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Oryza sativa
cluster # 2950 cluster # 2950       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2950#0 length = 622 sequences # 2  

consensusID : consensus_2950#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 622
fasta sequence
                              [GACTACGTGGCCGCGCTGGAGATGCAGGTCAAGGCCATGCGCGCCCTCGCCGACGCGCTCGCCGCCGCGCAGCTCTCCTCGTCAACTCCGCAGCAGGCGGAGGCCGCCGCCGACGAGACCGAGATGGAGAGGTGAGGGTTTCGTGGTCAATCGTGAGTTCATCACACGATCGATGATGCTGGATTCGATTCGATGGCTCGGAAATTGGAACGGCTCGGGGAAAAAATAAGGGCGATTAATTAGTGGATTATTATTGCGAGAGGGTTTGGGATTTGAGGAGGGTAATTGCGATGATTGATGCTGCTGATAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGACGATGATGATTTGTAAATTCTTGATACTTGTATAAGTAATGCTGCTCTGCTCCTCTCTTGTTTTTTTCTCCTTGATTCTTGAAATGTTTTTCTCCTCCTGATTTCCAAATCATGTTGGGGATTCCTGATTTCCTGTTTCATCTTGATTAGTAGTATTATGCTGTGATTGGGGATTAGTGTGTTTTGCCCTGTGTTAATCAGGGATTATATGTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTGCTTGCGAAGAATTGGAGAGAAAAAAATGTGAATTCTCTCAA]

[+] EMBL AK070651             [GACTACGTGGCCGCGCTGGAGATGCAGGTCAAGGCCATGCGCGCCCTCGCCGACGCGCTCGCCGCCGCGCAGCTCTCCTCGTCAACTCCGCAGCAGGCGGAGGCCGCCGCCGACGAGACCGAGATGGAGAGGTGAGGGTTTCGTGGTCAATCGTGAGTTCATCACACGATCGATGATGCTGGATTCGATTCGATGGCTCGGAAATTGGAACGGCTCGGGGAAAAAATAAGGGCGATTAATTAGTGGATTATTATTGCGAGAGGGTTTGGGATTTGAGGAGGGTAATTGCGATGATTGATGCTGCTGATAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGACGATGATGATTTGTAAATTCTTGATACTTGTATAAGTAATGCTGCTCTGCTCCTCTCTTGTTTTTTTCTCCTTGATTCTTGAAATGTTTTTCTCCTCCTGATTTCCAAATCATGTTGGGGATTCCTGATTTCCTGTTTCATCTTGATTAGTAGTATTATGCTGTGATTGGGGATTAGTGTGTTTTGCCCTGTGTTAATCAGGGATTATATGTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTGCTTGCGAAGAATTGGAGAGAAAAAAATGTGAATTCTCTCAA]
[+] EMBL AU162190             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGACGATGATGATTTGTAAATNCTTGATACTTGTATAAGTAATGCTGCTCTGCTCCTCTCTNGTTTTTTNCTCCTTGATTCTTGAAATGTTTTTCTCCTCCTGATTTCCAAATCATGTTGGGGATTCCTGATTTCCTGTTTCATCTTGATTAGTAGTATTATGCTGTGATTGGGGATTAGTGTGTTTTGCCCTGTGTTAATCAGGGATTAT                                                                 ]


>consensus_2950#0 GACTACGTGGCCGCGCTGGAGATGCAGGTCAAGGCCATGCGCGCCCTCGCCGACGCGCTC GCCGCCGCGCAGCTCTCCTCGTCAACTCCGCAGCAGGCGGAGGCCGCCGCCGACGAGACC GAGATGGAGAGGTGAGGGTTTCGTGGTCAATCGTGAGTTCATCACACGATCGATGATGCT GGATTCGATTCGATGGCTCGGAAATTGGAACGGCTCGGGGAAAAAATAAGGGCGATTAAT TAGTGGATTATTATTGCGAGAGGGTTTGGGATTTGAGGAGGGTAATTGCGATGATTGATG CTGCTGATAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATGACGATGATGATT TGTAAATTCTTGATACTTGTATAAGTAATGCTGCTCTGCTCCTCTCTTGTTTTTTTCTCC TTGATTCTTGAAATGTTTTTCTCCTCCTGATTTCCAAATCATGTTGGGGATTCCTGATTT CCTGTTTCATCTTGATTAGTAGTATTATGCTGTGATTGGGGATTAGTGTGTTTTGCCCTG TGTTAATCAGGGATTATATGTTCTCTCTTTTTTTTTTTTTGCTTGCGAAGAATTGGAGAG AAAAAAATGTGAATTCTCTCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)