Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 3182 cluster # 3182       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3182#0 length = 675 sequences # 2  

consensusID : consensus_3182#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 675
fasta sequence
                              [GGGACCACACACCGATTTTCGCAAACTAGAAAT-AATTAAGTAAGTTCTACTCTCGATTGATATGGCGATAGCTTGGGTGAACTTGGTAATCCTAGGCCTATCCCTTGTCGCTCCCCTTGTCCTCACCACCATCCCGGAGGTCGCTGGTGGGCGACCCGGCGGCTACATCGACTACGGCGCCATGAACAAAGACCGCATCCCTGGAACTCCAGAGTTCAACCACCTGGGCGGCTCCGCCAACCAGTACACGCGTGGTTGTGAGAAGCAGTTGCATTGCAGGGGTAAAAGGCGAGGGTTCTGATCGAAGCTGCTTGCAGAGTTGCAGTTCATCATGGCCGTTGATCATGGCTATTGATCGGCTACGTAGTTTATGCTTTGTTTTGGTGCTATAATATATAGTTTTTTAATAACACTTAGAACAACACATTGTTCAGATAGCTAGGTAATTTGGTGCTACAATAGGATTTCAGTAACGCTTTAGTTATAACAGCAAATTCTTATTTGGATATGTAATCATTCCTTTAACATAAAGTGTCTGTAGTACCTTTTTGTCAGCTTAACTTTTTTTTTAAAAAAAAATGATTGGTGCATATGTGTTGAGTTTGAATATTTCCTGGCTGATGCAACCAATTTTTTTTTAGAGAAGGGATTTTTTTACCCCCGGTCTCTATCACC]

[+] EMBL CB096578             [GGGACCACACACCGATTTTCGCAAACTAGAAAT AATTAAGTAAGTTCTACTCTCGATTGATATGGCGATAGCTTGGGTGAACTTGGTAATCCTAGGCCTATCCCTTGTCGCTCCCCTTGTCCTCACCACCATCCCGGAGGTCGCTGGTGGGCGACCCGGCGGCTACATCGACTACGGCGCCATGAACAAAGACCGCATCCCTGGAACTCCAGAGTTCAACCACCTGGGCGGCTCCGCCAACCAGTACACGCGTGGTTGTGAGAAGCAGTTGCATTGCAGGGGTAAAAGGCGAGGGTTCTGATCGAAGCTGCTTGCAGAGTTGCAGTTCATCATGGCCGTTGATCATGGCTATTGATCGGCTACGTAGTTTATGCTTTGTTTTGGTGCTATAATATATAGTTTTTTAATAACACTTAGAACAACACATTGTTCAGATAGCTAGGTAATTTGGTGCTACAATAGGATTTCAGTAACGCTTTAGTTATAACAGCAAATTCTTATTTGGATATGTAATCATTCCTTTAACATAAAGTGTCTGTAGTACCTT                                                                                                                                ]
[+] EMBL CA765831             [           CCGATTTTCGCAAACTAGAAATCAATTAAGTAAGTTCTACTCTCGATTGATATGGCGATAGCTTGGGTGAACTTGGTAATCCTAGGCCTATCCCTTGTCGCTCTCCTTGTCCTCACCACCATCCCGGAGGTCGCTGGTGGGCGACCCGGCGGCTACATCGACTACGGCGCCATGAACAAAGACCGCATCCCTGGAACTCCAGAGTTCAACCACCTGGGCGGCTCCGCCAACCAGTACACGCGTGGTTGTGAGAAGCAGTTGCATTGCAGGGGTAAAAGGCGAGGGTTCTGATCGAAGCTGCTTGCAGAGTTGCAGTTCATCATGGCCGTTGATCATGGCTATTGATCGGCTACGTAGTTTATGCTTTGTTTTGGTGCTATAATATATAGTTTTTTAATAACACTTAGAACAACACATTGTTCAGATAGCTAGGTAATTTGGTGCTACAATAGGATTTCAATAACGCTTTAGTTATAACAGCAAATTCTTATTTGGATATGTAATCATTCCTTTAACATAAAGTGTCTGTAGTACTTGTTTGTCAGCTTAACTTTTTTTTTAAAAAAAAATGATTGGTGCATATGTGTTGAGTTTGAATATTTCCTGGCTGATGCAACCAATTTTTTTTTAGAGAAGGGATTTTTTTACCCCCGGTCTCTATCACC]


>consensus_3182#0 GGGACCACACACCGATTTTCGCAAACTAGAAATAATTAAGTAAGTTCTACTCTCGATTGA TATGGCGATAGCTTGGGTGAACTTGGTAATCCTAGGCCTATCCCTTGTCGCTCCCCTTGT CCTCACCACCATCCCGGAGGTCGCTGGTGGGCGACCCGGCGGCTACATCGACTACGGCGC CATGAACAAAGACCGCATCCCTGGAACTCCAGAGTTCAACCACCTGGGCGGCTCCGCCAA CCAGTACACGCGTGGTTGTGAGAAGCAGTTGCATTGCAGGGGTAAAAGGCGAGGGTTCTG ATCGAAGCTGCTTGCAGAGTTGCAGTTCATCATGGCCGTTGATCATGGCTATTGATCGGC TACGTAGTTTATGCTTTGTTTTGGTGCTATAATATATAGTTTTTTAATAACACTTAGAAC AACACATTGTTCAGATAGCTAGGTAATTTGGTGCTACAATAGGATTTCAGTAACGCTTTA GTTATAACAGCAAATTCTTATTTGGATATGTAATCATTCCTTTAACATAAAGTGTCTGTA GTACCTTTTTGTCAGCTTAACTTTTTTTTTAAAAAAAAATGATTGGTGCATATGTGTTGA GTTTGAATATTTCCTGGCTGATGCAACCAATTTTTTTTTAGAGAAGGGATTTTTTTACCC CCGGTCTCTATCACC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)