cluster # 1339

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Oryza sativa
cluster # 1339 cluster # 1339 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1339#0 length = 670 sequences # 2

consensusID : consensus_1339#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 670
fasta sequence

                              [TGTCCCACCCATCTGCTGAAGGTGTGTGATATTAGGTGTTGATGACCAACCTTGAAGGTGGTCGACATTGGTGGACACTCCGTCTTCAGAGCAACCTCCTGTGACAAGAACCAGTTTGTGACCTTCATGAAGCGCTACATCAAGAACCTCTCCGCCAAGCTGGATCGGAAAACCAAGAGGAATTCAAGAAGAACATTGAGGGTGCCACCAAGTACTTGCTTGGAAAGCTCAAGGACCTTCAGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGCGGCTTGGTTTTTGCCTACTACAAGGACGGAGCCACCGACCCAACCTTCCTTTACTTCTCTCATGGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGCGGTTCCTTCTGCTCGACACTGATGTTTTATCTAT-CAGTCC-CGGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGTTATGCTCTAATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTCATGAGCTCCTTAAATGTTTGGAACGATATTAATTTGCTTTGTGATGGCTGGAGAAAGATANCTGATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI806576             [TGTCCCACCCATCTGCTGAAGGTGTGTGATATTAGGTGTTGATGACCAACCTTGAAGGTGGTCGACATTGGTGGACACTCCGTCTTCAGAGCAACCTCCTGTGACAAGAACCAGTTTGTGACCTTCATGAAGCGCTACATCAAGAACCTCTCCGCCAAGCTGGATCGGAAAACCAAGAGGAATTCAAGAAGAACATTGAGGGTGCCACCAAGTACTTGCTTGGAAAGCTCAAGGACCTTCAGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGCGGCTTGGTTTTTGCCTACTACAAGGACGGAGCCACCGACCCAACCTTCCTTTACTTCTCTCATGGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTGAGCGGTTCCTTCTGCTCGACACTGATGTTTTATCTAT CAGTCC CGGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGTTATGCTCTAATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTCATGAGCTCCTTAAATGTTTGGAACGATATTAATTTGCTTTGTGATGGCTGGAGAAAGATANCTGATGAAAAAAA                                                           ]
[+] EMBL CF315527             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGCGGTTCCTTCTGCTCGACACTGATGTTTTATCTATGCAGTCCGCCGTATTTTTGGTCTAGTCTATGGTTGTCAGTTGACTCGATATGGTCTAATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTTGCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTCATGAGCTCCTTAAATGTTTGGAACGATATTAATTTGCTTTGTGATGGCTGGAGAAGGATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_1339#0
TGTCCCACCCATCTGCTGAAGGTGTGTGATATTAGGTGTTGATGACCAACCTTGAAGGTG
GTCGACATTGGTGGACACTCCGTCTTCAGAGCAACCTCCTGTGACAAGAACCAGTTTGTG
ACCTTCATGAAGCGCTACATCAAGAACCTCTCCGCCAAGCTGGATCGGAAAACCAAGAGG
AATTCAAGAAGAACATTGAGGGTGCCACCAAGTACTTGCTTGGAAAGCTCAAGGACCTTC
AGTTCTTTGTTGGTGAGAGCATGCATGATGATGCGGCTTGGTTTTTGCCTACTACAAGGA
CGGAGCCACCGACCCAACCTTCCTTTACTTCTCTCATGGGCTGAAGGAGGTCAAGTGCTG
AGCGGTTCCTTCTGCTCGACACTGATGTTTTATCTATCAGTCCCGGTATTTTTGGTCTAG
TCTATGGTTGTCAGTTGACTCGTTATGCTCTAATGTTGGTGTCGGAAACAACTATCGTTT
GCTTGTTATGGATGTTGAGATGAGTCCTTTTAAAAAAACCTCCGGATTATTGGATTCATG
AGCTCCTTAAATGTTTGGAACGATATTAATTTGCTTTGTGATGGCTGGAGAAAGATANCT
GATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case