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Oryza sativa
cluster # 2110 cluster # 2110       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2110#0 length = 490 sequences # 2  

consensusID : consensus_2110#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 490
fasta sequence
                              [GTCAGCNCCTCTGTCCCNCCTCGCGCGACGNCCCCATCAGCTCGCCGGTCCAACGTCGCCGTGAGGGATCCCCCTCCTCCCTGCCGAGCTACAGCACCCTATTCCCCACTGCTGCACAGTGAGTGACAATGATGAAGACTATATGCCACCAATCGATTCATCTGAAGAAGAAGAAGAACCGTATGTTAGCACAGCACCAGATGATGGTGACATGTGCACCTTTCGGGATTTAATTGCAAACTCTCTGATGGCAAATAGACGACGCGGTACATAAAACTATGCATATGGTTCAGGTTGTATTTTGCTATGTGGTTGATGTATATATGGTAGTGGTTAATTAATTAGTACTTTGTTATTTGCATATATAGCGATGGCAAATTAGGCTTTTGTATGTGCTTGATGAACACATTTAGGTGGAAAAGTACAATGTATGTGTTTGCATTAAGTGATTAATTTGACCCTCCTTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU029924             [GTCAGCNCCTCTGTCCCNCCTCGCGCGACGNCCCCATCAGCTCGCCGGTCCAACGTCGCCGTGAGGGATCCCCCTCCTCCCTGCCGAGCTACAGCACCCTATTCCCCACTGCTGCACAGTGAGTGACAATGATGAAGACTATATGCCACCAATCGATTCATCTGAAGAAGAAGAAGAACCGTATGTTAGCACAGCACCAGATGATGGTGACATGTGCACCTTTCGGGATTTAATTGCAAACTCTCTGATGGCAAATAGACGACGCGGTACATAAAACTATGCATATGGTTCAGGTTGTATTTTGCTATGTGGTTGATGTATATATGGTAGTGGTTAATTAATTAGTACTTTGTTATTTGCATATATAGCGATGGCAAA                                                                                                                ]
[+] EMBL AU091962             [                                            CCGGTCCAACGTCGCCGTGAGGGATCCCCCTCCTCCCTGCCGAGCTACAGCACCCTATTCCCCACTGCTGCACAGTGNGTGACAATGATGAAGACTATATGCCNCCAATCGATTCATCTGAAGAAGAAGAAGAACCGTATGTTAGCACAGCACCNGATGATGGTGACATGTGCNCCTTTCGGGATTTAATTGCAAACTCTCTGATGGCAAATAGACGACGCGGTACATAAAACTATGCATATGGTTCAGGTTGTATTTTGCTATGTGGTTGATGTATATATGGTNGTGGTTAATTAATTAGTACTTTGTTATTTGCATATATAGCGATGGCAAATTAGGCTTTTGTATGTGCTTGATGAACACATTTAGGTGGAAAAGTACAATGTATGTGTTTGCATTAAGTGATTAATTTGACCCTCCTTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_2110#0 GTCAGCNCCTCTGTCCCNCCTCGCGCGACGNCCCCATCAGCTCGCCGGTCCAACGTCGCC GTGAGGGATCCCCCTCCTCCCTGCCGAGCTACAGCACCCTATTCCCCACTGCTGCACAGT GAGTGACAATGATGAAGACTATATGCCACCAATCGATTCATCTGAAGAAGAAGAAGAACC GTATGTTAGCACAGCACCAGATGATGGTGACATGTGCACCTTTCGGGATTTAATTGCAAA CTCTCTGATGGCAAATAGACGACGCGGTACATAAAACTATGCATATGGTTCAGGTTGTAT TTTGCTATGTGGTTGATGTATATATGGTAGTGGTTAATTAATTAGTACTTTGTTATTTGC ATATATAGCGATGGCAAATTAGGCTTTTGTATGTGCTTGATGAACACATTTAGGTGGAAA AGTACAATGTATGTGTTTGCATTAAGTGATTAATTTGACCCTCCTTATTAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)