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Oryza sativa
cluster # 1798 cluster # 1798       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1798#0 length = 1207 sequences # 2  

consensusID : consensus_1798#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1207
fasta sequence
                              [CCCTTCCCCCGCCGCCGCCGCCTCAGTCCTCCTCCCCTCCGCCGCCGGTGCCGCCGCCAAAATCCCCCACCGCGCGCGCGCCACCTACTCCCTCTCCCTCTCCACCAGGTTCAGGCGAGGTAGTGAGCCCTAATCCTAAGCCCTCATTCCTCTCCCCCACCGCGCCGGCATCAGCTCCACCCCGTTGTCACAAGTCTCCCCCACTGCTGGCATCAGCGTCCTCTCCTCCCCTGGCTCCTCGTGTCCACGCCGCCTGCGGCTGCGCCAAAGTCCAAGGCGTCTAGGCGTCTAGCCCCGCTCGCACTCGCCAGGCCACACACCATCTCCACTCTCCTGAACGCAGCAGCGTCCCCAGCCCCTGCCACTGAGGCGTTGTACTGCATTGCGGACCTCAGGAGCACGGCCGCCACGCAGATGGAAGCCCTCGAAGCGCTGCCGCGGCTATGCCCATCTCCCTCTCCCGCGCATCCAAGAGGTTGCCAGCGTGCAATTCAATGCTAAAGCAGTTAAAAGAGGATCACAGTCATCCATCTCTTTAAGATATGATGTTCATGGGAAAAGTCTGAAGCGGGAAAACCAATCCTGAAGCTACTATGGAGGAAGTCACTGAGGAGAAAACTATATATTTAAGGTTTGGCATCCTATGCTTCTGTAGTGCTCAAGCTATCAATGCAATCTTAATTTTGCTTTCAGATGTTAACTGAAATATTGAATGCTATTTTCCTTGGAGTTACTATAAAATTTACTGACTTGAGTTTATTTTCTTAGATATGATGAGATGTGCCCTTTGAAGTATCTGTGCTCCTATATTGCCATAACGATTTTTAA-TAGAACCTCAGTTGTAATATTTTAATCCATATAATGCCAATTGTGCACCTTTCTTCAAGATGAGATATTTTATTTTCTTATTGTGTTTGCTCTGGTCTGTAACTAAGACATTAAATGCTCATCCAATTATTGTATTTAAAAGGAGTCCTACAGAATATGTCTTCATTGATCTGACTGTATATTCTAAAGAGTAATTTGATAAAAACCATAAAAAACTTAGATAGTCAAGTTTACAATCGTAAAATATTTTTTTTGTCTTGCGATTCTTAATATATGCTACTTTTTGTTGTATTAGATAATAGCGAAAAAAATCTGCACAAATATCACTTGCTAATATAATTTTGAATGCCTCTGAAATTACACTGAGATATATATCTTC]

[+] EMBL CB630207             [CCCTTCCCCCGCCGCCGCCGCCTCAGTCCTCCTCCCCTCCGCCGCCGGTGCCGCCGCCAAAATCCCCCACCGCGCGCGCGCCACCTACTCCCTCTCCCTCTCCACCAGGTTCAGGCGAGGTAGTGAGCCCTAATCCTAAGCCCTCATTCCTCTCCCCCACCGCGCCGGCATCAGCTCCACCCCGTTGTCACAAGTCTCCCCCACTGCTGGCATCAGCGTCCTCTCCTCCCCTGGCTCCTCGTGTCCACGCCGCCTGCGGCTGCGCCAAAGTCCAAGGCGTCTAGGCGTCTAGCCCCGCTCGCACTCGCCAGGCCACACACCATCTCCACTCTCCTGAACGCAGCAGCGTCCCCAGCCCCTGCCACTGAGGCGTTGTACTGCATTGCGGACCTCAGGAGCACGGCCGCCACGCAGATGGAAGCCCTCGAAGCGCTGCCGCGGCTATGCCCATCTCCCTCTCCCGCGCATCCAAGAGGTTGCCAGCGTGCAATTCAATGCTAAAGCAGTTAAAAGAGGATCACAGTCATCCATCTCTTTAAGATATGATGTTCATGGGAAAAGTCTGAAGCGGGAAAACCAATCCTGAAGCTACTATGGAGGAAGTCACTGAGGAGAAAACTATATATTTAAGGTTTGGCATCCTATGCTTCTGTAGTGCTCAAGCTATCAATGCAATCTTAATTTTGCTTTCAGATGTTAACTGAAATATTGAATGCTATTTTCCTTGGAGTTACTATAAAATTTACTGACTTGAGTTTATTTTCTTAGATATGATGAGATGTGCCCTTTGAAGTATCTGTGCTCCTATATTGCCATAACGATTTTTAA TAGAACCTCAGTTGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AK120724             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCTATGCTTCTGTAGTGCTCAAGCTATCAATGCAATCTTAATTTTGCTTTCAGATGTTAACTGAAATATTGAATGCTATTTTCCTTGGAGTTACTATAAAATTTACTGACTTGAGTTTATTTTCTTAGATATGATGAGATGTGCCCTTTGAAGTATCTGTGCTCCTATATTGCCATAACGATTTTTAATTAGAACCTCAGTTGTAATATTTTAATCCATATAATGCCAATTGTGCACCTTTCTTCAAGATGAGATATTTTATTTTCTTATTGTGTTTGCTCTGGTCTGTAACTAAGACATTAAATGCTCATCCAATTATTGTATTTAAAAGGAGTCCTACAGAATATGTCTTCATTGATCTGACTGTATATTCTAAAGAGTAATTTGATAAAAACCATAAAAAACTTAGATAGTCAAGTTTACAATCGTAAAATATTTTTTTTGTCTTGCGATTCTTAATATATGCTACTTTTTGTTGTATTAGATAATAGCGAAAAAAATCTGCACAAATATCACTTGCTAATATAATTTTGAATGCCTCTGAAATTACACTGAGATATATATCTTC]


>consensus_1798#0 CCCTTCCCCCGCCGCCGCCGCCTCAGTCCTCCTCCCCTCCGCCGCCGGTGCCGCCGCCAA AATCCCCCACCGCGCGCGCGCCACCTACTCCCTCTCCCTCTCCACCAGGTTCAGGCGAGG TAGTGAGCCCTAATCCTAAGCCCTCATTCCTCTCCCCCACCGCGCCGGCATCAGCTCCAC CCCGTTGTCACAAGTCTCCCCCACTGCTGGCATCAGCGTCCTCTCCTCCCCTGGCTCCTC GTGTCCACGCCGCCTGCGGCTGCGCCAAAGTCCAAGGCGTCTAGGCGTCTAGCCCCGCTC GCACTCGCCAGGCCACACACCATCTCCACTCTCCTGAACGCAGCAGCGTCCCCAGCCCCT GCCACTGAGGCGTTGTACTGCATTGCGGACCTCAGGAGCACGGCCGCCACGCAGATGGAA GCCCTCGAAGCGCTGCCGCGGCTATGCCCATCTCCCTCTCCCGCGCATCCAAGAGGTTGC CAGCGTGCAATTCAATGCTAAAGCAGTTAAAAGAGGATCACAGTCATCCATCTCTTTAAG ATATGATGTTCATGGGAAAAGTCTGAAGCGGGAAAACCAATCCTGAAGCTACTATGGAGG AAGTCACTGAGGAGAAAACTATATATTTAAGGTTTGGCATCCTATGCTTCTGTAGTGCTC AAGCTATCAATGCAATCTTAATTTTGCTTTCAGATGTTAACTGAAATATTGAATGCTATT TTCCTTGGAGTTACTATAAAATTTACTGACTTGAGTTTATTTTCTTAGATATGATGAGAT GTGCCCTTTGAAGTATCTGTGCTCCTATATTGCCATAACGATTTTTAATAGAACCTCAGT TGTAATATTTTAATCCATATAATGCCAATTGTGCACCTTTCTTCAAGATGAGATATTTTA TTTTCTTATTGTGTTTGCTCTGGTCTGTAACTAAGACATTAAATGCTCATCCAATTATTG TATTTAAAAGGAGTCCTACAGAATATGTCTTCATTGATCTGACTGTATATTCTAAAGAGT AATTTGATAAAAACCATAAAAAACTTAGATAGTCAAGTTTACAATCGTAAAATATTTTTT TTGTCTTGCGATTCTTAATATATGCTACTTTTTGTTGTATTAGATAATAGCGAAAAAAAT CTGCACAAATATCACTTGCTAATATAATTTTGAATGCCTCTGAAATTACACTGAGATATA TATCTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)