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Oryza sativa
cluster # 336 cluster # 336       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_336#0 length = 1300 sequences # 2  

consensusID : consensus_336#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1300
fasta sequence
                              [GCAACCAGTTGTTTCTCTTAAAGCCTCTACATGTGGTCTTGATGTGCTGGACGACATCTTATTGGGCTATAAAGTTGATTGGCCAGTGAACATCGTCATTACAGAGGAGGCACTTAAAGCATATGCTGAAATATTTCGGTATCTTGTTCAGGTTAGGCTTGCAGTGTTTTCTCTGACTGAAGTGTGGCGATTTCTGAAGGAGTTAACACAGTTAATCAGTCGTTCCAGCCATAATAGACCTGATGTTTTAAAGGAATTGAGTTCTGTGATGAAACTGAGACATCAAGTTTATCACTTTCTATCAACACTACAACAGTATCTCCATTGCCATTTGTCTGATATATCATGGCGCCGTTTTCAACATTCACTTCAACATCAGGTGAGAGATATGCTGGATCTCGAGTATGTGCATCTATGTTATGTTACTGATGCGCTTCACATATGTTTCTTATCTGCTGAAACAAAACCAATTGCTGCCATAATTAATAGCATTCTACAACAAGCTTTGGAGTTGCGGTCATGTTTTAAGAGCCTCAATTACATTTCTGAGTCAACAGTAAAACAACTTAATCTGGATTCTCTTATAAATTTCTCTCAGGTGGACGCTATTAGAACGAAGTTTGAGGGTAATATCAAAGATTTGTATATTTTGCATTTGAAGTCTTCGAAATATGGGGAGATTGGTCTTTATCGTTTCTGGGGGTATCTTAACTACAATGAGTATCATTCCTTGATGATCAACAAAGATATGGGCTGCTTCTATTTCTAATGGGAAATCGTTTTTAACCAAAGCTCAAGTATCCCCTTTATCTTCTGTGGCTAGCTTGCCTTTTACAACAATTTGATGACAGCATGTTCTGCCTTTGATTGTACTGCTAGTAAGAAGAGGTGCATCCCTTTGGTCTGCTCAATCAGTTCACATTTTGCACCCTCGGTGACACAGGTATGTTTGTACAATTGTCTGTTTCTGAATATGCATCACTAGAGCACGCTGCTGAGGCTTCTCGTTTCCCTTCATTTCGGAAAGGAGGAACACACTGCTAGTCTGCTACCATCGCAGAGCATGAACTTACCTGAAGACAGTAGTTCCTTGTATGAACTTTCCTGAAGTAATAGTGATCTTTAGAGTTTGAGCATTGTATGGAGTTTTCACTTGATAGAATAGTGGTTTTGTGGAAAATACGAGGCTAGGAATGAACTTCAAACATCCAATTAAAAGGAAAAAAAAATTGACGTGACTGGGAATGCATGTTACTATTGTATAGCTGTAATCTGAGACATGGCCTGGTAAATTAAAGCT]

[+] EMBL AK060279             [GCAACCAGTTGTTTCTCTTAAAGCCTCTACATGTGGTCTTGATGTGCTGGACGACATCTTATTGGGCTATAAAGTTGATTGGCCAGTGAACATCGTCATTACAGAGGAGGCACTTAAAGCATATGCTGAAATATTTCGGTATCTTGTTCAGGTTAGGCTTGCAGTGTTTTCTCTGACTGAAGTGTGGCGATTTCTGAAGGAGTTAACACAGTTAATCAGTCGTTCCAGCCATAATAGACCTGATGTTTTAAAGGAATTGAGTTCTGTGATGAAACTGAGACATCAAGTTTATCACTTTCTATCAACACTACAACAGTATCTCCATTGCCATTTGTCTGATATATCATGGCGCCGTTTTCAACATTCACTTCAACATCAGGTGAGAGATATGCTGGATCTCGAGTATGTGCATCTATGTTATGTTACTGATGCGCTTCACATATGTTTCTTATCTGCTGAAACAAAACCAATTGCTGCCATAATTAATAGCATTCTACAACAAGCTTTGGAGTTGCGGTCATGTTTTAAGAGCCTCAATTACATTTCTGAGTCAACAGTAAAACAACTTAATCTGGATTCTCTTATAAATTTCTCTCAGGTGGACGCTATTAGAACGAAGTTTGAGGGTAATATCAAAGATTTGTATATTTTGCATTTGAAGTCTTCGAAATATGGGGAGATTGGTCTTTATCGTTTCTGGGGGTATCTTAACTACAATGAGTATCATTCCTTGATGATCAACAAAGATATGGGCTGCTTCTATTTCTAATGGGAAATCGTTTTTAACCAAAGCTCAAGTATCCCCTTTATCTTCTGTGGCTAGCTTGCCTTTTACAACAATTTGATGACAGCATGTTCTGCCTTTGATTGTACTGCTAGTAAGAAGAGGTGCATCCCTTTGGTCTGCTCAATCAGTTCACATTTTGCACCCTCGGTGACACAGGTATGTTTGTACAATTGTCTGTTTCTGAATATGCATCACTAGAGCACGCTGCTGAGGCTTCTCGTTTCCCTTCATTTCGGAAAGGAGGAACACACTGCTAGTCTGCTACCATCGCAGAGCATGAACTTACCTGAAGACAGTAGTTCCTTGTATGAACTTTCCTGAAGTAATAGTGATCTTTAGAGTTTGAGCATTGTATGGAGTTTTCACTTGATAGAATAGTGGTTTTGTGGAAAATACGAGGCTAGGAATGAACTTCAAACATCCAATTAAAAGGAAAAAAAAATTGACGTGACTGGGAATGCATGTTACTATTGTATAGCTGTAATCTGAGACATGGCCTGGTAAATTAAAGCT]
[+] EMBL AA750701             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GATTTGTATATTTTGCATTTGAAGTCTTCGAAATATGGGGAGATTGGTCTTTATCGGTTCTGGGGGTATCTGAACTACAATGAGTATCATTCCTTGATGATCAACAAAGATATGGGCTGCTTCTATTTCTAATGGGAAATCGTTTTTAACCAAAGCTCAAGTATCCCCTTTATCTTCTGTGGCTAGCTTGCCTTTTACAACAATTTGATGACAGCATGTTCTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]


>consensus_336#0 GCAACCAGTTGTTTCTCTTAAAGCCTCTACATGTGGTCTTGATGTGCTGGACGACATCTT ATTGGGCTATAAAGTTGATTGGCCAGTGAACATCGTCATTACAGAGGAGGCACTTAAAGC ATATGCTGAAATATTTCGGTATCTTGTTCAGGTTAGGCTTGCAGTGTTTTCTCTGACTGA AGTGTGGCGATTTCTGAAGGAGTTAACACAGTTAATCAGTCGTTCCAGCCATAATAGACC TGATGTTTTAAAGGAATTGAGTTCTGTGATGAAACTGAGACATCAAGTTTATCACTTTCT ATCAACACTACAACAGTATCTCCATTGCCATTTGTCTGATATATCATGGCGCCGTTTTCA ACATTCACTTCAACATCAGGTGAGAGATATGCTGGATCTCGAGTATGTGCATCTATGTTA TGTTACTGATGCGCTTCACATATGTTTCTTATCTGCTGAAACAAAACCAATTGCTGCCAT AATTAATAGCATTCTACAACAAGCTTTGGAGTTGCGGTCATGTTTTAAGAGCCTCAATTA CATTTCTGAGTCAACAGTAAAACAACTTAATCTGGATTCTCTTATAAATTTCTCTCAGGT GGACGCTATTAGAACGAAGTTTGAGGGTAATATCAAAGATTTGTATATTTTGCATTTGAA GTCTTCGAAATATGGGGAGATTGGTCTTTATCGTTTCTGGGGGTATCTTAACTACAATGA GTATCATTCCTTGATGATCAACAAAGATATGGGCTGCTTCTATTTCTAATGGGAAATCGT TTTTAACCAAAGCTCAAGTATCCCCTTTATCTTCTGTGGCTAGCTTGCCTTTTACAACAA TTTGATGACAGCATGTTCTGCCTTTGATTGTACTGCTAGTAAGAAGAGGTGCATCCCTTT GGTCTGCTCAATCAGTTCACATTTTGCACCCTCGGTGACACAGGTATGTTTGTACAATTG TCTGTTTCTGAATATGCATCACTAGAGCACGCTGCTGAGGCTTCTCGTTTCCCTTCATTT CGGAAAGGAGGAACACACTGCTAGTCTGCTACCATCGCAGAGCATGAACTTACCTGAAGA CAGTAGTTCCTTGTATGAACTTTCCTGAAGTAATAGTGATCTTTAGAGTTTGAGCATTGT ATGGAGTTTTCACTTGATAGAATAGTGGTTTTGTGGAAAATACGAGGCTAGGAATGAACT TCAAACATCCAATTAAAAGGAAAAAAAAATTGACGTGACTGGGAATGCATGTTACTATTG TATAGCTGTAATCTGAGACATGGCCTGGTAAATTAAAGCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)