cluster # 196

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Oryza sativa
cluster # 196 cluster # 196 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_196#0 length = 2213 sequences # 2
consensusID : consensus_196#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2213
fasta sequence
                              [CTAGCCGGCGGCCGCGGGCGAGTGATGACGACGCCACGACGGCGCGCTGACCCATCGCCCCCGCCTGCTCGCCGCCTCCTCCACCGCCTCGGCTCCGCGGCCTCCGGTCTGCAGACGCTGGCGTACAGCTCGAAGAAGGAAGGCGGCGGCGGCGACATGGGCCCACGCAACGGCGGTTCCTCTTCTAATAGAAGACCAGGATTTGTTGATTCTTCTTCATGGAGATATTTTGACTCGAGGGTTGTTGGTATTACTAGAGGGGATATACCTCGCCATGCCTGGACTGTCCTACACATGCTAAAACGAAAAGGGTTTGCAGCTTATCTTGTTGGGGGATGCGTGAGAGATTTGCTACTGAAAAGGGCACCTAAAGATTTTGATGTGATTACTACCGCAAGCCTCCAGCAGATTAAGAAAATGGTTTTCCAACGATGTATAATTATTGGCAAACGCTTTCCAATATGCCAGCTTAATATGTATGGCACAAAAATTGAGGTTTCTAGCTTTAGCACGAATGCAAATCATGTGAAAGGAAGTAAAAATATAGGATGTTCAGAGGAGTTTAAACGTTATGATGAGGGGGATATTCTTCTCTGGCAGAATTCTATGAAAAGAGACTTTACAATAAACAGCTTATTCTTTAATCCATTTAACTTTAAGATTTATGATTATGTGAATGGAGTAAGGGATATTAGCAAAAACAAGGTGTCTACAGTGATTCCTGCCCGTGTTTCATTCAAGGAAGACCCTGCCAGGATTTTGCGTGGCTTGAGAATTGCTGCTCGCCTTGGTTTTGAGTTCTCCAGTGAAACTTCTGCTGCAATACGGGAACTTTCTTTGTCCATAACAGATATTGACAAGGCAAGATTAATGATGGAATTGAATTATTTATTGTCTTATGGGGCAGCAGCTTCTTCTCTTAGGTTACTTAGAAAATATGGACTTCTCGATTTTTTGCTGCCTTTCCAGGCAGCATATATGTCGGATCAGATGAAGGATAAATCAAATGACACAGATTTAATGCTCATGAAACTACTGGCTAATCTTGATAAATTACTCTCTGCTGATCAGCCATGCCCCTCCTGTTTGTGGTTAGCACTGTTGACATTTCACAGTGCATTGGTAAATTCTCCACATGATGCCCAGGTAATCAGGGCTTTTGCTGCACTAATGTATTTTGGATCATGGGAGGGCGCAGTCAACTTCTTGAATCAAGACATTGGAGCACCAGCCCCGTTTATTCCAGAAACACTAGGGCCTTCTCGGAGCAAACTGGAGAATCTCATGGAACAAACATCACATTTAGCATCACTAGTCAAGTCGTCAGTTGATACGTTGACATCTATAGATGCTCTCCAACAATCACTGGCCAAATACTCAAAGGCTTCACAAGTTTCAGGACTGGTGCTTGTATCTAGCAGAGAGAGGGAGAGAGTGTTGAGAATATTTGAGGGCCTTGATACTGACTTAACTTCATATGAAGGGACAAGAGGGATGCAGGAAATTGATTATAAGTTACTGAAGGATGGGCACCCTGGTGAGG-TCCGGTTTGTTCTTGGGCAAGTAATCATGGACACTATGAGCGA-GGAGTTACCACGTGTATCCACTGA-GTATGATCAGCTCAATATGGAGGCTAGTGAAGATGATCTTGCTGACGGAAGCCGTCCTTCACTGTCCACATTATTTTCCAGTAAATCGTGATGGCTAAGCCGTAGTCACTCAACAAAAATTAGCCAGGATCTCTCCATTCCATGATTCCATAATCAACGCGCTCAGCGCATCGAAGTGCTTGGGCGTGCAGGATGGTCAGTTGGCCACCATACAATGCAGGCGAACTTTTACCGCAGCTAAACTCACGTGGATGCTGGAGAATGATGTTATTGCCCAAGTGCCTGCCTTGACGTCTTTTTGTAGTAGAACTGAGTCTAGTGCGTAGATAGTACTACCAGATAATTGTAACCTTATATTATTCACTTTGGCTTGTTAGTCTCCGCGTACTGTACCAATGTTGAGTCGTACTGCCCCTTGAACTTTTGAGCTTAGGTGAACTGAAAGTTTGAAACTGTCGCCATGGTTACTTGGGTTGAAAATACTTCATCAGTAATTTGATTACATGTAACATAGCGAACTGCCATGGGATTTGATAACCATGAGATATTTACTGGATTTCTGATTTGCAATGAGTTATATATGCCCTTTCATCCAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK103714             [CTAGCCGGCGGCCGCGGGCGAGTGATGACGACGCCACGACGGCGCGCTGACCCATCGCCCCCGCCTGCTCGCCGCCTCCTCCACCGCCTCGGCTCCGCGGCCTCCGGTCTGCAGACGCTGGCGTACAGCTCGAAGAAGGAAGGCGGCGGCGGCGACATGGGCCCACGCAACGGCGGTTCCTCTTCTAATAGAAGACCAGGATTTGTTGATTCTTCTTCATGGAGATATTTTGACTCGAGGGTTGTTGGTATTACTAGAGGGGATATACCTCGCCATGCCTGGACTGTCCTACACATGCTAAAACGAAAAGGGTTTGCAGCTTATCTTGTTGGGGGATGCGTGAGAGATTTGCTACTGAAAAGGGCACCTAAAGATTTTGATGTGATTACTACCGCAAGCCTCCAGCAGATTAAGAAAATGGTTTTCCAACGATGTATAATTATTGGCAAACGCTTTCCAATATGCCAGCTTAATATGTATGGCACAAAAATTGAGGTTTCTAGCTTTAGCACGAATGCAAATCATGTGAAAGGAAGTAAAAATATAGGATGTTCAGAGGAGTTTAAACGTTATGATGAGGGGGATATTCTTCTCTGGCAGAATTCTATGAAAAGAGACTTTACAATAAACAGCTTATTCTTTAATCCATTTAACTTTAAGATTTATGATTATGTGAATGGAGTAAGGGATATTAGCAAAAACAAGGTGTCTACAGTGATTCCTGCCCGTGTTTCATTCAAGGAAGACCCTGCCAGGATTTTGCGTGGCTTGAGAATTGCTGCTCGCCTTGGTTTTGAGTTCTCCAGTGAAACTTCTGCTGCAATACGGGAACTTTCTTTGTCCATAACAGATATTGACAAGGCAAGATTAATGATGGAATTGAATTATTTATTGTCTTATGGGGCAGCAGCTTCTTCTCTTAGGTTACTTAGAAAATATGGACTTCTCGATTTTTTGCTGCCTTTCCAGGCAGCATATATGTCGGATCAGATGAAGGATAAATCAAATGACACAGATTTAATGCTCATGAAACTACTGGCTAATCTTGATAAATTACTCTCTGCTGATCAGCCATGCCCCTCCTGTTTGTGGTTAGCACTGTTGACATTTCACAGTGCATTGGTAAATTCTCCACATGATGCCCAGGTAATCAGGGCTTTTGCTGCACTAATGTATTTTGGATCATGGGAGGGCGCAGTCAACTTCTTGAATCAAGACATTGGAGCACCAGCCCCGTTTATTCCAGAAACACTAGGGCCTTCTCGGAGCAAACTGGAGAATCTCATGGAACAAACATCACATTTAGCATCACTAGTCAAGTCGTCAGTTGATACGTTGACATCTATAGATGCTCTCCAACAATCACTGGCCAAATACTCAAAGGCTTCACAAGTTTCAGGACTGGTGCTTGTATCTAGCAGAGAGAGGGAGAGAGTGTTGAGAATATTTGAGGGCCTTGATACTGACTTAACTTCATATGAAGGGACAAGAGGGATGCAGGAAATTGATTATAAGTTACTGAAGGATGGGCACCCTGGTGAGG TCCGGTTTGTTCTTGGGCAAGTAATCATGGACACTATGAGCGA GGAGTTACCACGTGTATCCACTGA GTATGATCAGCTCAATATGGAGGCTAGTGAAGATGATCTTGCTGACGGAAGCCGTCCTTCACTGTCCACATTATTTTCCAGTAAATCGTGATGGCTAAGCCGTAGTCACTCAACAAAAATTAGCCAGGATCTCTCCATTCCATGATTCCATAATCAACGCGCTCAGCGCATCGAAGTGCTTGGGCGTGCAGGATGGTCAGTTGGCCACCATACAATGCAGGCGAACTTTTACCGCAGCTAAACTCACGTGGATGCTGGAGAATGATGTTATTGCCCAAGTGCCTGCCTTGACGTCTTTTTGTAGTAGAACTGAGTCTAGTGCGTAGATAGTACTACCAGATAATTGTAACCTTATATTATTCACTTTGGCTTGTTAGTCTCCGCGTACTGTACCAATGTTGAGTCGTACTGCCCCTTGAACTTTTGAGCTTAGGTGAACTGAAAGTTTGAAACTGTCGCCATGGTTACTTGGGTTGAAAATACTTCATCAGTAATTTGATTACATGTAACATAGCGAACTGCCATGGGATTTGATAACCATGAGATATTTACTGGATT                                             ]
[-] EMBL CA761585             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTTGTAAGGTTCCGGTTTGTTCTTGGACAAGTAATCATGGGCACTATTAGCGACGGAGTTGCCCCGTGTATTCCCTTAGGTATGATCAGCTCAATATGGAGGCTAGTGAGGATGATGTGTCTGGCGGAGACCGTCTTTCGCTGTCCACATTATTTTCCAGTAAATCGTGATGGCTAAGCCGTAGTCACTCAACAAAAATTAGTCAGGATCTCTCCATTCCATGATTCCATAATCAACGCGCTCAGCGCATCGAAGTGCTTGGGCGTGCAGGATGGTCAGTTGGCCACCATACAATGCAGGCGAACTTTTACCGCAGCTAAACTCACGTGGATGCTGGAGAATGATGTTATTGCCCAAGTGCCTGCCTTGACGTCTTTTTGTAGTAGAACTGAGTCTAGTGCGTAGATAGTACTACCAGATAATTGTAACCTTATATTATTCACTTTGGCTTGTTAGTCTCCGCGTACTGTACCAATGTTGAGTCGTACTGCCCTTTGAACTTTTGAGCTTAGGTGAACTGAGAGTTTGAAACTGTCGCCATGGTTACTTGGGTTGAAAATACTTCATCAGTAATTTGATTACATGTAACATAGCGAACTGCCATGGGATTTGATAACCATGAGATATTTACTGGATTTCTGATTTGCAATGAGTTATATATGCCCTTTCATCCAAAAAAAAA]




>consensus_196#0
CTAGCCGGCGGCCGCGGGCGAGTGATGACGACGCCACGACGGCGCGCTGACCCATCGCCC
CCGCCTGCTCGCCGCCTCCTCCACCGCCTCGGCTCCGCGGCCTCCGGTCTGCAGACGCTG
GCGTACAGCTCGAAGAAGGAAGGCGGCGGCGGCGACATGGGCCCACGCAACGGCGGTTCC
TCTTCTAATAGAAGACCAGGATTTGTTGATTCTTCTTCATGGAGATATTTTGACTCGAGG
GTTGTTGGTATTACTAGAGGGGATATACCTCGCCATGCCTGGACTGTCCTACACATGCTA
AAACGAAAAGGGTTTGCAGCTTATCTTGTTGGGGGATGCGTGAGAGATTTGCTACTGAAA
AGGGCACCTAAAGATTTTGATGTGATTACTACCGCAAGCCTCCAGCAGATTAAGAAAATG
GTTTTCCAACGATGTATAATTATTGGCAAACGCTTTCCAATATGCCAGCTTAATATGTAT
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AATATAGGATGTTCAGAGGAGTTTAAACGTTATGATGAGGGGGATATTCTTCTCTGGCAG
AATTCTATGAAAAGAGACTTTACAATAAACAGCTTATTCTTTAATCCATTTAACTTTAAG
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CCTGCCCGTGTTTCATTCAAGGAAGACCCTGCCAGGATTTTGCGTGGCTTGAGAATTGCT
GCTCGCCTTGGTTTTGAGTTCTCCAGTGAAACTTCTGCTGCAATACGGGAACTTTCTTTG
TCCATAACAGATATTGACAAGGCAAGATTAATGATGGAATTGAATTATTTATTGTCTTAT
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CCTTTCCAGGCAGCATATATGTCGGATCAGATGAAGGATAAATCAAATGACACAGATTTA
ATGCTCATGAAACTACTGGCTAATCTTGATAAATTACTCTCTGCTGATCAGCCATGCCCC
TCCTGTTTGTGGTTAGCACTGTTGACATTTCACAGTGCATTGGTAAATTCTCCACATGAT
GCCCAGGTAATCAGGGCTTTTGCTGCACTAATGTATTTTGGATCATGGGAGGGCGCAGTC
AACTTCTTGAATCAAGACATTGGAGCACCAGCCCCGTTTATTCCAGAAACACTAGGGCCT
TCTCGGAGCAAACTGGAGAATCTCATGGAACAAACATCACATTTAGCATCACTAGTCAAG
TCGTCAGTTGATACGTTGACATCTATAGATGCTCTCCAACAATCACTGGCCAAATACTCA
AAGGCTTCACAAGTTTCAGGACTGGTGCTTGTATCTAGCAGAGAGAGGGAGAGAGTGTTG
AGAATATTTGAGGGCCTTGATACTGACTTAACTTCATATGAAGGGACAAGAGGGATGCAG
GAAATTGATTATAAGTTACTGAAGGATGGGCACCCTGGTGAGGTCCGGTTTGTTCTTGGG
CAAGTAATCATGGACACTATGAGCGAGGAGTTACCACGTGTATCCACTGAGTATGATCAG
CTCAATATGGAGGCTAGTGAAGATGATCTTGCTGACGGAAGCCGTCCTTCACTGTCCACA
TTATTTTCCAGTAAATCGTGATGGCTAAGCCGTAGTCACTCAACAAAAATTAGCCAGGAT
CTCTCCATTCCATGATTCCATAATCAACGCGCTCAGCGCATCGAAGTGCTTGGGCGTGCA
GGATGGTCAGTTGGCCACCATACAATGCAGGCGAACTTTTACCGCAGCTAAACTCACGTG
GATGCTGGAGAATGATGTTATTGCCCAAGTGCCTGCCTTGACGTCTTTTTGTAGTAGAAC
TGAGTCTAGTGCGTAGATAGTACTACCAGATAATTGTAACCTTATATTATTCACTTTGGC
TTGTTAGTCTCCGCGTACTGTACCAATGTTGAGTCGTACTGCCCCTTGAACTTTTGAGCT
TAGGTGAACTGAAAGTTTGAAACTGTCGCCATGGTTACTTGGGTTGAAAATACTTCATCA
GTAATTTGATTACATGTAACATAGCGAACTGCCATGGGATTTGATAACCATGAGATATTT
ACTGGATTTCTGATTTGCAATGAGTTATATATGCCCTTTCATCCAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case