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consensusID : consensus_3262#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 1192 fasta sequence
[AAGCATCACATCTATCGCCATCATGGTCCCCAAGGTCGGTATCAACGGTTTCGGTCGTATTGGCCGCATTGTCTTCCGCAATGCCACCCAAGCTGGCACTGTCGACGTTGTCGCTGTCAACGACCCCTTCATTGAGGTTCACTACGCTGCCTACATGCTCCGCTATGACAGCACCCACGGCCAGTTCAAGGGTACCATTGAGATCAACGGTACCGAGGGCCTGATCGTCAACGGCAAGAAGATCCGCTTCTACGCTGAGCGTGACCCCGCTGCCATCCCCTGGGGTAAGGAGGGTGCCGACTACGTTGTCGAGTCCACTGGTGTCTTCACCACCACCGACAAGGCCTCTGCCCACATCAAGGGTGGTGCCAAGAAGGTCATCATCTCCGCTCCCTCCGCCGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTCAACAACGACTCCTACACCAAGGACGTCAACGTTCTCTCCAACGCCTCTTGCACCACCAACTGCCTTGCTCCCCTTGCCAAGGTTATCAACGACAAGTACGGTCTCGTTGAGGGTCTCATGACCACTGTCCACTCCTACACTGCCACCCAGAAGACCGTCGACGGCCCCTCCGGAAAGGACTGGCGTGGTGGCCGCACTGCGGCCCAGAACATCATCCCCTCCTCCACCGGTGCCGCCAAGGCTGTCGGCAAGGTCATCCCCTCTTTGAACGGCAAGCTCACCGGCATGTCCATGCGTGTCCCTACCGCCAACGTCTCCGTCGTTGACTTGACCTGCCGCATCGAGAAGGGTGCTACCTACGAGGAGATCAAGGCCACCATCAAGGCCGCCTCCGAGAACGAGCTCAAGGGCATTCTCGGCTACACCGAGGATGACATCGTCTCCACTGACCTCAACGGTGACGACCACTCCTCCATCTTCGATGCCAAGGCTGGTATCGCCCTCAACGCCAACTTCATCAAGCTTGTCTCTTGGTACGACAACGAGTGGGGTTACTCCCACCGTGTTGTTGACCTGATCTCCTACATCGCCAAGGTCGATGGCCAGTAGCAATTAAAACAGTCTCCTGAGGCCAGGAGCCTTCTCTGAGATGTGAAATGGCTCTTACGCTGCTCGCCCATAGATCTGATATCGGGTGCTTTTGAAGAGTTGCTTTCCGTCCTGTAGAAAAAATCAGCTGATAACGTCACTTTAATGAACCAAATA]
[+] EMBL AK108431 [AAGCATCACATCTATCGCCATCATGGTCCCCAAGGTCGGTATCAACGGTTTCGGTCGTATTGGCCGCATTGTCTTCCGCAATGCCACCCAAGCTGGCACTGTCGACGTTGTCGCTGTCAACGACCCCTTCATTGAGGTTCACTACGCTGCCTACATGCTCCGCTATGACAGCACCCACGGCCAGTTCAAGGGTACCATTGAGATCAACGGTACCGAGGGCCTGATCGTCAACGGCAAGAAGATCCGCTTCTACGCTGAGCGTGACCCCGCTGCCATCCCCTGGGGTAAGGAGGGTGCCGACTACGTTGTCGAGTCCACTGGTGTCTTCACCACCACCGACAAGGCCTCTGCCCACATCAAGGGTGGTGCCAAGAAGGTCATCATCTCCGCTCCCTCCGCCGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTCAACAACGACTCCTACACCAAGGACGTCAACGTTCTCTCCAACGCCTCTTGCACCACCAACTGCCTTGCTCCCCTTGCCAAGGTTATCAACGACAAGTACGGTCTCGTTGAGGGTCTCATGACCACTGTCCACTCCTACACTGCCACCCAGAAGACCGTCGACGGCCCCTCCGGAAAGGACTGGCGTGGTGGCCGCACTGCGGCCCAGAACATCATCCCCTCCTCCACCGGTGCCGCCAAGGCTGTCGGCAAGGTCATCCCCTCTTTGAACGGCAAGCTCACCGGCATGTCCATGCGTGTCCCTACCGCCAACGTCTCCGTCGTTGACTTGACCTGCCGCATCGAGAAGGGTGCTACCTACGAGGAGATCAAGGCCACCATCAAGGCCGCCTCCGAGAACGAGCTCAAGGGCATTCTCGGCTACACCGAGGATGACATCGTCTCCACTGACCTCAACGGTGACGACCACTCCTCCATCTTCGATGCCAAGGCTGGTATCGCCCTCAACGCCAACTTCATCAAGCTTGTCTCTTGGTACGACAACGAGTGGGGTTACTCCCACCGTGTTGTTGACCTGATCTCCTACATCGCCAAGGTCGATGGCCAGTAGCAATTAAAACAGTCTCCTGAGGCCAGGAGCCTTCTCTGAGATGTGAAATGGCTCTTACGCTGCTCGCCCATAGATCTGATATCGGGTGCTTTTGAAGAGTTGCTTTCCGTCCTGTAGAAAAAATCAGCTGATAACGTCACTTTAATGAACCAAATA]
consensusID : consensus_3262#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 1178 fasta sequence
[TCTTCTTCACATCTCTATCCATCCCCAAAACTACACAAATACCGCAAACATGGTTCCCAAGGTTGGTATCAACGGATTCGGCCGTATCGGTCGCATTGTCTTCCGCAATGCCATCAACCACGGTGGTGTCGACGTTGTCGCCGTCAACGACCCCTTCATTGAGGTCCACTACGCTGCATACATGCTCAAGTATGACAGCACTCACGGTCAGTTCAAGGGCACCATCGAGATCGATGGCACCTCCGGCCTGATTGTCAACGGCAAGAAGATCCGCTTCTACGCTGAGCGTGACCCCGCCTCCATCCCCTGGTCTGAGACCGGCGCCGCCTACGTCGTCGAGTCCACCGGTGTCTTCACCACCACCGAGAAGGCCTCTGCTCACTTGAAGGGTGGTGCCAAGAAGGTCATCATCTCTGCTCCCTCCGCCGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTCAACAACGACTCCTACAAGTCCGACGTCAACGTCCTCTCCAACGCTTCTTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCCCTCGCCAAGGTTATCAACGACAAGTACGGTCTCGTTGAGGGTCTGATGACCACCATCCACTCCTACACCGCTACCCAGAAGACCGTCGACGGTCCCTCCGCTAAGGACTGGCGTGGTGGCCGCACTGCGGCCCAGAACATCATCCCCTCCTCCACCGGTGCCGCCAAGGCTGTCGGCAAGGTTATCCCCTCCCTTAACGGCAAGCTCACTGGTATGGCCATGCGTGTGCCTACCGCCAACGTCTCCGTTGTCGACCTGACCTGCCGCATCGAGAAGGCCGCCACCTACGAGGACATCAAGGCCACCATCAAGGCCGCCTCCGAGGGTGAGCTCAAGGGTATCCTGGGCTACACCGAGGACGACATTGTCTCCTCCGACCTGAACGGTGATGACAACTCCTCCATCTTCGATGCCAAGGCCGGTATTGCCCTGAACCCCAACTTCATCAAGCTGGTTTCCTGGTACGACAACGAGTGGGGCTACTCCCACCGTGTTGTTGACCTCATCGCCTACATCGCCAAGGTCGATGGTCAGTAGGAATCAGGACGGCGTCCTGGGGCCAGGAGTCTTCTCTAAAAGACGGAGTTTGCTACGAAGATGGCCTTCGCCTTGTAGAAAAAATCCGATAACGTCAATTTAATGAAACCAAATA]
[+] EMBL AK108429 [TCTTCTTCACATCTCTATCCATCCCCAAAACTACACAAATACCGCAAACATGGTTCCCAAGGTTGGTATCAACGGATTCGGCCGTATCGGTCGCATTGTCTTCCGCAATGCCATCAACCACGGTGGTGTCGACGTTGTCGCCGTCAACGACCCCTTCATTGAGGTCCACTACGCTGCATACATGCTCAAGTATGACAGCACTCACGGTCAGTTCAAGGGCACCATCGAGATCGATGGCACCTCCGGCCTGATTGTCAACGGCAAGAAGATCCGCTTCTACGCTGAGCGTGACCCCGCCTCCATCCCCTGGTCTGAGACCGGCGCCGCCTACGTCGTCGAGTCCACCGGTGTCTTCACCACCACCGAGAAGGCCTCTGCTCACTTGAAGGGTGGTGCCAAGAAGGTCATCATCTCTGCTCCCTCCGCCGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTCAACAACGACTCCTACAAGTCCGACGTCAACGTCCTCTCCAACGCTTCTTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCCCTCGCCAAGGTTATCAACGACAAGTACGGTCTCGTTGAGGGTCTGATGACCACCATCCACTCCTACACCGCTACCCAGAAGACCGTCGACGGTCCCTCCGCTAAGGACTGGCGTGGTGGCCGCACTGCGGCCCAGAACATCATCCCCTCCTCCACCGGTGCCGCCAAGGCTGTCGGCAAGGTTATCCCCTCCCTTAACGGCAAGCTCACTGGTATGGCCATGCGTGTGCCTACCGCCAACGTCTCCGTTGTCGACCTGACCTGCCGCATCGAGAAGGCCGCCACCTACGAGGACATCAAGGCCACCATCAAGGCCGCCTCCGAGGGTGAGCTCAAGGGTATCCTGGGCTACACCGAGGACGACATTGTCTCCTCCGACCTGAACGGTGATGACAACTCCTCCATCTTCGATGCCAAGGCCGGTATTGCCCTGAACCCCAACTTCATCAAGCTGGTTTCCTGGTACGACAACGAGTGGGGCTACTCCCACCGTGTTGTTGACCTCATCGCCTACATCGCCAAGGTCGATGGTCAGTAGGAATCAGGACGGCGTCCTGGGGCCAGGAGTCTTCTCTAAAAGACGGAGTTTGCTACGAAGATGGCCTTCGCCTTGTAGAAAAAATCCGATAACGTCAATTTAATGAAACCAAATA]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_3262#0 ---------------------------AAGCATCACATCTATCGCCATCATGGTCCCCAA 33
consensus_3262#1 TCTTCTTCACATCTCTATCCATCCCCAAAACTACACAAATACCGCAAACATGGTTCCCAA 60
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consensus_3262#0 GGTCGGTATCAACGGTTTCGGTCGTATTGGCCGCATTGTCTTCCGCAATGCCACCCAAGC 93
consensus_3262#1 GGTTGGTATCAACGGATTCGGCCGTATCGGTCGCATTGTCTTCCGCAATGCCATCAACCA 120
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consensus_3262#0 TGGCACTGTCGACGTTGTCGCTGTCAACGACCCCTTCATTGAGGTTCACTACGCTGCCTA 153
consensus_3262#1 CGGTGGTGTCGACGTTGTCGCCGTCAACGACCCCTTCATTGAGGTCCACTACGCTGCATA 180
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consensus_3262#0 CATGCTCCGCTATGACAGCACCCACGGCCAGTTCAAGGGTACCATTGAGATCAACGGTAC 213
consensus_3262#1 CATGCTCAAGTATGACAGCACTCACGGTCAGTTCAAGGGCACCATCGAGATCGATGGCAC 240
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consensus_3262#0 CGAGGGCCTGATCGTCAACGGCAAGAAGATCCGCTTCTACGCTGAGCGTGACCCCGCTGC 273
consensus_3262#1 CTCCGGCCTGATTGTCAACGGCAAGAAGATCCGCTTCTACGCTGAGCGTGACCCCGCCTC 300
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consensus_3262#0 CATCCCCTGGGGTAAGGAGGGTGCCGACTACGTTGTCGAGTCCACTGGTGTCTTCACCAC 333
consensus_3262#1 CATCCCCTGGTCTGAGACCGGCGCCGCCTACGTCGTCGAGTCCACCGGTGTCTTCACCAC 360
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consensus_3262#0 CACCGACAAGGCCTCTGCCCACATCAAGGGTGGTGCCAAGAAGGTCATCATCTCCGCTCC 393
consensus_3262#1 CACCGAGAAGGCCTCTGCTCACTTGAAGGGTGGTGCCAAGAAGGTCATCATCTCTGCTCC 420
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consensus_3262#0 CTCCGCCGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTCAACAACGACTCCTACACCAAGGACGT 453
consensus_3262#1 CTCCGCCGATGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTCAACAACGACTCCTACAAGTCCGACGT 480
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consensus_3262#0 CAACGTTCTCTCCAACGCCTCTTGCACCACCAACTGCCTTGCTCCCCTTGCCAAGGTTAT 513
consensus_3262#1 CAACGTCCTCTCCAACGCTTCTTGCACCACCAACTGCCTGGCTCCCCTCGCCAAGGTTAT 540
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consensus_3262#0 CAACGACAAGTACGGTCTCGTTGAGGGTCTCATGACCACTGTCCACTCCTACACTGCCAC 573
consensus_3262#1 CAACGACAAGTACGGTCTCGTTGAGGGTCTGATGACCACCATCCACTCCTACACCGCTAC 600
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consensus_3262#0 CCAGAAGACCGTCGACGGCCCCTCCGGAAAGGACTGGCGTGGTGGCCGCACTGCGGCCCA 633
consensus_3262#1 CCAGAAGACCGTCGACGGTCCCTCCGCTAAGGACTGGCGTGGTGGCCGCACTGCGGCCCA 660
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consensus_3262#0 GAACATCATCCCCTCCTCCACCGGTGCCGCCAAGGCTGTCGGCAAGGTCATCCCCTCTTT 693
consensus_3262#1 GAACATCATCCCCTCCTCCACCGGTGCCGCCAAGGCTGTCGGCAAGGTTATCCCCTCCCT 720
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consensus_3262#0 GAACGGCAAGCTCACCGGCATGTCCATGCGTGTCCCTACCGCCAACGTCTCCGTCGTTGA 753
consensus_3262#1 TAACGGCAAGCTCACTGGTATGGCCATGCGTGTGCCTACCGCCAACGTCTCCGTTGTCGA 780
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consensus_3262#0 CTTGACCTGCCGCATCGAGAAGGGTGCTACCTACGAGGAGATCAAGGCCACCATCAAGGC 813
consensus_3262#1 CCTGACCTGCCGCATCGAGAAGGCCGCCACCTACGAGGACATCAAGGCCACCATCAAGGC 840
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consensus_3262#0 CGCCTCCGAGAACGAGCTCAAGGGCATTCTCGGCTACACCGAGGATGACATCGTCTCCAC 873
consensus_3262#1 CGCCTCCGAGGGTGAGCTCAAGGGTATCCTGGGCTACACCGAGGACGACATTGTCTCCTC 900
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consensus_3262#0 TGACCTCAACGGTGACGACCACTCCTCCATCTTCGATGCCAAGGCTGGTATCGCCCTCAA 933
consensus_3262#1 CGACCTGAACGGTGATGACAACTCCTCCATCTTCGATGCCAAGGCCGGTATTGCCCTGAA 960
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consensus_3262#0 CGCCAACTTCATCAAGCTTGTCTCTTGGTACGACAACGAGTGGGGTTACTCCCACCGTGT 993
consensus_3262#1 CCCCAACTTCATCAAGCTGGTTTCCTGGTACGACAACGAGTGGGGCTACTCCCACCGTGT 1020
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consensus_3262#0 TGTTGACCTGATCTCCTACATCGCCAAGGTCGATGGCCAGTAGCAATTAAAACAGTCTCC 1053
consensus_3262#1 TGTTGACCTCATCGCCTACATCGCCAAGGTCGATGGTCAGTAGGAATCAGGACGGCGTCC 1080
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consensus_3262#0 TGAGGCCAGGAGCCTTCTCTGAGATGTGAAATGGCTCTTACGCTGCTCGCCCATAGATCT 1113
consensus_3262#1 TGGGGCCAGGAGTCTTCTCTAAAAGACGGAGT--TTGCTACG------------------ 1120
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consensus_3262#0 GATATCGGGTGCTTTTGAAGAGTTGCTTTCCGTCCTGTAGAAAAAATCAGCTGATAACGT 1173
consensus_3262#1 -------------------AAGATGGCCTTCGCCTTGTAGAAAAAATC---CGATAACGT 1158
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consensus_3262#0 CACTTTAATGAA-CCAAATA 1192
consensus_3262#1 CAATTTAATGAAACCAAATA 1178
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||