These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_12917#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1065 fasta sequence [TACTCCCCTAGTTGTCAAGGGATTTTGTACAGTGAATTAGATAGCTAAGACATATGGTGTGTTAGAAATGTTGGGTTTATTTTAATGTAGCATAAATTAACATATATTTGTATGATAAAATCTGAAGGTAGAAAAATTGTTTTTTGGGGTCAGTTCTTGAAGATTAGTAGAAGTAATGCAAATGAATAATAATCACATAGTCCAATAGAGGAACTAATATAGGACAATATTTATAATA-TAGAAAAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGTGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGTAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTAGAATATAGTGGGTTGTAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAAAATTTGATTTGAAAGAGAGAAAAAAATTAAGAAAATGGTGATTTGTGCATTCTCCTCCCTTTATTACAATTCACTTGAAAATTTATTTTTTTTAGTTTTCAAAATTAGGTCAAACAAGCGAGGTGCAATATATAGTTATCTAAAATGTG-TTTCTAACATATATATAATCGATAAATCAGGGTCAACTGCAGGATAAGTGCATAAGGATGTGAATAAAGGATAAGGAAAAGTTTAGGAGCATGACATACCCAAAGAGTTTTCCCATTTACTTAAAACCGAAAACCAATTTGTTACTTANGGCATGTTTGACACACATTTTAGATCTGCGGTGAATTTGAAGTTTGTATGTTAAATTATAGTGGTTTAAATTTTT] [+] EMBL CB635307 [TACTCCCCTAGTTGTCAAGGGATTTTGTACAGTGAATTAGATAGCTAAGACATATGGTGTGTTAGAAATGTTGGGTTTATCTTAATGTAGCATAAATTATCATATATTTGTATGATAAAATCTGAAGGTAGAAAAATTGTTTTTTGGGGTCAGTTCTTGAAGATTAGTAGAAGTAATGCAAATGAATAATAATCACATAGTCCAATAGAGGAACTAATATAGGACAATATTTATAATA TAGAAAAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGTGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGTAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTAGAATATAGTGGGTTGTAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAAAATTTGATTTGAAAGAGAGAAAAAAATTAAGAAAATGGTGATTTGTGCATTCTCCTCCCTTTATTACAATTCACTTGAAAATTTATTTT ] [+] EMBL CB635528 [TACTCCGCGAGTTGTCAAGGGATTTTGTACAGTGAATTAGATAGCTAAGACATATGGTGTGTTAGAAATGTTGGGTTTATTTTAATGTAGCATAAATTAACATATATTTGTATGATAAAATCTGAAGGTAGAAAAATTGTTTTTTGGGGTCAGTTCTTGAAGATTAGTAGAAGTAATGCAAATGAATAATAATCACATAGTCCAATAGAGGAACTAATATAGGACAATATTTATAATA TAGAAAAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGTGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGTAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTAGAATATAGTGGGTTGTAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAAAATTTGATTTGAAAGAGAGAAAAAAATTAAGAAAATGGTGATTTGTGCATTCTCCTCCCTTTATTACAATTCACTTGAAAATTTA TTTTTTTAGTTTTCAAAATTAGGTCAAACAAGCGAGGTGCAATATATAGTTATCTAAAATGTGTTTTCTAca ] [+] EMBL CB631170 [ AGTGAATTAGATAGCTAAGACATATGGTGTGTTAGAAATGTTGGGTTTATTTTAATGTAGCATAAATTAACATATATTTGTATGATAAAATCTGAAGGTAGAAAAATTGTTTTTTGGGGTCAGTTCTTGAAGATTAGTAGAAGTAATGCAAATGAATAATAATCACATAGTCCAATAGAGGAACTAATATAGGACAATATTTATAATA TAGAAAAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGTGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGTAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTAGAATATAGTGGGTTGTAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAAAATTTGATTTGAAAGAGAGAAAAAAATTAAGAAAATGGTGATTTGTGCATTCTCCTCCCTTTATTACAATTCACTTGAAAATTTATTTTTTTTAGTTTTCCAAATTANGTCAAACA ] [+] EMBL CB635279 [ TAAGACATATGGCGTGTTAAAAATGTTGGGTCCATTTTAATGTATCATAAATTAACATATATTTGTATGATAAAATCTGAAGGTAGAAAAATTGTTTTTTGGGGCCAGATCTTGAAAATTAGGAGAAGTAATGCAAATGAATAATAATCACTTATTCCAATAGAGGAACTAATATAGGACAATATTTATAATA TATAAAAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGTGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGTAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTACAATATAGTGGGTTGTAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAA ] [+] EMBL CB626720 [ AGGAACTAATATAGGACAATATTTATAATA 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TAGAAAAATATAAACCGACATACATTAAAGCATATAATTAATGCAATGGAAAAACTAATGAATCAAGTACTATTCAATCAAGTTTCTCTATTTTTTTAAAAAAACAAAATTCAAATCAAACCAAATGAAGATGAAGAAATATAGGATTATATGTATATATGTTGATATATTGGGAAAATAATGTGAGAATGATTTAATGTCCTTGTATGTTGAGCTCTTGAGTATAACAAATTGTAGATTTGCATGTTAAGATGTAATAATCATTAGTGGACGATGATGTAACATGTTTATATATGTTAAGTTTTAGAATATAGTGGGTTGTAATTTTATAGAAGGTATATATTATAGAAATAATGAATATATGAAATATTATACAAATTATGTGGGATGATGATTTGACATTGTTGCATGTTGAGCTACCCATAGCTCGAAGTGCAATTTACTCAAAATATAAAATTTGATTTGAAAGAGAGAAAAAAATTAAGAAAATGGTGATTTGTGCATTCTCCTCCCTTTATTACAATTCACTTGAAAATTTATTTTTTTTAGTTTTCAAAATTAGGTCAAACAAGCGAGGTGCAATATATAGTTATCTAAAATGTG TTTCTAACATATATATAATCGATAAATCAGGGTCAACTGCAGGATAAGTGCATAAGGATGTGAATAAAGGATAAGGAAAAGTTTANGAGCATGACATACCCAAAGAGTTTTCCCATTTACTTAAAACCGAAAACCAATTTGTTACTTANGGCATGTTTG ] [+] EMBL CB631623 [ 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TAGATCTGCGGTGAATTTGAAGTTTGTATGTTAAATTATAGTGGTTTAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||