cluster # 1788

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Oryza sativa
cluster # 1788 cluster # 1788 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1788#0 length = 503 sequences # 2

consensusID : consensus_1788#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 503
fasta sequence

                              [ACCCAACCTCCGGCGCCCGGCGGCGTCGCGCAACCGCTCGGCATGCCGCCGCCCGCCCCCGCCCCCGCCACGCTCGCCTCCCTCAGCGCGCTCGTCACCTCGCTCGCGCGCTCGGGCCGCCCCGCGGACGCGCTGCGCGCCTTCCGCGACATGCTCGCGCGGGGTGTGCCGCCCGACCACTTCACCCTCCCACCTGTCCTCCGCTCCTGCGCGCTCACCGGCTCGTCGCCGCTCGCCGCCTCCGCCCACGCGCTGGCCCTCAAGATCGGGGCCCAGGGTAACCTCTTCGTGGCGTCCGCGCTGGTGCTCTGCTACTCGGGCCTGTCCAACCTCCCCGACGCCCGGAGGCTGTTCGACGGAATGCGCGAGCGAGACGCCGTCCTGTGGACCTCCATGCTGTCCGCGTACGCTCAGGGCGGGCATCCCGAGGCGGCGCTGCGGTTCTTCCAGGGGATGGTGGCGGCCAAGGTGCAGCTTGACGCGGTGGTCATGGTCAGCTCACT]

[+] EMBL CB641253             [ACCCAACCTCCGGCGCCCGGCGGCGTCGCGCAACCGCTCGGCATGCCGCCGCCCGCCCCCGCCCCCGCCACGCTCGCCTCCCTCAGCGCGCTCGTCACCTCGCTCGCGCGCTCGGGCCGCCCCGCGGACGCGCTGCGCGCCTTCCGCGACATGCTCGCGCGGGGTGTGCCGCCCGACCACTTCACCCTCCCACCTGTCCTCCGCTCCTGCGCGCTCACCGGCTCGTCGCCGCTCGCCGCCTCCGCCCACGCGCTGGCCCTCAAGATCGGGGCCCAGGGTAACCTCTTCGTGGCGTCCGCGCTGGTGCTCTGCTACTCGGGCCTGTCCAACCTCCCCGACGCCCGGAGGCTGTTCGACGGAATGCGCGAGCGAGACGCCGTCCTGTGGACCTCCATGCTGTCCGCGTACGCTCAGGGCGGGCATCCCGAGGCGGCGCTGCGGTTCTTCCAGGGGATGGTGGCGGCCAAGGTGCAGCTTGACGCGGTGGTCATGGTCAGCTCACT]
[+] EMBL CB641160             [    cACCTCCGGCGCCCGGCGGCGTCGCGCAACCGCTCGGCATGCCGCCGCCCGCCCCCGCCCCCGCCACGCTCGCCTCCCTCAGCGCGCTCGTCACCTCGCTCGCGCGCTCGGGCCGCCCCGCGGACGCGCTGCGCGCCTTCCGCGACATGCTCGCGCGGGGTGTGCCGCCCGA TACTTCACCCTCCCACCTGTCCTCCGCTCCTGCGCGCTCACCGGCTCGTCGCCGCTCGCCGCCTCCGCCCACGCGCTGGCCCTCAAGATCGGGGCCCAGGGTAACCTCTTCGTGGCGTCCGCGCTGGTGCTCTGCTACTCGGGCCTGTCCAACCTCCCCGACGCCCGGAGGCTGTTCCACGGAATGCGCGAGCGAGACGCCGTCCTGTGGA                                                                                                                   ]




>consensus_1788#0
ACCCAACCTCCGGCGCCCGGCGGCGTCGCGCAACCGCTCGGCATGCCGCCGCCCGCCCCC
GCCCCCGCCACGCTCGCCTCCCTCAGCGCGCTCGTCACCTCGCTCGCGCGCTCGGGCCGC
CCCGCGGACGCGCTGCGCGCCTTCCGCGACATGCTCGCGCGGGGTGTGCCGCCCGACCAC
TTCACCCTCCCACCTGTCCTCCGCTCCTGCGCGCTCACCGGCTCGTCGCCGCTCGCCGCC
TCCGCCCACGCGCTGGCCCTCAAGATCGGGGCCCAGGGTAACCTCTTCGTGGCGTCCGCG
CTGGTGCTCTGCTACTCGGGCCTGTCCAACCTCCCCGACGCCCGGAGGCTGTTCGACGGA
ATGCGCGAGCGAGACGCCGTCCTGTGGACCTCCATGCTGTCCGCGTACGCTCAGGGCGGG
CATCCCGAGGCGGCGCTGCGGTTCTTCCAGGGGATGGTGGCGGCCAAGGTGCAGCTTGAC
GCGGTGGTCATGGTCAGCTCACT

clustalw multiple alignements is not computed in this case