cluster # 3290

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Oryza sativa
cluster # 3290 cluster # 3290 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3290#0 length = 600 sequences # 2

consensusID : consensus_3290#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 600
fasta sequence

                              [GCTGGAGGAGAGGCTCTCTACCCTGCAAAACGAGAACCAGATGCTTAGGCAGGTGCTGAAGAACACAACAGCAAACAGAAGAGGGCCAGACAGCAGTGCCGGCGGAGACAGCTAGTAACCGCAATCTGTAGTCTGGAATCTGGAGTTCGATTAATTTTGTTAGCTTGGCTAGCTCCATTTGGCAGAGTCACAACTAAGACTCAAAGGGAAGCTGCTCCCTTTTGATTGATTTGTAGTTTCTTAGATAAAATTAATTACTACATTAAATACAACCATTCTTGGCTATGCACCTGAATAAGTACTCGTTAGTGCTAGCCAGATCGAGACAAATGAACTTACCTATGTATGCCTTCTCGAATCAACTCTGGAAGGCATATAATTGTTTCCATGTCTACCTCCTATTGGCGGATTGGCCGAGCCCTGCAAAAGTGTAATAAATGTATGTAATTCCGCCATTCCGGCCGTCAAATGGTGCGCACAAACGTCTACTGTTGAAGATGACAGTGTCAGTACGGTATATTGTTGAAGAACAGTAGCCGGTATTCAGTAGGAATGTGATTATGTGAGTGTAATGCATGATGGAAATGCAACTTCTTTCAG]

[+] EMBL CA764046             [GCTGGAGGAGAGGCTCTCTACCCTGCAAAACGAGAACCAGATGCTTAGGCAGGTGCTGAAGAACACAACAGCAAACAGAAGAGGGCCAGACAGCAGTGCCGGCGGAGACAGCTAGTAACCGCAATCTGTAGTCTGGAATCTGGAGTTCGATTAATTTTGTTAGCTTGGCTAGCTCCATTTGGCAGAGTCACAACTAAGACTCAAAGGGAAGCTGCTCCCTTTTGATTGATTTGTAGTTTCTTAGATAAAATTAATTACTACATTAAATACAACCATTCTTGGCTATGCACCTGAATAAGTACTCGTTAGTGCTAGCCAGATCGAGACAAATGAACTTACCTATGTATGCCTTCTCGAATCAACTCTGGAAGGCATATAATTGTTTCCATGTCTACCTCCTATTGGCGGATTGGCCGAGCCCTGCAAAAGTGTAATAAATGTATGTAATTCCGCCATTCCGGCCGTCAAATGGTGCGCACAAACGTCTACTGTTGAAGATGACAGTGTCAGTACGGTATATTGTTGAAGAACAGTAGCCGGTATTCAGTAGGAATGTGATTATGTGAGTGTAATGCATGATGGAAATGCAACTTCTTTCAG]
[+] EMBL BI801181             [                                                                                             CAGTGCCGGCGGAGACAGCTAGTAACCGCAATCTGTAGTCTGGAATCTGGAGTTCGATTAATTTTGTTAGCTTGGCTAGCTCCATTTGGCAGAGTCACAACTAAGACTCAAAGGGAAGCTGCTCCCTTTTGATTGATTTGTAGTTTCTTAGATAAAATTAATTACTACATTAAATACAACCATTCTTGGCTATGCACCTGAATAAGTACTCGTTAGTGCTAGCCAGATCGAGACAAATGAACTTACTTATTTAAGCCTTCTCGAATCAACTCTGGAAGGCATATAATTGTTTCCATGTCTAaaaaaaaaa                                                                                                                                                                                                     ]




>consensus_3290#0
GCTGGAGGAGAGGCTCTCTACCCTGCAAAACGAGAACCAGATGCTTAGGCAGGTGCTGAA
GAACACAACAGCAAACAGAAGAGGGCCAGACAGCAGTGCCGGCGGAGACAGCTAGTAACC
GCAATCTGTAGTCTGGAATCTGGAGTTCGATTAATTTTGTTAGCTTGGCTAGCTCCATTT
GGCAGAGTCACAACTAAGACTCAAAGGGAAGCTGCTCCCTTTTGATTGATTTGTAGTTTC
TTAGATAAAATTAATTACTACATTAAATACAACCATTCTTGGCTATGCACCTGAATAAGT
ACTCGTTAGTGCTAGCCAGATCGAGACAAATGAACTTACCTATGTATGCCTTCTCGAATC
AACTCTGGAAGGCATATAATTGTTTCCATGTCTACCTCCTATTGGCGGATTGGCCGAGCC
CTGCAAAAGTGTAATAAATGTATGTAATTCCGCCATTCCGGCCGTCAAATGGTGCGCACA
AACGTCTACTGTTGAAGATGACAGTGTCAGTACGGTATATTGTTGAAGAACAGTAGCCGG
TATTCAGTAGGAATGTGATTATGTGAGTGTAATGCATGATGGAAATGCAACTTCTTTCAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case