cluster # 2950

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Oryza sativa
cluster # 2950 cluster # 2950 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2950#0 length = 622 sequences # 2

consensusID : consensus_2950#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 622
fasta sequence

                              [GACTACGTGGCCGCGCTGGAGATGCAGGTCAAGGCCATGCGCGCCCTCGCCGACGCGCTCGCCGCCGCGCAGCTCTCCTCGTCAACTCCGCAGCAGGCGGAGGCCGCCGCCGACGAGACCGAGATGGAGAGGTGAGGGTTTCGTGGTCAATCGTGAGTTCATCACACGATCGATGATGCTGGATTCGATTCGATGGCTCGGAAATTGGAACGGCTCGGGGAAAAAATAAGGGCGATTAATTAGTGGATTATTATTGCGAGAGGGTTTGGGATTTGAGGAGGGTAATTGCGATGATTGATGCTGCTGATAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGACGATGATGATTTGTAAATTCTTGATACTTGTATAAGTAATGCTGCTCTGCTCCTCTCTTGTTTTTTTCTCCTTGATTCTTGAAATGTTTTTCTCCTCCTGATTTCCAAATCATGTTGGGGATTCCTGATTTCCTGTTTCATCTTGATTAGTAGTATTATGCTGTGATTGGGGATTAGTGTGTTTTGCCCTGTGTTAATCAGGGATTATATGTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTGCTTGCGAAGAATTGGAGAGAAAAAAATGTGAATTCTCTCAA]

[+] EMBL AK070651             [GACTACGTGGCCGCGCTGGAGATGCAGGTCAAGGCCATGCGCGCCCTCGCCGACGCGCTCGCCGCCGCGCAGCTCTCCTCGTCAACTCCGCAGCAGGCGGAGGCCGCCGCCGACGAGACCGAGATGGAGAGGTGAGGGTTTCGTGGTCAATCGTGAGTTCATCACACGATCGATGATGCTGGATTCGATTCGATGGCTCGGAAATTGGAACGGCTCGGGGAAAAAATAAGGGCGATTAATTAGTGGATTATTATTGCGAGAGGGTTTGGGATTTGAGGAGGGTAATTGCGATGATTGATGCTGCTGATAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGACGATGATGATTTGTAAATTCTTGATACTTGTATAAGTAATGCTGCTCTGCTCCTCTCTTGTTTTTTTCTCCTTGATTCTTGAAATGTTTTTCTCCTCCTGATTTCCAAATCATGTTGGGGATTCCTGATTTCCTGTTTCATCTTGATTAGTAGTATTATGCTGTGATTGGGGATTAGTGTGTTTTGCCCTGTGTTAATCAGGGATTATATGTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTGCTTGCGAAGAATTGGAGAGAAAAAAATGTGAATTCTCTCAA]
[+] EMBL AU162190             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGACGATGATGATTTGTAAATNCTTGATACTTGTATAAGTAATGCTGCTCTGCTCCTCTCTNGTTTTTTNCTCCTTGATTCTTGAAATGTTTTTCTCCTCCTGATTTCCAAATCATGTTGGGGATTCCTGATTTCCTGTTTCATCTTGATTAGTAGTATTATGCTGTGATTGGGGATTAGTGTGTTTTGCCCTGTGTTAATCAGGGATTAT                                                                 ]




>consensus_2950#0
GACTACGTGGCCGCGCTGGAGATGCAGGTCAAGGCCATGCGCGCCCTCGCCGACGCGCTC
GCCGCCGCGCAGCTCTCCTCGTCAACTCCGCAGCAGGCGGAGGCCGCCGCCGACGAGACC
GAGATGGAGAGGTGAGGGTTTCGTGGTCAATCGTGAGTTCATCACACGATCGATGATGCT
GGATTCGATTCGATGGCTCGGAAATTGGAACGGCTCGGGGAAAAAATAAGGGCGATTAAT
TAGTGGATTATTATTGCGAGAGGGTTTGGGATTTGAGGAGGGTAATTGCGATGATTGATG
CTGCTGATAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGACGATGATGATT
TGTAAATTCTTGATACTTGTATAAGTAATGCTGCTCTGCTCCTCTCTTGTTTTTTTCTCC
TTGATTCTTGAAATGTTTTTCTCCTCCTGATTTCCAAATCATGTTGGGGATTCCTGATTT
CCTGTTTCATCTTGATTAGTAGTATTATGCTGTGATTGGGGATTAGTGTGTTTTGCCCTG
TGTTAATCAGGGATTATATGTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTGCTTGCGAAGAATTGGAGAG
AAAAAAATGTGAATTCTCTCAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case