Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 2935 cluster # 2935       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2935#0 length = 1281 sequences # 2  

consensusID : consensus_2935#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1281
fasta sequence
                              [AACATTCCAGACCTCATCCCATTTTCTTCCGTACACGCTTTCACTTCCTCCCAATCCACCCATGGACTCGCCGCCGCCGCCGTCTCTCCCGCCGGCGAGCCCGCTCCCCCTCCCGCCGTGGCGGCCCGATCCGTCGCCGGCCGTCCTCCCCTGGCCGGACCTCCTCGCCGGCGCGGCCGCCGCCACCCGCCGCCTCATCGCCGCCCACTCCCGCCACTTCCTCGCCCTCTCGTCCCTCCTCCTCCTCCCGCTCTCCCTCCTCCTCCTCTCCCTCCCGGCTCCCTTCCTCCCGCCCGTCTCCCCCTCCGTCTCGCTCCGCTCTACTACGACGCCGCAGCCGGCGCTCCCCCTCCCGCTCCTCGCCCTGGTTGCCGCCGCCGCGCTCCTTTACCTCGCCGCCTTCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCGCACGCGGGGTTCTTCGGCCGCCCCGTCAAGCTGCTCGCCTCGCTGCTCTCCGTGCCCGCGTCCCTCCTCCGCCTCCTCCTGACGGCGCTCCCCGCAGCGCCGCTGCTGCTTCTCCCGCTCCTCCCGCTCCCGTTCCCGCTTACCGCCGCCCTCGCCGTTCTTGGCCTCCTCCTGTTAGTCCCATTCTGGTCTCTCGCCGGCGCCGCCGCCGTCGTCGAGTCCAGCGCCTGTGTGTCCCCGCTGCGGCAGAGCTGCCGGCTGCTCAATGGCGCGCGCCTCGCCGCGCTCTCTGCGTTCTTGGTGTTCGGCGCCGGGATAGGGGTCACGCTATGGGGATTTGGTGGGGTGGCCGCGGAGACCTATGATGCCAGTGCTGGGTGGGCCGGCATGGCGCCGGTGGTGGTGAAGGCGGTGGTCGGAACGGCGGTGCTGGTGGTTCTGATGCTTTATGGAATGGTGATCAACGTTGTGCTCTATATGCATTGCCGCGCGCTTCACGGGGAGCTCACGGGGGAGATCTACAACGAATTCGCCAACTCGTATGTCTTCCTGCCCTTTGACGAGGGCAAGGATCGGCATGTAGTGTCAGTGGTCACGGTGTGGCCATGATTGACTATCGCCGCGGTGGTGAGTTTGCGAATCCAAAGAACAGTTTTGACCACATCATGTATAACTGTGTGCGCATCTCTGTTCTTCTGTTCATAGGTGTCTCTTCAATTGTGCAAACGTTTGGATCAAATACTCTTCTATTAGCCTTAGGCCTTTACAGCCTTAGCCCTGGAATATATAATTTTGTTCAGGTAACGTATCTTTCATATGTACAATATTGTTTCAATATGCACTGAATAATAAAATAG]

[+] EMBL AK106104             [AACATTCCAGACCTCATCCCATTTTCTTCCGTACACGCTTTCACTTCCTCCCAATCCACCCATGGACTCGCCGCCGCCGCCGTCTCTCCCGCCGGCGAGCCCGCTCCCCCTCCCGCCGTGGCGGCCCGATCCGTCGCCGGCCGTCCTCCCCTGGCCGGACCTCCTCGCCGGCGCGGCCGCCGCCACCCGCCGCCTCATCGCCGCCCACTCCCGCCACTTCCTCGCCCTCTCGTCCCTCCTCCTCCTCCCGCTCTCCCTCCTCCTCCTCTCCCTCCCGGCTCCCTTCCTCCCGCCCGTCTCCCCCTCCGTCTCGCTCCGCTCTACTACGACGCCGCAGCCGGCGCTCCCCCTCCCGCTCCTCGCCCTGGTTGCCGCCGCCGCGCTCCTTTACCTCGCCGCCTTCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCGCACGCGGGGTTCTTCGGCCGCCCCGTCAAGCTGCTCGCCTCGCTGCTCTCCGTGCCCGCGTCCCTCCTCCGCCTCCTCCTGACGGCGCTCCCCGCAGCGCCGCTGCTGCTTCTCCCGCTCCTCCCGCTCCCGTTCCCGCTTACCGCCGCCCTCGCCGTTCTTGGCCTCCTCCTGTTAGTCCCATTCTGGTCTCTCGCCGGCGCCGCCGCCGTCGTCGAGTCCAGCGCCTGTGTGTCCCCGCTGCGGCAGAGCTGCCGGCTGCTCAATGGCGCGCGCCTCGCCGCGCTCTCTGCGTTCTTGGTGTTCGGCGCCGGGATAGGGGTCACGCTATGGGGATTTGGTGGGGTGGCCGCGGAGACCTATGATGCCAGTGCTGGGTGGGCCGGCATGGCGCCGGTGGTGGTGAAGGCGGTGGTCGGAACGGCGGTGCTGGTGGTTCTGATGCTTTATGGAATGGTGATCAACGTTGTGCTCTATATGCATTGCCGCGCGCTTCACGGGGAGCTCACGGGGGAGATCTACAACGAATTCGCCAACTCGTATGTCTTCCTGCCCTTTGACGAGGGCAAGGATCGGCATGTAGTGTCAGTGGTCACGGTGTGGCCATGATTGACTATCGCCGCGGTGGTGAGTTTGCGAATCCAAAGAACAGTTTTGACCACATCATGTATAACTGTGTGCGCATCTCTGTTCTTCTGTTCATAGGTGTCTCTTCAATTGTGCAAACGTTTGGATCAAATACTCTTCTATTAGCCTTAGGCCTTTACAGCCTTAGCCCTGGAATATATAATTTTGTTCAGGTAACGTATCTTTCATATGTACAATATTGTTTCAATATGCACTGAATAATAAAATAG]
[+] EMBL AK106000             [                                                            CATGGACTCGCCGCCGCCGCCGTCTCTCCCGCCGGCGAGCCCGCTCCCCCTCCCGCCGTGGCGGCCCGATCCGTCGCCGGCCGTCCTCCCCTGGCCGGACCTCCTCGCCGGCGCGGCCGCCGCCACCCGCCGCCTCATCGCCGCCCACTCCCGCCACTTCCTCGCCCTCTCGTCCCTCCTCCTCCTCCCGCTCTCCCTCCTCCTCCTCTCCCTCCCGGCTCCCTTCCTCCCGCCCGTCTCCCCCTCCGTCTCGCTCCGCTCTACTACGACGCCGCAGCCGGCGCTCCCCCTCCCGCTCCTCGCCCTGGTTGCCGCCGCCGCGCTCCTTTACCTCGCCGCCTTCGCCGCCGCCGCCGCCAGCGCGCACGCGGGGTTCTTCGGCCGCCCCGTCAAGCTGCTCGCCTCGCTGCTCTCCGTGCCCGCGTCCCTCCTCCGCCTCCTCCTGACGGCGCTCCCCGCAGCGCCGCTGCTGCTTCTCCCGCTCCTCCCGCTCCCGTTCCCGCTTACCGCCGCCCTCGCCGTTCTTGGCCTCCTCCTGTTAGTCCCATTCTGGTCTCTCGCCGGCGCCGCCGCCGTCGTCGAGTCCAGCGCCTGTGTGTCCCCGCTGCGGCAGAGCTGCCGGCTGCTCAATGGCGCGCGCCTCGCCGCGCTCTCTGCGTTCTTGGTGTTCGGCGCCGGGATAGGGGTCACGCTATGGGGATTTGGTGGGGTGGCCGCGGAGACCTATGATGCCAGTGCTGGGTGGGCCGGCATGGCGCCGGTGGTGGTGAAGGCGGTGGTCGGAACGGCGGTGCTGGTGGTTCTGATGCTTTATGGAATGGTGATCAACGTTGTGCTCTATATGCATTGCCGCGCGCTTCACGGGGAGCTCACGGGGGAGATCTACAACGAATTCGCCAACTCGTATGTCTTCCTGCCCTTTGACGAGGGCAAGGATCGGCATGTAGTGTCAGTGGTCACGGTGTGGCCATGATTGACTATCGCCGCGGTGGTGAGTTTGCGAATCCAAAGAACAGTTTTGACCACATCATGTATAACTGTGTGCGCATCTCTGTTCTTCTGTTCATAGGTGTCTCTTCAATTGTGCAAACGTTTGGATCAAATACTCTTCTATTAGCCTTAGGCCTTTACAGCCTTAGCCCTGGAATATATAATTTTGTTCAGGTAACGTATCTTTCATATGTACAATATTGTTTCAATATGCACTGAATAATAAAATAG]


>consensus_2935#0 AACATTCCAGACCTCATCCCATTTTCTTCCGTACACGCTTTCACTTCCTCCCAATCCACC CATGGACTCGCCGCCGCCGCCGTCTCTCCCGCCGGCGAGCCCGCTCCCCCTCCCGCCGTG GCGGCCCGATCCGTCGCCGGCCGTCCTCCCCTGGCCGGACCTCCTCGCCGGCGCGGCCGC CGCCACCCGCCGCCTCATCGCCGCCCACTCCCGCCACTTCCTCGCCCTCTCGTCCCTCCT CCTCCTCCCGCTCTCCCTCCTCCTCCTCTCCCTCCCGGCTCCCTTCCTCCCGCCCGTCTC CCCCTCCGTCTCGCTCCGCTCTACTACGACGCCGCAGCCGGCGCTCCCCCTCCCGCTCCT CGCCCTGGTTGCCGCCGCCGCGCTCCTTTACCTCGCCGCCTTCGCCGCCGCCGCCGCCAG CGCGCACGCGGGGTTCTTCGGCCGCCCCGTCAAGCTGCTCGCCTCGCTGCTCTCCGTGCC CGCGTCCCTCCTCCGCCTCCTCCTGACGGCGCTCCCCGCAGCGCCGCTGCTGCTTCTCCC GCTCCTCCCGCTCCCGTTCCCGCTTACCGCCGCCCTCGCCGTTCTTGGCCTCCTCCTGTT AGTCCCATTCTGGTCTCTCGCCGGCGCCGCCGCCGTCGTCGAGTCCAGCGCCTGTGTGTC CCCGCTGCGGCAGAGCTGCCGGCTGCTCAATGGCGCGCGCCTCGCCGCGCTCTCTGCGTT CTTGGTGTTCGGCGCCGGGATAGGGGTCACGCTATGGGGATTTGGTGGGGTGGCCGCGGA GACCTATGATGCCAGTGCTGGGTGGGCCGGCATGGCGCCGGTGGTGGTGAAGGCGGTGGT CGGAACGGCGGTGCTGGTGGTTCTGATGCTTTATGGAATGGTGATCAACGTTGTGCTCTA TATGCATTGCCGCGCGCTTCACGGGGAGCTCACGGGGGAGATCTACAACGAATTCGCCAA CTCGTATGTCTTCCTGCCCTTTGACGAGGGCAAGGATCGGCATGTAGTGTCAGTGGTCAC GGTGTGGCCATGATTGACTATCGCCGCGGTGGTGAGTTTGCGAATCCAAAGAACAGTTTT GACCACATCATGTATAACTGTGTGCGCATCTCTGTTCTTCTGTTCATAGGTGTCTCTTCA ATTGTGCAAACGTTTGGATCAAATACTCTTCTATTAGCCTTAGGCCTTTACAGCCTTAGC CCTGGAATATATAATTTTGTTCAGGTAACGTATCTTTCATATGTACAATATTGTTTCAAT ATGCACTGAATAATAAAATAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)