Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 2852 cluster # 2852       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2852#0 length = 992 sequences # 2  

consensusID : consensus_2852#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 992
fasta sequence
                              [ATAGCTGCACTTCTGAAAGACGCTCAACAAGCAGGTATTCAGCTTGATCCAAGCTGCTATGAGGATTTGATACAATCCAGAGCACATCACAATAATACCACAGGTGCTCTCAATCTTTTTAAAGAGTTGAAGAGTTTGAATATTTTGAAAGCTGGTCAGAATGAATTTGAGATGTTAGTACAAGGCTGCAATAACAATGGAGCTGCTTTGACAACTAAGCTAGTGGAGGAAGTCAGAAGTGGCCACCCGGTTAATCATGCTATTCATGACTGGAATAATGTTATCCATTTCTTCTGCAAGAAGAGATTGATGCATGATGCTCACAAAGCACTTGGCAAGATGAAAGCTTTAGGACACACGCCAAATGCACAGACATTCCATTCTTTAGTAACTGGTTATGCTGCTGTTGGTGGTAAATATGTAGAGGTGACAGATTTGTGGGGTGAAATGAAAGTTTTGGCCACCTCAAGTTCAATGAATTTTGATCAAGAGCTCCTGGACTCTCTGCTGTATTGCTTTGTGAGAGGCGGTTTCTTCCTTCGAGCCATGGAAGTTATAGAAATGATGG-AAAAGGCAAGATGTTTATAGACAAATACAAGTACAAGTCCCTGTGGCTTAAATACCACAGAACATTGTACAAAGGTAAGGCTCCTAAAGTGCAAACAGAAGCACAACTGAAACGGAGGGAAGCAGCATTGCATTTCAAGAGATGGATTGGATTAACATGAAAACTACAGAGCACAGGTCCTTGNAAACACTAAGCCTGGTAGATAGCTCCGCTGCTTTTGGTCACTGGATGTCATAGGGANAGGTTCTGGTATCANCCATGGGTTTGCTACCACTGGATGGATGGACACCACTGGATGGGAAACCTCTGGTAATAAAAACTTTTACATGAAGGCAGAAGGCTTCTTTTCCAAATGGGCCTGGTGCATATGAAATATATGGTTTCTTAGCCACAAACACTATGAGCTCAATTGGTGAAAGGGGCG]

[+] EMBL CA764230             [ATAGCTGCACTTCTGAAAGACGCTCAACAAGCAGGTATTCAGCTTGATCCAAGCTGCTATGAGGATTTGATACAATCCAGAGCACATCACAATAATACCACAGGTGCTCTCAATCTTTTTAAAGAGTTGAAGAGTTTGAATATTTTGAAAGCTGGTCAGAATGAATTTGAGATGTTAGTACAAGGCTGCAATAACAATGGAGCTGCTTTGACAACTAAGCTAGTGGAGGAAGTCAGAAGTGGCCACCCGGTTAATCATGCTATTCATGACTGGAATAATGTTATCCATTTCTTCTGCAAGAAGAGATTGATGCATGATGCTCACAAAGCACTTGGCAAGATGAAAGCTTTAGGACACACGCCAAATGCACAGACATTCCATTCTTTAGTAACTGGTTATGCTGCTGTTGGTGGTAAATATGTAGAGGTGACAGATTTGTGGGGTGAAATGAAAGTTTTGGCCACCTCAAGTTCAATGAATTTTGATCAAGAGCTCCTGGACTCTCTGCTGTATTGCTTTGTGAGAGGCGGTTTCTTCCTTCGAGCCATGGAAGTTATAGAAATGATGG AAAAGGCAAGATGTTTATAGACAAATACAAGTACAAGTCCCTGTGGCTTAAATACCACAGAACATTGTACAAAGGTAAGGCTCCTAAAGTGCAAACAGAAGCACAACTGAAACGGAGGGAAGCAGCATTGCATTTCAAGAGATGGATTGGATTAACATGAAAACTACAGAGCACAGGTCCTTGNAAACACTAAGCCTGGTAGATAGCTCCGCTGCTTTTGGTCACTGGATGTCATAGGGANAGGTTCTGGTATCANCCATGGGTTTGCTACCACTGGATGGATGGACACCACTGGATGGGAAACCTCTGGTAATAAAAACTTT                                                                                                     ]
[+] EMBL CB669016             [                                                                                                                                                                                                                                                  CCACCCGGCTAATCATGCTATTCATGACTGGAATAATGTTATCCATTTCTTCTGCAAGAAGAGATTGATGCATGATGCTCACAAAGCACTTGGCAAGATGAAAGCTTTAGGACACACGCCAAATGCACAGACATTCCATTCTTTAGTAACTGGTTATGCTGCTGTTGGTGGTAAATATGTAGAGGTGACAGATTTGTGGGGTGAAATGAAAGTTTTGGCCACCTCAAGTTCAATGAATTTTGATCAAGAGCTCCTGGACTCTCTGCTGTATTGCTTTGTGAGAGGCGGTTTTTTCCTTCGAGCCATGGAAGTTATAGAAATGATGGAAAAAGGCAAGATGTTTATAGACAAATACAAGTACAAGTCCCTGTGGCTTAAATACCACAGAACATTGTACAAAGGTAAGGCTCCTAAAGTGCAAACAGAAGCACAACTGAAACGGAGGGAAGCAGCATTGCATTTCAAGAGATGGATTGGATTAACATGAAAACTACAGAGCACAGGTCCTTGAAAACACTAAGCCTGGTAGATAGCTCTGCTGCTTTTGTTCACTGTATGTCATA GGAGATGTTCTGGTATCA GCAT GGTTTGCTACCACTGTATGGATGGACACCACTGTAT GGAAACCTCT GTCACAAAGTGACATACATGAAGGCAGAAGGCTTCTTTTCCAAATGGGCCTGGTGCATATGAAATATATGGTTTCTTAGCCACAAACACTATGAGCTCAATTGGTGAAAGGGGCG]


>consensus_2852#0 ATAGCTGCACTTCTGAAAGACGCTCAACAAGCAGGTATTCAGCTTGATCCAAGCTGCTAT GAGGATTTGATACAATCCAGAGCACATCACAATAATACCACAGGTGCTCTCAATCTTTTT AAAGAGTTGAAGAGTTTGAATATTTTGAAAGCTGGTCAGAATGAATTTGAGATGTTAGTA CAAGGCTGCAATAACAATGGAGCTGCTTTGACAACTAAGCTAGTGGAGGAAGTCAGAAGT GGCCACCCGGTTAATCATGCTATTCATGACTGGAATAATGTTATCCATTTCTTCTGCAAG AAGAGATTGATGCATGATGCTCACAAAGCACTTGGCAAGATGAAAGCTTTAGGACACACG CCAAATGCACAGACATTCCATTCTTTAGTAACTGGTTATGCTGCTGTTGGTGGTAAATAT GTAGAGGTGACAGATTTGTGGGGTGAAATGAAAGTTTTGGCCACCTCAAGTTCAATGAAT TTTGATCAAGAGCTCCTGGACTCTCTGCTGTATTGCTTTGTGAGAGGCGGTTTCTTCCTT CGAGCCATGGAAGTTATAGAAATGATGGAAAAGGCAAGATGTTTATAGACAAATACAAGT ACAAGTCCCTGTGGCTTAAATACCACAGAACATTGTACAAAGGTAAGGCTCCTAAAGTGC AAACAGAAGCACAACTGAAACGGAGGGAAGCAGCATTGCATTTCAAGAGATGGATTGGAT TAACATGAAAACTACAGAGCACAGGTCCTTGNAAACACTAAGCCTGGTAGATAGCTCCGC TGCTTTTGGTCACTGGATGTCATAGGGANAGGTTCTGGTATCANCCATGGGTTTGCTACC ACTGGATGGATGGACACCACTGGATGGGAAACCTCTGGTAATAAAAACTTTTACATGAAG GCAGAAGGCTTCTTTTCCAAATGGGCCTGGTGCATATGAAATATATGGTTTCTTAGCCAC AAACACTATGAGCTCAATTGGTGAAAGGGGCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)