|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_12760#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1314 fasta sequence
[CGGCAACTCAGATCAGCAGGGGTTGGATGGTCAACTTTCCCCACCTCCTCTCCTCCCAACTTTCCCCTTTGCTACAGTAGCTCCTTCTTCTTCTCCAGCCCCTCTTCCCCCCAAATTCCGGTGGTTCGCCGCCGATGATGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCCGAACTCATTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCC-TTGGATCTCCAGGTGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGCGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGCCTTGAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAGCGACAACCTTGGCAGCCCAAGTGTTGCTGCTCTGTGTGGTAGTCTTCAAACTCCAGGTGCTGTTGCTTCTTGTGATAGCCTTGGAGCTCTTCGTACTACTGCTCCGTGCGCTGGTG-ATACCTTGAGCTGCTGCTTTTCTGCAACGGTGAAAACATTG-GTGTGGGTGTGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTTCGTTGGGAGCTTGCTCCTTTTCATTTGTTGTGGTCCGCTTCAGTTCTACAATCCTGCAGCAATCCTCGGCCTTCTACAAAGACAGAAGTTTTAT--CAACCATATGATTTCTC--GTCATGTGGACTACCTGTTCTACCGAATCTTGCTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATACCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCTCTACCTTGTTAAAAATGGTTTCTTGGCTTAAGTTGTATCTTTATGTGATGTATTGGGGTATATCCCCTAAATTCTGTCTTTTTGAATAAAGTTGTTCATGTTATCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGGCGT]
[+] EMBL CF329496 [CGGCAACTCAGATCAGCAGGGGTTGGATGGTCAACTTTCCCCACCTCCTCTCCTCCCAACTTTCCCCTTTGCTACAGTAGCTCCTTCTTCTTCTCCAGCCCCTCTTCCCCCCAAATTCCGGTGGTTCGCCGCCGATGATGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCCGAACTCATTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCC TTGGATCTCCAGGTGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGCGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGCCTTGAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAGCGACAACCTTGGCAGCCCAAGTGTTGTTGCTCTGTGTGGTAGTCTTCAA ]
[+] EMBL OSC24652 [ TGGATGGTCAACTTTCCCCACCTCCTCTCCTCCCAACTTTCCCCTTTGCTACAGTAGCTCCTTCTTCTTCTCCAGCCCCTCTTCCCCCCAAATTCCGGTGGTTCGCCGCCGATGATGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTAATGCTGGTGCCGANCTAATNGGTCTCCGCn ]
[+] EMBL C26024 [ CCCTTTGCTACAGTAGCTCCTTCTTCTTCTCCAGCCCCTCTTCCCCCCAAATTCCGGTGGTTCGCCGCCGATGATGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCCGAACTCATTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCCTTTGGATCT ]
[+] EMBL C26248 [ GTCCGGCCACCTCCCCTATTAGTATAGTGTAGCTAGGTTGTAGTTTCTTTGTCAGGTTTTTCCTGTTTCTGTGGCTATGTCCCGTTTGGTTACGTTCAAGCGAAGAGCTCTGATTGCTGGTGGTGATGATTACCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCCGAACTCATTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCC TTGGATCTCCAGGTGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGCGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGCCTTTAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAG ]
[+] EMBL CF311933 [ AAGAGCCCTGGTTGCTGGTGGTGATGATTGCCGGAGTTGGAGCTGCGACTTGAAGGACAGAATCTTCTTCTTATGCTGGTGCTGAACTCGTTGGTCTGCGCCGTGTGCAGACGGCGGTTGCC TTGGATCTCTGGATGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGTGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGTCTTGAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAGCGACAACCTTGGCAGCCCAAGTGTTGCTGCTCTGTGTGGTAGTCTTCAAACTCCAGGTGCTGTTGCTTCTTGTGATAGCCTTGGAGCTCTTCGTACTACTGCTCCGTGCGCTGGTG ATACCTTGAGCTGCTGCTTTTCTGCAACGGTGAAAACATTGTGTG GGGTGTGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTTCGTTGGGAGCTTGC ]
[+] EMBL CF329809 [ CCGTGTGCAGACCGCGGTTGCC TTGGATCTCTGGATGGCGCTGCTTCGTACAGCGGCGGTGGCGGCCCTGGATCTCTGGGTGCCGGTGCTCTGTGTGGTGGCAACGGTCTTGAAATTTCTGGCGATGTTGCTCCGAGCGACAACCTTGGCAGCCCAAGTGTTGCTGCTCTGTGTGGTAGTCTTCAAACTCCAGGTGCTGTTGCTTCTTGTGATAGCCTTGGAGCTCTACGTACTACTGCTCCGTGCGCTGGTG ATACCTTGAGCTGCTGCTTTTCTGCAACGGTGAAAACATT GTGTGGGTGTGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTTCGTTGGGAGCTTGCTCCTTTTCATTTGTTGTGGTCCGCTTCAGTTCTACAATCCTGCAGCAATCCTCGGCCTTCTACAAAGACTGAAGTTTTATCGCAACCATCTGATTTCTCATGTCATGTGGACTACCTGTTCTCCTGAATCTTGCTTC ]
[+] EMBL OSC24231 [ tTGTTGCTTCTTGTGATAGCCTTGGAGCTCTTCGTACTACTGCTCCGTGCGCCGGTG ATATCTTGAGCTGCTGCTTTTCTACAACGGTGAAAACATT GTGTGGGTATGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTTCGTTGGGAGCTTGCTCCTTTTCATTTGTTGTGGTCCGCTTCAGTTCTACAATCCTGCAGCAATCCTCGGCCTTCTACAAAGACAGAAGTTTTAT CAACCATATGATTTCTC GTCATGTGGACTACCTGTTCTACCGAATCTTGCTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTA ]
[+] EMBL AU078286 [ CTACTGNTCCGTGCGCCGGTGAATATCTTGAGCTGCTGCTTTTCTACAACGGTGAAAACATTG GTGTGGGTATGGCATCTTATTTCTCCAATCTGAAGGTTACTTCTNCGTTGGGAGCTTNCTCCTTTTCATTTGTTGTGNTCCGCTTCAGTTCTACAATCCTGCAGCAATCCTCGGCCTTCTACAAAGACAGAAGTTTTAT CAACCATATGATTTCTC GTCATGTGGACTACCTGTTCTACCGAATCTTGCTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATNCCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCTCTACCTTGTTAAAAATGGTTTCTTGGCTTAAGTTGTATCTTTATGTGATGTATTGGGGTATATCCCCTAAATTCTGTCTTTTTGAATAAAGTTGTTCATGTTATCTTCAAAAA ]
[-] EMBL CF329497 [ GTTTTAT CAACCATATGATTTCTC GTCATGTGGACTACCTGTTCTACCGAATCTTGCTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATACCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCTCTACCTTGTTAAAAATGGTTTCTTGGCTTAAGTTGTATCTTTATGTGATGTATTGGGGTATATCCCCTAAATTCTGTCTTTTTGAATAAAGTTGTTCATGTTATCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACTGTCATGGCGT]
[+] EMBL C97952 [ CTTCCTTTTGCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATACCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCTCTACCTTGTTAAAAATGGTTTCTTGGCTTAAGTTGTATCTTTATGTGATGTATTGGGGTATATCCCCTAAATTCTGTCTTTTTGAATAAAGTTGTTCATGTTATNTTCAAA ]
[+] EMBL OS0186A [ GCTTCAAAACAACAGTATCCATACAGGGTCTATCATTCGGGTTGAGCAATCTCTGCTCCTCAGATCTAATGAAAGACTCCATGGAACCAACCTGCTGAGTCCGGTGATACCTACACCAAAATCTACGGCTCAGAAACAAACCTCCGATCTGTGCCGTTTCCGTGGTGACAGCTGTAGGAGCCTTCCAGTCTGTCAAGCGGTGTGCATGTCAATGGAGGCCAAAGGATTCAATCGTCGTGGCTTTGCTGCAAAACTCTGTTGATCTGATTTCCTACTGTTGTTTTGTTTCATCAGAAAGTTTGCTTTTTTAGAGTGGTTACTCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||