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Oryza sativa
cluster # 1795 cluster # 1795       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1795#0 length = 2671 sequences # 2  

consensusID : consensus_1795#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2671
fasta sequence
                              [GGTTTGCAGCGAACAGCTTCCACTGAAGAAGTTGCCAGATGGTGGCAAGGCACATACTTCACTCAAAAGCTCCAACAAGCTGTTAGTTAATTAGGTCTCACCTCTCAACAAGTCAAGCCTCTGAAGCTTTTGATCCCTTCACCTCGCACTCGCAGCAGCAGCAGGCTGTACTGACCAACCACCAAGAAGTATCGGCGCCATTGCTGTCCTCCTCCTTGGCTTGAACTCAACTCAACTCCAGTGCAGGCACATGCTTGCTTTCCAAACCAAGGGATAACCACTCATCTAATCAAGCCAACTCCACAAGCAGCTGGCCATCCACTGATTGATCAATCCATCCATCCATCAGCTTGCTCATGGGGAAACTTAGCTGCAAGAACCTATTGCCGTGCTGCATGGGCCATCCACCGGCGACCTCACCGGCCGGCGCCACCGCCGGCGTCAGCGTTAAGGTCAGCGACCGATATGTTGAGATTAAAAATGGCATATTTGAGCTTACGCTGTCCAACCCCGACGGGATCGTGACCGGCGTCCGGTATAATGGTGTGGACAACTTGATGGAGATTCTTAACAAAGAAGACAACAGAGGGTACTGGGACCTTGTTTGGAGTAAACTGGGAGAAAGAACTGGCATATTTGATGTAATAAAAGGGACAGAGTTCCGAATCATATATCAGGATGAAAACCATGCAGAGGTCTCGTTCGTTAGAACATGGGATCCTTCTCTGGAAGGCAAAGCTGTTCCCTTGAACATTGATAAGAGGTTCATTGTACTCCGGGGCTGCTCAGGATTCTATACCTATGGAATCTATGAGCATCAGGAAGGGTGGCCTGGTTTTAGCCTGGGAGAGACCAGGGTGGCCTTCAAGCTTCGGAAAGACAAGTTTCATTACATGGCATTAGCTGACGACAGGCAGAGAATAATGCCGATGCCTGAAGACCGAGTGCCGCCCCGGGGACAGCAATTAGCATACCCTGAAGCTGTCCTTCTTGTGGACCCAATAAATCCTGACCTAAGAGGAGAGGTTGATGATAAATACCAATACTCCTGTGAAGACCAGTATAACAATGTCCATGGATGGATATCATTCGATCCTCCAATTGGCTTCTGGCAGATCACTCCGAGTGACGAGTTCCGAACAGGAGGTCCCGTCATGCAGAACTTGACCTCTCATGTTGGGCCAACTATGCTGGCTATGTTTCTTAGCGGTCATTATGCTGGGGATGACCTTACACCCAAGTTCTTGACTGGTGAATACTGGAAAAAGGTCCATGGGCCTGTCTTCATGTACCTTAACTCCAGTTGGGATGGAAGTGACCCAACTCTACTCTGGGAGGATGCAAAAGTTCAGATGATGATTGAGAAAGAGAGCTGGCCGTACTGTTTTGCACTGTCAGATGATTTTCAGAAGACTGAGCAAAGAGGTTGTATCTCTGGTAGATTACTCGTCCGAGACAGGTATTTAGATGATGCAGATCTTTATGCTACATCAGCTTATGTAGGCTTAGCTCTACCAGGAGATGTTGGATCCTGGCAAAGAGAGTGCAAGGGATACCAATTCTGGTGTAGGGCAGAAGATGATGGAAGCTTTTGCATAAGAAACATTGTAGCTGGAGACTACAACCTTTATGCATGGGTTCCAGGATTTATAGGGGACTACAAACTGGATGCTAAGCTAACCATATCTTCAGGGGATGACATTTATCTGGGTGACCTTGTGTATGAACCACCAAGAGACGGTCCCACGATGTGGGAGATCGGAATACCTGATCGATCCGCCTCTGAATTCTTTGTTCCAGACCCTAATCCCAACTATGTGAATAGGTTGTATATCAACCATCCTGACAGATTTAGGCAGTATGGACTTTGGGAAAGATATGCAGAGCTGTATCCAGACGGTGATCTGGTATACACAATTGGCCAGAGCGACTATACCACCGATTGGTTCTTTGCTCAAGTAAACAGAAGAACTGATCAGAGCACCTACCAGCCAACCACATGGCAAATAAAGTTCAATCTTGACAGTGTCAGTCCTAACAGCACATACAAATTCAGAGTGGCTCTTGCATCATCCGCAAATGCCGAGTTGCAGGTTCGTTTCAACGATCAGGACAGAACTGCTCCTCACTTCACAACTGGGTTGATTGGGAAAGACAACACGATTGCGAGGCACGGGATCCATGGGCTGTACTGGCTGTTCAACATCGATGTGAGTGGAGCTTGGCTTGTTCAAGGGATGAACACCATCTACCTGAAGCAGCCCAGGAACCAGAGTCCATTTCAGGGACTGATGTATGACTACCTGAGAATGGAAGGTCCTTCTGGCAGCTAAGGCCAGTCTTTAGCTAGTTTAACCAGCCTCACCTGTATGGCTAGTATAGCTGTACTATGCCTAGGTATGCAGTACGATTATGACCCAGATATTCCCATCCACTAATATTCTATTTAGTGTGCTTTAAAGTTTAATCTTATTTTACCAAAAAAAATCCTGGGTTTTGTCTAACCCCGGATTTAGCTTATCTGATTTAGGTTAGCTGGTAAAGATGTAAGCTGCCGAAATTTCGCAGAGCATCAGAATTCAGAAAACGATTAGATATACTCTAAATCGGTGATATGTATTGGAAAAAGAAATAACATTTCCCTGCTGTTTTAACTCTAGTGTAACAATTT]

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[+] EMBL AK121429             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTTAACAAAGAAGACAACAGAGGGTACTGGGACCTTGTTTGGAGTAAACTGGGAGAAAGAACTGGCATATTTGATGTAATAAAAGGGACAGAGTTCCGAATCATATATCAGGATGAAAACCATGCAGAGGTCTCGTTCGTTAGAACATGGGATCCTTCTCTGGAAGGCAAAGCTGTTCCCTTGAACATTGATAAGAGGTTCATTGTACTCCGGGGCTGCTCAGGATTCTATACCTATGGAATCTATGAGCATCAGGAAGGGTGGCCTGGTTTTAGCCTGGGAGAGACCAGGGTGGCCTTCAAGCTTCGGAAAGACAAGTTTCATTACATGGCATTAGCTGACGACAGGCAGAGAATAATGCCGATGCCTGAAGACCGAGTGCCGCCCCGGGGACAGCAATTAGCATACCCTGAAGCTGTCCTTCTTGTGGACCCAATAAATCCTGACCTAAGAGGAGAGGTTGATGATAAATACCAATACTCCTGTGAAGACCAGTATAACAATGTCCATGGATGGATATCATTCGATCCTCCAATTGGCTTCTGGCAGATCACTCCGAGTGACGAGTTCCGAACAGGAGGTCCCGTCAAGCAGAACTTGACCTCTCATGTTGGGCCAACTATGCTGGCTATGTTTCTTAGCGGTCATTATGCTGGGGATGACCTTACACCCAAGTTCTTGACTGGTGAATACTGGAAAAAGGTCCATGGGCCTGTCTTCATGTACCTTAACTCCAGTTGGGATGGAAGTGACCCAACTCTACTCTGGGAGGATGCAAAAGTTCAGATGATGATTGAGAAAGAGAGCTGGCCGTACTGTTTTGCACTGTCAGATGATTTTCAGAAGACTGAGCAAAGAGGTTGTATCTCTGGTAGATTACTCGTCCGAGACAGGTATTTAGATGATGCAGATCTTTATGCTACATCAGCTTATGTAGGCTTAGCTCTACCAGGAGATGTTGGATCCTGGCAAAGAGAGTGCAAGGGATACCAATTCTGGTGTAGGGCAGAAGATGATGGAAGCTTTTGCATAAGAAACATTGTAGCTGGAGACTACAACCTTTATGCATGGGTTCCAGGATTTATAGGGGACTACAAACTGGATGCTAAGCTAACCATATCTTCAGGGGATGACATTTATCTGGGTGACCTTGTGTATGAACCACCAAGAGACGGTCCCACGATGTGGGAGATCGGAATACCTGATCGATCCGCCTCTGAATTCTTTGTTCCAGACCCTAATCCCAACTATGTGAATAGGTTGTATATCAACCATCCTGACAGATTTAGGCAGTATGGACTTTGGGAAAGATATGCAGAGCTGTATCCAGACGGTGATCTGGTATACACAATTGGCCAGAGCGACTATACCACCGATTGGTTCTTTGCTCAAGTAAACAGAAGAACTGATCAGAGCACCTACCAGCCAACCACATGGCAAATAAAGTTCAATCTTGACAGTGTCAGTCCTAACAGCACATACAAATTCAGAGTGGCTCTTGCATCATCCGCAAATGCCGAGTTGCAGGTTCGTTTCAACGATCAGGACAGAACTGCTCCTCACTTCACAACTGGGTTGATTGGGAAAGACAACACGATTGCGAGGCACGGGATCCATGGGCTGTACTGGCTGTTCAACATCGATGTGAGTGGAGCTTGGCTTGTTCAAGGGATGAACACCATCTACCTGAAGCAGCCCAGGAACCAGAGTCCATTTCAGGGACTGATGTATGACTACCTGAGAATGGAAGGTCCTTCTGGCAGCTAAGGCCAGTCTTTAGCTAGTTTAACCAGCCTCACCTGTATGGCTAGTATAGCTGTACTATGCCTAGGTATGCAGTACGATTATGACCCAGATATTCCCATCCACTAATATTCTATTTAGTGTGCTTTAAAGTTTAATCTTATTTTACCAAAAAAAATCCTGGGTTTTGTCTAACCCCGGATTTAGCTTATCTGATTTAGGTTAGCTGGTAAAGATGTAAGCTGCCGAAAATTCGCAGAGCATCAGAATTCAGGAAACGATTAGATATACTCTAAATCGGTGA                                                          ]


>consensus_1795#0 GGTTTGCAGCGAACAGCTTCCACTGAAGAAGTTGCCAGATGGTGGCAAGGCACATACTTC ACTCAAAAGCTCCAACAAGCTGTTAGTTAATTAGGTCTCACCTCTCAACAAGTCAAGCCT CTGAAGCTTTTGATCCCTTCACCTCGCACTCGCAGCAGCAGCAGGCTGTACTGACCAACC ACCAAGAAGTATCGGCGCCATTGCTGTCCTCCTCCTTGGCTTGAACTCAACTCAACTCCA GTGCAGGCACATGCTTGCTTTCCAAACCAAGGGATAACCACTCATCTAATCAAGCCAACT CCACAAGCAGCTGGCCATCCACTGATTGATCAATCCATCCATCCATCAGCTTGCTCATGG GGAAACTTAGCTGCAAGAACCTATTGCCGTGCTGCATGGGCCATCCACCGGCGACCTCAC CGGCCGGCGCCACCGCCGGCGTCAGCGTTAAGGTCAGCGACCGATATGTTGAGATTAAAA ATGGCATATTTGAGCTTACGCTGTCCAACCCCGACGGGATCGTGACCGGCGTCCGGTATA ATGGTGTGGACAACTTGATGGAGATTCTTAACAAAGAAGACAACAGAGGGTACTGGGACC TTGTTTGGAGTAAACTGGGAGAAAGAACTGGCATATTTGATGTAATAAAAGGGACAGAGT TCCGAATCATATATCAGGATGAAAACCATGCAGAGGTCTCGTTCGTTAGAACATGGGATC CTTCTCTGGAAGGCAAAGCTGTTCCCTTGAACATTGATAAGAGGTTCATTGTACTCCGGG GCTGCTCAGGATTCTATACCTATGGAATCTATGAGCATCAGGAAGGGTGGCCTGGTTTTA GCCTGGGAGAGACCAGGGTGGCCTTCAAGCTTCGGAAAGACAAGTTTCATTACATGGCAT TAGCTGACGACAGGCAGAGAATAATGCCGATGCCTGAAGACCGAGTGCCGCCCCGGGGAC AGCAATTAGCATACCCTGAAGCTGTCCTTCTTGTGGACCCAATAAATCCTGACCTAAGAG GAGAGGTTGATGATAAATACCAATACTCCTGTGAAGACCAGTATAACAATGTCCATGGAT GGATATCATTCGATCCTCCAATTGGCTTCTGGCAGATCACTCCGAGTGACGAGTTCCGAA CAGGAGGTCCCGTCATGCAGAACTTGACCTCTCATGTTGGGCCAACTATGCTGGCTATGT TTCTTAGCGGTCATTATGCTGGGGATGACCTTACACCCAAGTTCTTGACTGGTGAATACT GGAAAAAGGTCCATGGGCCTGTCTTCATGTACCTTAACTCCAGTTGGGATGGAAGTGACC CAACTCTACTCTGGGAGGATGCAAAAGTTCAGATGATGATTGAGAAAGAGAGCTGGCCGT ACTGTTTTGCACTGTCAGATGATTTTCAGAAGACTGAGCAAAGAGGTTGTATCTCTGGTA GATTACTCGTCCGAGACAGGTATTTAGATGATGCAGATCTTTATGCTACATCAGCTTATG TAGGCTTAGCTCTACCAGGAGATGTTGGATCCTGGCAAAGAGAGTGCAAGGGATACCAAT TCTGGTGTAGGGCAGAAGATGATGGAAGCTTTTGCATAAGAAACATTGTAGCTGGAGACT ACAACCTTTATGCATGGGTTCCAGGATTTATAGGGGACTACAAACTGGATGCTAAGCTAA CCATATCTTCAGGGGATGACATTTATCTGGGTGACCTTGTGTATGAACCACCAAGAGACG GTCCCACGATGTGGGAGATCGGAATACCTGATCGATCCGCCTCTGAATTCTTTGTTCCAG ACCCTAATCCCAACTATGTGAATAGGTTGTATATCAACCATCCTGACAGATTTAGGCAGT ATGGACTTTGGGAAAGATATGCAGAGCTGTATCCAGACGGTGATCTGGTATACACAATTG GCCAGAGCGACTATACCACCGATTGGTTCTTTGCTCAAGTAAACAGAAGAACTGATCAGA GCACCTACCAGCCAACCACATGGCAAATAAAGTTCAATCTTGACAGTGTCAGTCCTAACA GCACATACAAATTCAGAGTGGCTCTTGCATCATCCGCAAATGCCGAGTTGCAGGTTCGTT TCAACGATCAGGACAGAACTGCTCCTCACTTCACAACTGGGTTGATTGGGAAAGACAACA CGATTGCGAGGCACGGGATCCATGGGCTGTACTGGCTGTTCAACATCGATGTGAGTGGAG CTTGGCTTGTTCAAGGGATGAACACCATCTACCTGAAGCAGCCCAGGAACCAGAGTCCAT TTCAGGGACTGATGTATGACTACCTGAGAATGGAAGGTCCTTCTGGCAGCTAAGGCCAGT CTTTAGCTAGTTTAACCAGCCTCACCTGTATGGCTAGTATAGCTGTACTATGCCTAGGTA TGCAGTACGATTATGACCCAGATATTCCCATCCACTAATATTCTATTTAGTGTGCTTTAA AGTTTAATCTTATTTTACCAAAAAAAATCCTGGGTTTTGTCTAACCCCGGATTTAGCTTA TCTGATTTAGGTTAGCTGGTAAAGATGTAAGCTGCCGAAATTTCGCAGAGCATCAGAATT CAGAAAACGATTAGATATACTCTAAATCGGTGATATGTATTGGAAAAAGAAATAACATTT CCCTGCTGTTTTAACTCTAGTGTAACAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)