cluster # 12688

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Oryza sativa
cluster # 12688 cluster # 12688 Sequences # 11 consensus # 1
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consensus_12688#0 length = 1543 sequences # 11
consensusID : consensus_12688#0
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Sequences nbr = 11
consensus length = 1543
fasta sequence
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[+] EMBL AK104353             [                                           TCCTTCTTCCCTAATCCCCCTCGCCGGCGAAGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCTTCTTCCCTAATCCCCTCGCCAGCGGGGAGCCGCAGGGCGGCGGAGGCGTGCGTCGGCTGCTGCTGCTGCGCGGGCGGGGGAGGT GGGGAGAGATGCACAGATCCGCGGGCGCCACGATGGCGTGGAACGTGTTCAGGTTCTGCACTGCGCTGAGGGGGCTGGGCTCCATCATGATCCTGCTCGTCCTCTCCATCGTCGGGGTCACCTACTACGCGGTCGTGGTGTACAACTACGGCCCCGCGCTCTTCGCCGGCGGCGCCAGCACCCTCCTCGCGCTCGTCGTCCTGCTCCTCTTCCACTTCCTGCTTGTTATGCTTTTATGGAGCTACTTTTCTGTTGTATTCACCGACCCTGGTTCTGTTCCACCAAATTGGAATCTCGACTTTGATGAGGAGAGGGGAGAAACTGCCCCCCTTTCTGGCTTAGATTTCAATAGCCAGGTAAACTCGCAACAATCTATCGCTCACAATGACACAGGACATCCAAGGGCTAGGTATTGTAGGAAGTGCAACCAGATGAAGCCACCTCGATGCCATCATTGCTCTGTTTGTGGAAGATGTGTTCTTAAGATGGATCATCATTGTGTATGGGTTGTTAATTGTGTTGGGGCACTAAACTACAAATACTTTCTTCTCTTCCTGTTTTACACCTTCCTTGAGACAACACTGGTTACCCTTTCTCTATTGCCTCACTTCATAGCCTTCTTTAGTGATATTGATATCCCAGGAAGTCCTGCAGCACTTGCAACCACTTTCCTCACCTTTGTGTTGAACCTGGCCTTTTCCTTGAGTGTTCT GGTTTTATGATTATGCATGTTTCACTTGTTTCTGCTAATACAACAACAATTGAGGCATATGAAAAGAAAACTACGCCACGCTGGATGTATGATATTGGCCGGAAGAGG AATTTCATTCAGGTTTTTGGAAATGACAAGAGGTATTGGTTCAT CCCTGCGTACTCAGAAGAGGATTTGAGAAGAATGCCAGTTCTACAGGGCCTTGATTACCCTGTCAGGACAGATTTGGATGGGCAAGAATTGTGATGGGACAATTTCG CCTGTGCCCTCACTT  CCCATATGCACCAAATATG TTCCATGTAAATTTTACGGTTTCCTTCCGATATCGTAGAGTTAAATATTTTTAAAGGTACACCTTAGTACTGACAGCATTGCTGGTTGGGTACTACATGGCCTCCGAAGAGAGTGTTCCCAGAATTACTTTTCAAACCCTGTGTAATTCA CTTGTGCTGTCTGATTGGGCAAAGAACGTAGAGGTCTTGCTATTGTGGCTAAAAGAGGCATGTGATGTAAATTCTTTTTAGTGTGTTTCAGATGGGTTTCCAGATGTATGATGTACAATGATTTGAGCTGTGCAATAGACGTACAGTTATTAGAGCATGACATGTTGATAAGATAACCTGTGTTAATTAGAGAACTGGATG     ]
[+] EMBL CB655947             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTACGCGGTCGTGGTGTACAACTACGGCCCCGCGCTCTTCGCCGGCGGCGCCAGCACCCTCCTCGCGCTCGTCGTCCTGCTCCTCTTCCACTTCCTGCTTGTTATGCTTTTATGGAGCTACTTTTCTGTTGTATTCACCGACCCTGGTTCTGTTCCACCAAATTGGAATCTCGACTTTGATGAGGAGAGGGGAGAAACTGCCCCCCTTTCTGGCTTAGATTTCAATAGCCAGGTAAACTCGCAACAATCTATCGCTCACAATGACACAGGACATCCAAGGGCTAGGTATTGTAGGAAGTGCAACCAGATGAAGCCACCTCGATGCCATCATTGCTCTGTTTGTGGAAGATGTGTTCTTAAGATGGATCATCATTGTGTATGGGTTGTTAATTGTGTTGGGGCACTAAACTACAAATACTTTCTTCTCTTCCTGTTTTACACCTTCCTTGAGACAACACTGGTTACCCTTTCTCTATTGCCTCACTTCATAGCCTTCTTTAGTGATATTGATATCCCAGGAAGTCCTGCAGCACTTGCAACCACTTTCCTCACCTTTGTGTTGAACCTGGCCTTTTCCTTGAGTGTTCTGGGTTTTATGATTATGCATGTTTCACTTGTTTCTGCTAATACAACAACAATTGAGGCATATGAAAAGAAAACTACGCCACGCTGGATGTATGATATTGGCCGGAAGAGG AATTTCATTCAGGTTTTTGGAAATGACAAGAGGTATTGGTTCAT CCCTGCGTACTCAGAAGAGGATTTGAGAAGAATGCCAGTTCTACAGGGCCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CA998228             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AACCAGATGAAGCCACCTCGATGCCATCATTGCTCTGTTTGTGGAAGATGTGTTCTTAAGATGGATCATCATTGTGTATGGGTTGTTAATTGTGTTGGGGCACTAAACTACAAATACTTTCTTCTCTTCCTGTTTTACACCTTCCTTGAGACAACACTGGTTACCCTTTCTCTATTGCCTCACTTCATAGCCTTCTTTAGTGATATTGATATCCCAGGAAGTCCTGCAGCACTTGCAACCACTTTCCTCACCTTTGTGTTGAACCTGGCCTTTTCCTTGAGTGTTCTGGGTTTTATGATTATGCATGTTTCACTTGTTTCTGCTAATACAACAACAATTGACGCATATGAAAAGAAAACTACGCCACGCTGGATGTATGATATTGGCCGGAAGAGG AATTTCATTCAGGTTTTTGGAAATGACAAGAGGTATTGGTTCAT C                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CB000039             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATGTGTTCTTAAGATGGATCATCATTGTGTATGGGTTGTTAATTGTGTTGGGGCACTAAACTACAAATACTTTCTTCTCTTCCTGTTTTACACCTTCCTTGAGACAACACTGGTTACCCTTTCTCTATTGCCTCACTTCATAGCCTTCTTTAGTGATATTGATATCCCAGGAAGTCCTGCATCACTTGCAACCACTTTCCTCACCTTTGTGTTGAACCTGGACTTTTCCTTGAGTGTTCTGGGTTTTATGATTATGAATGTTTCACTTGTTTCTGCTAATACTTTAACAATTGAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CB655948             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGTATGGGTGTTTAATTGTGTTGGGGCACTAAACTACAAATACTTTCTTCTCTTCCTGTTTTACACCTTCCTTGAGACAACACTGGTTACCCTTTCTCTATTGCCTCACTTCATAGCCTTCTTTAGTGATATTGATATCCCAGGAAGTCCTGCAGCACTTGCAACCACTTTCCTCACCTTTGTGTTGAACCTGGCCTTTTCCTTGAGTGTTCTGGGTTTTATGATTATGCATGTTTCACTTGTTTCTGCTAATACAACAACAATTGAGGCATATGAAAAGAAAACTACGCCACGCTGGATGTATGATATTGGCCGGAAGAGG AATTTCATTCAGGTTTTTGGAAATGACAAGAGGTATTGGTTCAT CCCTGCGTACTCAGAAGAGGATTTGAGAAGAATGCCAGTTCTACAGGGCCTTGATTACCCTGTCAGGACAGATTTGGATGGGCAAGAATTGTGATGGGACAATTTCG CCTGTGCCCTCACTT  CCCATATGCACCAAATATG TTCCATGTAAATTTTACGGTTTCCTTCCGATATCGTAGAGTTAAATATTTTTAAAGGTACACCTTAGTACTGACAGCATTGCTGGTTGGGTACTACATGGCCTCCGAAGAGAGTGTTCCCAGAATTACTTTTCAAACCCTGTGTAATTCA CTTGTGCTGTCTGATTGGGCAAAGAACGTAGAGGTCTTGCTATTGTGGCTAAAAGAGGCATGTGATGTAAATTCTTTTTAGTGTGTTTCAGATGGGTTTCCAGATGTATGATGTACAATGATTGGAGCTGTGCAATAGACGTACAGTTATTAGAG                                                   ]
[-] EMBL CF332104             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGGCCGGAAGAGG AATTTCATTCAGGTTTTTGGAAATGACAAGAGGTATTGGTTCATCCCCTGCGTACTCAGAAGAGGATTTGAGAAGAATGCCAGTTCTACAGGGCCTTTATTACCCTGTCAGGACAGATTTGGATGGGCAAGAATTGTGATGGGACAATTTCGNCCTGTGCCCTCACTTCCCCCATATACACCAAATATGNTTCCATGTAAATTTTACGGTTTCCTTCCGATATCGTAGAGTTAAATATTTTTAAAGGTACACCTTAGTACTGACAGCATTGCTGGTTGGGTACTACATGGCCTCCGAAGAGAGTGTTCCCAGAATTACTTTTCAAACCCTGTGTAATTCA CTTGTGCTGTCTGATTGGGCAAAGAACGTAGAGGTCTTGCTATTGTGGCTAAAAGAGGCATGTGATGTAAATTCTTTTTAGTGTGTTTCAGATGGGTTTCCAGATGTATGATGTACAATGATTTGAGCTGTGCAATAGACGTACAGTTATTAGAGCAaaaaaa                                           ]
[+] EMBL BM039027             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGGAAATTTCATTCAGGTTTTTGGAAATGACAAGAGGTATTGGTTCAT CCCTGCGTACTCAGAAGAGGATTTGAGAAGAATGCCAGTTCTACA GGCCTTGATTACCCTGTCAGGACAGATTTGGATGGGCAAGAATTGTGATGGGAC ATTTCG CCTGTGCCCTCACTT  CCCATATGCACC AATATG TTCCATGTAAATTTTACGGTTTCCTTCCGATATCGTAGAGTTAAATATTTTTAAAGGTACACCTTAGTACTGACAGCATTGCTGGTTGGGTACTACATGACCTCCGAAGAGAGTGTTCCCAGAATTACTTTTC AACCCTGTGTAATTCACCTTGTGCTGTCTGATTGGGC AAGAACGTAGAGGTCTTGCTATTGTGGCTAAAAGAGGCATGTGATGTAAATTCTTTTTAGTGTGTTTCAGATGGGTTTCCAGATGTATGATGTACCATGATTTGAGCTGTGC ATAGACGTAC GTTATTAGAGCNTGACATGTTGATAAaaa                                ]




>consensus_12688#0
ACCTCTAACCTTTGCCATTCCCCTGTCTTCTTCCATCTCCAAATCCTTCTTCCCTAATCC
CCCTCGCCGGCGAAGCGCGGCGGCGGCGGCGGCGCCTTCTTCCCTAATCCCCTCGCCAGC
GGGGAGCCGCAGGGCGGCGGAGGCGTGCGTCGGCTGCTGCTGCTGCGCGGGCGGGGGAGG
TGGGGAGAGATGCACAGATCCGCGGGCGCCACGATGGCGTGGAACGTGTTCAGGTTCTGC
ACTGCGCTGAGGGGGCTGGGCTCCATCATGATCCTGCTCGTCCTCTCCATCGTCGGGGTC
ACCTACTACGCGGTCGTGGTGTACAACTACGGCCCCGCGCTCTTCGCCGGCGGCGCCAGC
ACCCTCCTCGCGCTCGTCGTCCTGCTCCTCTTCCACTTCCTGCTTGTTATGCTTTTATGG
AGCTACTTTTCTGTTGTATTCACCGACCCTGGTTCTGTTCCACCAAATTGGAATCTCGAC
TTTGATGAGGAGAGGGGAGAAACTGCCCCCCTTTCTGGCTTAGATTTCAATAGCCAGGTA
AACTCGCAACAATCTATCGCTCACAATGACACAGGACATCCAAGGGCTAGGTATTGTAGG
AAGTGCAACCAGATGAAGCCACCTCGATGCCATCATTGCTCTGTTTGTGGAAGATGTGTT
CTTAAGATGGATCATCATTGTGTATGGGTTGTTAATTGTGTTGGGGCACTAAACTACAAA
TACTTTCTTCTCTTCCTGTTTTACACCTTCCTTGAGACAACACTGGTTACCCTTTCTCTA
TTGCCTCACTTCATAGCCTTCTTTAGTGATATTGATATCCCAGGAAGTCCTGCAGCACTT
GCAACCACTTTCCTCACCTTTGTGTTGAACCTGGCCTTTTCCTTGAGTGTTCTGGGTTTT
ATGATTATGCATGTTTCACTTGTTTCTGCTAATACAACAACAATTGAGGCATATGAAAAG
AAAACTACGCCACGCTGGATGTATGATATTGGCCGGAAGAGGAATTTCATTCAGGTTTTT
GGAAATGACAAGAGGTATTGGTTCATCCCTGCGTACTCAGAAGAGGATTTGAGAAGAATG
CCAGTTCTACAGGGCCTTGATTACCCTGTCAGGACAGATTTGGATGGGCAAGAATTGTGA
TGGGACAATTTCGCCTGTGCCCTCACTTCCCATATGCACCAAATATGTTCCATGTAAATT
TTACGGTTTCCTTCCGATATCGTAGAGTTAAATATTTTTAAAGGTACACCTTAGTACTGA
CAGCATTGCTGGTTGGGTACTACATGGCCTCCGAAGAGAGTGTTCCCAGAATTACTTTTC
AAACCCTGTGTAATTCACTTGTGCTGTCTGATTGGGCAAAGAACGTAGAGGTCTTGCTAT
TGTGGCTAAAAGAGGCATGTGATGTAAATTCTTTTTAGTGTGTTTCAGATGGGTTTCCAG
ATGTATGATGTACAATGATTTGAGCTGTGCAATAGACGTACAGTTATTAGAGCATGACAT
GTTGATAAGATAACCTGTGTTAATTAGAGAACTGGATGTTTAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case