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Oryza sativa
cluster # 12760 cluster # 12760       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_12760#0 length = 1314 sequences # 11  

consensusID : consensus_12760#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1314
fasta sequence
                              [CGGCAACTCAGATCAGCAGGGGTTGGATGGTCAACTTTCCCCACCTCCTCTCCTCCCAACTTTCCCCTTTGCTACAGTAGCTCCTTCTTCTTCTCCAGCCCCTCTTCCCCCCAAATTCCGGTGGTTCGCCGCCGATGATGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCCGAACTCATTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCC-TTGGATCTCCAGGTGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGCGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGCCTTGAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAGCGACAACCTTGGCAGCCCAAGTGTTGCTGCTCTGTGTGGTAGTCTTCAAACTCCAGGTGCTGTTGCTTCTTGTGATAGCCTTGGAGCTCTTCGTACTACTGCTCCGTGCGCTGGTG-ATACCTTGAGCTGCTGCTTTTCTGCAACGGTGAAAACATTG-GTGTGGGTGTGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTTCGTTGGGAGCTTGCTCCTTTTCATTTGTTGTGGTCCGCTTCAGTTCTACAATCCTGCAGCAATCCTCGGCCTTCTACAAAGACAGAAGTTTTAT--CAACCATATGATTTCTC--GTCATGTGGACTACCTGTTCTACCGAATCTTGCTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATACCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCTCTACCTTGTTAAAAATGGTTTCTTGGCTTAAGTTGTATCTTTATGTGATGTATTGGGGTATATCCCCTAAATTCTGTCTTTTTGAATAAAGTTGTTCATGTTATCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGGCGT]

[+] EMBL CF329496             [CGGCAACTCAGATCAGCAGGGGTTGGATGGTCAACTTTCCCCACCTCCTCTCCTCCCAACTTTCCCCTTTGCTACAGTAGCTCCTTCTTCTTCTCCAGCCCCTCTTCCCCCCAAATTCCGGTGGTTCGCCGCCGATGATGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCCGAACTCATTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCC TTGGATCTCCAGGTGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGCGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGCCTTGAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAGCGACAACCTTGGCAGCCCAAGTGTTGTTGCTCTGTGTGGTAGTCTTCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL OSC24652             [                       TGGATGGTCAACTTTCCCCACCTCCTCTCCTCCCAACTTTCCCCTTTGCTACAGTAGCTCCTTCTTCTTCTCCAGCCCCTCTTCCCCCCAAATTCCGGTGGTTCGCCGCCGATGATGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTAATGCTGGTGCCGANCTAATNGGTCTCCGCn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL C26024               [                                                                CCCTTTGCTACAGTAGCTCCTTCTTCTTCTCCAGCCCCTCTTCCCCCCAAATTCCGGTGGTTCGCCGCCGATGATGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCCGAACTCATTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCCTTTGGATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL C26248               [                                                                                                                                                        GTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCCGAACTCATTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCC TTGGATCTCCAGGTGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGCGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGCCTTTAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CF311933             [                                                                                                                                                                                                                                                              AAGAGCCCTGGTTGCTGGTGGTGATGATTGCCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCTGAACTCGTTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCC TTGGATCTCTGGATGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGTGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGTCTTGAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAGCGACAACCTTGGCAGCCCAAGTGTTGCTGCTCTGTGTGGTAGTCTTCAAACTCCAGGTGCTGTTGCTTCTTGTGATAGCCTTGGAGCTCTTCGTACTACTGCTCCGTGCGCTGGTG ATACCTTGAGCTGCTGCTTTTCTGCAACGGTGAAAACATTGTGTG GGGTGTGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTTCGTTGGGAGCTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CF329809             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCGTGTGCAGACCGCGGTTGCC TTGGATCTCTGGATGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGTGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGTCTTGAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAGCGACAACCTTGGCAGCCCAAGTGTTGCTGCTCTGTGTGGTAGTCTTCAAACTCCAGGTGCTGTTGCTTCTTGTGATAGCCTTGGAGCTCTACGTACTACTGCTCCGTGCGCTGGTG ATACCTTGAGCTGCTGCTTTTCTGCAACGGTGAAAACATT  GTGTGGGTGTGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTTCGTTGGGAGCTTGCTCCTTTTCATTTGTTGTGGTCCGCTTCAGTTCTACAATCCTGCAGCAATCCTCGGCCTTCTACAAAGACTGAAGTTTTATCGCAACCATCTGATTTCTCATGTCATGTGGACTACCTGTTCTCCTGAATCTTGCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL OSC24231             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTGTTGCTTCTTGTGATAGCCTTGGAGCTCTTCGTACTACTGCTCCGTGCGCCGGTG ATATCTTGAGCTGCTGCTTTTCTACAACGGTGAAAACATT  GTGTGGGTATGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTTCGTTGGGAGCTTGCTCCTTTTCATTTGTTGTGGTCCGCTTCAGTTCTACAATCCTGCAGCAATCCTCGGCCTTCTACAAAGACAGAAGTTTTAT  CAACCATATGATTTCTC  GTCATGTGGACTACCTGTTCTACCGAATCTTGCTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AU078286             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTACTGNTCCGTGCGCCGGTGAATATCTTGAGCTGCTGCTTTTCTACAACGGTGAAAACATTG GTGTGGGTATGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTNCGTTGGGAGCTTNCTCCTTTTCATTTGTTGTGNTCCGCTTCAGTTCTACAATCCTGCAGCAATCCTCGGCCTTCTACAAAGACAGAAGTTTTAT  CAACCATATGATTTCTC  GTCATGTGGACTACCTGTTCTACCGAATCTTGCTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATNCCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCTCTACCTTGTTAAAAATGGTTTCTTGGCTTAAGTTGTATCTTTATGTGATGTATTGGGGTATATCCCCTAAATTCTGTCTTTTTGAATAAAGTTGTTCATGTTATCTTCAAAAA                                 ]
[-] EMBL CF329497             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GTTTTAT  CAACCATATGATTTCTC  GTCATGTGGACTACCTGTTCTACCGAATCTTGCTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATACCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCTCTACCTTGTTAAAAATGGTTTCTTGGCTTAAGTTGTATCTTTATGTGATGTATTGGGGTATATCCCCTAAATTCTGTCTTTTTGAATAAAGTTGTTCATGTTATCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGGCGT]
[+] EMBL C97952               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATACCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCTCTACCTTGTTAAAAATGGTTTCTTGGCTTAAGTTGTATCTTTATGTGATGTATTGGGGTATATCCCCTAAATTCTGTCTTTTTGAATAAAGTTGTTCATGTTATNTTCAAA                                   ]
[+] EMBL OS0186A              [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATACCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCT                                                                                                                                                  ]


>consensus_12760#0 CGGCAACTCAGATCAGCAGGGGTTGGATGGTCAACTTTCCCCACCTCCTCTCCTCCCAAC TTTCCCCTTTGCTACAGTAGCTCCTTCTTCTTCTCCAGCCCCTCTTCCCCCCAAATTCCG GTGGTTCGCCGCCGATGATGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGT GTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTG GTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGC GACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCCGAACTCATTGGTCTGCGCCGTGT GCAGACGGCGGTTGCCTTGGATCTCCAGGTGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGCGGCGGC CCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGCCTTGAAATTTCTGGCGAT GTTGCTCCGAGCGACAACCTTGGCAGCCCAAGTGTTGCTGCTCTGTGTGGTAGTCTTCAA ACTCCAGGTGCTGTTGCTTCTTGTGATAGCCTTGGAGCTCTTCGTACTACTGCTCCGTGC GCTGGTGATACCTTGAGCTGCTGCTTTTCTGCAACGGTGAAAACATTGGTGTGGGTGTGG CATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTTCGTTGGGAGCTTGCTCCTTTTCATTTG TTGTGGTCCGCTTCAGTTCTACAATCCTGCAGCAATCCTCGGCCTTCTACAAAGACAGAA GTTTTATCAACCATATGATTTCTCGTCATGTGGACTACCTGTTCTACCGAATCTTGCTTC CTTTTGCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTG CTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATACCTACA CCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGT AGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGT CGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGA AAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCTCTACCTTGTTAAAAATGGTTTCTTGGCTTAAG TTGTATCTTTATGTGATGTATTGGGGTATATCCCCTAAATTCTGTCTTTTTGAATAAAGT TGTTCATGTTATCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGGCGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)