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consensusID : consensus_3050#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 2265 fasta sequence
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consensusID : consensus_3050#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 1912 fasta sequence
[TTCATCCTCTTTTCAGGAGAACCAAGCTTACTTCTTCCCTGAATCCATATCACAACACGAAAACTACCGCACATCATGTCTTACGGTGGATACAGCAACGGTCCTAGCCGCGGTGGCTGCGGCGGCGGCGCTCCTCGCGGCGGCCCCAGCAGCTACGGTGGCGGAGGTGGCGGCTACGGCGGTGGCTCTTACGGCGGCGGTTCCTCCTCGTACGGCGGTGGAGGATACGGCGGCGGAGCTGGCGGCGGCTACGGCGGTGGCTACGGCGGTGGCTTTGGCGGCGGAGACCGCATGAGCAACCTCGGTGCTAACCTCGGTGCTGTCGACTGGAACAGCGTCGACCTCGTCAACTTCGAGAAGAACTTTTACATCGAAGACCCGCGCGTCGCTGGCCGCTCCGACCGCGAGGTGCAGGACTACCGCGCCTCCAAGCAGATGACCATCCAGGGTCAGAACGTCCCTAAGCCCGTCACCTCGTTCGACGAGGCCGGCTTCCCGGACTACATCCTTTCCGAAATCAAGAAGATGGGCTTTGCTGAGCCTTCGGCTATCCAGTCGCAGGCCTGGCCCATGGCGCTCAGCGGTCGCGACCTGGTCGCCATCGCCGAGACCGGTTCCGGTAAGACCATCGGCTTTGCCCTCCCCGCCATGGTCCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCAAGCCCGGCGATGGTCCCATCGCCCTCATCCTGGCTCCCACCCGTGAGCTCGCCAACCAGATCCAGGTCGAGTGCAACCGCTTCGGTGGCTCGAGCCGCCTGCGCACTTGCGCCGTCTACGGTGGTGTGCCCAAGGGCCCCCAGACCCGCGACCTGCAGCGTGGTGCCGAGATTGTCATCGCCACCCCTGGTCGTCTGATCGACATGGTCGACGCCGGCAAGACCAACCTCCGCCGCGTCACCTACCTCGTCATGGACGAGGCCGACCGCATGCTCGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGATTCTCCAGCAGATCCGCCCCGACCGTCAGACGCTCATGTTCTCGGCCACCTGGCCCAAGGAGGTGCAGCGTCTTGCCGGCGACTTCCTCAACGACTTTGCCCAGGTCAACATTGGCTCCACCGAGCTCGCCGCCAACCACAACGTCAAGCAGATCATCGAGGTCTGCTCCGAGTTTGAGAAGAAGGGCAAGCTCATCGGCCACCTCGAGACCATCTCGCAGGAGAACGGCAAGGTTATCATCTTCACCAGCACCAAGCGCGTCGCCGACGACCTCACCAAGTACCTCCGCCAGGACGGCTGGCCTGCGCTTGCCATCCACGGTGACAAGCAGCAGCAGGAGCGTGACTGGGTGCTGGCCGAGTTCAAGTCGGGTCGTAGCCCGATCATGGTCGCTACCGCTGTGGCGTCCCGAGGTCTCGACGTCAAGGACATTTCTTATGTCATCAACTACGACTTCCCCACCAACACGGAGGACTACGTGCACCAGATCGGCCGTACCGGACGTGCCGGCCGCACGGGTACCGCTTACACCTTCTTCACGCCCGAGAACTCCAAGTCGGCGCGCGAGCTGGTTGGCATTCTGCGTGAGGCCAAGCAGGAGATCCCGCGTGAGATCGAGGAGATGGGCCGCTTCGGCGGTGGAGGAGGCGGCCGTGGCTTCCGAGGCCGTGGTCGTGGCCGTGGCCGCGGTGGCTACGGCGGCGGAGGACGCACGGGTGCCAACTCGTTCGCTGTCGGCAACTCCCGATGGTAGATATGCACCTTGCTCGTCGTTCTTCTGAGCTGCTTTCTCGGCATGGTCGCTGGTCGCTTGAACTTTGTCGTCTCTACACCCACCGAGTCGTTTGGGTCTCACTCAAGGTATCACGTCGACTTTAGCTGGCTCAGCTCTCTTCCATGCTTTCCTGTAATGTGGTCATTTTGTT]
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_3050#0 CGGCGACCGTGGTGGTGACCGCAATGGTCACGGTGGTGGTTACGGAGGCCGAAGCAACGG 300
consensus_3050#1 CAGCTACGGTGGCGGAGGTGGCGGCTACGGCGGTGGCTCTTACGGCGGCGGTTCCTCCTC 209
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consensus_3050#1 CGGTGGCTTTGGCGGCGGAGACCGCATGAGCAACCTCGGTGCTAACCTCGGTGCTGTCGA 326
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consensus_3050#1 CGCTGGCCGCTCCGACCGCGAGGTGCAGGACTACCGCGCCTCCAAGCAGATGACCATCCA 446
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consensus_3050#0 TGGCACCGAGGTTCCCAAGCCCGTCGAGACTTTCGATGAGGCCGGCTTCCCACGATATGT 600
consensus_3050#1 GGGTCAGAACGTCCCTAAGCCCGTCACCTCGTTCGACGAGGCCGGCTTCCCGGACTACAT 506
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consensus_3050#1 CCTTTCCGAAATCAAGAAGATGGGCTTTGCTGAGCCTTCGGCTATCCAGTCGCAGGCCTG 566
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consensus_3050#0 GCCTATGGCCCTCTCTGGTCGTGATGTCGTTGGTATTGCCGAGACTGGTTCCGGAAAGAC 720
consensus_3050#1 GCCCATGGCGCTCAGCGGTCGCGACCTGGTCGCCATCGCCGAGACCGGTTCCGGTAAGAC 626
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consensus_3050#0 CCTCACATACTGCCTTCCCTCCATCGTTCACATCAACGCCCAGCCTCTCCTCGCCCCCGG 780
consensus_3050#1 CATCGGCTTTGCCCTCCCCGCCATGGTCCACATCAACGCCCAGCCCCTCCTCAAGCCCGG 686
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consensus_3050#0 CGATGGTCCTATTGTCCTTGTCCTTGCTCCCACTCGTGAGCTTGCTGTTCAGATCCAGGA 840
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consensus_3050#0 CCCCAAGGGTCCTCAAATCCGTGACCTTTCCCGAGGAGTCGAGGTCTGCATTGCCACCCC 960
consensus_3050#1 GCCCAAGGGCCCCCAGACCCGCGACCTGCAGCGTGGTGCCGAGATTGTCATCGCCACCCC 866
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consensus_3050#0 CGGTCGTTTGATTGACATGCTCGAGGCCGGTAAGACCAACCTGCGTCGTGTTACCTACCT 1020
consensus_3050#1 TGGTCGTCTGATCGACATGGTCGACGCCGGCAAGACCAACCTCCGCCGCGTCACCTACCT 926
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consensus_3050#0 CGTCCTCGACGAGGCTGATCGCATGCTCGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGAT 1080
consensus_3050#1 CGTCATGGACGAGGCCGACCGCATGCTCGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATCCGCAAGAT 986
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consensus_3050#0 TATTGGCCAGATTCGACCCGACCGACAGACTCTCACGTGGTCTGCTGCCTGGCCCAAGGA 1140
consensus_3050#1 TCTCCAGCAGATCCGCCCCGACCGTCAGACGCTCATGTTCTCGGCCACCTGGCCCAAGGA 1046
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consensus_3050#0 GGTTCGTGCTCTGGCTTCCGACTTCCTCAACGACTTCATCCAAGTCAACATCGGTTCCAT 1200
consensus_3050#1 GGTGCAGCGTCTTGCCGGCGACTTCCTCAACGACTTTGCCCAGGTCAACATTGGCTCCAC 1106
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consensus_3050#0 GGAGCTTGCCGCCAACCACCGAATTACCCAAATTGTCGAGGTTGTTACCGATATGGAGAA 1260
consensus_3050#1 CGAGCTCGCCGCCAACCACAACGTCAAGCAGATCATCGAGGTCTGCTCCGAGTTTGAGAA 1166
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consensus_3050#0 GCGTGACCGTATGATTAAGCATCTCGAGAAGACCATGGAGAATAAGGAGAACAAGATCCT 1320
consensus_3050#1 GAAGGGCAAGCTCATCGGCCACCTCGAGACCATCTCGCAGGAGAACGG---CAAGGTTAT 1223
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consensus_3050#0 CATCTTTGTCGGTACTAAGCGAATTGCTGACGAGATCACCCGATTCCTTCGCCAGGACGG 1380
consensus_3050#1 CATCTTCACCAGCACCAAGCGCGTCGCCGACGACCTCACCAAGTACCTCCGCCAGGACGG 1283
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consensus_3050#0 CTGGCCTGCGCTTTCCATTCACGGTGACAAGCAGCAGAACGAGCGTGATTGGGTCCTTGA 1440
consensus_3050#1 CTGGCCTGCGCTTGCCATCCACGGTGACAAGCAGCAGCAGGAGCGTGACTGGGTGCTGGC 1343
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consensus_3050#0 CCAGTTCAAGACCGGAAAGTCCCCCATCATGGTGGCCACTGATGTTGCCTCGCGTGGTAT 1500
consensus_3050#1 CGAGTTCAAGTCGGGTCGTAGCCCGATCATGGTCGCTACCGCTGTGGCGTCCCGAGGTCT 1403
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consensus_3050#0 TGATGTGCGCAACATCACTCATGTGTTGAACTACGATTACCCCCACAACTCGGAAGACTA 1560
consensus_3050#1 CGACGTCAAGGACATTTCTTATGTCATCAACTACGACTTCCCCACCAACACGGAGGACTA 1463
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consensus_3050#0 CATTCACCGAATTGGTCGTACCGGTCGTGCTGGTGCCAAGGGTACCGCTATTACCCTTTT 1620
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consensus_3050#1 CACGCCCGAGAACTCCAAGTCGGCGCGCGAGCTGGTTGGCATTCTGCGTGAGGCCAAGCA 1583
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consensus_3050#1 GGAGAT---CCCGCGTGAGATCGAGGAGATGGGCCGCTTCGGCGGTGGAGGAGGCGGCCG 1640
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consensus_3050#0 CGGTGGATGGGGACGTGGCCGTGGCGGTGGTAGAGGTGGGTTCCGCCGTCGCTAAAGCAG 1800
consensus_3050#1 TGGCTTCCGAGGCCGTGGTCGTGGCCGTGGCCGCGGTGGCTACGGCGGCGGAGGACGCAC 1700
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consensus_3050#1 --GGGTGCCAACTCGTTCGCTGTCGGCAACTCCCGATGGTA--GATATGCACCTTGCTCG 1756
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consensus_3050#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_3050#1 ------------------------------------------------------------
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||