These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2070#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 917 fasta sequence [AAGGGACAAGGTGCGAAAGATGGAGTATAAAAATAGGGAGGATTTTAGGCATGATGTGGCTCAGATAGCACTGAATGCACATACATACAATCTTAACCGCCATCCCCACATCCCTCCGCTTGCTGATGAGCTCTTGGAGTTGTGTGATTATCTTCTTGAGGAAAGCGCGGATGTGCTAGATGATGCGGAATACGCGATCGAGGACTAGTGCACACTAACCAGATATGGCATTTAGATCTTGCTATATTCTAACTTAGATGCTGTAATGCTGACCTGTAGGAGGGGGGAAGAGCACCTGTAGAATTTTTCATTTTAGGCTCTGGCTATGGTATACCTGGGATCCCCAATTCCAACTATTTTGCCTCTTGTTGGTATTGGGAGTTGGGAGTTGGAATGTACACAAACTCTAGGTTAGACATTGAGGGCCCACTGTAACTATTGGCCTCTTGCTGTAAAAATGTAGCGATGTAATTTTTTGTCCATATCCATGG-CCTTGGGTGTCTCAAATTCTGATGTTGTAGCATTACATCCTATGTGAATGGCATCTAACC--ATGAGTCAAAGGTGCAACACGTCAAAGCATGTGCTAAAGGTTGTACCCGGTCTAACCTGATTGGTGAAGGTCCCTTCAAATCCTGCATGATTAGAGGCTTACCATGCAACTATGCGAAGTCAAAACCTGTAATTGTAACTGTAACGTGAGAGATGGTGTACCGGCAGTACAAGTTGTTTGAGTTGCTGCCAGATGATGATGTATTTGATGTTGCATGCTTTGAATGAGTATTCACCGCTCAACGATATCATTGGATGGTGCAGTTCATAGTTTCATACCTTTGGTTTTTGGTTTGTGATGTTGTAGCAACAGAACAACAAGTAATCATCCATTAAACAATCAAGTCCCTTTCTCCTAAAAAAAAAA] [+] EMBL AK108404 [AAGGGACAAGGTGCGAAAGATGGAGTATAAAAATAGGGAGGATTTTAGGCATGATGTGGCTCAGATAGCACTGAATGCACATACATACAATCTTAACCGCCATCCCCACATCCCTCCGCTTGCTGATGAGCTCTTGGAGTTGTGTGATTATCTTCTTGAGGAAAGCGCGGATGTGCTAGATGATGCGGAATACGCGATCGAGGACTAGTGCACACTAACCAGATATGGCATTTAGATCTTGCTATATTCTAACTTAGATGCTGTAATGCTGACCTGTAGGAGGGGGGAAGAGCACCTGTAGAATTTTTCATTTTAGGCTCTGGCTATGGTATACCTGGGATCCCCAATTCCAACTATTTTGCCTCTTGTTGGTATTGGGAGTTGGGAGTTGGAATGTACACAAACTCTAGGTTAGACATTGAGGGCCCACTGTAACTATTGGCCTCTTGCTGTAAAAATGTAGCGATGTAATTTTTTGTCCATATCCATGG CCTTGGGTGTCTCAAATTCTGATGTTGTAGCATTACATCCTATGTGAATGGCATCTAACC ATGAGTCAAAGGTGCAACACGTCAAAGCATGTGCTAAAGGTTGTACCCGGTCTAACCTGATTGGTGAAGGTCCCTTCAAATCCTGCATGATTAGAGGCTTACCATGCAACTATGCGAAGTCAAAACCTGTAATTGTAACTGTAACGTGAGAGATGGTGTACCGGCAGTACAAGTTGTTTGAGTTGCTGCCAGATGATGATGTATTTGATGTTGCATGCTTTGAATGAGTATTCA ] [+] EMBL BQ908975 [ CATTGAGGNCCCACTGTAACTATTGGCCTCTTGCTGTAAAAATGTAGCGATGTAATTTTTTGTCCATATCCATGGCCCTTGGGTGTCTCAAATTCTGATGTTGTAGCATTACATCCTATGTGAATGGCATCTAACCATATGAGTCAAAGGTGCAACACGTCAAAGTATGTGCTAAAGGTTGTACCCGGTCTAACCTGATTGGTGAAGGTCCCTTCAAATCCTGCATGATTAGAGGCTTACCATACAACTATGCGAAGTCAAAACCTGTAATTGTAACTGTAACGTGAGAGATGGTGTACCGGCAGTACAAGTTGTTTGAGTTGCTGCCAGATGATGATGTATTTGATGTTGCATGCTTTGAATGAGTATTCACCGCTCAACGATATCATTGGATGGTGCAGTTCATAGTTTCATACCTTTGGTTTTTGGTTTGTGATGTTGTAGCAACAGAACAACAAGTAATCATCCATTAAACAATCAAGTCCCTTTCTCCTAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||