cluster # 3054

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Oryza sativa
cluster # 3054 cluster # 3054 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3054#0 length = 2091 sequences # 2
consensusID : consensus_3054#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2091
fasta sequence
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[+] EMBL AK109608             [GCGGAGGTGCGAAGCCATCGAGGTGAGTGGAAGCTTCTGGAACCTTACCCTCCTTTTTCCTTTCTATCTCGCTGCGGTTGGCTTAATTTGCCTCTGCGGGCGCGTCGCGGTTTTGCTTCTAGAACCTTCTAGTTCTTGTGGTGGTATGAAGTTTCTCCGTGAGTGTCAAATGTGGATCCGCCATTAGAGATGGATTTGAGTTCGCTGTGCTTTGTGACGATAGGCTTGTTTCGGTGGAGATTTCATGGATAGGTCGACGACGAGTTCATAGAAGGAGGGGCTTTATATGCATTAGATGAACGGCTTCCAACAGTTTCCGTAGCAAGAAGCTTCTATGGTTTAATCTAATTCTAGGAGGGCGGTAGGGGTGATGTTTGTGTGCCGAAGTCTTGCTAACCTGGATCAATGGAATGCGCTTGTTGTGCAATGCAGTTGGAAACTGTGGAGTAGCCCGTGTGACAGTGTGAGTTAATTACTTGGTTGCTTATTTGAGGATTAGGATACACACAGGAGGTCATGAGATGTTGTTTGGTTAAACTGAACATTTAATTTGTAGTCTATTAGGCTGAAAGGAAAATAAAGAACCATTCAGCCTAGTTGCAAGACTAGTTTTTCTTTGTAACGTTGGTGAATTGTACTGTGTTTAAGCCAAACTAAGTTGTTAAAGGTTTAGACTGACGTCCCCTTATGTGATGTTTAT CTTT GTTGTTGTTGTCATATTTTGAAAATTGTGCATTCACCATCTCTAAAATAGCTCATAGGGCATTAACGAGTGATTTC AATCGAGGTGCCTTGTTTACAACTATTGCTTTGCATATTCTGATCATTGCAATGTTTTCAACCAGTTATTGCATATGGTGGCACCAAGCATGAGGTTACAACTGCATTACTTGCAAGGGAATCACAAGTCACAAGAAACACATGTTATTACAATGGATGTAAGATTTTTTTATTCCCAGTTTATTTTCCCATGATTTTGCGACAGTGAATAGTTTTATTTTTTTTAAATAAAATGAACTTACATGATCATTGATGTTGTCTTTAACAACAACTCACCAATGAACAACCATACATTGTCATATGTGAACTCTGGTTAAAGAGTATCTTTTTGTAACTTAAGATAAATGGGCATCTGTCCTGCAAATGGAGATGGAAAGTTTGCATAGAAGTAACAGTGATATGCTATTCTGCTTATAATCACCTTTCCAGATATATGTTGTGCTGTACTAGCAGTCTAATACATACTATATGATGTCTGTTGTTAATATTCAGAAAATGACCCTGTTTTTTGCCACCATAAGTTTCCAACTTTTCAGGCTATCATATTTCAGTATGCTGTGATAGATAAGTGAACCTCTTTGTGTGTAAATGTTTCATGGTCTGATGGATAAACAAGATAATTGTGTACAGAACCCAGCTTGCAGCATATCTGCATTAAGCAGATGTAGTTTTGCTGCAAGCAAAGCATGGCTTATTGCTATACCATTGCCTTTGTGAGTGGAATGGTATATCTTCTAAATTAAGGAAAAGATGACTTTCTCCTTTTCTGGAGCTATGTTGGGGTTGGCTCTGTTCAAGATCAGAGGGAGTATATTCCTCCTCTCAAGAGCTCAAAACTTTTCTTGTGAATAAGTTTCCATGTTAAGGACTGCATAGAGCCCCTTTTCCATTGATAGGTACACCCAAGGCAGCGGGCAGTCTCATTATATAAAATTATGTTGGTATGGTCAAAGCGCACCATCAGCAGGTTGAACCTTCCTACTTAGTTCTTCAATTCCTTGTGTCAAAGGTGGTCCTATGGCAGAAGATTGATTGCTTCAATCTAAATGGAATTAAAACAAAGTTGCAGATATTAATGAAGCACATGCTAAGGTGACCTTCATCTGAGATGTGACTATTGACATCACATACGCTCATTTTGAGTTGGTTCTCTAAATTCCAGAGATCTCTTGCATTTAGGCCAGCAAGCTCCTGTCCATATTTATCAATAAACACAGGACGGAGTTGATTTAACATTCTGAGAAAAATTGTCACAATTTGATTTCTTATACATGTATTCTTTCTCACTAACTTACTAATATTATGGAAGAG]
[+] EMBL CA765204             [   aAGGGGGGAAGCCATCGAGGTGAGTGGAAGCTTCTGGAACCTTACCCTCCTTTTTCCTTTCTATCTCGCTGCGGTTGGCTTAATTTGCCTCTGCGGGCGCGTCGCGGTTTTGCTTCTAGAACCTTCTAGTTCTTGTGGTGGTATGAAGTTTCTCCGTGAGTGTCAAATGTGGATCCGCCATTAGAGATGGATTTGAGTTCGCTGTGCTTTGTGACGATAGGCTTGTTTCGGTGGAGATTTCATGGATAGGTCGACGACGAGTTCATAGAAGGAGGGGCTTTATATGCATTAGATGAACGGCTTCCAACAGTTTCCGTAGCAAGAAGCTTCTATGGTTTAATCTAATTCTAGGAGGGCGGTAGGGGTGATGTTTGTGTGCCGAAGTCTTGCTAACCTGGATCAATGGAATGCGCTTGTTGTGCAATGCAGTTGGAAACTGTGGAGTAGCCCGTGTGACAGTGTGAGTTAATTACTTGGTTGCTTATTTGAGGATTAGGATACACACAGGAGGTCATGAGATGTTGTTTGGTTAAACTGAACATTTAATTTGTAGTCTATTAGGCTGAAAGGAAAATAAAGAACCATTCAGCCTAGTTGCAAGACTAGTTTTTCTTTGTAACGTTGGTGAATTGTACTGTGTTTAAGCCAAACTAAGTTGTTAAAGGTTTAGACTGACGTCCCCTTATGTGATGTTTATCCTTTGGTGGTTGGTGGCATATTTTGAAAATTGTGCATTCACCATCTCTAAAATAGCTCATAGGGCATTAACGAGTGATTTCAAATCGAGGGGCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]




>consensus_3054#0
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TTTCTATCTCGCTGCGGTTGGCTTAATTTGCCTCTGCGGGCGCGTCGCGGTTTTGCTTCT
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TTTCATGGATAGGTCGACGACGAGTTCATAGAAGGAGGGGCTTTATATGCATTAGATGAA
CGGCTTCCAACAGTTTCCGTAGCAAGAAGCTTCTATGGTTTAATCTAATTCTAGGAGGGC
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AATCGAGGTGCCTTGTTTACAACTATTGCTTTGCATATTCTGATCATTGCAATGTTTTCA
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ATCACAAGTCACAAGAAACACATGTTATTACAATGGATGTAAGATTTTTTTATTCCCAGT
TTATTTTCCCATGATTTTGCGACAGTGAATAGTTTTATTTTTTTTAAATAAAATGAACTT
ACATGATCATTGATGTTGTCTTTAACAACAACTCACCAATGAACAACCATACATTGTCAT
ATGTGAACTCTGGTTAAAGAGTATCTTTTTGTAACTTAAGATAAATGGGCATCTGTCCTG
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CTGATGGATAAACAAGATAATTGTGTACAGAACCCAGCTTGCAGCATATCTGCATTAAGC
AGATGTAGTTTTGCTGCAAGCAAAGCATGGCTTATTGCTATACCATTGCCTTTGTGAGTG
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GAGTTGGTTCTCTAAATTCCAGAGATCTCTTGCATTTAGGCCAGCAAGCTCCTGTCCATA
TTTATCAATAAACACAGGACGGAGTTGATTTAACATTCTGAGAAAAATTGTCACAATTTG
ATTTCTTATACATGTATTCTTTCTCACTAACTTACTAATATTATGGAAGAG
clustalw multiple alignements is not computed in this case