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consensusID : consensus_12896#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 566 fasta sequence
[GAGGTTTCTTCGCCCGGGTTC-GGGTTC-TGA--CG-TTC-TCGAGCGA-CA-GGCCCATGCG-CGA-C-CC-ATCGA-GGGGATG-AACGGCAAGGAG-CTCGAC-GCCGCAACATCA-CCGTTAACGAGGCCC-AGTCG-C--CC-GCTCCGGAGGCGGAG-GCGC--GTGGCTACGGCCAGCG-C-G-CGGAGGCGGAGGCT-ACGGT-G-CGGCGGCTA-CGGT-GTT-GT-G-CGG-CG-CGGTGGCTACGGCCAGCGCCGTGAAGGCGGCTACGGCGGT-G-CGGTGGCTA-CGGT-GC-G-CCGTGGTGGCGGCA-GCTAC-GGTGGTGGCTACGGCAGCC-G-C-GGC-GGC-GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA-GCGGTGGGGCCCTCATGGCCA-AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCG-CA-AGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGAT-CAAATGAATGAATGAATGAATC-TTAGTGTGCTCCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI798167 [GAGGTTTCTGC CCCGGGTTC GGGTTCGTGAACCGTTTC TCGAGCGA CACAGCCAATGCG CGA CGCC ATCGA GGGGATG AACGGCAAGGAG CTCGACGGCCGCAACATCA CCGTTAACGAGGCCCAAGTCG CAGCCAGCTCCGGA GCGGAGCGCAG GTGGCTACGGCCAGCG CGG CGGA GCGGAGGCT AC GT G CGGCGGCTA CGGTGGTG GT G CGG CG CGGTGGCTACGGCCAGCGCCGTGAAGGCGGCTACGGCGGT G CGGTGGCTA CGGTGGCGG CCGTGGTGGCGGCA GCTAC GGTGGTGGCTACGGCAGCC G C GGC GGC GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA GCGGTGGGGCCCTCATGGCCA AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCGCCA AGAAGAAAGCTCCTCTCGTTTGCTTTGAT CAAATGAATGAAaaa ]
[+] EMBL BM038143 [ TTCGCCGGGTTTCTGGGTTCNTGA CG TTCTTCGAGCGAGCANGGCCCATGCGTCGA N AC TCGA GGGGATGTAACGGCAAGGAG CTCGAC GCCGCAACATCA CCGTTAACGAGGCCC AGTCG CG CC GCTCCGGAGGCGGAG GCGC GTGGCT CGGCCAGCA C G CGGAGGCGGAGGCTAACGGT G CGGCGGCTA CGGTGGTG GTGG CGG CG CGGTGGCTACGGCCAGCGCCGTGAA GCGGCTAC GCGGT G CGGTGGCTA CGGT GC G CCGTGGT GCGGCG GCTAC GGTGGTGGCTAC GCA CC G C GGC GGC GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA GCGGTGGGGCCCTCATGGCCA AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCG CA AGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGAT CAAATGAATGNATGAATGAATCATTAGTGTGCTCCGCAAAAAAA ]
[+] EMBL BI811427 [ ggtagTTCGCCCGGGTTC GGGTTC TGA CG TTC TCGACCGA CA GCCCATGCG CGA C CCAATCGAGGGGGATG TAC GCAAGGAGTCTCGGC GCCGC ACATCA CCGTTTACGAGGCCC AGTCG CG CC GCTCCGGA GCGGAG GCGCG GTGGCTAC GCCAGCG C G CGGAGGCGGAGGCT ACGGT G CGGCGGCTA CGTT GGT GT G GCG CG CGGTGGCTACGGCCAGCGCCGTGAAGGCGGCTACGGCGGTGG CGGTGGCTA CGGT GC G CCGTGTTGCAGGCAGGCTACAGGTGGTGGCTACGGCAGCCAG CAGGCAGGCAGGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGACGCGGTGGGGCCCTCATGGCCA AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCG CA AGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGAT CAAAaaaaaaa ]
[+] EMBL BI796557 [ cgTC CGGTTC AA CG TTC TCGAGCGA CA GG CCATGC CGACC CC ATCGA GGGGATG AAC GCAAGGAG CTCGAC GCCGCAACATCA CCGTTAACGAGGCCC A TCG C CC GCTCC GA GCGGAGCGCG GTGGCTACGGCCAGCC G G CGGA GCGGAGGCT ACGGTGG CGGCGGCTA CGGT GGT GT G C G CG CGGTGGCTACGGCCAGCGCCGTGAAGGCGGCTAC GC GT G CGGTGGCTA C GT GC G CCGTGGTGGCGGCA GCTAC GGTGGTGGCTACGGCAGCC G C GGC GGC GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA GCGGTGGGGCCCTCATGGCCA AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCG CA AGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGAT CAAAaaaaaaa ]
[+] EMBL BI799351 [ G TTC TCGAGCGAGCA CGCCCATGCG CGA C CC ATCGA GGGGATG AAC GCAAGGAG CTCGAC GCCGCAACATCA CCGTTAACGAGGCCC AGTCG C CC GCTCCGGAGGCGGAG CCGCCGGTGGCTACGGCCAGCG C GCCGGAGCCGGAGGCT ACGGT GCCGGCGGCTA CGGTGGTG GT G CGG CGCCGGTGGCTACGGCCAGCCCCGTGAA GCGGCTAC GCGGT G CGGTGGCTACCGGTGGC G CCGTGGTGGCGGCA GCTAC GGTGGTGGCTACGGCAGCC G C GGC GGC GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA CGGTGGGGCCCTCATGGCCA AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGT GTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCGCCA AGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGATCCAAATGAATGAATGAATGAATC TTA GTGCTGC CAAAAAAAAAA ]
[+] EMBL BI809082 [ CATGCG CGA C CC ATCGA GGGGATG AACGGCAAGGAG CTCGACGGCCGCAACATCA CCGTTAACGAGGCCC AGTCG CAGCC GCTCCGGAGGCGGAGCGCG GTGGCTAC GCCAGCG CGG CGGA GCGGAGGCT ACGGTGG CGGCGGCTA CGGT GTT GT G C G CG CGGTGGCTAC GCCAGC CCGTGAA GCGGCTACGGCGGT GCCGGTGGCTA CGTG GC G CCGTGGT GC GCG GCTAC GGTGGTGGCTACGGCA CC G C GGC GGC GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA CGGTGGGGCCCTCATGGCCA AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCG CA AGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGAT CAAATGAATGAATGAATGAATC TTAGTGTGCaaaaa ]
[+] EMBL BI798271 [ AACGCCAAGGAG CTCGAC GCCGCAACATCA CCGTTAAGGAGCCCC ATTCGCC CC GCTCCGGAGCCGGAGCGCCG GTGGCTACGGCCAGCGCC GCCGGAGCCGGAGGCT CCGGT G CGGCGGCTACCGGT GTTGGT GCCGGCCGCCGGTGGCTACGGCCAGC CCGTGAAGGCGGCTACGGCGGT GCCGGTGGCTA CGGT GC GCCCGTGGTGGCGGCA GCTAC GGTGGTGGCTAC GCAGCC GCC GGC GGC GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA CCGGTGGGGCCCTCATGGCCA AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTCATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCG CC AGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGAT CCAATGAATGAATGAATGAATC TTAGTGTGCTCCcccc ]
[+] EMBL BI796149 [ AACATCACCCGTT ACGA GCCC CGTCG C CC GCTCCGGAGCCGGA GCGC GTTGCTAC GCCAGCG C G CGGA GC GAGGCT ACGGG G C GCGGCTA C GT GTT GT G C G CG CGGTGGCTAC GCCAGC CCGTGAA GCGGCTAC GC GT G CGGTGGCTA C GT GC G CC T GTGCCGGCA GCTAC GGTGGTGGCTACGGCAGCC G C GGC GGC GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA GCGGTGGGGCCCTCATGGCCA AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCG C AGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGAT CAAATGAATGAATGAATGAATC TTAGTGTGCTCCGCTAAAAAAA ]
[+] EMBL BI795455 [ gGTT ACGAGG CC AGTCG C CC GCTCC GA GCGGA GCGC GGTGCTACGGCCAGCG CGG CGGAGGCGGAGGCT ACGGT G C GCGGCTA CGGT GTT GT G CGC GG CGGTGGCTACGGCCAGCGCCGTGAAGGCGGCTACGGCGGTGG CGGTGGCTA CGGTGGCGG CCGTGTTGGC GCA GCTAC GGTGGTGGCTACGGCA CC G C GC GC GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA CGGTGGGCCCCTCATGCCCA AGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGT TTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCG CA AGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGAT CAAATGAATGAATGAATGAATC TTAGTGTccaaaa ]
[+] EMBL BI808793 [ GGCTA CGGT G T GT G C G CG GCGT GCTACGGCCAGCGCCGTGAAGGCGGCTAC GCGGT G CGGTGGCTA CGGT GC G CCGTGGTGGCGGCG GCTAC GGTGGTGGCTACGGCA CC C GGC GGC GGCAACTCCGACGGGAACTGGAGGAACTGA GCGGTGGGGCCCTCATGGCCACAGTTATCTATCTATCTAATCGAGCTACCATCATCATCATCCGATCGTTATCATCGTTAGTTTTGTGTGGAACTATCTAGTTTGTGTTAACTGTGTGGTTGCCCATCTGTGTTTTTGATCG CACAGAAGAAAGCTCGTCTCGTTTGCTTTGAT CAAATGAATGAATGAATGAATC TTAGTGTGCTCCGCTCTCGTCCAAAAAAAAAA]
consensusID : consensus_12896#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 529 fasta sequence
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_12896#0 GAGGTTTCTTCGCCCGGGTTCGGGTTCTGACGTTCTCGAGCGACAGGCCCATGCGCGACC 60
consensus_12896#1 ---------------------------TGACGTTCTCGAGCGAGCAGCC-ATGCGCGACC 32
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consensus_12896#1 TCGCCCGCTCCGGAG-CGGAGCGCGGTGGCTACGGCCAGCGCGCGGAGGCGGAGGCTATC 149
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consensus_12896#0 GTGTGCTCCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 566
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||