Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 1324 cluster # 1324       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1324#0 length = 593 sequences # 2  

consensusID : consensus_1324#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 593
fasta sequence
                              [GTTGGGTGACAATGGTGGACCACCTTCCCGTCTTTCAGGAGCAACCTCCTTTTGACAAGAAGCACAGTTTGGTGACCTTCATGGAAGCGCGTACATCAAGAGACCTCTCCGCACAAGCTGGATGCTGGAAAAGCAAGAGGAATTCAAGAAGAACATTGAGGTGGCCACCAAGTACTTGCTTGGAAAGCTCAAGGACCTTCAGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGGCGGCTTGGTGTTTGCCTACTACAAGGACGGAGCCACCGACCCAAACCTTCCTGTTACTTCTCTCATGGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGCGGTTCCTTCTGCTCGACACTGATG-TTTATCTATCGCAGTCCGCGGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGTTATGGTCCAGATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTAAAAAGCTCCTTAAATGTTTGGAACGATATTAATTTGCTTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAATCATGCCGTTACGTAGCGTATC]

[+] EMBL BI799086             [GTTGGGTGACAATGGTGGACCACCTTCCCGTCTTTCAGGAGCAACCTCCTTTTGACAAGAAGCACAGTTTGGTGACCTTCATGGAAGCGCGTACATCAAGAGACCTCTCCGCACAAGCTGGATGCTGGAAAAGCAAGAGGAATTCAAGAAGAACATTGAGGTGGCCACCAAGTACTTGCTTGGAAAGCTCAAGGACCTTCAGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGGCGGCTTGGTGTTTGCCTACTACAAGGACGGAGCCACCGACCCAAACCTTCCTGTTACTTCTCTCATGGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGCGGTTCCTTCTGCTCGACACTGATG TTTATCTATCGCAGTCCGCGGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGTTATGGTCCAGATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTAAAAA                                                                                      ]
[-] EMBL CF299623             [                                                                                                                        GATGC GGAAAAGCAAGAGGAATTCAAGAAGAACATTGAGGGTGCCACCAAGTACTTGCTTGGAAAGCTCAAGGACCTTCAGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGGCGGCTTGGTGTTTGCCTACTACAAGGACGGAGCCACCGACCC AACCTTCCT TTACTTTTTTCATGGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGCGGTTCCTTTTGCTCGACACTGATGTTTTATCTAT GCAGTCCGCCGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGATATGGTTTA ATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTCATGAGCTCCTTAAATGTTTGGAACGATATTAATTTGCTTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAATCATGCCGTTACGTAGCGTATC]


>consensus_1324#0 GTTGGGTGACAATGGTGGACCACCTTCCCGTCTTTCAGGAGCAACCTCCTTTTGACAAGA AGCACAGTTTGGTGACCTTCATGGAAGCGCGTACATCAAGAGACCTCTCCGCACAAGCTG GATGCTGGAAAAGCAAGAGGAATTCAAGAAGAACATTGAGGTGGCCACCAAGTACTTGCT TGGAAAGCTCAAGGACCTTCAGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGGCGGCTT GGTGTTTGCCTACTACAAGGACGGAGCCACCGACCCAAACCTTCCTGTTACTTCTCTCAT GGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGCGGTTCCTTCTGCTCGACACTGATGTTTATCTATC GCAGTCCGCGGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGTTATGGTCCAGAT GTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAA AAAACCTCCGGATTATTGGATTAAAAAGCTCCTTAAATGTTTGGAACGATATTAATTTGC TTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAATCATGCCGTTACGTAGCGTATC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)