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Oryza sativa
cluster # 2795 cluster # 2795       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2795#0 length = 1350 sequences # 2  

consensusID : consensus_2795#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1350
fasta sequence
                              [CATTGCCCTACGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCACCGG-GAGNGACCCTGACCAGATCGGACGCCTCCCGGACTGCCTCCTCACCACCATCCTCTCCCTCCTCCCCCTCGACGCCGCCGCGCGCACCACCGCTCTTTCCCGTCGCTGGCGCANTCCT-NGGCCATCCGCGCCGCTCCGCCTCCACGACTCCNATCTCCCCTCCCGCTCCCAGTATCTCTCCGCCGCCATCTCCGGCATCCTCGCCTCCCACCGTGGCGACGCGGTGAGCTTCCGTCTCTCCTCGGGTCGNCCCTCCTCAGCGGACCTCGACAACTGGCTCCGAATNCTCGCCGGCAAACGCCTCCAGGAGCTCCTCCTCCAGCCGCCATCCGAGCCCCTTCCCCTCCCGCCGTCACTCCTCGGCTGCCACTCCCTCCGCTCCGCTGACCTCACCAATTGCCGCCTGCCGGCAGCCGCCGCAGCAACCGCCTCGTTCCCCCACCTCCACGAGCTCACTCTCCGCTACTGCTTCGCCTCCTCCCGGGCGCTCCACGGCCTGCTCGCCGGCTGCCCCGCGCTAGCGGCCCTGTCCCTCGACCGTGTCTTCGGCTGCCGGAGCCTCCGCGTGCGCTCCAGGACCCTGCGCAGCCTGACGGTGTCGGTCTCCTTGCGGCGGCGGGACGAGGTCGGCGACGAGCTGCAGGACCTCGCCGTCGAGGATGGGCCCCTCCTGGAGAGGCTACTCGGGCACGACGTCAACTGGGGCCCGTCGATCCATGTCCTCCACGCGCCGAGGCTGGAGATGCTCGGCTACTTGGGCGTCGGCATCCCATCGCTTCAGATTGGGGCGGCATTGTTCCACTCGATGCGGGCTGTTAGATTGGCGGCGGAGTTCCGATGCTTGAAGACTCTGGCGCTAGAGATGGTCGATCCGCAGGTGAAGCCTGTGGTTGATTTTCTCCGGTGTTTCCCGTGCTTGGAGGCGCTCTATATCACGTCACATATGTTTGAGCCACGGAGTATGGAAACACTAAAGTGTGATAACATGGATTATCCAATTGAATGCCTCAACCGTCACCTCAAGAAAGTGGTGCTTGCAGGATACGAAGGGCGAAGGCGTGAACTTCAGCTTGCCAGGTTTCTTGTTTCTAATGCAAGAGTCCTACAGGTTATGAAATTTTTGTGTGCAAATGATTGCAAACCAACATGGTTGGCTAGCCAAAAAAGGCAGTTGTGCTGGGAGAGTAGGCTATCTTTAGGACCACAGGTTATTTTTGAGGTATACAGGAAGAGCCATACTAGGTTTCGGAAGCATGCTAGTAACATAACTTTAGTTGATCCTTTTGATGTTAAAACGTAATTGTTAATTGTGC]

[+] EMBL AU068881             [CATTGCCCTACGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCACCGG GAGNGACCCTGACCAGATCGGACGCCTCCCGGACTGCCTCCTCACCACCATCCTCTCCCTCCTCCCCCTCGACGCCGCCGCGCGCACCACCGCTCTTTCCCGTCGCTGGCGCANTCCT NGGCCATCCGCGCCGCTCCGCCTCCACGACTCCNATCTCCCCTCCCGCTCCCAGTATCTCTCCGCCGCCATCTCCGGCATCCTCGCCTCCCACCGTGGCGACGCGGTGAGCTTCCGTCTCTCCTCGGGTCGNCCCTCCTCAGCGGACCTCGACAACTGGCTCCGAATNCTCGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AK108052             [ ATTGCCCTACGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCACCGGCGAG GACCCTGACCAGATCGGACGCCTCCCGGACTGCCTCCTCACCACCATCCTCTCCCTCCTCCCCCTCGACGCCGCCGCGCGCACCACCGCTCTTTCCCGTCGCTGGCGCA GCCTCTGGCCATCCGCGCCGCTCCGCCTCCACGACTCCGATCTCCCCTCCCGCTCCCAGTATCTCTCCGCCGCCATCTCCGGCATCCTCGCCTCCCACCGTGGCGACGCGGTGAGCTTCCGTCTCTCCTCGGGTCGCCCCTCCTCAGCGGACCTCGACACCTGGCTCCGAATCCTCGCCGGCAAACGCCTCCAGGAGCTCCTCCTCCAGCCGCCATCCGAGCCCCTTCCCCTCCCGCCGTCACTCCTCGGCTGCCACTCCCTCCGCTCCGCTGACCTCACCAATTGCCGCCTGCCGGCAGCCGCCGCAGCAACCGCCTCGTTCCCCCACCTCCACGAGCTCACTCTCCGCTACTGCTTCGCCTCCTCCCGGGCGCTCCACGGCCTGCTCGCCGGCTGCCCCGCGCTAGCGGCCCTGTCCCTCGACCGTGTCTTCGGCTGCCGGAGCCTCCGCGTGCGCTCCAGGACCCTGCGCAGCCTGACGGTGTCGGTCTCCTTGCGGCGGCGGGACGAGGTCGGCGACGAGCTGCAGGACCTCGCCGTCGAGGATGGGCCCCTCCTGGAGAGGCTACTCGGGCACGACGTCAACTGGGGCCCGTCGATCCATGTCCTCCACGCGCCGAGGCTGGAGATGCTCGGCTACTTGGGCGTCGGCATCCCATCGCTTCAGATTGGGGCGGCATTGTTCCACTCGATGCGGGCTGTTAGATTGGCGGCGGAGTTCCGATGCTTGAAGACTCTGGCGCTAGAGATGGTCGATCCGCAGGTGAAGCCTGTGGTTGATTTTCTCCGGTGTTTCCCGTGCTTGGAGGCGCTCTATATCACGTCACATATGTTTGAGCCACGGAGTATGGAAACACTAAAGTGTGATAACATGGATTATCCAATTGAATGCCTCAACCGTCACCTCAAGAAAGTGGTGCTTGCAGGATACGAAGGGCGAAGGCGTGAACTTCAGCTTGCCAGGTTTCTTGTTTCTAATGCAAGAGTCCTACAGGTTATGAAATTTTTGTGTGCAAATGATTGCAAACCAACATGGTTGGCTAGCCAAAAAAGGCAGTTGTGCTGGGAGAGTAGGCTATCTTTAGGACCACAGGTTATTTTTGAGGTATACAGGAAGAGCCATACTAGGTTTCGGAAGCATGCTAGTAACATAACTTTAGTTGATCCTTTTGATGTTAAAACGTAATTGTTAATTGTGC]


>consensus_2795#0 CATTGCCCTACGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCACCGGGAGNGACCCTGACCAGATCGGAC GCCTCCCGGACTGCCTCCTCACCACCATCCTCTCCCTCCTCCCCCTCGACGCCGCCGCGC GCACCACCGCTCTTTCCCGTCGCTGGCGCANTCCTNGGCCATCCGCGCCGCTCCGCCTCC ACGACTCCNATCTCCCCTCCCGCTCCCAGTATCTCTCCGCCGCCATCTCCGGCATCCTCG CCTCCCACCGTGGCGACGCGGTGAGCTTCCGTCTCTCCTCGGGTCGNCCCTCCTCAGCGG ACCTCGACAACTGGCTCCGAATNCTCGCCGGCAAACGCCTCCAGGAGCTCCTCCTCCAGC CGCCATCCGAGCCCCTTCCCCTCCCGCCGTCACTCCTCGGCTGCCACTCCCTCCGCTCCG CTGACCTCACCAATTGCCGCCTGCCGGCAGCCGCCGCAGCAACCGCCTCGTTCCCCCACC TCCACGAGCTCACTCTCCGCTACTGCTTCGCCTCCTCCCGGGCGCTCCACGGCCTGCTCG CCGGCTGCCCCGCGCTAGCGGCCCTGTCCCTCGACCGTGTCTTCGGCTGCCGGAGCCTCC GCGTGCGCTCCAGGACCCTGCGCAGCCTGACGGTGTCGGTCTCCTTGCGGCGGCGGGACG AGGTCGGCGACGAGCTGCAGGACCTCGCCGTCGAGGATGGGCCCCTCCTGGAGAGGCTAC TCGGGCACGACGTCAACTGGGGCCCGTCGATCCATGTCCTCCACGCGCCGAGGCTGGAGA TGCTCGGCTACTTGGGCGTCGGCATCCCATCGCTTCAGATTGGGGCGGCATTGTTCCACT CGATGCGGGCTGTTAGATTGGCGGCGGAGTTCCGATGCTTGAAGACTCTGGCGCTAGAGA TGGTCGATCCGCAGGTGAAGCCTGTGGTTGATTTTCTCCGGTGTTTCCCGTGCTTGGAGG CGCTCTATATCACGTCACATATGTTTGAGCCACGGAGTATGGAAACACTAAAGTGTGATA ACATGGATTATCCAATTGAATGCCTCAACCGTCACCTCAAGAAAGTGGTGCTTGCAGGAT ACGAAGGGCGAAGGCGTGAACTTCAGCTTGCCAGGTTTCTTGTTTCTAATGCAAGAGTCC TACAGGTTATGAAATTTTTGTGTGCAAATGATTGCAAACCAACATGGTTGGCTAGCCAAA AAAGGCAGTTGTGCTGGGAGAGTAGGCTATCTTTAGGACCACAGGTTATTTTTGAGGTAT ACAGGAAGAGCCATACTAGGTTTCGGAAGCATGCTAGTAACATAACTTTAGTTGATCCTT TTGATGTTAAAACGTAATTGTTAATTGTGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)