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consensusID : consensus_2806#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 2184 fasta sequence
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[+] EMBL AK101928 [ACCTCTTCATCCTCCTGCACGCGAGAATGGCCATGGCGACGCCAATGGCTCCCCGCTCCACGTTCGCCATCTTCCTCATCCTCCTGCTCCGTTCCGGCCACTCTCCGGCGGCCGCGTTCTATCTCCCGGGCAGCTACCCGCACCGCTACCGCCCCGGCGAGGCGCTGGCCGCGAAGGTGAACTCCCTCACCTCGCCGTCGTCCAAGCTCCTCTTCCCCTACTACTCCCTCCCGTTCTGCGCGCCGCAGGGCGGCGTCAACAGCGCCGCCGAGAGCCTCGGCGAGCTCCTCCTCGGCGACCGCATCGAGACCTCGCCGTACCGCTTCTCCATGCTCAAGAATGCCACCGCCTTCCTCTGCCGCACCGACCCGCTTCCCCCCGCCACCGCCGACCTCCTCATGTTCCGCATCGACGACGCCTACCACGTCAACCTCCTCCTCGACACGCTCCCCGTCGTCCGGTATGTCAAGAACATGGCCGCGCCAGGGGTGTTCGTCCGGTCTACCGGCTTCCCCGTCGGCGTGCGCGCCGACGACGGCGAGTACTACGTGTACAACCACCTCAAGCTCACCGTGCTGGTCAACAAGCCGCGGAACGGCACCACCAGGGCGGAGGCCCTGATGGCGACCGCCGACGCCGTCGAGCTCATCAGCTTCGCCGGCGGGAGCAAGGACGGCGGCGGGTACACCGTCGTCGGGTTCGAGGTCGTTCCGTGCAGCGTGGAGCACGATGCGGCGGCGATCAAGGGCAAGAAGATGTACGACGAGCTGCCGGCGAGGGCGGCCGCCGGGTGCGACCCTTCGGTGGTCGGCATGCGCGTGCGGGCCAACCGGCCGCTCGTCTTCTCCTACGAGGTGGCGTTCGTGGAGAGCGGCGTCGAGTGGCCGTCGCGGTGGGACGCGTACCTGGAGATGGGCGGCGCCAAGGTGCACTGGTTCTCCATCCTCAACTCCATCGTGGTGGTGGCGTTCCTCGCCGCCATCCTGCTCGTCATCCTGCTGCGCACCGTGCGGCGCGACCTCGCGCAGTACGACGAGCACGGCGGCGAGGCGGGGTTGGCGCCGCAGGCGGACGAGCTCGCCGGGTGGAAGCTCGTCGCCGGGGACGTGTTCCGGGAGCCCGCCCACCATCCTCTTCGCGGCGCTCGGGTTCATGTCGCCGGCGTCGCGCGGCGCGCTCGTGACGGGCATGCTCGGCATCTACCTCCTCCTCGGCTTCGCGGCGGGGTACGCCGCCGTGCGGCTCTGGAAGACGGTGCGGCACGGGGACAGCGCCGGGTGGAAGCGCGTGGCGTGGCGCGCCTCCTGCGCCTTCCCCGGCGCGGGCTTCGCCGTCTTCACCGCGCTCAACTGCGTGCTCTGGTACAACGGCAGCACGGGCGCCGTGCCGTTCCTGCTCTTCGCCGTGATCCTCCTCCTCTGGGCGTTCGTCTCCGTGCCGCTCACCCTCGCCGGCGGGCTGGTGGCATCCCGCGTCGGGCACCTCGAGTACCCGGTGAAGACGAACAAGATCGCGAGGCAGGTGCCGGCGGCGCAGTGCTCGCCGTGGGTGTTCGTGGCGGTGGCGGGGACGCTGCCGTTCGGGACGCTGTTCATCGAGCTGCTGTTCATCATGTCGAGCCTGTGGCTGGGGAGGGTGTACTACGTGTTCGGGTTCCTGCTGGTGGTGATGGCGCTGCTGGTGGCCGTGTGCGGCGAGGTGTCGGTGGTGCTCACCTACATGGGGCTCTGCGTGGAGGACTGGAGGTGGTGGTGGCGCGCCTTCTTCGCCTCGGGCTCCGTCGCGGCCTACACCCTCGGCTACGCCGTCTACTACCTCGTCTTCGACCTGCACAGCCTCAGCGGCCCGGTCTCCGCCGCGCTCTACGTCGGCTACTCGCTGCTCATGGCGCTCGCCGTCATGCTCGCCACCGGCGCCGTCGGGCTCGCCGCCTCCTTCGCCTTCGTCTACTACCTCTTCTCCGCCGTCAAGCTCGACTGATCCATGGCGTCATCGTCCGCACTGTCCACGTCATTTCATTATGTAGGTGATCTATGCGTTTTATTACTACATGATAATAAGATTATTATTTTTTGTTCCTCGTTTTGGTGTTTTCCATTTTGTACTTCATGAGTATACACCGTAGTAGTACTAGATAGAAACGAGTTTGAGTTTGGTTTAAAGGAGCACTATTACAAGATTTCA]
consensusID : consensus_2806#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 2039 fasta sequence
[CACGACACACATTGATCAGCTCACCTCTTCATCCTCCTGCACGCGAGAATGGCCATGGCGACGCCAATGGCTCCCCGCTCCACGTTCGCCATCTTCCTCATCCTCCTGCTCCGTTCCGGCCACTCTCCGGCGGCCGCGTTCTATCTCCCGGGCAGCTACCCGCACCGCTACCGCCCCGGCGAGGCGCTGGCCGCGAAGGTGAACTCCCTCACCTCGCCGTCGTCCAAGCTCCCCTTCCCCTACTACTCCCTCCCGTTCTGCGCGCCGCAGGGCGGCGTCAACCGCGCCGCCGAGAGCCTCGGCGAGCTCCTCCTCGGCGACCGCATCGAGACCTCGCCGTACCGCTTCTCCATGCTCAAGAATGCCACCGCCTTCCTCTGCCGCACCGACCCGCTTCCCCCCGCCACCGCCGACCTCCTCATGTTCCGCATCGACGACGCCTACCACGTCAACCTCCTCCTCGACACGCTCCCCGTCGTCCGGTATGTCAAGAACCTGGCCGCGCCAGGGGTGTTCGTCCGGTCTACCGGCTTCCCCGTCGGCGTGCGCGCCGACGACGGCGAGTACTACGTGTACAACCACCTCAAGCTCACCGTGCTGGTCAACAAGCCGCGGAACGGCACCACCAGGGCGGAGGCCCTGATGGCGACCGCCGACGCCGTCGAGCTCATCAGCTTCGCCGGCGGGAGCAAGGACGGCGGCGGGTACACCGTCGTCGGGTTCGAGGTCGTTCCGTGCAGCGTGGAGCACGATGCGGCGGCGATCAAGGGCAAGAAGATGTACGACGAGCTGCCGGCGAGGGCGGCCGCCGGGTGCGACCCTTCGGTGGTCGGCATGCGCGTGCGGGCCAACCGGCCGCTCGTCTTCTCCTACGAGGTGGCGTTCGTGGAGAGCGGCGTCGAGTGGCCGTCGCGGTGGGACGCGTACCTGGAGATGGGCGGCGCCAAGGTGCACTGGTTCTCCGTCCTCAACTCCATCGTGGTGGTGGCGTTCCTCGCCGCCATCCTGCTCGTCATCCTGCTGCGCACCGTGCGGCGCGACCTCGCGCAGTACGACGAGCACGGCGGCGAGGCGGGGTTGGCGCCGCAGGCGGACGAGCTCGCCGGGTGGAAGCTCGTCGCCGGGGACGTGTTCCGGGAGCCCGCCCACCCGGTGCTCCTCTGCGTGATGGTCGGCGACGGGGTGCGCATCCTGGCCATGGCCGTCGCCACCATCCTCTTCGCGGCGCTCGGGTTCATGTCGCCGGCGTCGCGCGGCGCGCTCGTGACGGGCATGCTCGGCATCTACCTCCTCCTCGGCTTCGCGGCGGGGTACGCCGCCGTGCGGCTCTGGAAGACGGTGCGGCACGGGGACAGCGCCGGGTGGAAGCGCGTGGCGTGGCGCGCCTCCTGCGCCTTCCCCGGCGCGGGCTTCGCCGTCTTCACCGCGCTCAACTGCGTGCTCTGGTACAACGGCAGCACGGGCGCCGTGCCGTTCCTGCTCTTCGCCGTGATCCTCCTCCTCTGGGCGTTCGTCTCCGTGCCGCTCACCCTCGCCGGCGGGCTGGTGGCATCCCGCGTCGGGCACCTCGAGTACCCGGTGAAGACGAACAAGATCGCGAGGCAGGTGCCGGCGGCGCAGTGCTCGCCGTGGGTGTTCGTGGCGGTGGCGGGGACGCTGCCGTTCGGGACGCTGTTCATCGAGCTGCTGTTCATCATGTCGAGCCTGTGGCTGGGGAGGGTGTACTACGTGTTCGGGTTCCTGCTGGTGGTGATGGCGCTGCTGGTGGCCGTGTGCGGCGAGGTGTCGGTGGTGCTCACCTACATGGGGCTCTGCGTGGAGGACTGGAGGTGGTGGTGGCGCGCCTTCTTCGCCTCGGGCTCCGTCGCGGCCTACACCCTCGGCTACGCCGTCTACTACCTCGTCTTCGACCTGCACAGCCTCAGCGGCCCGGTCTCCGCCGCGCTCTACGTCGGCTACTCGCTGCTCATGGCGCTCGCCGTCATGCTCGCCACCGGCGCCGTCGGGCTCGCCGCCTCCTTCGCCTTCGTCTACTACCT]
[+] EMBL AK102738 [CACGACACACATTGATCAGCTCACCTCTTCATCCTCCTGCACGCGAGAATGGCCATGGCGACGCCAATGGCTCCCCGCTCCACGTTCGCCATCTTCCTCATCCTCCTGCTCCGTTCCGGCCACTCTCCGGCGGCCGCGTTCTATCTCCCGGGCAGCTACCCGCACCGCTACCGCCCCGGCGAGGCGCTGGCCGCGAAGGTGAACTCCCTCACCTCGCCGTCGTCCAAGCTCCCCTTCCCCTACTACTCCCTCCCGTTCTGCGCGCCGCAGGGCGGCGTCAACCGCGCCGCCGAGAGCCTCGGCGAGCTCCTCCTCGGCGACCGCATCGAGACCTCGCCGTACCGCTTCTCCATGCTCAAGAATGCCACCGCCTTCCTCTGCCGCACCGACCCGCTTCCCCCCGCCACCGCCGACCTCCTCATGTTCCGCATCGACGACGCCTACCACGTCAACCTCCTCCTCGACACGCTCCCCGTCGTCCGGTATGTCAAGAACCTGGCCGCGCCAGGGGTGTTCGTCCGGTCTACCGGCTTCCCCGTCGGCGTGCGCGCCGACGACGGCGAGTACTACGTGTACAACCACCTCAAGCTCACCGTGCTGGTCAACAAGCCGCGGAACGGCACCACCAGGGCGGAGGCCCTGATGGCGACCGCCGACGCCGTCGAGCTCATCAGCTTCGCCGGCGGGAGCAAGGACGGCGGCGGGTACACCGTCGTCGGGTTCGAGGTCGTTCCGTGCAGCGTGGAGCACGATGCGGCGGCGATCAAGGGCAAGAAGATGTACGACGAGCTGCCGGCGAGGGCGGCCGCCGGGTGCGACCCTTCGGTGGTCGGCATGCGCGTGCGGGCCAACCGGCCGCTCGTCTTCTCCTACGAGGTGGCGTTCGTGGAGAGCGGCGTCGAGTGGCCGTCGCGGTGGGACGCGTACCTGGAGATGGGCGGCGCCAAGGTGCACTGGTTCTCCGTCCTCAACTCCATCGTGGTGGTGGCGTTCCTCGCCGCCATCCTGCTCGTCATCCTGCTGCGCACCGTGCGGCGCGACCTCGCGCAGTACGACGAGCACGGCGGCGAGGCGGGGTTGGCGCCGCAGGCGGACGAGCTCGCCGGGTGGAAGCTCGTCGCCGGGGACGTGTTCCGGGAGCCCGCCCACCCGGTGCTCCTCTGCGTGATGGTCGGCGACGGGGTGCGCATCCTGGCCATGGCCGTCGCCACCATCCTCTTCGCGGCGCTCGGGTTCATGTCGCCGGCGTCGCGCGGCGCGCTCGTGACGGGCATGCTCGGCATCTACCTCCTCCTCGGCTTCGCGGCGGGGTACGCCGCCGTGCGGCTCTGGAAGACGGTGCGGCACGGGGACAGCGCCGGGTGGAAGCGCGTGGCGTGGCGCGCCTCCTGCGCCTTCCCCGGCGCGGGCTTCGCCGTCTTCACCGCGCTCAACTGCGTGCTCTGGTACAACGGCAGCACGGGCGCCGTGCCGTTCCTGCTCTTCGCCGTGATCCTCCTCCTCTGGGCGTTCGTCTCCGTGCCGCTCACCCTCGCCGGCGGGCTGGTGGCATCCCGCGTCGGGCACCTCGAGTACCCGGTGAAGACGAACAAGATCGCGAGGCAGGTGCCGGCGGCGCAGTGCTCGCCGTGGGTGTTCGTGGCGGTGGCGGGGACGCTGCCGTTCGGGACGCTGTTCATCGAGCTGCTGTTCATCATGTCGAGCCTGTGGCTGGGGAGGGTGTACTACGTGTTCGGGTTCCTGCTGGTGGTGATGGCGCTGCTGGTGGCCGTGTGCGGCGAGGTGTCGGTGGTGCTCACCTACATGGGGCTCTGCGTGGAGGACTGGAGGTGGTGGTGGCGCGCCTTCTTCGCCTCGGGCTCCGTCGCGGCCTACACCCTCGGCTACGCCGTCTACTACCTCGTCTTCGACCTGCACAGCCTCAGCGGCCCGGTCTCCGCCGCGCTCTACGTCGGCTACTCGCTGCTCATGGCGCTCGCCGTCATGCTCGCCACCGGCGCCGTCGGGCTCGCCGCCTCCTTCGCCTTCGTCTACTACCT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_2806#0 ----------------------ACCTCTTCATCCTCCTGCACGCGAGAATGGCCATGGCG 38
consensus_2806#1 CACGACACACATTGATCAGCTCACCTCTTCATCCTCCTGCACGCGAGAATGGCCATGGCG 60
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consensus_2806#1 CACTCTCCGGCGGCCGCGTTCTATCTCCCGGGCAGCTACCCGCACCGCTACCGCCCCGGC 180
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consensus_2806#1 GAGGCGCTGGCCGCGAAGGTGAACTCCCTCACCTCGCCGTCGTCCAAGCTCCCCTTCCCC 240
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consensus_2806#0 TACTACTCCCTCCCGTTCTGCGCGCCGCAGGGCGGCGTCAACAGCGCCGCCGAGAGCCTC 278
consensus_2806#1 TACTACTCCCTCCCGTTCTGCGCGCCGCAGGGCGGCGTCAACCGCGCCGCCGAGAGCCTC 300
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consensus_2806#1 GGCGAGCTCCTCCTCGGCGACCGCATCGAGACCTCGCCGTACCGCTTCTCCATGCTCAAG 360
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consensus_2806#0 AATGCCACCGCCTTCCTCTGCCGCACCGACCCGCTTCCCCCCGCCACCGCCGACCTCCTC 398
consensus_2806#1 AATGCCACCGCCTTCCTCTGCCGCACCGACCCGCTTCCCCCCGCCACCGCCGACCTCCTC 420
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consensus_2806#0 ATGTTCCGCATCGACGACGCCTACCACGTCAACCTCCTCCTCGACACGCTCCCCGTCGTC 458
consensus_2806#1 ATGTTCCGCATCGACGACGCCTACCACGTCAACCTCCTCCTCGACACGCTCCCCGTCGTC 480
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consensus_2806#0 CGGTATGTCAAGAACATGGCCGCGCCAGGGGTGTTCGTCCGGTCTACCGGCTTCCCCGTC 518
consensus_2806#1 CGGTATGTCAAGAACCTGGCCGCGCCAGGGGTGTTCGTCCGGTCTACCGGCTTCCCCGTC 540
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consensus_2806#0 GGCGTGCGCGCCGACGACGGCGAGTACTACGTGTACAACCACCTCAAGCTCACCGTGCTG 578
consensus_2806#1 GGCGTGCGCGCCGACGACGGCGAGTACTACGTGTACAACCACCTCAAGCTCACCGTGCTG 600
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consensus_2806#0 GTCAACAAGCCGCGGAACGGCACCACCAGGGCGGAGGCCCTGATGGCGACCGCCGACGCC 638
consensus_2806#1 GTCAACAAGCCGCGGAACGGCACCACCAGGGCGGAGGCCCTGATGGCGACCGCCGACGCC 660
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consensus_2806#0 GTCGAGCTCATCAGCTTCGCCGGCGGGAGCAAGGACGGCGGCGGGTACACCGTCGTCGGG 698
consensus_2806#1 GTCGAGCTCATCAGCTTCGCCGGCGGGAGCAAGGACGGCGGCGGGTACACCGTCGTCGGG 720
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consensus_2806#0 TTCGAGGTCGTTCCGTGCAGCGTGGAGCACGATGCGGCGGCGATCAAGGGCAAGAAGATG 758
consensus_2806#1 TTCGAGGTCGTTCCGTGCAGCGTGGAGCACGATGCGGCGGCGATCAAGGGCAAGAAGATG 780
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consensus_2806#0 TACGACGAGCTGCCGGCGAGGGCGGCCGCCGGGTGCGACCCTTCGGTGGTCGGCATGCGC 818
consensus_2806#1 TACGACGAGCTGCCGGCGAGGGCGGCCGCCGGGTGCGACCCTTCGGTGGTCGGCATGCGC 840
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consensus_2806#0 GTGCGGGCCAACCGGCCGCTCGTCTTCTCCTACGAGGTGGCGTTCGTGGAGAGCGGCGTC 878
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consensus_2806#1 GAGTGGCCGTCGCGGTGGGACGCGTACCTGGAGATGGGCGGCGCCAAGGTGCACTGGTTC 960
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consensus_2806#0 TCCATCCTCAACTCCATCGTGGTGGTGGCGTTCCTCGCCGCCATCCTGCTCGTCATCCTG 998
consensus_2806#1 TCCGTCCTCAACTCCATCGTGGTGGTGGCGTTCCTCGCCGCCATCCTGCTCGTCATCCTG 1020
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consensus_2806#0 CTGCGCACCGTGCGGCGCGACCTCGCGCAGTACGACGAGCACGGCGGCGAGGCGGGGTTG 1058
consensus_2806#1 CTGCGCACCGTGCGGCGCGACCTCGCGCAGTACGACGAGCACGGCGGCGAGGCGGGGTTG 1080
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consensus_2806#0 GCGCCGCAGGCGGACGAGCTCGCCGGGTGGAAGCTCGTCGCCGGGGACGTGTTCCGGGAG 1118
consensus_2806#1 GCGCCGCAGGCGGACGAGCTCGCCGGGTGGAAGCTCGTCGCCGGGGACGTGTTCCGGGAG 1140
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consensus_2806#0 CCCGCCCACC-------------------------------------------------- 1128
consensus_2806#1 CCCGCCCACCCGGTGCTCCTCTGCGTGATGGTCGGCGACGGGGTGCGCATCCTGGCCATG 1200
**********
consensus_2806#0 ------------ATCCTCTTCGCGGCGCTCGGGTTCATGTCGCCGGCGTCGCGCGGCGCG 1176
consensus_2806#1 GCCGTCGCCACCATCCTCTTCGCGGCGCTCGGGTTCATGTCGCCGGCGTCGCGCGGCGCG 1260
************************************************
consensus_2806#0 CTCGTGACGGGCATGCTCGGCATCTACCTCCTCCTCGGCTTCGCGGCGGGGTACGCCGCC 1236
consensus_2806#1 CTCGTGACGGGCATGCTCGGCATCTACCTCCTCCTCGGCTTCGCGGCGGGGTACGCCGCC 1320
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consensus_2806#0 GTGCGGCTCTGGAAGACGGTGCGGCACGGGGACAGCGCCGGGTGGAAGCGCGTGGCGTGG 1296
consensus_2806#1 GTGCGGCTCTGGAAGACGGTGCGGCACGGGGACAGCGCCGGGTGGAAGCGCGTGGCGTGG 1380
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consensus_2806#0 CGCGCCTCCTGCGCCTTCCCCGGCGCGGGCTTCGCCGTCTTCACCGCGCTCAACTGCGTG 1356
consensus_2806#1 CGCGCCTCCTGCGCCTTCCCCGGCGCGGGCTTCGCCGTCTTCACCGCGCTCAACTGCGTG 1440
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consensus_2806#0 CTCTGGTACAACGGCAGCACGGGCGCCGTGCCGTTCCTGCTCTTCGCCGTGATCCTCCTC 1416
consensus_2806#1 CTCTGGTACAACGGCAGCACGGGCGCCGTGCCGTTCCTGCTCTTCGCCGTGATCCTCCTC 1500
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consensus_2806#0 CTCTGGGCGTTCGTCTCCGTGCCGCTCACCCTCGCCGGCGGGCTGGTGGCATCCCGCGTC 1476
consensus_2806#1 CTCTGGGCGTTCGTCTCCGTGCCGCTCACCCTCGCCGGCGGGCTGGTGGCATCCCGCGTC 1560
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consensus_2806#0 GGGCACCTCGAGTACCCGGTGAAGACGAACAAGATCGCGAGGCAGGTGCCGGCGGCGCAG 1536
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consensus_2806#0 GAGCTGCTGTTCATCATGTCGAGCCTGTGGCTGGGGAGGGTGTACTACGTGTTCGGGTTC 1656
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consensus_2806#0 CTGCTGGTGGTGATGGCGCTGCTGGTGGCCGTGTGCGGCGAGGTGTCGGTGGTGCTCACC 1716
consensus_2806#1 CTGCTGGTGGTGATGGCGCTGCTGGTGGCCGTGTGCGGCGAGGTGTCGGTGGTGCTCACC 1800
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consensus_2806#0 TACATGGGGCTCTGCGTGGAGGACTGGAGGTGGTGGTGGCGCGCCTTCTTCGCCTCGGGC 1776
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consensus_2806#0 TCCGTCGCGGCCTACACCCTCGGCTACGCCGTCTACTACCTCGTCTTCGACCTGCACAGC 1836
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consensus_2806#0 CTCAGCGGCCCGGTCTCCGCCGCGCTCTACGTCGGCTACTCGCTGCTCATGGCGCTCGCC 1896
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consensus_2806#0 TTCTCCGCCGTCAAGCTCGACTGATCCATGGCGTCATCGTCCGCACTGTCCACGTCATTT 2016
consensus_2806#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_2806#1 ------------------------------------------------------------
consensus_2806#0 AGAAACGAGTTTGAGTTTGGTTTAAAGGAGCACTATTACAAGATTTCA 2184
consensus_2806#1 ------------------------------------------------
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||