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consensusID : consensus_15868#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 13 consensus length = 1171 fasta sequence
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_15868#1 GACTGAAGGAGTAGAAACCATCACGATATACATTCAAACCGGAGGCGCTTTCCCCTTCTC 63
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 CCCCTCCGGCCCCTCTTCCCCTTCGATTCCGGCGGCTTGCCGCCGGCGAGGGTTGGAGGA 120
consensus_15868#2 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#1 TCGTTCCGCTCATCTCTCTACAGTTCCCTTCCCAAAATCCCTCCCCTCGGGCCCCTCTTC 123
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 GGGGTCCGGCCACCTCCCCCTAGTAGTATTGTGTCAGGTTTGTCCTGTAGTTAGGGTCTG 180
consensus_15868#2 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#1 CCCTTCGATTCTGGCGGTTTGCCGCCGGCGAGGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTCCC 183
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 TCCTGTGTCTCTTTTG--CCGGTGAGGTTCTATGGTTGCCGGAGTTATTGATGGCGTTGG 238
consensus_15868#2 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#1 CTCCACTAGTATTGTATAGTTAGATTTGTTTTTAGGTCGTCAGGTGTTTCCTGTAGTTAG 243
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 CGTTGGTCGATGGCGAGCTGTGGATGTTTCCTGGCAGCGGCGTGGTCTCGTCGTCGTCGT 298
consensus_15868#2 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#1 GGTTTGTCCTTAGTTGGTGTTTTTGCCGACGAGTCTCCATGGGTGCCGTTGTGGTCGGCG 303
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 TGTTGGTGTCTTGCAGCTAGTGGAAGTGGAGGATATGCTGGATTTGAAGCTTGAGGTGAT 358
consensus_15868#2 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#1 GCGACGGCAGTTGGTGGCGGTGGAGGTGCGAGATCCAAAGACCTGTGGATGAATCGACGG 363
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 GGGGCGGTGTCTGGTCTTGCCGCCGCCGTGGTCATTGCTGCTGCGCATGGAGGTGCTGTT 418
consensus_15868#2 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#1 AAGGAGCTGGCTCCTTGCGGCGGCGGCGGCGGCTGCATCGTCGTTTGCGGCCGGGAGGTT 423
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 GGTGCTCTACGAGAAGGTTTATTGCTTGTGGTCTCTTTCCCTCTGTGCCGGCTGTGGTCT 478
consensus_15868#2 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#1 GCCACCCCGTTCCTAGCGTTGCGTGCGGTGACTTCTCGTGGCTTGCATCGTCTGGATCTG 483
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 GGGATGGTGGTGGTGCTTTGTGCCTCTTGCTAGTGTCCGGGATGATGGCGTCGTCGCCGG 538
consensus_15868#2 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#1 CTGTCGCCCGGAGCTTGCTGCTCGTGGTGCATGATGATAGCCCGTCGACGAGGTGGCGGT 543
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 AGTCGGTGATGTCGTTGTCCCTGCCACCGAGCTGGCCGAAGCCCTTCTCCGACCTCCTCC 598
consensus_15868#2 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#1 TCGAGAGCTTCCAATGCCAAGGTTCCATCCGTCAAGATTCACAGGATTTCTCTTCCCCAT 603
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 CTCCTCGGGTTCCCAGTTGGTGCTTC-TGCTTCACCTTCTGCTAGTCCGCTCTTTCCCAA 657
consensus_15868#2 ------------------------------------------------GAGTAGAAAGAA 12
consensus_15868#1 CCCCGTAAGTCGATCCAAGAAGACAACAGTCTGTTTGCCACCAATCGAGTTATTCAGTTG 663
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 CGTTGTGCGTCGTTCCCTCTAGAGAACAGTTCATTCGTCAATGGTTGTGCTCTTCACTGC 717
consensus_15868#2 TGGCCGAGACGGACGCCCCCCCAGAGCCTCTCGTTCCCCTCCTCCCTCTACAGTAAACTT 72
consensus_15868#1 GTTTGGGGATTTAGATGTGGGCTCCTTCTTTCTATGTGTTTCCTACCAGCTTGCTCCATG 723
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 TTCAGGGTGGCTGGATCTGGGGTCCTTCTCCCTCTTCGTTTCTGGGCAGTTGTATCCACG 777
consensus_15868#2 CACAAAATTTCTCCCCTCTGGCCCCT-CTTCCCCTTCGATTCCGGCGGTTTTCCGCCGGC 131
consensus_15868#1 CAGGGTTTGTTGTTCGGGTTGAGCTCACGCTCCTCAGATTTAATGACGAACTCTGTGGAC 783
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 CTGGGTGGGCCATTCGGGTTGAGCTCATGCTCCTCAGATTCAAAGGCGAACTCCGTGGTG 837
consensus_15868#2 GAGGGTTGGAGGAGGGGTCCGGCCACCTTCCCCTAGTAGTATTTAGTCAGGTTTGTCCTG 191
consensus_15868#1 ATCTCTTGCTGAGTCCGGTTATGCTTAATCCAAAATCTATGGCTCAACAGCAGACCTCCG 843
consensus_15868#3 ------------------------------------------------------------
consensus_15868#0 AAGTTTGGTTAAGTCCGGTGAAGCTTACACCAAAATCTACGGCTCAACAGCAAATCTCCA 897
consensus_15868#2 TTTCTTTAGCAGTCTTGTGTCCTAGGGTTCGGCCGGTGATGTCTTCCATGGTGGCGGCCG 251
consensus_15868#1 TTTTTGTGCAGTCTTCGTAGAGGCAACCGGATGGGGATTGCCGGTTTGTCGAGCGTGCTG 903
consensus_15868#3 --TTTGTGCAGTCTTCGTAGAGGCAACCGGATGGGGATTGCCGGTTTGTCGAGCGTGCTG 58
consensus_15868#0 A-TTTGTGCAGACTCTGTGAAGGCGTCCGAA-GAGGATTACCGGTTCGTCAAGCGGTCTG 955
consensus_15868#2 GTGTTGTG--GTTCTCGAAGGCGGCGGTGGTTGGAGATGGTGGCTTCGT---GCCTCTTT 306
***** * * * * * *** * ** ** ** *
consensus_15868#1 CACGCCGAA--GGAGGCCCAAGGTTGCA---TTCGTCACGGCATTATCGCAGCTCCCTGT 958
consensus_15868#3 CACNCCGAA--GGAGGCCCAAGGTTGCA---TNCGTCACGGCATTATCGCAGCTCCCTGT 113
consensus_15868#0 CATGTCAAA--GGAGACCCAAGGTTCTA---ATCGTCGTGGCTTCGCCGCAGCTCC-TGT 1009
consensus_15868#2 GTTGCCGAATCGAAGCTCCGGTGGTGTAATCTTCCTCGCGCAAGGGTTCTGAAGGCTGGT 366
* ** * ** ** * * * * ** * * **
consensus_15868#1 CGATGTGCAACTTCTCTGTTGTG-TGGTTTCAATATGAAGATTGTAGCCCTAGTGCAGTT 1017
consensus_15868#3 CGATGTGCAACTTCTCTGNNGNG-TGGTTTCAATATGAAGATTGTAGCCCTAGTGCAGTT 172
consensus_15868#0 CGATTCGCGCCTTCTACGCTGCC-TAGTTTCAGGAGGTTGTTTGTACTCTTAGTCTAGTT 1068
consensus_15868#2 GAAGTTTCCAGATCTAGGTGGAGGTGGAGGAGTTGATTCCGGCGAGACCGGAGTCCTTCT 426
* * *** * * * * * * *** *
consensus_15868#1 TT-CCGTTCATTGGAAACAGATGGTTTT--ATGCTCTCTTTATCTGTTTGGCAATGTACT 1074
consensus_15868#3 TT-CCGTTCATTGGAAACAGATGGTTTT--ATGNTCTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 229
consensus_15868#0 TT-CTCTGATGTGCATCTTGTTGGTTCT--TTCTGTTGGCGATGTACGGGGCTTGCCCCC 1125
consensus_15868#2 CTGCTGTGCTTGCGAAGCTGGTGCTTCTCGGTGGCTTCCCCTTCGGCTCCGGCAGCTACA 486
* * * * * ** ** * * *
consensus_15868#1 GGGATTTATTCCAGTGAACTCTGTCGTTTTATATTAATGGAGGTTTAAGTTTAAAAAAAA 1134
consensus_15868#3 AAAAAAAAAAAAAAAAAAA----------------------------------------- 248
consensus_15868#0 TTGATCTGTTGCTCTAATATATATGTTTAAGTTTCAAAAAAAAAGA-------------- 1171
consensus_15868#2 GCAGCCGGCACGGCGCCTTCTCCGAGACTGCGGCCTTCGCCGGTGCGCGATTCGTCTGGC 546
consensus_15868#1 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAA 1159
consensus_15868#3 -------------------------
consensus_15868#0 -------------------------
consensus_15868#2 AGGAGTCG----------------- 554
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||