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Oryza sativa
cluster # 1707 cluster # 1707       Sequences # 2       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1707#0 length = 2665 sequences # 1  
consensus_1707#1 length = 2422 sequences # 1  

consensusID : consensus_1707#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 2665
fasta sequence
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>consensus_1707#0 TCTTTCTCCTTGTTCCTATGAGTCCTGTAAATAATGAGTTGAGTCAGTTGGTTTGATATT GGAATTGAATTTATTCAATTGCTACTGCTATTTCTTTTTTAGATAGTGGAAAATTTAAGA ACTGCATACTAGTTTGAATGTGACTATTTGACTTGTAAACATGTATTCTTAAATAAGAAA GCATGTAAATAATTAAAATAGTTCTAAAATTAATCGTGCTATAACTATATGATCCAATTT ATATCTAGTACTATAAGTATTTGATTTTAAACTAGTTCATGATTCTTTTTCTATTGCGAC TAATTATATTTTGCAAGTTGATCAACCAAAATTGGATCAAAATTCTGGTAAGTCTCTAAA CTAATAAGTACTAGTATAATGCTAAAACACTTGTTCTAATCTAAAATAGTATCAATTACA ACAGGTCTATATTAAATTTACAGTGTAGTAAATATGTTATTCTATCAAAATACTACTGTA AATTATGTAAATAAGTAAACTTTATTCCCCACATAATAAACAGTAGAAGTATTGTGATCA CCTTTTTTGTTTGAATAGATGCTATCCATTCGAAGCAACTCTGTATTCTTTGAAATGTTT ATTTCCTCCAATCGACCTGTATTTTGAAATTTTGATGTATGATAATCCAAACAAAATTCT TAATAATGAAAAATGAACAATCAACTAAAACTATAGATTTGATGAGCTAATCTTGGAAAC ACAAATATGAATTACAATGTTTTTGGCAAACAGCGTGGTAGAAGAATGACCAGTAATTTT GTTTTGAAGTGAGCAACCTTGCACATTTTAATTATTTTCCCAAATGATGATAATTAACAT TTTTAGTAAACACATCAGTGTTTTGTGGGTTATCTGGTGAGAAATACTAACCTATAGTTA ACGTTTGTTTTCCCATAGCATTGTATCTTTCTGTGATATGTGAAAGTAAGTGTATTAGAG CTCTCTAGTTTTAACTTTAATATGTGGAATAAACTGAAATTGTCATTNTGATTCATGCAT TTGTTGTCTATGGTATTCAAGTTCTTATGCATTTGATGCATGTGTCTTCATACAACTATT GATTTTTCCCTCCTTGTTTCTTTCTTTCCTGCAAATAACGTATTGTAATTGTTAAAGTTG ACTTATATGATGCTTCTATCAAAATTATAGTGTTTTTTTCCTGTAATTGTATCACATATG TACTGTAATTGCATAACTTTTGAGTTTATACATTAGGATGAAAATCGAATGGTACTCTAT TGGTGCTATATTTGAAAAATAATATGGCAGATTCCTGAAATTAAAATTTGCATTAGTAAT CAGATTTTGCAGATCCCTGAAACTTTGTTGGCACCATCATGTTTTTGAAATAGAAGGGAT TATGAAGGGATTATATACCTCTAGTGAGATGTTATCAGATAAGCACTCAAGTTCTGATCC ATTGTTTGATAAAAATAGTACTTTATGTTTCTAAACAGATTTGAGATTCAATTATATATG ATAATATACATTAATTGTTCTTCTACTATTTTTGCATGAATAAATTTTTATTTACACCAT GCATACTGTATTTAAGTGTGAAACAGTTTGTATGAATGATCTACTTGTAAGTTTCTGAAC TTAATAGTTAAAAGATTGCTTTGATTCAAACATTGAATTGATTATGATTTCAAATCAAAT ATTTTATATTTGTGATCATCTGATTTATAAACTATGTTCATTTTTAATATAATTATGAAT TGATTTATAATTTGATGTATTGAAAAGTTATATGGAACTAAAGGTATACATTTACATTAA ATGCCACATGGTGCACAAATTCTAATATATTGGTTGTTTCAAATTTTAGATTTTGCATCA CTTACATAAAATTAGTACTGAAATTACAATATTTTTTATATGTAATTCATTATCAATTGG ACTATAGTTTGTTTGAATAATCTCTATTGATAATGTGCAAAATATACAGAGATGCATAAT GTGTTGTTTGGCATTCCAACACACGGTTACCATTCTGATTTCAGTATAAGATAATTTGAG TAGTTCATAGAATCTTTTTTTCCATATGTCTCCAGATGTTGTTTACCTGAGGTTGTTTCT TCCATTTTCTTTGATTTTGTTCCATATGGCTGGTTGGAAATTTTGTTCTGATTAGTGCTG CATTGTTTCTCTTGCAGGGAAGTTGATTTGAATTGGTGTCCTAAGAGGGAAGCCATGAAT GCGAAAAAGATAAGTACTGCACACTAACTTTTTGATATGTTAAGAGTTTTGAATTTTGTT GATATCGATACGTTACACTGACTAGTTCGTTGAAATTATCTAAAAAAAATGTAAGGTAAA ATTATCATGACATTACAACAATTCTGAATTTTTTAGGTCTAGTTCTATTTCTAAAATGAC TTTTTTTGATATTCAGGTTTGCATTTATCTGCCTGATGTGAGGCCACTTTTTTTTATAGA GAATACTTCCTGATCTGTATGTTTGAAACTTTATCAATTTACTTCCATGTTACTTCTGAA ATTTAACTCTAGATATAGTATTGTGTTAAATAATGAACTGAGTTAGTAGTTTGTGTTAGT TACAGGAATTTACTATTGAAATTTCACCTTTTTTGTGTAATTTTTTAACTAAATAACTGT AATATCTTACCTGATCAGTTTCTGT



consensusID : consensus_1707#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
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fasta sequence
                              [AGAGAGAGTGAGAGCATACAGGGCGAGAAAATTTCTTGCTCTCATCGTCCCACGCGATGCGGCGATTGTGGAAGGCGACACAACATCGATTCGCCGTGGTGGGTTTTTGACGCTGATTTGTGGGAGTCATCGACGATTCGTTGGCAATATCGTTCTTCCTTTCTCCGGGAAGTTGATTTGAATTGGTGTCCTAAGAGGGAAGCCATGAATGCGAAAAAGATAAGTACTGCACACTAACTTTTTGATATGTTAAGAGTTTTGAATTTTGTTGATATCGATACGTTACACTGACTAGTTCGTTGAAATTATCTAAAAAAAATGTAAGGTAAAATTATCATGACATTACAACAATTCTGAATTTTTTAGGTCTAGTTCTATTTCTAAAATGACTTTTTTTGATATTCAGGTTTGCATTTATCTGCCTGATGTGAGGCCACTTTTTTTTATAGAGAATACTTCCTGATCTGTATGTTTGAAACTTTATCAATTTACTTCCATGTTACTTCTGAAATTTAACTCTAGATATAGTATTGTGTTAAATAATGAACTGAGTTAGTAGTTTGTGTTAGTTACAGGAATTTACTATTGAAATTTCACCTTTTTTGTGTAATTTTTTAACTAAATAACTGTAATATCTTACCTGATCAGTTTCTGTTTTTGAATTGAAACTGTGTAACTTAAATTTGTTCTATCAATCTGTGAAACATGTATGATGGATTGAGATCACTTCACATGGTAGATTTCAGATGATTGATTTGTTTTCTATACAGAATTTTACACAGTCAGATTAATAAATGCAGAAGTAAACATGATCTTTTATCTCCTTTTACTTTATACTGATGTCTTTAACATTGTCTATTTGGAAATTGTCCACAATAACTAGAGTTCAGGTATATATTAGGGCCTATTGATGTATTTAGGTTTAAGTTTATTTCTGAAGTGACTTTTTCTGATATTTAGATTTTGTTTTTATCTGCCTTATTTGAGACAATGAACTCTAGATGTAGTACTGTGTTAAATGATGAACTGAGTTAGTAATTTGTGTCAGTTACAGGAATGTACTATTGAAATTACAAAATTTTTTTGGTGTAATTCTTTAACTAAAAAAACTGTAATATATTTGCAAACATGTAAAACAGTTCATAGTTTGCTATAATGAATGTTTTTTTGCTTTTTTGTAAGTATGTTACTCTTTTAATATTTTTGTTTGTAACTTTGAATAATTGACTTTGCTGTCCTTGGCTACTTTTGTGTGTTCTTCTTGATCTTGTCCAGTTTGTTTGTTTGTATGTAAATTAGAGGACTTGTTTCTTGAAAATGAAAATGAAAATGGTGGCTAATATCTTCACTAGGAGAAATATGATGTGCATTTTTTATTCTTTTTTATGTCACCAAGTTAAATGCATGGTTTGAAATTAGTATGCATGTGTACTTTATCATTTTGCACTATAAATACTATATCTATTACTATTACTATAGTGCATTAATTCATCAATTACAGTAATTTATTACTGAAATTACACTCTTTCTTTTGTTGTAATTCCTTAACTAAATAACTGTAATATGTTTTGAAACATGTAAAATAATACATAGTTAACTGTAATGGATGCATTTTTTTAATTTGGAATGAAGGTGTTGAACCAGAGAATGAAATTAATGATGATGTTAATGAAGCTGTTCAAGATAATGATAATTTTACATCATCTCCAATGGTATAATTTTTTAACTCACTTTTTTATTAATTACATCATCTCCAATGGTATAATTACAATGTAATTTTGTACAATGTGTGTATTTGAATAGTTTTATGCTTCAGTTGTATAATAGCTGAAAACCTTGAAATTGTTAGGGTGTACAGTGTGTGCATTTGAACAGTTTTATGTAATCTGCAAATGGTTAAATAGGGTTTTCTAATTGAAAGATTGATTATGGTGACAATTTGCATTGCTACCTAATTTGTGTTGATGACAAGAATGTGCAATTCTTGCTAGACCAGGTAGAAATATAATTGATGTTCTGAATTTTTATGATTGATGACAGTTACTAATTCTATTGAAGCATTCAGGGTGTTTTTGAGGCTATAATTTTGCAAATGCTATATGCTATGTGCAATTTAGTTAGGTATTTTTAATCTTTCAGTGACAATCTTGCATGAGTAAAGAACAAAAGTTATTGACGATTTCAAAATGAGTCATAGAGGCTGATTTCCTGATGCTCGTAGATATTTTTCATATTAGTTTCAAATTGATTTTAGATTGTTACATGACTAAGACAGGCTGACTTTTACTAAGTTTCAGATTGTTCTCTGTATTTCAATTTACAGTACAAACATATTGCAGTTACAGTTTAATAGTACTGTAATTCTATTAGAAATTTACTGTAATTTTTGAATTTGTCCTGTTAATTCAAAGAATTAAGCATT]

[+] EMBL AK100048             [AGAGAGAGTGAGAGCATACAGGGCGAGAAAATTTCTTGCTCTCATCGTCCCACGCGATGCGGCGATTGTGGAAGGCGACACAACATCGATTCGCCGTGGTGGGTTTTTGACGCTGATTTGTGGGAGTCATCGACGATTCGTTGGCAATATCGTTCTTCCTTTCTCCGGGAAGTTGATTTGAATTGGTGTCCTAAGAGGGAAGCCATGAATGCGAAAAAGATAAGTACTGCACACTAACTTTTTGATATGTTAAGAGTTTTGAATTTTGTTGATATCGATACGTTACACTGACTAGTTCGTTGAAATTATCTAAAAAAAATGTAAGGTAAAATTATCATGACATTACAACAATTCTGAATTTTTTAGGTCTAGTTCTATTTCTAAAATGACTTTTTTTGATATTCAGGTTTGCATTTATCTGCCTGATGTGAGGCCACTTTTTTTTATAGAGAATACTTCCTGATCTGTATGTTTGAAACTTTATCAATTTACTTCCATGTTACTTCTGAAATTTAACTCTAGATATAGTATTGTGTTAAATAATGAACTGAGTTAGTAGTTTGTGTTAGTTACAGGAATTTACTATTGAAATTTCACCTTTTTTGTGTAATTTTTTAACTAAATAACTGTAATATCTTACCTGATCAGTTTCTGTTTTTGAATTGAAACTGTGTAACTTAAATTTGTTCTATCAATCTGTGAAACATGTATGATGGATTGAGATCACTTCACATGGTAGATTTCAGATGATTGATTTGTTTTCTATACAGAATTTTACACAGTCAGATTAATAAATGCAGAAGTAAACATGATCTTTTATCTCCTTTTACTTTATACTGATGTCTTTAACATTGTCTATTTGGAAATTGTCCACAATAACTAGAGTTCAGGTATATATTAGGGCCTATTGATGTATTTAGGTTTAAGTTTATTTCTGAAGTGACTTTTTCTGATATTTAGATTTTGTTTTTATCTGCCTTATTTGAGACAATGAACTCTAGATGTAGTACTGTGTTAAATGATGAACTGAGTTAGTAATTTGTGTCAGTTACAGGAATGTACTATTGAAATTACAAAATTTTTTTGGTGTAATTCTTTAACTAAAAAAACTGTAATATATTTGCAAACATGTAAAACAGTTCATAGTTTGCTATAATGAATGTTTTTTTGCTTTTTTGTAAGTATGTTACTCTTTTAATATTTTTGTTTGTAACTTTGAATAATTGACTTTGCTGTCCTTGGCTACTTTTGTGTGTTCTTCTTGATCTTGTCCAGTTTGTTTGTTTGTATGTAAATTAGAGGACTTGTTTCTTGAAAATGAAAATGAAAATGGTGGCTAATATCTTCACTAGGAGAAATATGATGTGCATTTTTTATTCTTTTTTATGTCACCAAGTTAAATGCATGGTTTGAAATTAGTATGCATGTGTACTTTATCATTTTGCACTATAAATACTATATCTATTACTATTACTATAGTGCATTAATTCATCAATTACAGTAATTTATTACTGAAATTACACTCTTTCTTTTGTTGTAATTCCTTAACTAAATAACTGTAATATGTTTTGAAACATGTAAAATAATACATAGTTAACTGTAATGGATGCATTTTTTTAATTTGGAATGAAGGTGTTGAACCAGAGAATGAAATTAATGATGATGTTAATGAAGCTGTTCAAGATAATGATAATTTTACATCATCTCCAATGGTATAATTTTTTAACTCACTTTTTTATTAATTACATCATCTCCAATGGTATAATTACAATGTAATTTTGTACAATGTGTGTATTTGAATAGTTTTATGCTTCAGTTGTATAATAGCTGAAAACCTTGAAATTGTTAGGGTGTACAGTGTGTGCATTTGAACAGTTTTATGTAATCTGCAAATGGTTAAATAGGGTTTTCTAATTGAAAGATTGATTATGGTGACAATTTGCATTGCTACCTAATTTGTGTTGATGACAAGAATGTGCAATTCTTGCTAGACCAGGTAGAAATATAATTGATGTTCTGAATTTTTATGATTGATGACAGTTACTAATTCTATTGAAGCATTCAGGGTGTTTTTGAGGCTATAATTTTGCAAATGCTATATGCTATGTGCAATTTAGTTAGGTATTTTTAATCTTTCAGTGACAATCTTGCATGAGTAAAGAACAAAAGTTATTGACGATTTCAAAATGAGTCATAGAGGCTGATTTCCTGATGCTCGTAGATATTTTTCATATTAGTTTCAAATTGATTTTAGATTGTTACATGACTAAGACAGGCTGACTTTTACTAAGTTTCAGATTGTTCTCTGTATTTCAATTTACAGTACAAACATATTGCAGTTACAGTTTAATAGTACTGTAATTCTATTAGAAATTTACTGTAATTTTTGAATTTGTCCTGTTAATTCAAAGAATTAAGCATT]


>consensus_1707#1 AGAGAGAGTGAGAGCATACAGGGCGAGAAAATTTCTTGCTCTCATCGTCCCACGCGATGC GGCGATTGTGGAAGGCGACACAACATCGATTCGCCGTGGTGGGTTTTTGACGCTGATTTG TGGGAGTCATCGACGATTCGTTGGCAATATCGTTCTTCCTTTCTCCGGGAAGTTGATTTG AATTGGTGTCCTAAGAGGGAAGCCATGAATGCGAAAAAGATAAGTACTGCACACTAACTT TTTGATATGTTAAGAGTTTTGAATTTTGTTGATATCGATACGTTACACTGACTAGTTCGT TGAAATTATCTAAAAAAAATGTAAGGTAAAATTATCATGACATTACAACAATTCTGAATT TTTTAGGTCTAGTTCTATTTCTAAAATGACTTTTTTTGATATTCAGGTTTGCATTTATCT GCCTGATGTGAGGCCACTTTTTTTTATAGAGAATACTTCCTGATCTGTATGTTTGAAACT TTATCAATTTACTTCCATGTTACTTCTGAAATTTAACTCTAGATATAGTATTGTGTTAAA TAATGAACTGAGTTAGTAGTTTGTGTTAGTTACAGGAATTTACTATTGAAATTTCACCTT TTTTGTGTAATTTTTTAACTAAATAACTGTAATATCTTACCTGATCAGTTTCTGTTTTTG AATTGAAACTGTGTAACTTAAATTTGTTCTATCAATCTGTGAAACATGTATGATGGATTG AGATCACTTCACATGGTAGATTTCAGATGATTGATTTGTTTTCTATACAGAATTTTACAC AGTCAGATTAATAAATGCAGAAGTAAACATGATCTTTTATCTCCTTTTACTTTATACTGA TGTCTTTAACATTGTCTATTTGGAAATTGTCCACAATAACTAGAGTTCAGGTATATATTA GGGCCTATTGATGTATTTAGGTTTAAGTTTATTTCTGAAGTGACTTTTTCTGATATTTAG ATTTTGTTTTTATCTGCCTTATTTGAGACAATGAACTCTAGATGTAGTACTGTGTTAAAT GATGAACTGAGTTAGTAATTTGTGTCAGTTACAGGAATGTACTATTGAAATTACAAAATT TTTTTGGTGTAATTCTTTAACTAAAAAAACTGTAATATATTTGCAAACATGTAAAACAGT TCATAGTTTGCTATAATGAATGTTTTTTTGCTTTTTTGTAAGTATGTTACTCTTTTAATA TTTTTGTTTGTAACTTTGAATAATTGACTTTGCTGTCCTTGGCTACTTTTGTGTGTTCTT CTTGATCTTGTCCAGTTTGTTTGTTTGTATGTAAATTAGAGGACTTGTTTCTTGAAAATG AAAATGAAAATGGTGGCTAATATCTTCACTAGGAGAAATATGATGTGCATTTTTTATTCT TTTTTATGTCACCAAGTTAAATGCATGGTTTGAAATTAGTATGCATGTGTACTTTATCAT TTTGCACTATAAATACTATATCTATTACTATTACTATAGTGCATTAATTCATCAATTACA GTAATTTATTACTGAAATTACACTCTTTCTTTTGTTGTAATTCCTTAACTAAATAACTGT AATATGTTTTGAAACATGTAAAATAATACATAGTTAACTGTAATGGATGCATTTTTTTAA TTTGGAATGAAGGTGTTGAACCAGAGAATGAAATTAATGATGATGTTAATGAAGCTGTTC AAGATAATGATAATTTTACATCATCTCCAATGGTATAATTTTTTAACTCACTTTTTTATT AATTACATCATCTCCAATGGTATAATTACAATGTAATTTTGTACAATGTGTGTATTTGAA TAGTTTTATGCTTCAGTTGTATAATAGCTGAAAACCTTGAAATTGTTAGGGTGTACAGTG TGTGCATTTGAACAGTTTTATGTAATCTGCAAATGGTTAAATAGGGTTTTCTAATTGAAA GATTGATTATGGTGACAATTTGCATTGCTACCTAATTTGTGTTGATGACAAGAATGTGCA ATTCTTGCTAGACCAGGTAGAAATATAATTGATGTTCTGAATTTTTATGATTGATGACAG TTACTAATTCTATTGAAGCATTCAGGGTGTTTTTGAGGCTATAATTTTGCAAATGCTATA TGCTATGTGCAATTTAGTTAGGTATTTTTAATCTTTCAGTGACAATCTTGCATGAGTAAA GAACAAAAGTTATTGACGATTTCAAAATGAGTCATAGAGGCTGATTTCCTGATGCTCGTA GATATTTTTCATATTAGTTTCAAATTGATTTTAGATTGTTACATGACTAAGACAGGCTGA CTTTTACTAAGTTTCAGATTGTTCTCTGTATTTCAATTTACAGTACAAACATATTGCAGT TACAGTTTAATAGTACTGTAATTCTATTAGAAATTTACTGTAATTTTTGAATTTGTCCTG TTAATTCAAAGAATTAAGCATT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_1707#0      TCTTTCTCCTTGTTCCTATGAGTCCTGTAAATAATGAGTTGAGTCAGTTGGTTTGATATT 60
consensus_1707#1      ----------AGAGAGAGTGAGAGC-ATACAGGGCGAGA-AAATTTCTTGCTCTCATCGT 48
                                 *      ****  *  ** *    ***   * *   *** * * **  *

consensus_1707#0      GGAATTGAATTTATTCAATTGCTACTGCTATTTCTTTTTTAGATAGTGGAAAATTTAAGA 120
consensus_1707#1      CCCACGCGATGCGG-CGATTGTGGAAGGCGACACAACATCGATTCGCCGTGG---TGGGT 104
                         *    **     * ****     *      *    *    * *  *      *  * 

consensus_1707#0      ACTGCATACTAGTTTGAATGTGAC-TATTTGACTTGTAAACATGTATTCTTAAATAAGAA 179
consensus_1707#1      TTTTGACGCTGATTTGTGGGAGTCATCGACGATTCGTTGGCA-ATATCGTTCTTCCTTTC 163
                        *  *  **  ****   * * * *    ** * **   **  ***  **         

consensus_1707#0      AGCATGTAAATAATTAAAATAGTTCTAAAATTAATCGTGCTATAACTATATGATCCAATT 239
consensus_1707#1      TCCGGGAAGTTGATTTGAATTGGTGTCCTAAGAGGGAAGCCATGAATGCGAAA---AAGA 220
                        *  * *  * ***  *** * * *   *  *     ** ** * *     *   **  

consensus_1707#0      TATATCTAGTACTATAAGTATTTGATTTTAAACTAGTTCATGATTCTTTTTCTATTGCGA 299
consensus_1707#1      TAAGTACTGCACACTAACTTTTTGATATGTTAAGAGTTTTGAATTTTGTTGATAT--CGA 278
                      **  *   * **  *** * ****** *   *  ****    *** * **  ***  ***

consensus_1707#0      CTAATTATATTTTGCAAGTTGATCAACCAAAATTGGATCAAAATTCTGGTAAGTCTCTAA 359
consensus_1707#1      TACGTTACACTG-ACTAGTTCGTTGAAATTATCTAAAAAAAATGTAAGGTAAAATTATCA 337
                          *** * *   * ****  *  *    *  *  *  ***  *  *****   * * *

consensus_1707#0      ACTAATAAGTACTAGTAT-AATGCTAAAACACTTGTTCTAAT-CTAAAATAGTATCAATT 417
consensus_1707#1      TGACATTACAACAATTCTGAATTTTTTAGGTCTAGTTCTATTTCTAAAATGACTTTTTTT 397
                          ** *  ** * * * ***  *  *   ** ****** * *******    *   **

consensus_1707#0      ACAA--CAGGTCTATATTAAATTTACAGTGTAGTAAATATGTTATTCTATCAA-AATACT 474
consensus_1707#1      GATATTCAGGTTTGCATTTATCTGCCTGATGTGAGGCCACTTTTTTTTATAGAGAATACT 457
                         *  ***** *  *** *  *  * *    *     *  ** ** ***  * ******

consensus_1707#0      ACTGTAAAT-TATGTAAATAAGTAAACTTTATTCCCCACATAATAAACAGTAGAAGTA-T 532
consensus_1707#1      TCCTGATCTGTATGTTTGAAACTTTATCAATTTACTTCCATGTTACTTCTGAAATTTAAC 517
                       *   *  * *****    ** *  *     ** *   ***  **      * *  **  

consensus_1707#0      TGTGATCACCTTTTTTGTTTGAATAGATGCTATCCATTCGAAGCAACTCTGTATTCTTTG 592
consensus_1707#1      TCTAGATATAGTATTGTGTTAAATA-ATGAACTGAGTTAGTAG----TTTGTGTTAGTTA 572
                      * *    *   * **   ** **** ***   *   ** * **    * *** **  ** 

consensus_1707#0      -AAATGTTTATTTCCTCCAATCGACCTGTATTTTGAAATTTTGATGTATGATAATCCAAA 651
consensus_1707#1      CAGGAATTTACTATTGAAATTTCACCTTTTTTGTGTAATTTTTTAACTAAATAACTGTAA 632
                       *    **** *      * *  **** * ** ** ******        ****    **

consensus_1707#0      CAAAATTCTTAAT-AATGAAAAATGAACAATC--AACTAAA-ACTATAGATTTGATGAGC 707
consensus_1707#1      TATCTTACCTGATCAGTTTCTGTTTTTGAATTGAAACTGTGTAACTTAAATTTGTTCTAT 692
                       *   * * * ** * *      *    ***   ****    *   ** ***** *    

consensus_1707#0      TAATCTTGGAAACACAAAT-ATGAATTACAATGTTTTTGGCAAACAGCGTGGTAGAAGAA 766
consensus_1707#1      CAATCTGTGAAACATGTATGATGGATTGAGATCACTTCA--------CATGGTAGATTTC 744
                       *****  ******   ** *** ***   **   **          * *******    

consensus_1707#0      TGACCAGTAATTTTGTTTTGAAGTGAGCAACCTTGCACATTTTAATTATTTTCCCAAATG 826
consensus_1707#1      AGATGATTGATTTGTTTTCTA--TACAGAATTTTACACAGTCAGATTAAT-----AAATG 797
                       **  * * ****  ***  *  *    **  ** **** *   **** *     *****

consensus_1707#0      ATGATAATTAACATTTTTAGTAAACACATCAGTGTTTTGTGGGTTATCTGGTGAGAAATA 886
consensus_1707#1      CAGA-AGTAAACATGATCTTTTATCTCCTTT-TACTTTATA------CTGATGTCTT-TA 848
                        ** * * *****  *   * * * * *   *  *** *       *** **     **

consensus_1707#0      CTAACCTATAGTTAACGTTTGTTTTCCCATAGCATTGTATCTTTCTGTGATATGTGAAAG 946
consensus_1707#1      ACATTGTCTATTTGGAAATTGT----CCACAATAAC-TAGAGTTCAGGTATATATTAGGG 903
                        *   * ** **     ****    *** *  *   **   *** *  **** * *  *

consensus_1707#0      TAAGTGTATTAGAGCTCTCTAGTTTTAACTTTAATATGTGGAATAAACTGAAATTGTCAT 1006
consensus_1707#1      C----CTATT-GATGTATTTAGGTTTAAGTTTA-TTTCTGAAGTGA-CTTTTTCTGATAT 956
                            **** **  * * *** ***** **** * * ** * * * **     **  **

consensus_1707#0      TNTGATTCATGCATTTGTTGTCTATGGTATTCAAGTTCTTATGCATTTGATGCATGTGTC 1066
consensus_1707#1      TTAGATTT---TGTTT-TTATCTGCCTTATTTGAGACAATGAACTCTAGATGTA-GTA-C 1010
                      *  ****      *** ** ***    ****  **    *   *  * **** * **  *

consensus_1707#0      TTCATACAACTATTGATTTTTCCCTCCTTGTTTCTTTCTTTCCTGCAAATAACGTATTGT 1126
consensus_1707#1      TGTGTTAAATGATGAACTGAG--TTAGTAATTTGTGTCAGTTACAGGAATGTACTATTGA 1068
                      *   *  **  **  * *      *  *  *** * **  *      ***    ***** 

consensus_1707#0      AATTGTTAAAGTTGACTTATATGATGCTTCTATCAAAATTATAGTGTTTTTTTCCTGTAA 1186
consensus_1707#1      AATTACAAAATTTTTTTGGTGTAATTCTTTAACTAAAAAAACTGTAATATATT--TGCAA 1126
                      ****   *** **   *  * * ** ***  *  ****  *  **  * * **  ** **

consensus_1707#0      TTGTATCACATATGTACTGTAATTGCATAACTTTTGAGTTTATACATTAGGATGAAAATC 1246
consensus_1707#1      ACATGTAAAACAGTTCATAGTTTGCTATAATGAATGTTTTTTTGCTTTTTTGTAA----- 1181
                         * * * * *  *  *    *   ****    **  *** * * **    * *     

consensus_1707#0      GAATGGTACTCTATTGGTGCTATATTTGAAAAATAATATGGCAGATTCCTGAAATTAAAA 1306
consensus_1707#1      GTATGTTACTCTTTTAA---TATTTTTGT---------TTGTAACTTTGAATAATTGAC- 1228
                      * *** ****** **     *** ****          * * *  **     **** *  

consensus_1707#0      TTTGCATTAGTAATCAGATTTTGCAGATCCCTGAAACTTTGTTGGCACCATCATGTTTTT 1366
consensus_1707#1      TTTGCTGTCCTTGGCTACTTTTGTGTGTTC--------TTCTTGATCTTGTCCAGTTTGT 1280
                      *****  *  *   *   *****    * *        ** ***      **  **** *

consensus_1707#0      GAAATAGAAGGGATTATGAAGGGATTATATACCTCTAGTGAGATGTTATCAGATAAGCAC 1426
consensus_1707#1      TTGTTTGTATGTAAATTAGAGGACTTGTTTCTTGAAAATGAAA----ATGAAAATGGTGG 1336
                          * * * * *   *  ***  ** * *      * *** *    ** * *   *   

consensus_1707#0      TCAAGTTCTGATCCATTGTTTGATAAAAATAGTACTTTATGTTTCTAAACAGATTTGAGA 1486
consensus_1707#1      CTAATATCT----------TCACTAGGAGAAATATGATGTGC----------ATTTTTTA 1376
                        **  ***          *   **  *  * **   * **           ****   *

consensus_1707#0      TTCAATTATATATGATAATATACATTAATTGTTCTTCTACTATTTTTGCATGAATAAATT 1546
consensus_1707#1      TTCTTTTTTATGTCACCAAGTTAAATGCATGGTTTGAAATTAGTAT-GCATGTGTACTTT 1435
                      ***  ** *** * *  *  *  * *   ** * *   * ** * * *****  **  **

consensus_1707#0      TTTATTT-ACACCATGCATACTGTATTTAAGTGTGAAACAGTTTGTATGAATGATCTACT 1605
consensus_1707#1      ATCATTTTGCACTATAAATACTATATCTAT------TACTATTACTATAGTGCATTAATT 1489
                       * ****  *** **  ***** *** **        **  **  ***     **  * *

consensus_1707#0      TGTAAGTTTCTGAACTTAATAGTTAAAAGATTGCTTTGATTCAAACATTGAATTGATTAT 1665
consensus_1707#1      CATCAATTACAGTAATTTATTACTGAAA--TTACACTCTTTCTTTTGTTG---TAATTCC 1544
                        * * ** * * * ** **   * ***  ** *  *  ***     ***   * ***  

consensus_1707#0      GATTTCAAATCAAATATTTTATATTTGTGATCATCTGATTTATAAACTATGTTCATTTTT 1725
consensus_1707#1      TTAACTAAAT-AACTGTAATATGTTTTGAAACATGTAAA--ATAATACATAGTTAACTGT 1601
                            **** ** * *  *** ***   * *** * *   ****   **  * *  * *

consensus_1707#0      AATATAATTATGAATTGATTTATAATTTGATGTATTGAAAAGTTATATGGAACTAAAGGT 1785
consensus_1707#1      AATGGATGCATTTTTTTAATTTGGAATGAAGGTGTTGAACCAGAGAATGAAATTAATGAT 1661
                      ***  *   **   ** * **   * *  * ** *****       *** ** *** * *

consensus_1707#0      ATACATTTACATTAAATGCCACATGGTGCACAAATTCTAATATATTGGTTGTTTCAAATT 1845
consensus_1707#1      G---ATGTTAATGAAGCTGTTCAAGAT-----AATGATAATTT-TACATCATCTCCAATG 1712
                          ** *  ** **      ** * *     ***  **** * *   *  * ** *** 

consensus_1707#0      TTAGATTTTGCATCACTTACATAAAATTAGTACTGAAATTACAATATTTTTTATA-TGTA 1904
consensus_1707#1      GTATAATTT------TTTAACTCACTTTTTTATT--AATTACATCATCTCCAATGGTATA 1764
                       ** * ***       ***  * *  **  ** *  *******  ** *   **  * **

consensus_1707#0      ATT-CATTATCAATTGG-ACTATA-GTTTGTTTGAATAATCTCTATTGATAATGTGCAAA 1961
consensus_1707#1      ATTACAATGTAATTTTGTACAATGTGTGTATTTGAATAGT-TTTATGCTTCAGTTGTATA 1823
                      *** ** * * * ** * ** **  ** * ******** * * ***   * *  ** * *

consensus_1707#0      ATATACAGAGATGCATAATGTGTTGTTTGGCATTCCAACACACGGTTACCATTCTGATTT 2021
consensus_1707#1      ATAGCTGAAAACCTTGAA---ATTGTTAGGGTGTACAGTGTGTG-----CATTTGAA--- 1872
                      ***     * *     **    ***** **   * **      *     ****   *   

consensus_1707#0      CAGTATAAGATAATTTGAGTAGTTCATAGAATCTTTTTTTCCATATGTCTCCAGATGTTG 2081
consensus_1707#1      CAGTTTTATGTAATCT--GCAAATGGTTAAATAGGGTTTTCTAATTG-----AAAGATTG 1925
                      **** * *  **** *  * *  *  *  ***    ***** *  **     * *  ***

consensus_1707#0      TTTACCTGAGGTTGTTTCTTCCATTTTCTTTGATTTTGT-TCCATATGGCTGGTTGGAAA 2140
consensus_1707#1      ATTAT----GGTGACAATTTGCATTGCTACCTAATTTGTGTTGATGACAAGAATGTGCAA 1981
                       ***     ***      ** ****       * ***** *  **        *  * **

consensus_1707#0      TTTTGTTCTGATTAGTGCTGCATTGTTTCTCTTGCAGGGAAGTTGATTTGAATTGGTGTC 2200
consensus_1707#1      TTCTTGCTAGACCAG-GTAGAAATATAATTGATGTTCTGAATTT--TTATGATTGATGAC 2038
                      ** *     **  ** *  * * * *   *  **    *** **  **   **** ** *

consensus_1707#0      CTAAGAGGGAAGCCATGAATGCGAAAAAGATAAGTACTGCACACTAACTTTTTGATATGT 2260
consensus_1707#1      A-GTTACTAATTCTATTGAAGCATTCAGGGTGTTTTTGAGGCTATAATTTTGCAA-ATGC 2096
                           *   *  * **  * **    * * *   *      *  *** ***   * *** 

consensus_1707#0      TAAGAGTTTTG---AATTTTGTT-GATATCGATA-CGTTACACTGACTAGTTCGTTGAAA 2315
consensus_1707#1      TATATGCTATGTGCAATTTAGTTAGGTATTTTTAATCTTTCAGTGACAATCTTGCATGAG 2156
                      **   * * **   ***** *** * ***   **   ** ** **** *  * *    * 

consensus_1707#0      TTATCTAAAAAAAATGTAAGGTAAAATTATCATGACATTACAACAATTCTGAATTTTTTA 2375
consensus_1707#1      TAA---AGAACAAAAGTTATTGACGATT-TCAAAATGAGTCATAGAGGCTGATTTCCTGA 2212
                      * *   * ** *** ** *   *  *** ***  *     **   *  **** **  * *

consensus_1707#0      GGTCTAGTTCTATTTCTAAAATGACTTTTTTTGATATTCAGGTTTGCATTTATCTGCCTG 2435
consensus_1707#1      TGCTCGTAGATATTTTTCATATTAGTTTCAAATTGATTTTAGATTG---TTACATGACTA 2269
                       *        ***** * * ** * ***       ***   * ***   ***  ** ** 

consensus_1707#0      ATGTGAGGCCACTTTTTTTTATAGAGAATACTTCCTGATCTGTATGTTTGAAACTTTATC 2495
consensus_1707#1      AGACAGGCTGACTTTTACT-----AAGTTTCAGATTGTTCTCTGTATTTCAA--TTTACA 2322
                      *     *   ******  *     *   * *    ** *** * * *** **  ****  

consensus_1707#0      AATTTACTTCCATGTTACTTCTGAAATTTAACTCTAGATATAGTATTGTGTTAAAT--AA 2553
consensus_1707#1      G---TACAAACATATTGCAGTTACAGTTTAATAGTAC-TGTAATTCTATTAGAAATTTAC 2378
                          ***   *** ** *   *  * *****   **  * ** *  * *   ****  * 

consensus_1707#0      TGAACTGAGTTAGTAGTTTGTGTTAGTTACAGGAATTTACTATTGAAATTTCACCTTTTT 2613
consensus_1707#1      TGTAATTTTTGAATTTGTCCTGTTAATTCAAAGAATTAAGCATT---------------- 2422
                      ** * *   * * *   *  ***** **  * ***** *  ***                

consensus_1707#0      TGTGTAATTTTTTAACTAAATAACTGTAATATCTTACCTGATCAGTTTCTGT 2665
consensus_1707#1      ----------------------------------------------------
                                                                          




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)