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Oryza sativa
cluster # 2783 cluster # 2783       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2783#0 length = 1892 sequences # 2  

consensusID : consensus_2783#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1892
fasta sequence
                              [GAATATTTGATGGACAGGATTGGCCTATCTCACTTCCTATCTCAAAGCGAAGAAGCACAATTCCTGCATATTCTCTAAAAACAGTAAGAAGATAGGATAGGTGGGGGGTGACCACACAAAAACAACCCAGTAATTAGCTAGAGCTAAGCTGCTCCCAAAAAAAAAAGTTGTGCCATCCTCTTATTATTCCGTATGTGCATTAGAATTTATTATTTGACACATACTAATTCCTTTTGTCATTGTCATATTGTCAATGAAACATTTAAACACCACATTAATGTCTCCCCATCCTAAGATTTTGTTTTCAGTTGCATTGTCATTTAGATATAATCACTCCTATGGGTTTTTGCAGTCCTGTTAGAAGCTCTTCTTGCTAGTTTATTCTGCTTGACTGCTTGTAAGTTGATTTGTTGAATGCTTCATTGAAGATTCTTTCTGAAAATGTAATCATAACTTAATTGTTCCATCTTCGCCGCAAAAAAGAAGAAGAAGAAAACATTGGATTGTTCCATCTATTTTGATTGCGTTATGACTTTCTAGGCAACTACAATATATATATTCTTCAGTAATTTTGCAATATAGTACAAAAGATTTAGCTATATATAAGTTTACTTTACAAGGCAAAATTTGTGTACACTTTCAATTTGAATGCAGTTTTGTGTCCTCAATGTAAATTTCCAATCTATTATAATAAAAATGTGCTTGATGCTTTTAAAAAGAAAGTTTCTGTTTCATGGGAATTCATGTACCCAATATCGAATGCCCTGTGTTGCAATGATTTGAAAATTGCTACTAAAATCATTACCGTAGTATACAAAGTTCTACAAACCTGCAATTCAATATCAAGTTTGATCTAGAAGTAAAGGAAAAAAGAAGACAAGAACCAATGTGAATGGTTCATCATGTCCCAAGTACAACTTGCCTTGTTTGGATCTTGACGTGTGGGATGAATCTGGCATTCATTTTCCTTTTTGCATGTCTGTACAACTTTATGTATACTTCACTCATGATTATTGAATACTGCAAATGTTGGATTTCACTATTTCTGCAACGGGGTTGTAGCCACATGTGCAGGGCACAGAAATGTTTAGTTTTGGTTGTTATTGCGACCTATGTTCTCCAATACATGTTGTTTCCTATTATGCCAAGTTGACTGGGTTAATTAGTGTCAACTCTGAATACAGAAAGGTTGTTTTGTTGCTTCAT-AATTTTGTGAAGCTCATGTACATACTTCGGTAATTCAACAATCCTATGTAACTGAGCCTAGCTTGGTGGAAGGTCAGCATCTCCACCCTCCACAACACCTGGGTTTGACCTCGCTTTGAGCTTAGGTTCCTTTTTTCTTCTTAGTGGAGAAAATCCTAATTTCTCTTATGTATTCTTTCTTGCATTGAGATTCCTGAATACCTGTTGATAGTTTTATTTATAGTTGGCAAATTTGACTGAATCATCCAGTTGATCCCAGATTATTCACATGTTTCATATACAGCACAAGTTCGTTCCATATTGAGAAAGGTTTGCAAGACTGTGAACTAGATATATGAGCCATCTTTCAGTTATTATTATTAAATTGGATGCCAACATTGCGTCAAAAAAAAAAAAAATGGATGCCAACAGAATATGAGGAACTGGAAGGCACCAGCCCTCAGTTTTCCTTCAACAGGCATGCAAGGTACAGAACCTGAGGTGGAGAATGAAATTTCAGGATTCAAACTCCAGGAATTTAATGATGAATTTTAGGTGGATGGAATCTTATATGGTCAACTTTGTAAAAGAAAGGTTCCTTTGTTTTGAGGCATCTGCTTAAGATGTTTAAATTCATGCTTTATGCCTTTGTTTTCTTTTCCTTTTTCTGGAGAGACACAATGGCTATTGTTTTCAATATAACCTTC]

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[+] EMBL AK101302             [GAATATTTGATGGACAGGATTGGCCTATCTCACTTCCTATCTCAAAGCGAAGAAGCACAATTCCTGCATATTCTCTAAAAACAGTAAGAAGATAGGATAGGTGGGGGGTGACCACACAAAAACAACCCAGTAATTAGCTAGAGCTAAGCTGCTCCCAAAAAAAAAAATTGTGCCATCCTCTTATTATTCCGTATGTGCATTAGAATTTATTATTTGACACATACTAATTCCTTTTGTCATTGTCATATTGTCAATGAAACATTTAAACACCACATTAATGTCTCCCCATCCTAAGATTTTGTTTTCAGTTGCATTGTCATTTAGATATAATCACTCCTATGGGTTTTTGCAGTCCTGTTAGAAGCTCTTCTTGCTAGTTTATTCTGCTTGACTGCTTGTAAGTTGATTTGTTGAATGCTTCATTGAAGATTCTTTCTGAAAATGTAATCATAACTTAATTGTTCCATCTTCGCCGCAAAAAAGAAGAAGAAGAAAACATTGGATTGTTCCATCTATTTTGATTGCGTTATGAC TTCTAGGCAACTACAATATATATATTCTTCAGTAATTTTGCAATATAGTACAAAAGATATAGCTATATATAAGTTTACTTTACAAGGCAAAATTTGTGTACACTTTCAATTTGAATGCAGTTTTGTGTCCTCAATGTAAATTTCCAATCTATTATAATAAAAATGTGCTTGATGCTTTTAAAAAGAAAGTTTCTGTTTCATGGGAATTCATGTACCCAATATCGAATGCCCTGTGTTGCAATGATTTGAAAATTGCTACTAAAATCATTACCGTAGTATACAAAGTTCTACAAACCTGCAATTCAATATCAAGTTTGATCTAGAAGTAAAGGAAAAAAGAAGACAAGAACCAATGTGAATGGTTCATCATGTCCCAAGTACAACTTGCCTTGTTTGGATCTTGACGTGTGGGATGAATCTGGCATTCATTTTCCTTTTTGCATGTCTGTACAACTTTATGTATACTTCACTCATGATTATTGAATACTGCAAATGTTGGATTTCACTATTTCTGCAACGGGGATGTAGCCACATGTGCAGGGCACAGAAATGTTTAGTTTTGGTTGTTATTGCGACCTATGTTCTCCAATACATGTTGTTTCCTATTATGCCAAGTTGACTGGGTTAATTAGTGTCAACTCTGAATACAGAAAGGTTGTTTTGTTGCTTCATCAATTTTGTGAAGCTCATGTACATACTTCGGTAATTCAACAATCCTATGTAACTGAGCCTAGCTTGGTGGAAGGTCAGCATCTCCACCCTCCACAACACCTGGGTTTGACCTCGCTTTGAGCTTAGGTTCCTTTTTTCTTCTTAGTGGAGAAAATCCTAATTTCTCTTATGTATTCTTTCTTGCATTGAGATTCCTGAATACCTGTTGATAGTTTTATTTATAGTTGGCAAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_2783#0 GAATATTTGATGGACAGGATTGGCCTATCTCACTTCCTATCTCAAAGCGAAGAAGCACAA TTCCTGCATATTCTCTAAAAACAGTAAGAAGATAGGATAGGTGGGGGGTGACCACACAAA AACAACCCAGTAATTAGCTAGAGCTAAGCTGCTCCCAAAAAAAAAAGTTGTGCCATCCTC TTATTATTCCGTATGTGCATTAGAATTTATTATTTGACACATACTAATTCCTTTTGTCAT TGTCATATTGTCAATGAAACATTTAAACACCACATTAATGTCTCCCCATCCTAAGATTTT GTTTTCAGTTGCATTGTCATTTAGATATAATCACTCCTATGGGTTTTTGCAGTCCTGTTA GAAGCTCTTCTTGCTAGTTTATTCTGCTTGACTGCTTGTAAGTTGATTTGTTGAATGCTT CATTGAAGATTCTTTCTGAAAATGTAATCATAACTTAATTGTTCCATCTTCGCCGCAAAA AAGAAGAAGAAGAAAACATTGGATTGTTCCATCTATTTTGATTGCGTTATGACTTTCTAG GCAACTACAATATATATATTCTTCAGTAATTTTGCAATATAGTACAAAAGATTTAGCTAT ATATAAGTTTACTTTACAAGGCAAAATTTGTGTACACTTTCAATTTGAATGCAGTTTTGT GTCCTCAATGTAAATTTCCAATCTATTATAATAAAAATGTGCTTGATGCTTTTAAAAAGA AAGTTTCTGTTTCATGGGAATTCATGTACCCAATATCGAATGCCCTGTGTTGCAATGATT TGAAAATTGCTACTAAAATCATTACCGTAGTATACAAAGTTCTACAAACCTGCAATTCAA TATCAAGTTTGATCTAGAAGTAAAGGAAAAAAGAAGACAAGAACCAATGTGAATGGTTCA TCATGTCCCAAGTACAACTTGCCTTGTTTGGATCTTGACGTGTGGGATGAATCTGGCATT CATTTTCCTTTTTGCATGTCTGTACAACTTTATGTATACTTCACTCATGATTATTGAATA CTGCAAATGTTGGATTTCACTATTTCTGCAACGGGGTTGTAGCCACATGTGCAGGGCACA GAAATGTTTAGTTTTGGTTGTTATTGCGACCTATGTTCTCCAATACATGTTGTTTCCTAT TATGCCAAGTTGACTGGGTTAATTAGTGTCAACTCTGAATACAGAAAGGTTGTTTTGTTG CTTCATAATTTTGTGAAGCTCATGTACATACTTCGGTAATTCAACAATCCTATGTAACTG AGCCTAGCTTGGTGGAAGGTCAGCATCTCCACCCTCCACAACACCTGGGTTTGACCTCGC TTTGAGCTTAGGTTCCTTTTTTCTTCTTAGTGGAGAAAATCCTAATTTCTCTTATGTATT CTTTCTTGCATTGAGATTCCTGAATACCTGTTGATAGTTTTATTTATAGTTGGCAAATTT GACTGAATCATCCAGTTGATCCCAGATTATTCACATGTTTCATATACAGCACAAGTTCGT TCCATATTGAGAAAGGTTTGCAAGACTGTGAACTAGATATATGAGCCATCTTTCAGTTAT TATTATTAAATTGGATGCCAACATTGCGTCAAAAAAAAAAAAAATGGATGCCAACAGAAT ATGAGGAACTGGAAGGCACCAGCCCTCAGTTTTCCTTCAACAGGCATGCAAGGTACAGAA CCTGAGGTGGAGAATGAAATTTCAGGATTCAAACTCCAGGAATTTAATGATGAATTTTAG GTGGATGGAATCTTATATGGTCAACTTTGTAAAAGAAAGGTTCCTTTGTTTTGAGGCATC TGCTTAAGATGTTTAAATTCATGCTTTATGCCTTTGTTTTCTTTTCCTTTTTCTGGAGAG ACACAATGGCTATTGTTTTCAATATAACCTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)