cluster # 2559

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Oryza sativa
cluster # 2559 cluster # 2559 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2559#0 length = 1770 sequences # 2
consensusID : consensus_2559#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1770
fasta sequence
                              [AGACAGACTGCCATGTCTCTATCGATTCCAATGGTCTGTTGCTGAAAAGGACAATCTGGTAGAGCGGCTCGCACGATACAGACACATGCACTTCTTGGGGATGCTCGCCCCTCCTTCCTAGTAACATTCTTCACCCCCCATTTTCTTTGTTTCTACTTCTCTTTCCCTTTCTTGTGCTCCCTCCCCTCCTCAATCCGTATATATAAGCTAGCTGCTCGTTCTTGTTGGCTCCTTCTTCCTATTATTTCTTTGTTTGCTCCCTCCCCTTGCTGGTTGGCTGGCTGGGTCGGTCGGGTTCTTTCTTGATCTGCATTTCGCCCTCCGCCACCGGGATGGAGAACGGACACGCCAAGAATCTTGTGGCCGTCATCGGCAGCGGCAACTGGGGCAGCGTCGCCTCCCGCCTCATCGCTTCTAACACCGCTAAGTTGCCCTCCTTTCATGATGAAGTAAGGATGTGGGTGTTTGAAGAAATATTACCAACAGGCAAGAAGCTCTCTGAGTCCATTAACCAAGCAAATGAGAATTGCAAATACTTACCTGGTATAAAGCTCGGAGCTAATGTAATTGCTGATCCTGATTTGGAGAATGCAGTGAAAGATGCAAATATGCTTGTTTTTGTGACTCCCCATCAATTTGTGGAGGGTATATGTAAGAAGCTTGTGGGTAAACTAAGGCCAGGAACTGAGGGTATCTCCCTCATCAAGGGCATGGAGGTCAAGATGGAAGGACCATGCATGATATCTAAATTAATTACAAACATACTTGGAATCAATTGCTGTGTCCTTATGGGTGCTAACATTGCAAATGAGATTGCTGTTGAGAAATTCAGTGAAGCGACAATTGGATATAAGAAAGACAAGGAAGTGGCAACCCGATGGGCTAAACTTTTTACAACACCTTACTTCCTGGTTTCTGTTGTAGAGGATATTGAAGGAGTTGAATTATGTGGAACACTGAAAAATGTCGTGGCCATTGCAGCAGGTCTTGTTGATGGTTTGGATATGGGGAACAATACCAAGGCTGCAATAATGAGGATTGGTTTGCGGGAAATGCGTGCTTTCTCTAAGCTTCTATCCCCTACAGTCAGGGACAACACTTTCTTTGAGAGCTGTGGTGTGGCTGACCTAATAACTACATGCCTTGGTGGGAGAAACAGAAGAGTCGCTGAGGCCTTTGCACGAAATGGTGGCAAAAGGTCTTTTGATGAGTTGGAGGCCGAGATGCTACATGGCCAAAAACTTCAGGGAGTGTCCACAGCAAAAGAAGTTTATGAAGTCTTGACTTATCGAGGGTGGCAAGAATTGTTTCCTCTTCTGTCCACAGTGCATGAGATTTGTATTGGTCAGCTACCTCCTACATCAATAGTTGAATACAGAATCCACTGAATGCTGTTCTCTGAAGATGTCATCAATAACAGTTTCAGCTTGCTAAAGGTCTTGAAGGACCTCTGCTTTCTAGTGGAGCAAGGCTCAGGAAATTCTTCATGTCAGTGTTCTTCGTTGCGGGGTCATCAACTCATCTGTCAGATCTTGGACATTTCCAGGCCTTCAGCAACAGTCCATGCAAGAAGTCGTCAGAATGCACTTACATTTCACATCTGTTTATGACTGATTACACATTATGCTCATATGTGCTTTA-TTCTTTTAATGATACAACGCATCAGTATGTGAGCAATATAGTTTGCTCATATTTGTTATCGTCTAACAGTGGCTTGTTAACTATGTTGAGGTTTTATATTCACAACTAAAAACTTTGTAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK070366             [AGACAGACTGCCATGTCTCTATCGATTCCAATGGTCTGTTGCTGAAAAGGACAATCTGGTAGAGCGGCTCGCACGATACAGACACATGCACTTCTTGGGGATGCTCGCCCCTCCTTCCTAGTAACATTCTTCACCCCCCATTTTCTTTGTTTCTACTTCTCTTTCCCTTTCTTGTGCTCCCTCCCCTCCTCAATCCGTATATATAAGCTAGCTGCTCGTTCTTGTTGGCTCCTTCTTCCTATTATTTCTTTGTTTGCTCCCTCCCCTTGCTGGTTGGCTGGCTGGGTCGGTCGGGTTCTTTCTTGATCTGCATTTCGCCCTCCGCCACCGGGATGGAGAACGGACACGCCAAGAATCTTGTGGCCGTCATCGGCAGCGGCAACTGGGGCAGCGTCGCCTCCCGCCTCATCGCTTCTAACACCGCTAAGTTGCCCTCCTTTCATGATGAAGTAAGGATGTGGGTGTTTGAAGAAATATTACCAACAGGCAAGAAGCTCTCTGAGTCCATTAACCAAGCAAATGAGAATTGCAAATACTTACCTGGTATAAAGCTCGGAGCTAATGTAATTGCTGATCCTGATTTGGAGAATGCAGTGAAAGATGCAAATATGCTTGTTTTTGTGACTCCCCATCAATTTGTGGAGGGTATATGTAAGAAGCTTGTGGGTAAACTAAGGCCAGGAACTGAGGGTATCTCCCTCATCAAGGGCATGGAGGTCAAGATGGAAGGACCATGCATGATATCTAAATTAATTACAAACATACTTGGAATCAATTGCTGTGTCCTTATGGGTGCTAACATTGCAAATGAGATTGCTGTTGAGAAATTCAGTGAAGCGACAATTGGATATAAGAAAGACAAGGAAGTGGCAACCCGATGGGCTAAACTTTTTACAACACCTTACTTCCTGGTTTCTGTTGTAGAGGATATTGAAGGAGTTGAATTATGTGGAACACTGAAAAATGTCGTGGCCATTGCAGCAGGTCTTGTTGATGGTTTGGATATGGGGAACAATACCAAGGCTGCAATAATGAGGATTGGTTTGCGGGAAATGCGTGCTTTCTCTAAGCTTCTATCCCCTACAGTCAGGGACAACACTTTCTTTGAGAGCTGTGGTGTGGCTGACCTAATAACTACATGCCTTGGTGGGAGAAACAGAAGAGTCGCTGAGGCCTTTGCACGAAATGGTGGCAAAAGGTCTTTTGATGAGTTGGAGGCCGAGATGCTACATGGCCAAAAACTTCAGGGAGTGTCCACAGCAAAAGAAGTTTATGAAGTCTTGACTTATCGAGGGTGGCAAGAATTGTTTCCTCTTCTGTCCACAGTGCATGAGATTTGTATTGGTCAGCTACCTCCTACATCAATAGTTGAATACAGAATCCACTGAATGCTGTTCTCTGAAGATGTCATCAATAACAGTTTCAGCTTGCTAAAGGTCTTGAAGGACCTCTGCTTTCTAGTGGAGCAAGGCTCAGGAAATTCTTCATGTCAGTGTTCTTCGTTGCGGGGTCATCAACTCATCTGTCAGATCTTGGACATTTCCAGGCCTTCAGCAACAGTCCATGCAAGAAGTCGTCAGAATGCACTTACATTTCACATCTGTTTATGACTGATTACACATTATGCTCATATGTGCTTTA TTCTTTTAATGATACAACGCATCAGTATGTGAGCAATATAGTTTGCTCATATTTGTTATCGTCTAACAGTGGCTTGTTAACTATGTTGAGGTTTTAT                                ]
[-] EMBL CA762967             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGTGTGGCTGACCTAATAACTACATGCCTTGGTGGGAGAAACAGAAGAGTCGCTGAGGCCTTTGCACGAAATGGTGGCAAAAGGTCTTTTGATGAGTTGGAGGCCGAGATGCTACATGGCCAAAAACTTCAGGGAGTGTCCACAGCAAAAGAAGTTTATGAAGTCTTGACTTATCGAGGGTGGCAAGAATTGTTTCCTTTTCTGTCCACAGTGCATGAGATTTGTATTGGTCAGCTACCTCCTACATCAATAGTTGAATACAGAATCCACTGAATGCTGTTCTCTGAAGATGTCATCAATAACAGTTTCAGCTTGCTAAAGGTCTTGAAGGACCTCTGCTTTCTAGTGGAGCAAGGCTCAGGAAATTCTTCATGTCAGTGTTTTTCGTTGCGGGGTCATCAACTCATCTGTCAGATCTTGGACATTTCCAGGCCTTCAGCAACAGTCCATGCAAGAAGTCGTCAGAATGCACTTACATTTCACATCTGTTTATGACTGATTACACATTATGCTCATATGTGCTTTATTTTTTTTAATGATACAACGCATCGGTATGTGAGCAATATAGTTTGCTCATATTTGTTATCGTCTAACAGTGGCTTGTTAACTATGTTGAGGTTTTATATTCACAACTAAAAACTTTGTAAAAAAAAAAA]




>consensus_2559#0
AGACAGACTGCCATGTCTCTATCGATTCCAATGGTCTGTTGCTGAAAAGGACAATCTGGT
AGAGCGGCTCGCACGATACAGACACATGCACTTCTTGGGGATGCTCGCCCCTCCTTCCTA
GTAACATTCTTCACCCCCCATTTTCTTTGTTTCTACTTCTCTTTCCCTTTCTTGTGCTCC
CTCCCCTCCTCAATCCGTATATATAAGCTAGCTGCTCGTTCTTGTTGGCTCCTTCTTCCT
ATTATTTCTTTGTTTGCTCCCTCCCCTTGCTGGTTGGCTGGCTGGGTCGGTCGGGTTCTT
TCTTGATCTGCATTTCGCCCTCCGCCACCGGGATGGAGAACGGACACGCCAAGAATCTTG
TGGCCGTCATCGGCAGCGGCAACTGGGGCAGCGTCGCCTCCCGCCTCATCGCTTCTAACA
CCGCTAAGTTGCCCTCCTTTCATGATGAAGTAAGGATGTGGGTGTTTGAAGAAATATTAC
CAACAGGCAAGAAGCTCTCTGAGTCCATTAACCAAGCAAATGAGAATTGCAAATACTTAC
CTGGTATAAAGCTCGGAGCTAATGTAATTGCTGATCCTGATTTGGAGAATGCAGTGAAAG
ATGCAAATATGCTTGTTTTTGTGACTCCCCATCAATTTGTGGAGGGTATATGTAAGAAGC
TTGTGGGTAAACTAAGGCCAGGAACTGAGGGTATCTCCCTCATCAAGGGCATGGAGGTCA
AGATGGAAGGACCATGCATGATATCTAAATTAATTACAAACATACTTGGAATCAATTGCT
GTGTCCTTATGGGTGCTAACATTGCAAATGAGATTGCTGTTGAGAAATTCAGTGAAGCGA
CAATTGGATATAAGAAAGACAAGGAAGTGGCAACCCGATGGGCTAAACTTTTTACAACAC
CTTACTTCCTGGTTTCTGTTGTAGAGGATATTGAAGGAGTTGAATTATGTGGAACACTGA
AAAATGTCGTGGCCATTGCAGCAGGTCTTGTTGATGGTTTGGATATGGGGAACAATACCA
AGGCTGCAATAATGAGGATTGGTTTGCGGGAAATGCGTGCTTTCTCTAAGCTTCTATCCC
CTACAGTCAGGGACAACACTTTCTTTGAGAGCTGTGGTGTGGCTGACCTAATAACTACAT
GCCTTGGTGGGAGAAACAGAAGAGTCGCTGAGGCCTTTGCACGAAATGGTGGCAAAAGGT
CTTTTGATGAGTTGGAGGCCGAGATGCTACATGGCCAAAAACTTCAGGGAGTGTCCACAG
CAAAAGAAGTTTATGAAGTCTTGACTTATCGAGGGTGGCAAGAATTGTTTCCTCTTCTGT
CCACAGTGCATGAGATTTGTATTGGTCAGCTACCTCCTACATCAATAGTTGAATACAGAA
TCCACTGAATGCTGTTCTCTGAAGATGTCATCAATAACAGTTTCAGCTTGCTAAAGGTCT
TGAAGGACCTCTGCTTTCTAGTGGAGCAAGGCTCAGGAAATTCTTCATGTCAGTGTTCTT
CGTTGCGGGGTCATCAACTCATCTGTCAGATCTTGGACATTTCCAGGCCTTCAGCAACAG
TCCATGCAAGAAGTCGTCAGAATGCACTTACATTTCACATCTGTTTATGACTGATTACAC
ATTATGCTCATATGTGCTTTATTCTTTTAATGATACAACGCATCAGTATGTGAGCAATAT
AGTTTGCTCATATTTGTTATCGTCTAACAGTGGCTTGTTAACTATGTTGAGGTTTTATAT
TCACAACTAAAAACTTTGTAAAAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case