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Oryza sativa
cluster # 13115 cluster # 13115       Sequences # 12       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_13115#0 length = 1768 sequences # 3  
consensus_13115#1 length = 729 sequences # 9  

consensusID : consensus_13115#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1768
fasta sequence
                              [CCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGGTATAATTTTACCTGGCTGTACAATGAATTGAGCTCTGCGTCTACTATATGGTTTGCTATGATGCCTGACAATATGTCTCCCGGAGTATTTGTTACTTGTTAGAGCTTTGCTGGTTTCGAACTTAGGCCATTTTCTAGTTCCTTTACATTGTTTAGATCTTTGAGTTGTATGCCGTTTTTTGTGCTTAATGTTGGTGCAGATCTTTGTTGAAGTAATGTTATCCTTTTCCATGTCTATGTACAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTTAGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCGGTGGTCAAGCCACCAAAGTGTATGGCTTCTATGAATTTCAAATTTAATCAATTTGCATTGTCTAGCAGG-AGCATGGTTTATCATAATCTAGTAAGGCTTAAGTGGGGTTTCTTTGCTCATTTTTCAACATATCCCAGATGAACTTATCCTATAGGGTTAATTAACCATGCTGATGAAGTGCGTAGTTTTGATTATTAAATGCTTTCTTTAAGCTTCAGGATCCTTTAAGAGAACTTTCAGTATTTGGTTTTAGGAATAAATGGCTGTTTTTTGTTTAGTTTGAGTGCATCAAGATGGTCTTATTGATCAATCTAATTTTTCTATTGTCCAGGGTAAAAACATATCAGTGCACTCAGTTTTTTAGCTTTTCCAAAGAAAAGATGCAAAATTAGTTGAAGTGACTAGCTTATAATGATTTTGCATGGGGTTTTTCTTTGTGCACTAAAGGCTATTCTTACTTTGATATCATGTAATGTCAACAAGATTAATAATCACTAGCTAAAGAACTCAGGTGTTCAGTTTGTTCGAACAGTTCATATGCATCCCATTGCTGTCTGTACTGTTTCAGCTACTTGGTTAATTCAATTCAAGTGCATTTACTTAATTAATTGTATCATTGTTATGTGAATCATGTTATACGAAGATAAGTACCTTCAAAGAACAATTTTTCGCCTTGCCAATATGTAAATCTGGCCTACAGCTACACAGCTTGTACTAGACTACTGTTAGTCCTGTATCAAGTTTATTTTTAACGTAATCCTGTATCATGTGATGATGTCAACTCCCTTTGTGCTATGAATTTTAATGAATTGCATTCTTTTCCATTCTAGGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTGAGCTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAGCTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK068912             [CCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGGTATAATTTTACCTGGCTGTACAATGAATTGAGCTCTGCGTCTACTATATGGTTTGCTATGATGCCTGACAATATGTCTCCCGGAGTATTTGTTACTTGTTAGAGCTTTGCTGGTTTCGAACTTAGGCCATTTTCTAGTTCCTTTACATTGTTTAGATCTTTGAGTTGTATGCCGTTTTTTGTGCTTAATGTTGGTGCAGATCTTTGTTGAAGTAATGTTATCCTTTTCCATGTCTATGTACAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTTAGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCGGTGGTCAAGCCACCAAAGTGTATGGCTTCTATGAATTTCAAATTTAATCAATTTGCATTGTCTAGCAGG AGCATGGTTTATCATAATCTAGTAAGGCTTAAGTGGGGTTTCTTTGCTCATTTTTCAACATATCCCAGATGAACTTATCCTATAGGGTTAATTAACCATGCTGATGAAGTGCGTAGTTTTGATTATTAAATGCTTTCTTTAAGCTTCAGGATCCTTTAAGAGAACTTTCAGTATTTGGTTTTAGGAATAAATGGCTGTTTTTTGTTTAGTTTGAGTGCATCAAGATGGTCTTATTGATCAATCTAATTTTTCTATTGTCCAGGGTAAAAACATATCAGTGCACTCAGTTTTTTAGCTTTTCCAAAGAAAAGATGCAAAATTAGTTGAAGTGACTAGCTTATAATGATTTTGCATGGGGTTTTTCTTTGTGCACTAAAGGCTATTCTTACTTTGATATCATGTAATGTCAACAAGATTAATAATCACTAGCTAAAGAACTCAGGTGTTCAGTTTGTTCGAACAGTTCATATGCATCCCATTGCTGTCTGTACTGTTTCAGCTACTTGGTTAATTCAATTCAAGTGCATTTACTTAATTAATTGTATCATTGTTATGTGAATCATGTTATACGAAGATAAGTACCTTCAAAGAACAATTTTTCGCCTTGCCAATATGTAAATCTGGCCTACAGCTACACAGCTTGTACTAGACTACTGTTAGTCCTGTATCAAGTTTATTTTTAACGTAATCCTGTATCATGTGATGATGTCAACTCCCTTTGTGCTATGAATTTTAATGAATTGCATTCTTTTCCATTCTAGGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTGAGCTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAGCTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAAC                                                             ]
[+] EMBL CF306098             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGTGGTCAAGCCACCAAAGTGTATGGCTTCTATGAATTTCAAATTTAATCAATTTGCATTGTCTATCTGGTAGCATGGTTTATCATAATCTAGTAAGGCTTAAGTGGGGTTTCTTTGCTCATTTTTCAACATATCCCAGATGAACTTATCCTATAGGGTTAATTAACCATGCTGATGAAGTGCGTAGTTTTGATTATTAAATGCTTTCTTTAAGCTTCAGGATCCTTTAAGAGAACTTTCAGTATTTGGTTTTAGGAATAAATGGCTGTTTTTTGTTTAGTTTGAGTGCATCAAGATGGTCTTATTGATCAATCTAATTTTTCTATTGTCCAGGGTAAAAACATATCAGTGCACTCAGTTTTTTAGCTTTTCCAAAGAAAAGATGCAAAATTAGTTGAAGTGACTAGCTTATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AU094653             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGGTTAACTTTCAGGCTNTNGCCAGCCTNTGATCTCCATTTGNTGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCNCCNCCCCTNTCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATNCTTGTTGNAACATAACTCATTTNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_13115#0 CCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGG ATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGGTATAATTT TACCTGGCTGTACAATGAATTGAGCTCTGCGTCTACTATATGGTTTGCTATGATGCCTGA CAATATGTCTCCCGGAGTATTTGTTACTTGTTAGAGCTTTGCTGGTTTCGAACTTAGGCC ATTTTCTAGTTCCTTTACATTGTTTAGATCTTTGAGTTGTATGCCGTTTTTTGTGCTTAA TGTTGGTGCAGATCTTTGTTGAAGTAATGTTATCCTTTTCCATGTCTATGTACAGTTAGT CGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAG GTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTTAGCTCCTACTCTGAATCTG GATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAG TTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCGGTGGTCAA GCCACCAAAGTGTATGGCTTCTATGAATTTCAAATTTAATCAATTTGCATTGTCTAGCAG GAGCATGGTTTATCATAATCTAGTAAGGCTTAAGTGGGGTTTCTTTGCTCATTTTTCAAC ATATCCCAGATGAACTTATCCTATAGGGTTAATTAACCATGCTGATGAAGTGCGTAGTTT TGATTATTAAATGCTTTCTTTAAGCTTCAGGATCCTTTAAGAGAACTTTCAGTATTTGGT TTTAGGAATAAATGGCTGTTTTTTGTTTAGTTTGAGTGCATCAAGATGGTCTTATTGATC AATCTAATTTTTCTATTGTCCAGGGTAAAAACATATCAGTGCACTCAGTTTTTTAGCTTT TCCAAAGAAAAGATGCAAAATTAGTTGAAGTGACTAGCTTATAATGATTTTGCATGGGGT TTTTCTTTGTGCACTAAAGGCTATTCTTACTTTGATATCATGTAATGTCAACAAGATTAA TAATCACTAGCTAAAGAACTCAGGTGTTCAGTTTGTTCGAACAGTTCATATGCATCCCAT TGCTGTCTGTACTGTTTCAGCTACTTGGTTAATTCAATTCAAGTGCATTTACTTAATTAA TTGTATCATTGTTATGTGAATCATGTTATACGAAGATAAGTACCTTCAAAGAACAATTTT TCGCCTTGCCAATATGTAAATCTGGCCTACAGCTACACAGCTTGTACTAGACTACTGTTA GTCCTGTATCAAGTTTATTTTTAACGTAATCCTGTATCATGTGATGATGTCAACTCCCTT TGTGCTATGAATTTTAATGAATTGCATTCTTTTCCATTCTAGGGAGATCTATGCATCGTT TGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTGAGCTGGA CCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTG ATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCA TGCTAATTGCGCACCACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAGCTTTGTATCAAAC ATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



consensusID : consensus_13115#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 729
fasta sequence
                              [CGCAGCCAGCTCCGGCTTTCCCCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT-AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA-AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT-GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC-AGTGCCGCTAGCTTTGAG-CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA-TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCATGTTATGTGAAATTGTCCCGTTGTTTCGCAAAAAATAAAAAAAAA]

[-] EMBL CA763565             [CGCAGCCAGCTCCGGCTTTCCCCTCGCGACCTCTCACGCCGCGGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGTGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCGGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATCTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCA                                                                                                 ]
[+] EMBL CF281152             [                  TCCCCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTNTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAAC                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL C73706               [                  TCCCCTCGCNACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGTNGGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL OSR06501A            [                      CTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGNCGCCGNGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGCCATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGNGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGNAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATNTCATGCATGGACAAGCTCTACAAGATCTCAGCAGNCAGTTCCAGT GG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AU101627             [                                                                                 ATATTTTCACTGTGACCAGGCTCGATCNTGATGGNAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCAAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATG ACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCATGTTATGTGAAATTGTCCCGTTGTTTCGCAAAAAA          ]
[-] EMBL CF281151             [                                                                                                                                                                 TTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAAGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTANTCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCATGTTATGTGAAATTGTCCCGTTGTTTCGCATTTGGTAAAAAAAAA]
[-] EMBL BI306368             [                                                                                                                                                                                                           CCGATGTGTGGTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATGTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTTATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAGCCTGGCCCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCATTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTTTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAAtt                                                       ]
[-] EMBL BI306603             [                                                                                                                                                                                                            taATGCGTGCTGGTGACAGATTCTCCATGGTTTT AGCTCGTACTTTGAATCTGGATGGAACTCCGGACATTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTGTGATGATGGTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCAaaag                                         ]
[-] EMBL CB966012             [                                                                                                                                                                                                                                         GTTTTGAGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGTACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGTAATACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGAC AATACTTGTTGAAACATAAC                                                        ]


>consensus_13115#1 CGCAGCCAGCTCCGGCTTTCCCCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAA TGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGA AGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGT TAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTTAG CTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAA AAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAG ACAGTTCCAGTGGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGA TGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTGAGCTGGACCAGAGGCTGTTCC TCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTT TCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCAC CACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTT GTTGAAACATAACTCATTTAAGCATGTTATGTGAAATTGTCCCGTTGTTTCGCAAAAAAT AAAAAAAAA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_13115#0      CCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGG 60
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      ATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGGTATAATTT 120
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      TACCTGGCTGTACAATGAATTGAGCTCTGCGTCTACTATATGGTTTGCTATGATGCCTGA 180
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      CAATATGTCTCCCGGAGTATTTGTTACTTGTTAGAGCTTTGCTGGTTTCGAACTTAGGCC 240
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      ATTTTCTAGTTCCTTTACATTGTTTAGATCTTTGAGTTGTATGCCGTTTTTTGTGCTTAA 300
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      TGTTGGTGCAGATCTTTGTTGAAGTAATGTTATCCTTTTCCATGTCTATGTACAGTTAGT 360
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      CGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAG 420
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      GTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTTAGCTCCTACTCTGAATCTG 480
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      GATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAG 540
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      TTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCGGTGGTCAA 600
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      GCCACCAAAGTGTATGGCTTCTATGAATTTCAAATTTAATCAATTTGCATTGTCTAGCAG 660
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      GAGCATGGTTTATCATAATCTAGTAAGGCTTAAGTGGGGTTTCTTTGCTCATTTTTCAAC 720
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      ATATCCCAGATGAACTTATCCTATAGGGTTAATTAACCATGCTGATGAAGTGCGTAGTTT 780
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      TGATTATTAAATGCTTTCTTTAAGCTTCAGGATCCTTTAAGAGAACTTTCAGTATTTGGT 840
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      TTTAGGAATAAATGGCTGTTTTTTGTTTAGTTTGAGTGCATCAAGATGGTCTTATTGATC 900
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      AATCTAATTTTTCTATTGTCCAGGGTAAAAACATATCAGTGCACTCAGTTTTTTAGCTTT 960
consensus_13115#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13115#0      TCCAAAGAAAAGATGCAAAATTAGTTGAAGTGACTAGCTTATAATGATTTTGCATGGGGT 1020
consensus_13115#1      --------------------------------------------------CGCAGCCAGC 10
                                                                          ***    * 

consensus_13115#0      TTTTCTTTGTGCACTAAAGGCTATTCTTACTTTGATATCATGTAATGTCAACAAGATTAA 1080
consensus_13115#1      TCCGGCTT-TCCCCTCGCGACC--TCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGA 67
                       *     ** * * **   * *   *** **   *    *          ** * * ** *

consensus_13115#0      TAATCACTAGCTAAAGAACTCAGGTGTTCAGTTTGTTCGAACA-GTTCATATGCATCCCA 1139
consensus_13115#1      GCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTG-ACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCG 126
                         * *  *      * * **    ***  *    * **** *  * *   * * *   * 

consensus_13115#0      TTGCTGTCTGTACTGTTTCAGCTACT--TGGTTAATTCAATTCAAGTGCATTTACTTAAT 1197
consensus_13115#1      ACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGA--CATGTACATGCAGTTAGA 184
                            **  **    *   ****  *   *   * *** *  ** ** ***  * ***  

consensus_13115#0      TAATTGTATCATTGT-TATGTGAATCATGTTATACGAAGATAAGTACCTTCAAAGAACAA 1256
consensus_13115#1      TGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCT----GGTGACAGATTCACC------ATGG 234
                       *  *  **     ** ***  **  * ** *    *  ** *  * *         *   

consensus_13115#0      TTTTTCGCCTTGCCAATATGTAAATCTGGCCTACAGCTACACAGCTTGTACTAGACTACT 1316
consensus_13115#1      TTTTAGCTCCTAC-----TCTGAATCTGGA-TGGAACTCCGGACACTGGCTT---CTACA 285
                       ****    * * *     * * *******  *  * ** *  *   **   *   **** 

consensus_13115#0      GTTAGTCCTGTATCAAGTTTATTTTTAACGTAATCCTGTATCATGTGATGATGTCAACTC 1376
consensus_13115#1      CGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGAC--AAGTTTG-ACTATGTCATGCATGGAAAGC 342
                          ** *  * *  **     **  * **  **   ** *  **** ***     **  *

consensus_13115#0      CCTTTGTGCTATGAATTTTAATGAATTGCATTCTTTT--CCATTCTAG-GGAGATCTATG 1433
consensus_13115#1      TCTACAAGATCTCAG---AAGACAGTTCCAGTGGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATG 399
                        **    * * * *     *   * ** ** *  *    ***    ** ***********

consensus_13115#0      CATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTG 1493
consensus_13115#1      CATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTG 459
                       ************************************************************

consensus_13115#0      AGCTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATA 1553
consensus_13115#1      AGCTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATA 519
                       ************************************************************

consensus_13115#0      ACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTT 1613
consensus_13115#1      ACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTT 579
                       ************************************************************

consensus_13115#0      CTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAGCTTTGT 1673
consensus_13115#1      CTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGT 639
                       ***************************************************** ******

consensus_13115#0      ATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTNAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1733
consensus_13115#1      ATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCATGTTATGTGAAATTG 699
                       **************************************** *  *    *    ***   

consensus_13115#0      AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1768
consensus_13115#1      TCCCGTTGTTTCGCAAAAAATAAAAAAAAA----- 729
                                     ****** *********     




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)