cluster # 350

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 350 cluster # 350 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_350#0 length = 1359 sequences # 2
consensusID : consensus_350#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1359
fasta sequence
                              [CCACGAGCACCGCAAGAAGCTGCCGCAGACGCTATCGGGCTTCTTCTACAAGAGCATCGACTACGAGCGCTGCCCGCACATGGCGCGCCATTTCACCAACGCCACTGGGAGAGGCATGCCTCTCGTCTGCCCGACCTTCTCCTTCCTGCCCCAGTGCCACCACGTCGTCATCTTGGATAGCTGCAATGGCCTCCTCCTCTGCCGCTGCCACGTGTCTCGTGAGACTTTGCAGTTCCAGTATGCTGTGTGCAATCCTGCGACCGGGGAATGTGTGATGTTGCCGGACGCCAACTGGGCTATTGACGAGAACCGCACCGCCTGCTTGTGTTTCGATCCAGCCATCTCGTCGCATTTCCATGTGCTCGAGTATGTGGAGGATGAAGAGTATGTGGAGGATGAAGATGAATACGACGCACTGGTCACAGGGGTGGTGATCTATTCGTCTAAAACTGGGTTATGGAGTCTCCATGTAAATGGATGGGATGATGAAGTTATGGTTAGCCTTCCGGTCGATCGGACAAGGGTTTTCCTTAATGGTTTTCTGCATTCTGTCACGACTTGCGATATTGTGGCTGTTGACATGGAGGGGAAGAAATGGAGGAAGATTCCCATGCCGGATCCTGATGGTGATATTGGGATAATTCATCAAACTCAGGGTCGCTTGTGTGCTTTTAATGTTGATCCAAATGATATCCTCGAACTGTCAATTTGGTTTCTTGAAGACTATGATACAGATAATTGGATCTTAAAGCACACCGTTAGCTCAATTAATCTGTTTGGACGAAAGAAATACCAATTAGATTTTGACTACCAAGTAATTGCAGTTCATCCAGAATGCAATTTGATCTTCTTTGTTTATGGATGGCACAATACTTTGATGGCGTATGAAATGGATCGCAAGGAAGTCCGTGTCATACGCAAACTCGGACATGAGTCATGCCTGCCATACCTACCATATGTTCCAATGTTCTCTGAGTCATTACCTGATGGGTGGTGCTAACATGCAGAGGTGCGGCTCCACTTATGTTATTGCAAAACCATCTTTGTACCGTAATGAGAATCAGGCTTAGGGTCAGCAGCCAATCTCTAATATGAATTATGAATTTCTGTTTTATCGTACTTGTGTGATGGCTCATTTGTGTTGTTTTGAAGAATGTTGTGAAATCATAGATGGCACGTAACTTGGCCTTTCGGAAGGTATGTCCTGTTCTGAAGGTTATGTCTTGTTTTTCACTGGTGTTTACCCTATGCCCTATGCTAGTTAAAATTTATGTCCTGTGTTAACAAGACATACCTTTTGATTGTACCAGCAGTCAGCTTATGGAACAGTGACAAATGCTTTGGAAGTTGGATCATATG]

[+] EMBL AK063410             [CCACGAGCACCGCAAGAAGCTGCCGCAGACGCTATCGGGCTTCTTCTACAAGAGCATCGACTACGAGCGCTGCCCGCACATGGCGCGCCATTTCACCAACGCCACTGGGAGAGGCATGCCTCTCGTCTGCCCGACCTTCTCCTTCCTGCCCCAGTGCCACCACGTCGTCATCTTGGATAGCTGCAATGGCCTCCTCCTCTGCCGCTGCCACGTGTCTCGTGAGACTTTGCAGTTCCAGTATGCTGTGTGCAATCCTGCGACCGGGGAATGTGTGATGTTGCCGGACGCCAACTGGGCTATTGACGAGAACCGCACCGCCTGCTTGTGTTTCGATCCAGCCATCTCGTCGCATTTCCATGTGCTCGAGTATGTGGAGGATGAAGAGTATGTGGAGGATGAAGATGAATACGACGCACTGGTCACAGGGGTGGTGATCTATTCGTCTAAAACTGGGTTATGGAGTCTCCATGTAAATGGATGGGATGATGAAGTTATGGTTAGCCTTCCGGTCGATCGGACAAGGGTTTTCCTTAATGGTTTTCTGCATTCTGTCACGACTTGCGATATTGTGGCTGTTGACATGGAGGGGAAGAAATGGAGGAAGATTCCCATGCCGGATCCTGATGGTGATATTGGGATAATTCATCAAACTCAGGGTCGCTTGTGTGCTTTTAATGTTGATCCAAATGATATCCTCGAACTGTCAATTTGGTTTCTTGAAGACTATGATACAGATAATTGGATCTTAAAGCACACCGTTAGCTCAATTAATCTGTTTGGACGAAAGAAATACCAATTAGATTTTGACTACCAAGTAATTGCAGTTCATCCAGAATGCAATTTGATCTTCTTTGTTTATGGATGGCACAATACTTTGATGGCGTATGAAATGGATCGCAAGGAAGTCCGTGTCATACGCAAACTCGGACATGAGTCATGCCTGCCATACCTACCATATGTTCCAATGTTCTCTGAGTCATTACCTGATGGGTGGTGCTAACATGCAGAGGTGCGGCTCCACTTATGTTATTGCAAAACCATCTTTGTACCGTAATGAGAATCAGGCTTAGGGTCAGCAGCCAATCTCTAATATGAATTATGAATTTCTGTTTTATCGTACTTGTGTGATGGCTCATTTGTGTTGTTTTGAAGAATGTTGTGAAATCATAGATGGCACGTAACTTGGCCTTTCGGAAGGTATGTCCTGTTCTGAAGGTTATGTCTTGTTTTTCACTGGTGTTTACCCTATGCCCTATGCTAGTTAAAATTTATGTCCTGTGTTAACAAGACATACCTTTTGATTGTACCAGCAGTCAGCTTATGGAACAGTGACAAATGCTTTGGAAGTTGGATCATATG]
[+] EMBL AA749660             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACTCGGACATGAGTCATGCCTGCCATACCTACCATATGTTCCAATGTTCTCTGAGTCATTACCTGATGGGTGGTGCTAACATGCAGAGGTGCGGCTCCACTTATGTTATTGCAAAACCA CTTTGTACCGTAATGAGAATCAGGCTTAGGGTCAGCAGCCAATCTCTAATGTGAATTATGA                                                                                                                                                                                                                                                                 ]




>consensus_350#0
CCACGAGCACCGCAAGAAGCTGCCGCAGACGCTATCGGGCTTCTTCTACAAGAGCATCGA
CTACGAGCGCTGCCCGCACATGGCGCGCCATTTCACCAACGCCACTGGGAGAGGCATGCC
TCTCGTCTGCCCGACCTTCTCCTTCCTGCCCCAGTGCCACCACGTCGTCATCTTGGATAG
CTGCAATGGCCTCCTCCTCTGCCGCTGCCACGTGTCTCGTGAGACTTTGCAGTTCCAGTA
TGCTGTGTGCAATCCTGCGACCGGGGAATGTGTGATGTTGCCGGACGCCAACTGGGCTAT
TGACGAGAACCGCACCGCCTGCTTGTGTTTCGATCCAGCCATCTCGTCGCATTTCCATGT
GCTCGAGTATGTGGAGGATGAAGAGTATGTGGAGGATGAAGATGAATACGACGCACTGGT
CACAGGGGTGGTGATCTATTCGTCTAAAACTGGGTTATGGAGTCTCCATGTAAATGGATG
GGATGATGAAGTTATGGTTAGCCTTCCGGTCGATCGGACAAGGGTTTTCCTTAATGGTTT
TCTGCATTCTGTCACGACTTGCGATATTGTGGCTGTTGACATGGAGGGGAAGAAATGGAG
GAAGATTCCCATGCCGGATCCTGATGGTGATATTGGGATAATTCATCAAACTCAGGGTCG
CTTGTGTGCTTTTAATGTTGATCCAAATGATATCCTCGAACTGTCAATTTGGTTTCTTGA
AGACTATGATACAGATAATTGGATCTTAAAGCACACCGTTAGCTCAATTAATCTGTTTGG
ACGAAAGAAATACCAATTAGATTTTGACTACCAAGTAATTGCAGTTCATCCAGAATGCAA
TTTGATCTTCTTTGTTTATGGATGGCACAATACTTTGATGGCGTATGAAATGGATCGCAA
GGAAGTCCGTGTCATACGCAAACTCGGACATGAGTCATGCCTGCCATACCTACCATATGT
TCCAATGTTCTCTGAGTCATTACCTGATGGGTGGTGCTAACATGCAGAGGTGCGGCTCCA
CTTATGTTATTGCAAAACCATCTTTGTACCGTAATGAGAATCAGGCTTAGGGTCAGCAGC
CAATCTCTAATATGAATTATGAATTTCTGTTTTATCGTACTTGTGTGATGGCTCATTTGT
GTTGTTTTGAAGAATGTTGTGAAATCATAGATGGCACGTAACTTGGCCTTTCGGAAGGTA
TGTCCTGTTCTGAAGGTTATGTCTTGTTTTTCACTGGTGTTTACCCTATGCCCTATGCTA
GTTAAAATTTATGTCCTGTGTTAACAAGACATACCTTTTGATTGTACCAGCAGTCAGCTT
ATGGAACAGTGACAAATGCTTTGGAAGTTGGATCATATG
clustalw multiple alignements is not computed in this case