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Oryza sativa
cluster # 297 cluster # 297       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_297#0 length = 1651 sequences # 2  
consensusID : consensus_297#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1651
fasta sequence 
                              [CAGCGCTCCACAAAGCAACCCGGCTGCGGCGGCGGCGCCACCCACCTGCTTCATTGCTCACTCCGGCGGCGATGGCCGACGACGTCGCGCCGCGCACCGCCTCCGCCTACCTCGACCCCTCCTACTGGGACGAGCGGTTCGGGAAGGAGGAGCACTATGAGTGGTTCAAGGATTTCTCCCACTTCCGCCACCTCCTCGCCCCGCTCCTCTCCCCTTCCATCTCGGTTCTTGAGGTTGGGTGTGGCAACTCGCGGCTCGGGGAGGAGCTGCTGCGGGAGGGCGTCGCCGGCGGCATCACCTGCGTTGACCTCTCGCCCGTCGCCGTCCAGCGGATGCGTGACCGCCTCGCGGAGCAGGGCACCGAGGGTGTGGAGGTTGTGGTGGCGGACATGCTTGATCTGCCGTTCGATCGTGAGAGCTTCGATCTCGTGATTGAGAAAGGCACCATGGACGTATTATTTGTGGACAGTGGTGATCCTTGGAACCCAAATCCTACAACAGTGGATAATGTGATGAAAATGCTTGAAGGTATCCACAAGGTTTTGAAGCCTGAAGGCATATTTGTATCAATTACCTTTGGACAGCCACATTTCCGTCGTCGATTTTTTGAAGCACCTGGGTTTACATGGTCTGTTGAGTGGAGCACCTTTGGTGATGGCTTCCATTATTTCTTCTATATTCTTAAAAAGGGCAAGAGGTTGTTGGATTCCAACGGTAACCAACATACACAGCCTGCTGCTCCAAGCATTAATATGTTCCATGAAGAGCTTGAGAGTGAGGACTACATATTCCGAACAAATGTTGATGAGTTGTAACTGGCAATTTAACAAGTGCATCATCGGCTTGGGTGGGAGTTTTGATGAAGCTACTACACATCAAGAGAGACGTCCCGTCCAGCATCAACTTGGTAGATGAATGATCTTGGACAGATGCATGGAAAGATCTTGCTTGGTGCTGTACCATTGCCCTGGCTAGGGATTTCTGTGCCAGCTGAATTGACTAGAAAACAGGTACCTTTATCATTGTTCCCAGATTTTTAGTAAACCTTCCAAAGAAGTTCCCTTTTGTTTCCAAACAATGCACTTCTTTGCTACTCCCTCCGTTTCATATTATAATTCGTTTGACTTTTTTAAATTCTATTTTTTTAAGTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAATATAGTAACATTTTTAACCCAAAACAAACATATTATTAAAATATATTCAATGTTAAATTTAATGAAACTAATTTGGTGTTGTTAATGTTGCTAGTTTTTTTTTATAAACTTGGCCAAACCTAAAGAACTTTGACCAAGTAAAAAGTCAAACGATTTATATGAAACGGAGGGAGTACTAAAGTAGCAATGATGTTATCTGATGCTGCAAATATGCCTTCTGACGGTGTCAACTGTGGCCTAGTTTGGCACGTCCAAAATCCTGGTCTATCCCATGGGGTGAGTAATTTGGTTCAATTTCCTGGGCATTTGCAAGCTAGGCCTTCAGTTTCATGTTAGGACTTGTCTGGAATTCATGGAAAATTTTATGGGAACCTTGCTTTGTTCTATACTCCCCACTACTAATGACCTACTTTGTGGAGTTCCTAAAAAATTATGACAGATGCCTTAATCAATGCTCCATTTATTTCAAAATATAAGGCA]

[+] EMBL AK071694             [CAGCGCTCCACAAAGCAACCCGGCTGCGGCGGCGGCGCCACCCACCTGCTTCATTGCTCACTCCGGCGGCGATGGCCGACGACGTCGCGCCGCGCACCGCCTCCGCCTACCTCGACCCCTCCTACTGGGACGAGCGGTTCGGGAAGGAGGAGCACTATGAGTGGTTCAAGGATTTCTCCCACTTCCGCCACCTCCTCGCCCCGCTCCTCTCCCCTTCCATCTCGGTTCTTGAGGTTGGGTGTGGCAACTCGCGGCTCGGGGAGGAGCTGCTGCGGGAGGGCGTCGCCGGCGGCATCACCTGCGTTGACCTCTCGCCCGTCGCCGTCCAGCGGATGCGTGACCGCCTCGCGGAGCAGGGCACCGAGGGTGTGGAGGTTGTGGTGGCGGACATGCTTGATCTGCCGTTCGATCGTGAGAGCTTCGATCTCGTGATTGAGAAAGGCACCATGGACGTATTATTTGTGGACAGTGGTGATCCTTGGAACCCAAATCCTACAACAGTGGATAATGTGATGAAAATGCTTGAAGGTATCCACAAGGTTTTGAAGCCTGAAGGCATATTTGTATCAATTACCTTTGGACAGCCACATTTCCGTCGTCGATTTTTTGAAGCACCTGGGTTTACATGGTCTGTTGAGTGGAGCACCTTTGGTGATGGCTTCCATTATTTCTTCTATATTCTTAAAAAGGGCAAGAGGTTGTTGGATTCCAACGGTAACCAACATACACAGCCTGCTGCTCCAAGCATTAATATGTTCCATGAAGAGCTTGAGAGTGAGGACTACATATTCCGAACAAATGTTGATGAGTTGTAACTGGCAATTTAACAAGTGCATCATCGGCTTGGGTGGGAGTTTTGATGAAGCTACTACACATCAAGAGAGACGTCCCGTCCAGCATCAACTTGGTAGATGAATGATCTTGGACAGATGCATGGAAAGATCTTGCTTGGTGCTGTACCATTGCCCTGGCTAGGGATTTCTGTGCCAGCTGAATTGACTAGAAAACAGGTACCTTTATCATTGTTCCCAGATTTTTAGTAAACCTTCCAAAGAAGTTCCCTTTTGTTTCCAAACAATGCACTTCTTTGCTACTCCCTCCGTTTCATATTATAATTCGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AK107593             [                                                     TTGCTCACTCCGGCGGCGATGGCCGACGACGTCGCGCCGCGCACCGCCTCCGCCTACCTCGACCCCTCCTACTGGGACGAGCGGTTCGGGAAGGAGGAGCACTATGAGTGGTTCAAGGATTTCTCCCACTTCCGCCACCTCCTCGCCCCGCTCCTCTCCCCTTCCATCTCGGTTCTTGAGGTTGGGTGTGGCAACTCGCGGCTCGGGGAGGAGCTGCTGCGGGAGGGCGTCGCCGGCGGCATCACCTGCGTTGACCTCTCGCCCGTCGCCGTCCAGCGGATGCGTGACCGCCTCGCGGAGCAGGGCACCGAGGGTGTGGAGGTTGTGGTGGCGGACATGCTTGATCTGCCGTTCGATCGTGAGAGCTTCGATCTCGTGATTGAGAAAGGCACCATGGACGTATTATTTGTGGACAGTGGTGATCCTTGGAACCCAAATCCTACAACAGTGGATAATGTGATGAAAATGCTTGAAGGTATCCACAAGGTTTTGAAGCCTGAAGGCATATTTGTATCAATTACCTTTGGACAGCCACATTTCCGTCGTCGATTTTTTGAAGCACCTGGGTTTACATGGTCTGTTGAGTGGAGCACCTTTGGTGATGGCTTCCATTATTTCTTCTATATTCTTAAAAAGGGCAAGAGGTTGTTGGATTCCAACGGTAACCAACATACACAGCCTGCTGCTCCAAGCATTAATATGTTCCATGAAGAGCTTGAGAGTGAGGACTACATATTCCGAACAAATGTTGATGAGTTGTAACTGGCAATTTAACAAGTGCATCATCGGCTTGGGTGGGAGTTTTGATGAAGCTACTACACATCAAGAGAGACGTCCCGTCCAGCATCAACTTGGTAGATGAATGATCTTGGACAGATGCATGGAAAGATCTTGCTTGGTGCTGTACCATTGCCCTGGCTAGGGATTTCTGTGCCAGCTGAATTGACTAGAAAACAGGTACCTTTATCATTGTTCCCAGATTTTTAGTAAACCTTCCAAAGAAGTTCCCTTTTGTTTCCAAACAATGCACTTCTTTGCTACTCCCTCCGTTTCATATTATAATTCGTTTGACTTTTTTAAATTCTATTTTTTTAAGTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAATATAGTAACATTTTTAACCCAAAACAAACATATTATTAAAATATATTCAATGTTAAATTTAATGAAACTAATTTGGTGTTGTTAATGTTGCTAGTTTTTTTTTATAAACTTGGCCAAACCTAAAGAACTTTGACCAAGTAAAAAGTCAAACGATTTATATGAAACGGAGGGAGTACTAAAGTAGCAATGATGTTATCTGATGCTGCAAATATGCCTTCTGACGGTGTCAACTGTGGCCTAGTTTGGCACGTCCAAAATCCTGGTCTATCCCATGGGGTGAGTAATTTGGTTCAATTTCCTGGGCATTTGCAAGCTAGGCCTTCAGTTTCATGTTAGGACTTGTCTGGAATTCATGGAAAATTTTATGGGAACCTTGCTTTGTTCTATACTCCCCACTACTAATGACCTACTTTGTGGAGTTCCTAAAAAATTATGACAGATGCCTTAATCAATGCTCCATTTATTTCAAAATATAAGGCA]




>consensus_297#0
CAGCGCTCCACAAAGCAACCCGGCTGCGGCGGCGGCGCCACCCACCTGCTTCATTGCTCA
CTCCGGCGGCGATGGCCGACGACGTCGCGCCGCGCACCGCCTCCGCCTACCTCGACCCCT
CCTACTGGGACGAGCGGTTCGGGAAGGAGGAGCACTATGAGTGGTTCAAGGATTTCTCCC
ACTTCCGCCACCTCCTCGCCCCGCTCCTCTCCCCTTCCATCTCGGTTCTTGAGGTTGGGT
GTGGCAACTCGCGGCTCGGGGAGGAGCTGCTGCGGGAGGGCGTCGCCGGCGGCATCACCT
GCGTTGACCTCTCGCCCGTCGCCGTCCAGCGGATGCGTGACCGCCTCGCGGAGCAGGGCA
CCGAGGGTGTGGAGGTTGTGGTGGCGGACATGCTTGATCTGCCGTTCGATCGTGAGAGCT
TCGATCTCGTGATTGAGAAAGGCACCATGGACGTATTATTTGTGGACAGTGGTGATCCTT
GGAACCCAAATCCTACAACAGTGGATAATGTGATGAAAATGCTTGAAGGTATCCACAAGG
TTTTGAAGCCTGAAGGCATATTTGTATCAATTACCTTTGGACAGCCACATTTCCGTCGTC
GATTTTTTGAAGCACCTGGGTTTACATGGTCTGTTGAGTGGAGCACCTTTGGTGATGGCT
TCCATTATTTCTTCTATATTCTTAAAAAGGGCAAGAGGTTGTTGGATTCCAACGGTAACC
AACATACACAGCCTGCTGCTCCAAGCATTAATATGTTCCATGAAGAGCTTGAGAGTGAGG
ACTACATATTCCGAACAAATGTTGATGAGTTGTAACTGGCAATTTAACAAGTGCATCATC
GGCTTGGGTGGGAGTTTTGATGAAGCTACTACACATCAAGAGAGACGTCCCGTCCAGCAT
CAACTTGGTAGATGAATGATCTTGGACAGATGCATGGAAAGATCTTGCTTGGTGCTGTAC
CATTGCCCTGGCTAGGGATTTCTGTGCCAGCTGAATTGACTAGAAAACAGGTACCTTTAT
CATTGTTCCCAGATTTTTAGTAAACCTTCCAAAGAAGTTCCCTTTTGTTTCCAAACAATG
CACTTCTTTGCTACTCCCTCCGTTTCATATTATAATTCGTTTGACTTTTTTAAATTCTAT
TTTTTTAAGTTTGACCAAGTTTGTAGAAAAATATAGTAACATTTTTAACCCAAAACAAAC
ATATTATTAAAATATATTCAATGTTAAATTTAATGAAACTAATTTGGTGTTGTTAATGTT
GCTAGTTTTTTTTTATAAACTTGGCCAAACCTAAAGAACTTTGACCAAGTAAAAAGTCAA
ACGATTTATATGAAACGGAGGGAGTACTAAAGTAGCAATGATGTTATCTGATGCTGCAAA
TATGCCTTCTGACGGTGTCAACTGTGGCCTAGTTTGGCACGTCCAAAATCCTGGTCTATC
CCATGGGGTGAGTAATTTGGTTCAATTTCCTGGGCATTTGCAAGCTAGGCCTTCAGTTTC
ATGTTAGGACTTGTCTGGAATTCATGGAAAATTTTATGGGAACCTTGCTTTGTTCTATAC
TCCCCACTACTAATGACCTACTTTGTGGAGTTCCTAAAAAATTATGACAGATGCCTTAAT
CAATGCTCCATTTATTTCAAAATATAAGGCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)