These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_1324#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 593 fasta sequence [GTTGGGTGACAATGGTGGACCACCTTCCCGTCTTTCAGGAGCAACCTCCTTTTGACAAGAAGCACAGTTTGGTGACCTTCATGGAAGCGCGTACATCAAGAGACCTCTCCGCACAAGCTGGATGCTGGAAAAGCAAGAGGAATTCAAGAAGAACATTGAGGTGGCCACCAAGTACTTGCTTGGAAAGCTCAAGGACCTTCAGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGGCGGCTTGGTGTTTGCCTACTACAAGGACGGAGCCACCGACCCAAACCTTCCTGTTACTTCTCTCATGGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGCGGTTCCTTCTGCTCGACACTGATG-TTTATCTATCGCAGTCCGCGGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGTTATGGTCCAGATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTAAAAAGCTCCTTAAATGTTTGGAACGATATTAATTTGCTTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAATCATGCCGTTACGTAGCGTATC] [+] EMBL BI799086 [GTTGGGTGACAATGGTGGACCACCTTCCCGTCTTTCAGGAGCAACCTCCTTTTGACAAGAAGCACAGTTTGGTGACCTTCATGGAAGCGCGTACATCAAGAGACCTCTCCGCACAAGCTGGATGCTGGAAAAGCAAGAGGAATTCAAGAAGAACATTGAGGTGGCCACCAAGTACTTGCTTGGAAAGCTCAAGGACCTTCAGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGGCGGCTTGGTGTTTGCCTACTACAAGGACGGAGCCACCGACCCAAACCTTCCTGTTACTTCTCTCATGGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGCGGTTCCTTCTGCTCGACACTGATG TTTATCTATCGCAGTCCGCGGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGTTATGGTCCAGATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTAAAAA ] [-] EMBL CF299623 [ GATGC GGAAAAGCAAGAGGAATTCAAGAAGAACATTGAGGGTGCCACCAAGTACTTGCTTGGAAAGCTCAAGGACCTTCAGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGGCGGCTTGGTGTTTGCCTACTACAAGGACGGAGCCACCGACCC AACCTTCCT TTACTTTTTTCATGGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGCGGTTCCTTTTGCTCGACACTGATGTTTTATCTAT GCAGTCCGCCGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGATATGGTTTA ATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTCATGAGCTCCTTAAATGTTTGGAACGATATTAATTTGCTTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAATCATGCCGTTACGTAGCGTATC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||