cluster # 174

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Oryza sativa
cluster # 174 cluster # 174 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_174#0 length = 596 sequences # 2

consensusID : consensus_174#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 596
fasta sequence

                              [CTTTGGAGCTTGGCCCCTACCTACTCAGGACAAGCGTGTAGATGCAGGCGTGAATAGCCTTTGCCTGTGCTCCCATGTCAATCAAGTGTTCTGTGCTAGATTGGTCCCAGAGATGGTGCCTCTCTGGTGCTAATTTCTCTTGAGGGTGTTTCTGGTTTGGATTACTGAGTTAATGACGCCATGGCTGGGCAGAGTAGGATGAGGTTTCTTGCTTCTTCCTCTCTTGAGTTTGTTCTTGGGTAATTAATCCTTTTCCTGGGAGCAACTTGTGAGTTGTGACTGTTTCTTGGTTTCCTCCGCCTTGGTTTTACCCCCTTTTTTTGCGTTTTTTCGAGGCATCGATTTCTGAGCCGGATAAGTAGTTGAGCTGCTGGTGGCTGAATTATTAACAGTCCAATTAATTGCTGACATCCCAAGATGGGCAGTTCTTGATAACCCCAGTAATTTAATCGCTCGGTTTAGTAGCTCTGGTTTCAATTGCTCCCACATGGAGTAACAATTCATTAGTTAGAGGGATTTAGAGCTGAAACTTCTTCTCAAAATCGCAGTTCTTGGTTGTTGATTTCCCTCTGTTCATCGTGGAAACGTGTTAAGCT]

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[+] EMBL CB638474             [CTTTGGAGCTTGGCCCCTACCTACTCAGGACAAGCGTGTAGATGCAGGCGTGAATAGCCTTTGCCTGTGCTCCCATGTCAATCAAGTGTTCTGTGCTAGATTGGTCCCAGAGATGGTGCCTCTCTGGTGCTAATTTCTCTTGAGGGTGTTTCTGGTTTGGATTACTGAGTTAATGACGCCATGGCTGGGCAGAGTAGGATGAGGTTTCTTGCTTCTTCCTCTCTTGAGTTTGTTCTTGGGTAATTAATCCTTTTCCTGGGAGCAACTTGTGAGTTGTGACTGTTTCTTGGTTTCCTCCGCCTTGGTTTTACCCCCTTTTTTTGCGTTTTTTCGAGGCATCGATTTCTGAGCCGGATAAGTAGTTGAGCTGCTGGTGGCTGAATTATTAACAGTCCAATTAATTGCTGACATCCCAAGATGGGCAGTTCTTGATAACCCCAGTAATTTAATCGCTCGGTTTAGTAGCTCTGGTTTCAATTGC                                                                                                                   ]




>consensus_174#0
CTTTGGAGCTTGGCCCCTACCTACTCAGGACAAGCGTGTAGATGCAGGCGTGAATAGCCT
TTGCCTGTGCTCCCATGTCAATCAAGTGTTCTGTGCTAGATTGGTCCCAGAGATGGTGCC
TCTCTGGTGCTAATTTCTCTTGAGGGTGTTTCTGGTTTGGATTACTGAGTTAATGACGCC
ATGGCTGGGCAGAGTAGGATGAGGTTTCTTGCTTCTTCCTCTCTTGAGTTTGTTCTTGGG
TAATTAATCCTTTTCCTGGGAGCAACTTGTGAGTTGTGACTGTTTCTTGGTTTCCTCCGC
CTTGGTTTTACCCCCTTTTTTTGCGTTTTTTCGAGGCATCGATTTCTGAGCCGGATAAGT
AGTTGAGCTGCTGGTGGCTGAATTATTAACAGTCCAATTAATTGCTGACATCCCAAGATG
GGCAGTTCTTGATAACCCCAGTAATTTAATCGCTCGGTTTAGTAGCTCTGGTTTCAATTG
CTCCCACATGGAGTAACAATTCATTAGTTAGAGGGATTTAGAGCTGAAACTTCTTCTCAA
AATCGCAGTTCTTGGTTGTTGATTTCCCTCTGTTCATCGTGGAAACGTGTTAAGCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case