cluster # 2675

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Oryza sativa
cluster # 2675 cluster # 2675 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2675#0 length = 543 sequences # 2

consensusID : consensus_2675#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 543
fasta sequence

                              [GGGTTATATCGATCTAATCATTTCTCCCTTGCCAATTAAGTCTCCATCGATCGGTAAATCAGCTATGGAAGCGAGAAAAGCCAGTGTTGTTTGCTGCATCTTACTGCTTGTGTTAGCACTTGGAGGTCCTGCTTCTGCCACAGATTATTGCTACAAAGCCATTGGCAAGCTGATCGTCTGCGTGGGTCCTACGTGCAAGTTGGACTGTTGGCTTGAGGCGAAATACAATAAAGGCAGAGTCAAGCGTCACAAGTGCATGAAACATGGCATATTTGCCAAATGTTACTGCGAAATCTGTGTTACATTTTGAGGGAATCGATCGACAATTTGTAAAAGTCTTTAGTTGATTTAGTCTCGT-GTAATAATCTAGTACGTTG-TTTGCTAGCTAGTTTCTTTTAATAATTGATTAGTTTT-GGGAGTTGCTTTTGTTTGGATATAGGATATGTGATTATTTAATTTCTTCCTCCAATGTATCAGTTATCACTGTACTCTCATTCAAGATTTTTTTTAAAATAAAGTATAAGTGATAATTGCATTAAAAAA]

[+] EMBL AU101251             [GGGTTATATCGATCTAATCATTTCTCCCTTGCCAATTAAGTCTCCATCGATCGGTAAATCAGCTATGGAAGCGAGAAAAGCCAGTGTTGTTTGCTGCATCTTACTGCTTGTGTTAGCACTTGGAGGTCCTGCTTCTGCCACAGATTATTGCTACAAAGCCATTGGCAAGCTGATCGTCTGCGTGGGTCCTACGTGCAAGTTGGACTGTTGGCTTGAGGCGAAATACAATAAAGGCAGAGTCAAGCGTCACAAGTGCATGAAACATGGCATATTTGCCAAATGTTACTGCGAAATCTGTGTTACATTTTGAGGGAATCGATCGACAATTTGTAAAAGTCTTTAGTTGATTTAGTCTCGT GTAATAATCTAGTACGTTG TTTGCTAGCTAGTTTCTTTTAATAATTGATTAGTTTT GGGAGTTGCTTTTGTTTGGATATAGGATATGTGATTATTTAATTTCTTCCTCCAATGTATCAGTTATCACTGTACTCTCATTCAAGATTTTTTTTAAAATAAAGTATAAGTGATAATTGCATTAAAAAA]
[+] EMBL C73342               [GGGTTATATCGATCTAATCATTTCTCCCTTGCCAATTAAGTCTCCATCGATCGGTAAATCAGCTATGGAAGCGAGAAAAGCCAGTNTTGTTTGCTGCATCTNACTGCTTGTNTTAGCACTTGGAGGTCCTGCTTCTGCCACAGATTATTGCTACAAAGCCATTGGCAAGCTGATCGTCTGCGTGGGTCCTACGTGCAAGTTGGACTGTTGGCTTGAGGCGAAATACAATAAAGGCAGAGTCAAGCGTCACAAGTGCATGAAACATGGCATATTTGCCAAATGTTACTGCGAAATCTGTGTTACATTTTGAGGGAATCGATCGACAATTTGTAAAAGTCTTTAGTTGATTTAGTCTCGTGGTAATAATCTAGTACGTTGNTTTGCTAGCTAGTTTCTTTTAATAATTGATTAGTTTTGGGGAGTTGCTTTTNGTTGGGTATAGGgnt                                                                                                    ]




>consensus_2675#0
GGGTTATATCGATCTAATCATTTCTCCCTTGCCAATTAAGTCTCCATCGATCGGTAAATC
AGCTATGGAAGCGAGAAAAGCCAGTGTTGTTTGCTGCATCTTACTGCTTGTGTTAGCACT
TGGAGGTCCTGCTTCTGCCACAGATTATTGCTACAAAGCCATTGGCAAGCTGATCGTCTG
CGTGGGTCCTACGTGCAAGTTGGACTGTTGGCTTGAGGCGAAATACAATAAAGGCAGAGT
CAAGCGTCACAAGTGCATGAAACATGGCATATTTGCCAAATGTTACTGCGAAATCTGTGT
TACATTTTGAGGGAATCGATCGACAATTTGTAAAAGTCTTTAGTTGATTTAGTCTCGTGT
AATAATCTAGTACGTTGTTTGCTAGCTAGTTTCTTTTAATAATTGATTAGTTTTGGGAGT
TGCTTTTGTTTGGATATAGGATATGTGATTATTTAATTTCTTCCTCCAATGTATCAGTTA
TCACTGTACTCTCATTCAAGATTTTTTTTAAAATAAAGTATAAGTGATAATTGCATTAAA
AAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case