These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_12636#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 2138 fasta sequence [TCGTCAATGGCATATCTACACACTTAGAAATACTGAAAACCCCAAAATGTTGCACCGGGTATTTTTCCGAACCCTTGTCAGGCAACCCAGTGTATCCAACAAGTTTTCTTCGGGCCAGATTGGTGACATGGAAGTTGGGAGTGCTGAAGAACCTCTGTCATTTACATCAACCAGCATATTAAGATCTTTGATGACTGCTATAGAGGAATTGGAGCTTCACGCAATTAGAACTGGCCATTCACACATGTATTTGCATGTATTGAAAGAACAAAAGCTTCTTGATCTTGTTCCAGTTTCAGGGAATACAGTTTTGGATGTTGGTCAAGATGAAGCTACTGCATATTCACTTTTAAAAGAAATGGCTATGAAGATACATGAACTTGTTGGTGCAAGAATGCACCATCTTTCTGTATGCCAATGGGAAGTGAAACTTAAGTTGGACTGCGATGGTCCTGCCAGTGGTACCTGGAGGATTGTAACAACCAATGTTACTAGTCACACTTGCACTGTGGATATCTACCGTGAGATGGAAGATAAAGAATCACGGAAGTTAGTATACCATCCCGCCACTCCGGCGGCTGGTCCTCTGCATGGTGTGGCACTGAATAATCCATATCAGCCTTTGAGTGTCATTGATCTCAAACGCTGTTCTGCTAGGAATAATAGAACTACATACTGCTATGATTTTCCACTGGCATTTGAAACTGCAGTGAGGAAGTCATGGTCCTCTAGTACCTCTGGTGCTTCTAAAGGTGTTGAAAATGCCCAATGTTATGTTAAAGCTACAGAGTTGGTATTTGCGGACAAACATGGGTCATGGGGCACTCCTTT-AGTTCAAATGGACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCACTCCTGAATTTCCTAGTGGTAGGGAGATTATTGTTGTTGCAAATGATATTACGTTCAGAGCTGGATCATTTGGCCCAAGGGAAGATGCATTTTTTGAAGCTGTTACCAACCTAGCCTGTGAGAAGAAACTTCCTCTTATTTATTTGGCAGCAAATTCTGGTGCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGAAGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCATACATTCCTGAGAACTCGTGTGATCCTCGAGCGGCTATCCGTGGTGTTGATGACAGCCAAGGGAAATGGTTAGGT-GGTATGTTTGATAAAGACAGCTTTGTGGAAACATTTGAAGGTTGGGCTAAGACAGTGGTTACTGGCAGAGCAAAGCTTGGTGGAATTCCAGTGGGTGTGATAGCTGTGGAGACTCAGACCATGATGCAAACTATCCCTGCTGACCCTGGTCAGCTTGATTCCCGTGAGCAATCTGTTCCTCGTGCTGGACAAGTGTGGTTTCCAGATTCTGCAACCAAGACTGCGCAGGCATTGCTGGACTTCAACCGTGAAGGATTACCTCTGTTCATCCTCGCTAACTGGAGAGGCTTCTCTGGTGGACAAAGAGATCTTTTTGAAGGAATTCTTCAGGCTGGCTCGACTATTGTTGAGAACCTTANGACATACAATCAGCCTGCCTTTGTCTACATTCCCATGG] [+] EMBL CB629344 [TCGTCAATGGCATATCTACACACTTAGAAATACTGAAAACCCCAAAATGTTGCACCGGGTATTTTTCCGAACCCTTGTCAGGCAACCCAGTGTATCCAACAAGTTTTCTTCGGGCCAGATTGGTGACATGGAAGTTGGGAGTGCTGAAGAACCTCTGTCATTTACATCAACCAGCATATTAAGATCTTTGATGACTGCTATAGAGGAATTGGAGCTTCACGCAATTAGAACTGGCCATTCACACATGTATTTGCATGTATTGAAAGAACAAAAGCTTCTTGATCTTGTTCCAGTTTCAGGGAATACAGTTTTGGATGTTGGTCAAGATGAAGCTACTGCATATTCACTTTTAAAAGAAATGGCTATGAAGATACATGAACTTGTTGGTGCAAGAATGCACCATCTTTCTGTATGCCAATGGGAAGTGAAACTTAAGTTGGACTGCGATGGTCCTGCCAGTGGTACCTGGAGGATTGTAACAACCAATGTTACTAGTCACACTTGCACTGTGGATATCTACCGTGAGATGGAAGATAAAGAATCACGGAAGTTAGTATACCATCCCGCCACTCCGGCGGCTGGTCCTCTGCATGGTGTGGCACTGAATAATCCATATCAGCCTTTGAGTGTCATTGATCTCAAACGCTGTTCTGCTAGGAATAATAGAACTACATACTGCTATGATTTTCCACTGGCATTTGAAACTGCAGTGAGGAAGTCATGGTCCTCTAGTACCTCTGGTGCTTCTANAGGTGTTGAAAATGCCCAATGTTATGTTAAAGCTACAGAGTTGGTATTTGCGGACA ] [+] EMBL CB677579 [ ACCGGGTATTTTTCCGAACCCTTGTCAGGCAACCCAGTGTATCCAACAAGTTTTCTTCGGGCCAGATTGGTGACATGGAAGTTGGGAGTGCTGAAGAACCTCTGTCATTTACATCAACCAGCATATTAAGATCTTTGATGACTGCTATAGAGGAATTGGAGCTTCACGCAATTAGAACTGGCCATTCACACATGTATTTGCATGTATTGAAAGAACAAAAGCTTCTTGATCTTGTTCCAGTTTCAGGGAATACAGTTTTGGATGTTGGTCAAGATGAAGCTACTGCATATTCACTTTTAAAAGAAATGGCTATGAAGATACATGAACTTGTTGGTGCAAGAATGCACCATCTTTCTGTATGCCAATGGGAAGTGAAACTTAAGTTGGACTGCGATGGTCCTGCCAGTGGTACCTGGAGGATTGTAACAACCAATGTTACTAGTCACACTTGCACTGTGGATATCTACCGTGAGATGGAAGATAAAGAATCACGGAAGTTAGTATACCATCCCGCCACTCCGGCGGCTGGTCCTCTGCATGGTGTGGCACTGAATAATCCATATCAGCCTTTGAGTGTCATTGATCTCAAACGCTGTTCTGCTAGGAATAATAGAACTACATACTGCTATGATTTTCCACTGGCATTTGAAACTGCAGTGAGGAAGTCATGGTCCTCTAGTACCTCTGGTGCTTCTAAAGGTGTTGAAAATGCCCAATGTTATGTTAAAGCTACAGAGTTGGTATTTGCGGACAAACATGGGTCATGGGGCACTCCTTTNAGTTC AATGGA ] [+] EMBL CF307235 [ TCCTGCCAGTGGTACCTGGAGGATTGTAACAACCAATGTTACTAGTCACACTTGCACTGTGGATATCTACCGTGAGATGGAAGATAAAGAATCACGGAAGTTAGTATACCATCCCGCCACTCCGGCGGCTGGTCCTCTGCATGGTGTGGCACTGAATAATCCATATCAGCCTTTGAGTGTCATTGATCTCAAACGCTGTTCTGCTAGGAATAATAGAACTACATACTGCTATGATTTTCCACTGGCATTTGAAACTGCAGTGAGGAAGTCATGGTCCTCTAGTACCTCTGGTGCTTCTAAAGGTGTTGAAAATGCCCAATGTTATGTTAAAGCTACAGAGTTGGTATTTGCGGACAAACATGGGTCATGGGGCACTCCTTT AGTTCAAATGGACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCACTCCTGAATTTCCTAGTGGTAGGGAGATTATTGTTGTTGCAAATGATATTACGTTCAGAGCTGGATCATTTGGCCCAAGGGAAGATGCATTTTTTGAAGCTGTTACCAACCTAGCCTGTGAGAAGAAACTTCCTCTTATTTATTTGGCAGCAAATTCTGGTGCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGgt ] [+] EMBL CB680290 [ AATGTTCCTAGTCACACTTGCACTGTGGATATCTACCGTGAGATGGAAGATAAAGAATCACGGAAGTTAGTATACCATCCCGCCACTCCGGCGGCTGGTCCTCTGCATGGTGTGGCACTGAATAATCCATATCAGCCTTTGAGTGTCATTGATCTCAAACGCTGTTCTGCTAGGAATAATAGAACTACATACTGCTATGATTTTCCACTGGCATTTGAAACTGCAGTGAGGAAGTCATGGTCCTCTAGTACCTCTGGTGCTTCTAAAGGTGTTGAAAATGCCCAATGTTATGTTAAAGCTACAGAGTTGGTATTTGCGGACAAACATGGGTCATGGGGCACTCCTTT AGTTCAAATGGACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCACTCCTGAATTTCCTAGTGGTAGGGAGATTATTGTTGTTGCAAATGATATTACGTTCAGAGCTGGATCATTTGGCCCAAGGGAAGATGCATTTTTTGAAGCTGTTACCAACCTAGCCTGTGAGAAGAAACTTCCTCTTATTTATTTGGCAGCAAATTCTGGTGCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTANGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGTCA ] [+] EMBL CB634341 [ AAATGGACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCACTCCTGAATTTCCTAGTGGTAGGGAGATTATTGTTGTTGCAAATGATATTACGTTCAGAGCTGGATCATTTGGCCCAAGGGAAGATGCATTTTTTGAAGCTGTTACCAACCTAGCCTGTGAGAAGAAACTTCCTCTTATTTATTTGGCAGCAAATTCTGGTGCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGAAGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACAC ] [-] EMBL CB965535 [ ACCGGCCTGCTGGGCTCAATGACATTGGTATGGTAGCTTGGACCTTGAAGATGTCCACTCCTGAATTTCCTAGTGGTAGGGAGATTATTGTTGTTGCAAATGATATTACGTTCAGAGCTGGATCATTTGGCCCAAGGGAAGATGCATTTTTTGAAGCTGTTACCAACCTAGCCTGTGAGAAGAAACTTCCTCTTATTTATTTGGCAGCAAATTCTGGTGCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGAAGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCG ] [+] EMBL CB642141 [ GCTCGAATTGGCATAGCAGATGAAGTGAAATCTTGCTTCCGTGTTGGGTGGTCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGAAGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCATACATTCCTGAGAACTCGTGTGATCCTCGAGCGGCTATCCGTGGTGTTGATGACAGCCAAGGGAAATGGTTAGGT GGTATGTTTGATAAAGACAGCTTTGTGGAAACATTTGAAGGTTGGGCTAAGACAGTGGTTACTGGCAGAGCAAAGCTTGGTGGAATTCCAGTGGGTGTGATAGCTGTGGAGACTCAGACCATGATGCAAACTATCCC ] [+] EMBL CF325419 [ TCTGATGATGGCAGCCCTGAACGTGGGTTTCAGTACATTTATCTAAGCGAAGAAGACTATGCTCGTATTGGCACTTCTGTCATAGCACATAAGATGCAGCTAGACAGTGGTGAAATTAGGTGGGTTATTGATTCTGTTGTGGGCAAGGAAGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCA ] [+] EMBL AU225620 [ gccgctGATGGACTTGGTGTGGAGAATATACATGGAAGTGCTGCTATTGCCAGTGCTTATTCTAGGGCATATAAGGAGACATTTACACTTACATTTGTGACTGGAAGAACTGTTGGAATAGGAGCTTATCTTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTAGTCCATCTTACTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACA TGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACC GACAGACCTG TGCATACATTCCTGAGAACTCGTG ] [+] EMBL CF303813 [ TTGCTCGACTTGGCATCCGGTGCATACAGCGTCTTGACCAGCCTATTATTCTTACAGGCTATTCTGCACTGAACAAGCTTCTTGGGCGGGAAGTGTACAGCTCCCACATGCAGTTGGGTGGTCCCAAAATCATGGCAACTAATGGTGTTGTCCATTTTATTGTTTCAGATGACCTTGAAGGCGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCATACATTCCTGAGAACTCGTGTGATCCTCGAGCGGCTATCCGTGGTGTTGATGACAGCCAAGGGAAATGGTTAGGTNGGTATGTTTGATAAAGACAGCTTTGTGGAAACATTTGAAGGTTGGGCTAAGACAGTGGTTACTGGCAGAGCAAAGCTTGGTGGAATTCCAGTGGGTGTGATAGCTGTGGAGACTCAGACCATGATGCAAACTATCCCTGCTGACCCTGGTCAGCTTGATTCCCGTGAGCAATCTGTTCCTCGTGCTGG ] [+] EMBL CF304729 [ CGTTTCTAATATATTGAGGTGGCTCAGTTATGTTCCTGCCTACATTGGTGGACCACTTCCAGTAACAACACCGTTGGACCCACCGGACAGACCTGTTGCATACATTCCTGAGAACTCGTGTGATCCTCGAGCGGCTATCCGTGGTGTTGATGACAGCCAAGGGAAATGGTTAGGT GGTATGTTTGATAAAGACAGCTTTGTGGAAACATTTGAAGGTTGGGCTAAGACAGTGGTTACTGGCAGAGCAAAGCTTGGTGGAATTCCAGTGGGTGTGATAGCTGTGGAGACTCAGACCATGATGCAAACTATCCCTGCTGACCCTGGTCAGCTTGATTCCCGTGAGCAATCTGTTCCTCGTGCTGGACAAGTGTGGTTTCCAGATTCTGCAACCAAGACTGCGCAGGCATTGCTGGACTTCAACCGTGAAGGATTACCTCTGTTCATCCTCGCTAACTGGAGAGGCTTCTCTGGTGGACAAAGAGATCTTTTTGAAGGAATTCTTCAGGCTGGCTCGACTATTGTTGAGAACCTTANGACATACAATCAGCCTGCCTTTGTCTACATTCCCATGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||