAAGTGATAAGAAGATCTTA
GTTGACATGCTGTTCTGGGCTATTGACAACCCTCCACCAGCAAACTATTTGTTAATTTCT
GGTGATCGGGATTTCTCTAATGCCCTTCATAAGCTTACAATGAGACGGTACAATATTCTA
CTAGCACAGCCTCCAAATGTGTCTCAGGCCCTTACTGCTGCAGCGAAAAGTGTTTGGCTC
TGGAAAAGCCTTGTAGCTGGAGAACCACCTCTAGCAGAGTCGCCATATGTTAGTAGCACA
GCAAGTGGCAATATGGTTGAGTTAGATAAGTCTAAGAACATTAATTCAGATTCTTCAGAC
ACTACTACAGACACAAACCCTCAGAATGGTCTCCAGTCTGATCATCAAAAGGGTGGTAAT
GGCAAGGCAGATAAGCAATCTAAAGTGAAGCAACCTCGAAGAAACCAGTCAGACAATGTA
TCTAAACCAGCAAGCAACGAAGAAAATTCAGTTGAAGTTGCTGATAATTCTAAAGAATAC
ACTACTGACCATCCAACTCAGTCTTCTATGCCATCGTCATCTTCATCATCAAGCTCTGAA
TCACAGGATGGGGCAAAGGTGAACCAGTCAAGTAAACCAAAAGTTCAGCCCTTTTCCCTG
CCTAAAAAGCCTGCAAAATCTGCTCATTGCCATCAAAAGACTGCTCCACATGACTTCAAT
AGTAAGAAGTCTGGTGCCTCAGCGGAATCTGCTGCGAAGAATGGTACTCCTGACTCTGGC
AACGGTGGTGGCTATAATCCAAAACATCATAAACCTCATACCTCCCAGTCTCCAAGACCA
CAAAATTCAATTACTCATCCTCATAGTGGATCTGAGATTTTTCATCATACATTGAGTTCA
CAAAGAACCAACTCATGCTCACCATCAGCTGGGCATAATGGCGCTCCTACTGCACCACTG
CAATCCTGGCCAAGTGCCCCTCCCTATCACAGCCCACCAGTTAATTATCCTGATTTGAAT
CGGATAAATATTTCTGGATACCCCAGAGGAATTCATGACAACCAAGGTGTGAACATGAAC
TACCACCCTAACCATTCTGGCTCTCCTCATAATGTTCAGCCTGCTTATAATAGTTACAGA
CCTCCAACACCACCTAGTATGCCCAGCAACATGCAAAATGCTGGACAATGGGGAGTGAAC
CCAGGATATCCACAGCCATCTTCTGACCCTCAAGGTCTTATAAGAAATATATTAGGTGCT
TTGGAAGTATTGAAGACAGAGAAGATTCCACCAATAGAACAGCATATTTCAGATTGTATA
CGTTATGGAGAAGCTAACTTACCAAATTTTGATGTTAAGAAGGCTCTTGAACTTGCCATT
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clustalw multiple alignements is not computed in this case