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Oryza sativa
cluster # 2746 cluster # 2746       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2746#0 length = 779 sequences # 2  

consensusID : consensus_2746#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 779
fasta sequence
                              [ACTTTCGGCTGTGTCCTTTCCTCCGCCTTTCCAACTTCCACAAATTTTTGACAATTTAACCCTTTTCGAAAACTAATTTTACAAATAAATCGTGCCCAAACTTATTTAAAAAATGACGCTTTTGTTCAGCGTCAAATCGTATGGCGCTGAAATTAGACACCTCAACGCCAAATAGAACGACGCTGAATGCACGTTGGCACGCCGACTCAGTCTCTCGTCCGCGGTGACACGATATTCTGCGCCAATTGACGTAGCACTGAGGTGTCTAAGTTTAGCGACATACGATTTGACGCTAAACAAAAAGTGTCATTTTTAAAATAAGTTTTGGCCACGATTCATTTGTAAAATTAGTTTTTGGAAAGAGTCAAATTGTCAAAATTTGTGTTCCAACTCTTGTGTCCACATTTTTAAAACAAAATTATAGTAAAGTTTATTTTTAAAATACATATTAATCTATTTTTTAAAATTGCTACAGCTGACATTTAATTAATCATATGTTCCTTTTAGTCCGCAGAGATTTAGTTTTCGACCTGATTTGCCGTACACTGCCAGAAATTTCGTGAGAGAGCTTGATTTCGAAAATAATCATTGCTTTCCGAATAGTCTTGTCTTAAAAGAAAGAGCTTTTTTTTTACTTGGTTGAATTAGCTACAGCCTTATAGTTGGTCCATTGGGCCCTGCAGAGATGGAAATTGTGCCTAGTTGATGTGGGACTTGGGCCCATCGTGCTTAGTGCCAAAACGGGCCAGGATTTTTATACCGTGTGGGCCGACGTGACT]

[+] EMBL CB684319             [ACTTTCGGCTGTGTCCTTTCCTCCGCCTTTCCAACTTCCACAAATTTTTGACAATTTAACCCTTTTCGAAAACTAATTTTACAAATAAATCGTGCCCAAACTTATTTAAAAAATGACGCTTTTGTTCAGCGTCAAATCGTATGGCGCTGAAATTAGACACCTCAACGCCAAATAGAACGACGCTGAATGCACGTTGGCACGCCGACTCAGTCTCTCGTCCGCGGTGACACGATATTCTGCGCCAATTGACGTAGCACTGAGGTGTCTAAGTTTAGCGACATACGATTTGACGCTAAACAAAAAGTGTCATTTTTAAAATAAGTTTTGGCCACGATTCATTTGTAAAATTAGTTTTTGGAAAGAGTCAAATTGTCAAAATTTGTGTTCCAACTCTTGTGTCCACATTTTTAAAACAAAATTATAGTAAAGTTTATTTTTAAAATACATATTAATCTATTTTTTAAAATTGCTACAGCTGACATTTAATTAATCATATGTTCCTTTTAGTCCGCAGAGATTTAGTTTTCGACCTGATTTGCCGTACACTGCCAGAAATTTCGTGAGAGAGCTTGATTTCGAAAATAATCATTGCTTTCCGAATAGTCTTGTCTTAAAAGAAAGAGCTTTTTTTTTACTTGGTTGAATTAGCTACAGCCTTATAGTTGGTCCATTGGGCCCTGCAGAGATGGAAATTGTGCCTAGTTGATGTGGGACTTGGGCCCATCGTGCTTAGTGCCAAAACGGGCCAG                              ]
[+] EMBL CB684318             [                                                                 TCGAAAACTAATTTTACAAATAAATCGTGCCCAAACTTATTTAAAAAATGACGCTTTTGTTCAGCGTCAAATCGTATGGCGCTGAAATTAGACACCTCAACGCCAAATAGAACGACGCTGAATGCACGTTGGCACGCCGACTCAGTCTCTCGTCCGCGGTGACACGATATTCTGCGCCAATTGACGTAGCACTGAGGTGTCTAAGTTTAGCGACATACGATTTGACGCTAAACAAAAAGTGTCATTTTTAAAATAAGTTTTGGCCACGATTCATTTGTAAAATTAGTTTTTGGAAAGAGTCAAATTGTCAAAATTTGTGTTCCAACTCTTGTGTCCACATTTTTAAAACAAAATTATAGTAAAGTTTATTTTTAAAATACATATTAATCTATTTTTTAAAATTGCTACAGCTGACATTTAATTAATCATATGTTCCTTTTAGTCCGCAGAGATTTAGTTTTCGACCTGATTTGCCGTACACTGCCAGAAATTTCGTGAGAGAGCTTGATTTCGAAAATAATCATTGCTTTCCGAATAGTCTTGTCTTAAAAGAAAGAGCTTTTTTTTTACTTGGTTGAATTAGCTACAGCCTTATAGTTGGTCCATTGGGCCCTGCAGAGATGGAAATTGTGCCTAGTTGATGTGGGACTTGGGCCCATCGTGCTTAGTGCCAAAACGGGCCAGGATTTTTATACCGTGTGGGCCGACGTGACT]


>consensus_2746#0 ACTTTCGGCTGTGTCCTTTCCTCCGCCTTTCCAACTTCCACAAATTTTTGACAATTTAAC CCTTTTCGAAAACTAATTTTACAAATAAATCGTGCCCAAACTTATTTAAAAAATGACGCT TTTGTTCAGCGTCAAATCGTATGGCGCTGAAATTAGACACCTCAACGCCAAATAGAACGA CGCTGAATGCACGTTGGCACGCCGACTCAGTCTCTCGTCCGCGGTGACACGATATTCTGC GCCAATTGACGTAGCACTGAGGTGTCTAAGTTTAGCGACATACGATTTGACGCTAAACAA AAAGTGTCATTTTTAAAATAAGTTTTGGCCACGATTCATTTGTAAAATTAGTTTTTGGAA AGAGTCAAATTGTCAAAATTTGTGTTCCAACTCTTGTGTCCACATTTTTAAAACAAAATT ATAGTAAAGTTTATTTTTAAAATACATATTAATCTATTTTTTAAAATTGCTACAGCTGAC ATTTAATTAATCATATGTTCCTTTTAGTCCGCAGAGATTTAGTTTTCGACCTGATTTGCC GTACACTGCCAGAAATTTCGTGAGAGAGCTTGATTTCGAAAATAATCATTGCTTTCCGAA TAGTCTTGTCTTAAAAGAAAGAGCTTTTTTTTTACTTGGTTGAATTAGCTACAGCCTTAT AGTTGGTCCATTGGGCCCTGCAGAGATGGAAATTGTGCCTAGTTGATGTGGGACTTGGGC CCATCGTGCTTAGTGCCAAAACGGGCCAGGATTTTTATACCGTGTGGGCCGACGTGACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)