cluster # 2308

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Oryza sativa
cluster # 2308 cluster # 2308 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2308#0 length = 772 sequences # 2

consensusID : consensus_2308#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 772
fasta sequence

                              [TATTCTTTAAATAACTATACTAAAAACTAAGAAAACTTTTTTGCATGATTCAAATGAAAAATCTTTCTCAACGATTTCTCCTCTACTACTTCTACTAACAAGAGTAGACGTGCAAAATTTATGTTTGTTCCTGAAGGGAAAACCGTTCGAGTTGTTCCTGAATAGCTTCCTTCAAAAGGATTTCCGCTTCCTCGGTGAATGTCTTGCTAGAAGATATAATTTCTTGGAATTGAGGTTTAGTATCTTTTAGGTGTTTACGTAACTCATCCAGAAATTTCTTTACCTGTCCAATTTCTAAGGAATCAAGATATCCTCTTGTTCCGATATAAATAGTAGCTATCTGCTCTTCCACTGGAAGAGGATTTGCTTGGGATTGTTTAAGCAATTCTCGTAATCGTCGGCCCCTTGCCAATTGATTCTGACTTGTTTTATCGAGAGCAGAGGCGAATTGTGCAAAGGCTTGTAACTCCGCGAATTGAGCTAATTCCAATTTTAATTTGCCAGCTACTTGTTTCATGGCTTTAATTTGAGCCGCGGATCCTACTCTGGAAACGGAAATACCCACATTAATAGCAGGCCGAATTCCGGCATTGAATAGATCTGCGGATAAGAATATTTGTCCATCTGTAATGGAGATTACATTAGTAGGAATATAGGCGGAAACGTCTCCAGATTGAGTCTCAACTATTGGTAAAGCAGTCATACTTCCTTCCCCTAAAAGAGAATTTAATTTAGCGGCTCTTTCTAAAAGGCGTGAATGCAAATAAAAAAC]

[+] EMBL CB619390             [TATTCTTTAAATAACTATACTAAAAACTAAGAAAACTTTTTTGCATGATTCAAATGAAAAATCTTTCTCAACGATTTCTCCTCTACTACTTCTACTAACAAGAGTAGACGTGCAAAATTTATGTTTGTTCCTGAAGGGAAAACCGTTCGAGTTGTTCCTGAATAGCTTCCTTCAAAAGGATTTCCGCTTCCTCGGTGAATGTCTTGCTAGAAGATATAATTTCTTGGAATTGAGGTTTAGTATCTTTTAGGTGTTTACGTAACTCATCCAGAAATTTCTTTACCTGTCCAATTTCTAAGGAATCAAGATATCCTCTTGTTCCGATATAAATAGTAGCTATCTGCTCTTCCACTGGAAGAGGATTTGCTTGGGATTGTTTAAGCAATTCTCGTAATCGTCGGCCCCTTGCCAATTGATTCTGACTTGTTTTATCGAGAGCAGAGGCGAATTGTGCAAAGGCTTGTAACTCCGCGAATTGAGCTAATTCCAATTTTAATTTGCCAGCTACTTGTTTCATGGCTTTAATTTGAGCCGCGGATCCTACTCTGGAAACGGAAATACCCACATTAATAGCAGGCCGAATTCCGGCATTGAATAGATCTGCGGATAAGAATATTTGTCCATCTGTAATGGAGATTACATTAGTAGGAATATAGGCGGAAACGTCTCCAGATTGAGTCTCAACTATTGGTAAAGCAGTCATACTTCCTTCCCCTAAAAGAGAATTTAATTTAGCGGCTCTTTCTAAAAGGCGTGAATGCAAATAAAAAAC]
[+] EMBL CA761980             [                               tttttTTTTTTGCATGATTCAAATGAAAAATCTTTCTCAACGATTTCTCCTCTACTACTTCTACTAACAAGAGTAGACGTGCAAAATTTATGTTTGTTCCTGAAGGGAAAACCGTTCGAGTTGTTCCTGAATAGCTTCCTTCAAAAGGATTTCCGCTTCCTCGGTGAATGTCTTGCTAGAAGATATAATTTCTTGGAATTGAGGTTTAGTATCTTTTAGGTGTTTACGTAACTCATCCAGAAATTTCTTTACCTGTCCAATTTCTAAGGAATCAAGATATCCTCTTGTTCCGATATAAATAGTAGCTATCTGCTCTTCCACTGGAAGAGGATTTACTTGGGATTGTTTAAGCAATTCTCGTAATCGTCGGCCCCTTGCCAATTGATTCTGACTTGTTTTATCGAGAGCAGAGGCGAATTGTGCAAAGGCTTGTAACTCTGCGAATTGAGCTAATTCCAATTTTGATTTGCCAGCTACTTGTTTCATGGCTTTAATTTGAGCCGCGGATCCTACTCTGGAAACGGAAATACCCACATTAATAGCAGGCCGAATTCCGGCATTGAATAGATCTGCGGATAAGAATATTTGTCCATCTGNTATGGAGATTACATTAGTAGGAATATAGGCGGAAACGTCTCCAGATTGAGTCTCAACTATTGGTAAAGCAGTCATACTTCCTTCC                                                           ]




>consensus_2308#0
TATTCTTTAAATAACTATACTAAAAACTAAGAAAACTTTTTTGCATGATTCAAATGAAAA
ATCTTTCTCAACGATTTCTCCTCTACTACTTCTACTAACAAGAGTAGACGTGCAAAATTT
ATGTTTGTTCCTGAAGGGAAAACCGTTCGAGTTGTTCCTGAATAGCTTCCTTCAAAAGGA
TTTCCGCTTCCTCGGTGAATGTCTTGCTAGAAGATATAATTTCTTGGAATTGAGGTTTAG
TATCTTTTAGGTGTTTACGTAACTCATCCAGAAATTTCTTTACCTGTCCAATTTCTAAGG
AATCAAGATATCCTCTTGTTCCGATATAAATAGTAGCTATCTGCTCTTCCACTGGAAGAG
GATTTGCTTGGGATTGTTTAAGCAATTCTCGTAATCGTCGGCCCCTTGCCAATTGATTCT
GACTTGTTTTATCGAGAGCAGAGGCGAATTGTGCAAAGGCTTGTAACTCCGCGAATTGAG
CTAATTCCAATTTTAATTTGCCAGCTACTTGTTTCATGGCTTTAATTTGAGCCGCGGATC
CTACTCTGGAAACGGAAATACCCACATTAATAGCAGGCCGAATTCCGGCATTGAATAGAT
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AAACGTCTCCAGATTGAGTCTCAACTATTGGTAAAGCAGTCATACTTCCTTCCCCTAAAA
GAGAATTTAATTTAGCGGCTCTTTCTAAAAGGCGTGAATGCAAATAAAAAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case