cluster # 347

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Oryza sativa
cluster # 347 cluster # 347 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_347#0 length = 1506 sequences # 2
consensusID : consensus_347#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1506
fasta sequence
                              [CAACCTCTCTCGTGTCGCGTGCCATTCGCCATCGCCACCACCTCCACTACTCGATCCCCTCCCATCCCTCCGGAACCTCCACTACTACTCGCCCCACCAATGGCTGACGGCGAGTCTCCGCCATGGGCGGAGCTCGTCCCCGACATCGTCCGCAAGATCGGCCGCCACCTCCTGTGCGAGATCGACCGCCACCACGCGGATGGCCTCTGCAGGTCCTGGCGCGACGCGCTTCTACAACTCCGGCCCCCGCCTCCGCCGCTCCCGCGGCTTGTCCTCCCGGAAGCCGACGGGCCCGCGTTCTACTGCGTCCCCAGCGGCTGCCGCCCCCACCCCTTCGTCCTCCCGCCCGCCGCGCTCCGCGCGCGGTGCTTCGGCTCGTACAACGGCGCCTGGATCTTCCAGGCCGTCGACCAGGCGGCGAACCACGTCCTCCTCAACCTCATCACCCACCAGCAGCTCAACCTCCCCAACCTGATCCGTTTCCCCTCCTTCCGGCTTCCGGGATTGACATTTGACTTCGAGGTCGCCTTCGTCGCCGCCACCCTCTCTAGCCAGCCGACTGATCAGGGATGCGTCGGCGCCAGCATCATCGGCTTCAAACGCAGGCCCCTCAACCCACGGCACATCGCGTTCTGGCGCATGGGCGATGAGGCGTTCTCGCAGTCCATCGAGTCGAGGTGGATTGACGAGGAGCTGGAACTGGATGTGGTGGACCTCCTGTACAGCGGCCATGGCGCTGGCGCCTTCCTCTTCCTCACCCGAGGGGAAAACATCCGTGTGTTTCGTCAACCGATATTCCCTCTCGGAGACATGCAGACGACAGTGCTCTACTTCGAGCGGCGCGGTGACGACGACGACGACGACGGGCGGCCGGTCCTTGATCGCTACCTCGTGGAGTCCCGGGGGAAGCTGCTCATGGTCGTCAGGTTAGGAGATCGTGAGCCTGGCCGCTTGCCGACCACGACGTTCCGGGTGTTCGAGAGAGAAGACGAGCTGTTCAACAACTACTGGACCAAGCTGCCCGACCTTGGCGGCCGAATGCTGTTCGTCGGAAGAGGCTGCTCCAGATCGTACGAAGCGGCAGATGGGTACCCCGGCATGGAGGGCGTCTACTTCCTGGACGACCGGAGCTTCCACGACCCGATGGTTGTGTACAAGGATGCCGCCCAACGGCGGTATCCCTGCAGCGACAACGGGAGATGGTCGGGAGCACCGCCACCAGCGGAGGTAGAGCGCTGCTTCCCAGAGCAAGGTCCGTCGAACTACTCCCCTCCGGTTTGGATTCTCCCATGAGGCGCACGACACATGTTTTTGGTTGTTGAAATTGTTGCCGGTGATCAGGCTAGTCTGTGATCGTTGCTAAGCTTTCATGCCTTCATCAGCATGTACTGTGTTAGTGTGTTTATTCGTTGAGTTTGGATGGTTTTCTCGTGTTAAAATTGTTACTGGTGTAAGCTGAAGCAGGATTGCTCAATTCAGTGGAGAAATTGATCTGCAGGTGACTTA]

[+] EMBL AK121777             [CAACCTCTCTCGTGTCGCGTGCCATTCGCCATCGCCACCACCTCCACTACTCGATCCCCTCCCATCCCTCCGGAACCTCCACTACTACTCGCCCCACCAATGGCTGACGGCGAGTCTCCGCCATGGGCGGAGCTCGTCCCCGACATCGTCCGCAAGATCGGCCGCCACCTCCTGTGCGAGATCGACCGCCACCACGCGGATGGCCTCTGCAGGTCCTGGCGCGACGCGCTTCTACAACTCCGGCCCCCGCCTCCGCCGCTCCCGCGGCTTGTCCTCCCGGAAGCCGACGGGCCCGCGTTCTACTGCGTCCCCAGCGGCTGCCGCCCCCACCCCTTCGTCCTCCCGCCCGCCGCGCTCCGCGCGCGGTGCTTCGGCTCGTACAACGGCGCCTGGATCTTCCAGGCCGTCGACCAGGCGGCGAACCACGTCCTCCTCAACCTCATCACCCACCAGCAGCTCAACCTCCCCAACCTGATCCGTTTCCCCTCCTTCCGGCTTCCGGGATTGACATTTGACTTCGAGGTCGCCTTCGTCGCCGCCACCCTCTCTAGCCAGCCGACTGATCAGGGATGCGTCGGCGCCAGCATCATCGGCTTCAAACGCAGGCCCCTCAACCCACGGCACATCGCGTTCTGGCGCATGGGCGATGAGGCGTTCTCGCAGTCCATCGAGTCGAGGTGGATTGACGAGGAGCTGGAACTGGATGTGGTGGACCTCCTGTACAGCGGCCATGGCGCTGGCGCCTTCCTCTTCCTCACCCGAGGGGAAAACATCCGTGTGTTTCGTCAACCGATATTCCCTCTCGGAGACATGCAGACGACAGTGCTCTACTTCGAGCGGCGCGGTGACGACGACGACGACGACGGGCGGCCGGTCCTTGATCGCTACCTCGTGGAGTCCCGGGGGAAGCTGCTCATGGTCGTCAGGTTAGGAGATCGTGAGCCTGGCCGCTTGCCGACCACGACGTTCCGGGTGTTCGAGAGAGAAGACGAGCTGTTCAACAACTACTGGACCAAGCTGCCCGACCTTGGCGGCCGAATGCTGTTCGTCGGAAGAGGCTGCTCCAGATCGTACGAAGCGGCAGATGGGTACCCCGGCATGGAGGGCGTCTACTTCCTGGACGACCGGAGCTTCCACGACCCGATGGTTGTGTACAAGGATGCCGCCCAACGGCGGTATCCCTGCAGCGACAACGGGAGATGGTCGGGAGCACCGCCACCAGCGGAGGTAGAGCGCTGCTTCCCAGAGCAAGGTCCGTCGAACTACTCCCCTCCGGTTTGGATTCTCCCATGAGGCGCACGACACATGTTTTTGGTTGTTGAAATTGTTGCCGGTGATCAGGCTAGTCTGTGATCGTTGCTAAGCTTTCATGCCTTCATCAGCATGTACTGTGTTAGTGTGTTTATTCGTTGAGTTTGGATGGTTTTCTCGTGTTAAAATTGTTACTGGTGTAAGCTGAAGCAGGATTGCTCAATTCAGTGGAGAAATTGATCTGCAGGTGA    ]
[+] EMBL AK064314             [ AACCTCTCTCGTGTCGCGTGCCATTCGCCATCGCCACCACCTCCACTACTCGATCCCCTCCCATCCCTCCGGAACCTCCACTACTACTCGCCCCACCAATGGCTGACGGCGAGTCTCCGCCATGGGCGGAGCTCGTCCCCGACATCGTCCGCAAGATCGGCCGCCACCTCCTGTGCGAGATCGACCGCCACCACGCGGATGGCCTCTGCAGGTCCTGGCGCGACGCGCTTCTACAACTCCGGCCCCCGCCTCCGCCGCTCCCGCGGCTTGTCCTCCCGGAAGCCGACGGGCCCGCGTTCTACTGCGTCCCCAGCGGCTGCCGCCCCCACCCCTTCGTCCTCCCGCCCGCCGCGCTCCGCGCGCGGTGCTTCGGCTCGTACAACGGCGCCTGGATCTTCCAGGCCGTCGACCAGGCGGCGAACCACGTCCTCCTCAACCTCATCACCCACCAGCAGCTCAACCTCCCCAACCTGATCCGTTTCCCCTCCTTCCGGCTTCCGGGATTGACATTTGACTTCGAGGTCGCCTTCGTCGCCGCCACCCTCTCTAGCCAGCCGACTGATCAGGGATGCGTCGGCGCCAGCATCATCGGCTTCAAACGCAGGCCCCTCAACCCACGGCACATCGCGTTCTGGCGCATGGGCGATGAGGCGTTCTCGCAGTCCATCGAGTCGAGGTGGATTGACGAGGAGCTGGAACTGGATGTGGTGGACCTCCTGTACAGCGGCCATGGCGCTGGCGCCTTCCTCTTCCTCACCCGAGGGGAAAACATCCGTGTGTTTCGTCAACCGATATTCCCTCTCGGAGACATGCAGACGACAGTGCTCTACTTCGAGCGGCGCGGTGACGACGACGACGACGACGGGCGGCCGGTCCTTGATCGCTACCTCGTGGAGTCCCGGGGGAAGCTGCTCATGGTCGTCAGGTTAGGAGATCGTGAGCCTGGCCGCTTGCCGACCACGACGTTCCGGGTGTTCGAGAGAGAAGACGAGCTGTTCAACAACTACTGGACCAAGCTGCCCGACCTTGGCGGCCGAATGCTGTTCGTCGGAAGAGGCTGCTCCAGATCGTACGAAGCGGCAGATGGGTACCCCGGCATGGAGGGCGTCTACTTCCTGGACGACCGGAGCTTCCACGACCCGATGGTTGTGTACAAGGATGCCGCCCAACGGCGGTATCCCTGCAGCGACAACGGGAGATGGTCGGGAGCACCGCCACCAGCGGAGGTAGAGCGCTGCTTCCCAGAGCAAGGTCCGTCGAACTACTCCCCTCCGGTTTGGATTCTCCCATGAGGCGCACGACACATGTTTTTGGTTGTTGAAATTGTTGCCGGTGATCAGGCTAGTCTGTGATCGTTGCTAAGCTTTCATGCCTTCATCAGCATGTACTGTGTTAGTGTGTTTATTCGTTGAGTTTGGATGGTTTTCTCGTGTTAAAATTGTTACTGGTGTAAGCTGAAGCAGGATTGCTCAATTCAGTGGAGAAATTGATCTGCAGGTGACTTA]




>consensus_347#0
CAACCTCTCTCGTGTCGCGTGCCATTCGCCATCGCCACCACCTCCACTACTCGATCCCCT
CCCATCCCTCCGGAACCTCCACTACTACTCGCCCCACCAATGGCTGACGGCGAGTCTCCG
CCATGGGCGGAGCTCGTCCCCGACATCGTCCGCAAGATCGGCCGCCACCTCCTGTGCGAG
ATCGACCGCCACCACGCGGATGGCCTCTGCAGGTCCTGGCGCGACGCGCTTCTACAACTC
CGGCCCCCGCCTCCGCCGCTCCCGCGGCTTGTCCTCCCGGAAGCCGACGGGCCCGCGTTC
TACTGCGTCCCCAGCGGCTGCCGCCCCCACCCCTTCGTCCTCCCGCCCGCCGCGCTCCGC
GCGCGGTGCTTCGGCTCGTACAACGGCGCCTGGATCTTCCAGGCCGTCGACCAGGCGGCG
AACCACGTCCTCCTCAACCTCATCACCCACCAGCAGCTCAACCTCCCCAACCTGATCCGT
TTCCCCTCCTTCCGGCTTCCGGGATTGACATTTGACTTCGAGGTCGCCTTCGTCGCCGCC
ACCCTCTCTAGCCAGCCGACTGATCAGGGATGCGTCGGCGCCAGCATCATCGGCTTCAAA
CGCAGGCCCCTCAACCCACGGCACATCGCGTTCTGGCGCATGGGCGATGAGGCGTTCTCG
CAGTCCATCGAGTCGAGGTGGATTGACGAGGAGCTGGAACTGGATGTGGTGGACCTCCTG
TACAGCGGCCATGGCGCTGGCGCCTTCCTCTTCCTCACCCGAGGGGAAAACATCCGTGTG
TTTCGTCAACCGATATTCCCTCTCGGAGACATGCAGACGACAGTGCTCTACTTCGAGCGG
CGCGGTGACGACGACGACGACGACGGGCGGCCGGTCCTTGATCGCTACCTCGTGGAGTCC
CGGGGGAAGCTGCTCATGGTCGTCAGGTTAGGAGATCGTGAGCCTGGCCGCTTGCCGACC
ACGACGTTCCGGGTGTTCGAGAGAGAAGACGAGCTGTTCAACAACTACTGGACCAAGCTG
CCCGACCTTGGCGGCCGAATGCTGTTCGTCGGAAGAGGCTGCTCCAGATCGTACGAAGCG
GCAGATGGGTACCCCGGCATGGAGGGCGTCTACTTCCTGGACGACCGGAGCTTCCACGAC
CCGATGGTTGTGTACAAGGATGCCGCCCAACGGCGGTATCCCTGCAGCGACAACGGGAGA
TGGTCGGGAGCACCGCCACCAGCGGAGGTAGAGCGCTGCTTCCCAGAGCAAGGTCCGTCG
AACTACTCCCCTCCGGTTTGGATTCTCCCATGAGGCGCACGACACATGTTTTTGGTTGTT
GAAATTGTTGCCGGTGATCAGGCTAGTCTGTGATCGTTGCTAAGCTTTCATGCCTTCATC
AGCATGTACTGTGTTAGTGTGTTTATTCGTTGAGTTTGGATGGTTTTCTCGTGTTAAAAT
TGTTACTGGTGTAAGCTGAAGCAGGATTGCTCAATTCAGTGGAGAAATTGATCTGCAGGT
GACTTA
clustalw multiple alignements is not computed in this case