cluster # 1661

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 1661 cluster # 1661 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1661#0 length = 754 sequences # 2

consensusID : consensus_1661#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 754
fasta sequence

                              [CTCAACTTGATCTTGCTCCGCAAGATGGGGATGGGGTGCACAAATATGCTGTCGCAGTCGCAGCTCTCGAAGATAAAGATGTTGGCGTCGCGGCCCGATATCTGCAAGAGGAACAGCCACCTGAAGCTCTGTTACAACCTCCGCAATCGCAATGTCTTCGTCCCCAACACCAACAAGCCACAGCTAGGCCCCCTCCACACCAACAAGCCACAGCTAGGCTCCCTCCAGTACAAGAAAGGGAAGGAACATGTGTATGATGTGTCAGGGCAGACCCCAACATGCGCAAAGGTTGCTCTCGAACACTATAACAGATCATATGAGGATGAGTATGAGATGGTTAAAGCACTGGACAGCGTTTCTTCCTTCTTCAATGGTGTGTGGGTGCATGTAAATTTCCTTGCTAAACTCANAGGGGCCACCCAATGTCCTGACCTTGTTCCCAAGTTCTTCTTTGCTGAGGAAGTCCAGAGGCAACACCAATTCGTGGTTGTGGGATTTGTCTGAATAATGCGATCTATTATCCTGCTGCTGGAGGGCACCGAGGCGACAGGAAGAATTCGTTTCATGCATTTGGTTCCCTTTGGTTTATGTTATGCACTATGGAGACTGTTGTTTCACGCAGTGGATTTATGTGTGGTTAAATTTCATGGTGTGTGAAACATGCNNATGAGAA-ATCAGTTTGGCTATGGATGTTTGTTTCGTGCAATGGATATATGTATCGTTAGAGTTAAGACGTTAAATTTGATGGTCTGGT]

[+] EMBL CA757066             [CTCAACTTGATCTTGCTCCGCAAGATGGGGATGGGGTGCACAAATATGCTGTCGCAGTCGCAGCTCTCGAAGATAAAGATGTTGGCGTCGCGGCCCGATATCTGCAAGAGGAACAGCCACCTGAAGCTCTGTTACAACCTCCGCAATCGCAATGTCTTCGTCCCCAACACCAACAAGCCACAGCTAGGCCCCCTCCACACCAACAAGCCACAGCTAGGCTCCCTCCAGTACAAGAAAGGGAAGGAACATGTGTATGATGTGTCAGGGCAGACCCCAACATGCGCAAAGGTTGCTCTCGAACACTATAACAGATCATATGAGGATGAGTATGAGATGGTTAAAGCACTGGACAGCGTTTCTTCCTTCTTCAATGGTGTGTGGGTGCATGTAAATTTCCTTGCTAAACTCANAGGGGCCACCCAATGTCCTGACCTTGTTCCCAAGTTCTTCTTTGCTGAGGAAGTCCAGAGGCAACACCAATTCGTGGTTGTGGGATTTGTCTGAATAATGCGATCTATTATCCTGCTGCTGGAGGGCACCGAGGCGACAGGAAGAATTCGTTTCATGCATTTGGTTCCCTTTGGTTTATGTTATGCACTATGGAGACTGTTGTTTCACGCAGTGGATTTATGTGTGGTTAAATTTCATGGTGTGTGAAACATGCNNATGAGAA ATCA                                                                             ]
[+] EMBL AK063031             [                                                                                                                  AGCCACCTGAAGCTCTGTTACAACCTCCGCAATCGCAATGTCTTCGTCCCCAACACCAACAAGCCACAGCTAGGCCCCCTCCACACCAACAAGCCACAGCTAGGCTCCCTCCAGTACAAGAAAGGGAAGGAACATGTGTATGATGTGTCAGGGCAGACCCCAACATGCGCAAAGGTTGCTCTCGAACACTATAACAGATCATATGAGGATGAGTATGAGATGGTTAAAGCACTGGACAGCGTTTCTTCCTTCTTCAATGGTGTGTGGGTGCATGTAAATTTCCTTGCTAAACTCAAAGGGGCCACCCAATGTCCTGACCTTGTTCCCAAGTTCTTCTTTGCTGAGGAAGTCCAGAGGCAACACCAATTCGTGGTTGTGGGATTTGTCTGAATAATGCGATCTATTATCCTGCTGCTGGAGGGCACCGAGGCGACAGGAAGAATTCGTTTCATGCATTTGGTTCCCTTTGGTTTATGTTATGCACTATGGAGACTGTTGTTTCACGCAGTGGATTTATGTGTGGTTAAATTTCATGGTGTGTGAAACATGC AATGAGAACATCAGTTTGGCTATGGATGTTTGTTTCGTGCAATGGATATATGTATCGTTAGAGTTAAGACGTTAAATTTGATGGTCTGGT]




>consensus_1661#0
CTCAACTTGATCTTGCTCCGCAAGATGGGGATGGGGTGCACAAATATGCTGTCGCAGTCG
CAGCTCTCGAAGATAAAGATGTTGGCGTCGCGGCCCGATATCTGCAAGAGGAACAGCCAC
CTGAAGCTCTGTTACAACCTCCGCAATCGCAATGTCTTCGTCCCCAACACCAACAAGCCA
CAGCTAGGCCCCCTCCACACCAACAAGCCACAGCTAGGCTCCCTCCAGTACAAGAAAGGG
AAGGAACATGTGTATGATGTGTCAGGGCAGACCCCAACATGCGCAAAGGTTGCTCTCGAA
CACTATAACAGATCATATGAGGATGAGTATGAGATGGTTAAAGCACTGGACAGCGTTTCT
TCCTTCTTCAATGGTGTGTGGGTGCATGTAAATTTCCTTGCTAAACTCANAGGGGCCACC
CAATGTCCTGACCTTGTTCCCAAGTTCTTCTTTGCTGAGGAAGTCCAGAGGCAACACCAA
TTCGTGGTTGTGGGATTTGTCTGAATAATGCGATCTATTATCCTGCTGCTGGAGGGCACC
GAGGCGACAGGAAGAATTCGTTTCATGCATTTGGTTCCCTTTGGTTTATGTTATGCACTA
TGGAGACTGTTGTTTCACGCAGTGGATTTATGTGTGGTTAAATTTCATGGTGTGTGAAAC
ATGCNNATGAGAAATCAGTTTGGCTATGGATGTTTGTTTCGTGCAATGGATATATGTATC
GTTAGAGTTAAGACGTTAAATTTGATGGTCTGGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case