cluster # 3532

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 3532 cluster # 3532 Sequences # 2 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3532#0 length = 1638 sequences # 2
consensusID : consensus_3532#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1638
fasta sequence
                              [GCGGAGGTCGTCGAGCTCTTCTGCCGGATGCGGAGGGGCGGCGTCCCAGTAAGCAGGTTCGTGCTCCCGAGCGTGCTCGCGGCTTGCGCCGGCCTGCGGGACATCGGGATGCTCCGAGCCGTGCACGCCTTGGTCATCAAGTGCGGCCTGTGCCGGCATGTCATCGTGGGCACTGCATTGGTTGACGGGTATACTGATTTTGGATTGGTGGATGATGCGAGGAAGGCGTTCGATGAGATAACAGACGCCAATATAGTTTCTTGGAGTGTGCTCATTGGTGGCTATGCCCGTTCTTCTCGGTGGGAAGAAACATTGGATGCTTTCTCCGCAATGCGGCGTGCTGGGGTGCTTCCAAATGATTCTGTTCTTGTAATGGCGATTCAGGCGTGCGGTGCATTGGGACGCCTGGTACATGGGAAGCAGCTGCATGGCTTAGCAGTTGTCCTTGGATTTGATAGGAATGCTACTGTTTGGAACTGCCTGATGGACATGTATGGGAAGTGTGGTGACATTGACAGTTGCAAGATGGTTTTTGAGACGATGATCGGCAGGGATCAAGTGAGTTGGAACACGCTAATCTCAAGTTATGCCCGTGTTGGTCTTTGTGAAGAGGCACTCGACATGATTGTGCAGATGCAAGAGTCTGGTTACATTGTCGATCGCTTCACCCTTGGCAGCGGAGTTACAGCTTGTGCCCGTTTGGCTGATATAGATAGCGGCCGTGCATTCCATGGTTATTTGGTTAGAAGATTGTTGGATACTGATGTCATCCAGGGCAGCGCGCTTGTTGACATGTATGGTAAATGCCACAACATGGAACTTGCACACATTGTATTCGACAGGATGGATGAGAGGAATTATGTATCATGGGATGCACTCTTGTCTGGGTATGTTGAGAATGAGCAGGTTGATTTAGCACTTGAGATTTTCCGGCAAATGGGTTGTGCAAACATAAAGTATAACCAGCATAATTTTGCTAACCTTCTTAAGCTCTGTGGCAGTCAGAGGTATAAAGAGTATGGAAGGCAAATTCACGGGCATGCCATTAAGACCATAAACAAGATGAATGTGGTTTTGGAAACGGAGCTTATTGACATGTACGCAAAGTGTGGCTGCATTGGGGTCGCTCGGCTACTATTTCTTCGGATGAATGAGAGAAACCTTATTTCCTGGAATGCCCTACTTTCAGGTTATGCAGCAGATGGACAGCCAGTTGCAACGATAAATATTTACCGCCAAATGGAGCTGGCATGCATTAGGCCTGACAAATACACTTTGGCAGGGCTTTTAAGCCTTTGCCGGTACCAAGGACTATTGCATTATGGAAGGCAGATACACGCTCATCTCATCAAGATGGGTTCTGAAATGAACGTGGTAATGCAAACTATACTTGTTCATATGTATATCAAGTGCATGCGTCAGCAGGATGCTGAAAATGTTTGTATAATGATCGAAGAAAGGAATTCATATGTGCTTGATGCATTTTCAAAGGTCTATGGAGATGACTACTTGATCTGAAGAAAAGAAAATATCTCATTTTACACTGGAGTTAGAATGTATGGGAATACTTTTGTCTTCCTTGTGGATACAAATCTTAGATGCAAAATTTGTATTTCCTGTATACTAAGGACTATAGTA]

[+] EMBL AK065002             [GCGGAGGTCGTCGAGCTCTTCTGCCGGATGCGGAGGGGCGGCGTCCCAGTAAGCAGGTTCGTGCTCCCGAGCGTGCTCGCGGCTTGCGCCGGCCTGCGGGACATCGGGATGCTCCGAGCCGTGCACGCCTTGGTCATCAAGTGCGGCCTGTGCCGGCATGTCATCGTGGGCACTGCATTGGTTGACGGGTATACTGATTTTGGATTGGTGGATGATGCGAGGAAGGCGTTCGATGAGATAACAGACGCCAATATAGTTTCTTGGAGTGTGCTCATTGGTGGCTATGCCCGTTCTTCTCGGTGGGAAGAAACATTGGATGCTTTCTCCGCAATGCGGCGTGCTGGGGTGCTTCCAAATGATTCTGTTCTTGTAATGGCGATTCAGGCGTGCGGTGCATTGGGACGCCTGGTACATGGGAAGCAGCTGCATGGCTTAGCAGTTGTCCTTGGATTTGATAGGAATGCTACTGTTTGGAACTGCCTGATGGACATGTATGGGAAGTGTGGTGACATTGACAGTTGCAAGATGGTTTTTGAGACGATGATCGGCAGGGATCAAGTGAGTTGGAACACGCTAATCTCAAGTTATGCCCGTGTTGGTCTTTGTGAAGAGGCACTCGACATGATTGTGCAGATGCAAGAGTCTGGTTACATTGTCGATCGCTTCACCCTTGGCAGCGGAGTTACAGCTTGTGCCCGTTTGGCTGATATAGATAGCGGCCGTGCATTCCATGGTTATTTGGTTAGAAGATTGTTGGATACTGATGTCATCCAGGGCAGCGCGCTTGTTGACATGTATGGTAAATGCCACAACATGGAACTTGCACACATTGTATTCGACAGGATGGATGAGAGGAATTATGTATCATGGGATGCACTCTTGTCTGGGTATGTTGAGAATGAGCAGGTTGATTTAGCACTTGAGATTTTCCGGCAAATGGGTTGTGCAAACATAAAGTATAACCAGCATAATTTTGCTAACCTTCTTAAGCTCTGTGGCAGTCAGAGGTATAAAGAGTATGGAAGGCAAATTCACGGGCATGCCATTAAGACCATAAACAAGATGAATGTGGTTTTGGAAACGGAGCTTATTGACATGTACGCAAAGTGTGGCTGCATTGGGGTCGCTCGGCTACTATTTCTTCGGATGAATGAGAGAAACCTTATTTCCTGGAATGCCCTACTTTCAGGTTATGCAGCAGATGGACAGCCAGTTGCAACGATAAATATTTACCGCCAAATGGAGCTGGCATGCATTAGGCCTGACAAATACACTTTGGCAGGGCTTTTAAGCCTTTGCCGGTACCAAGGACTATTGCATTATGGAAGGCAGATACACGCTCATCTCATCAAGATGGGTTCTGAAATGAACGTGGTAATGCAAACTATACTTGTTCATATGTATATCAAGTGCATGCGTCAGCAGGATGCTGAAAATGTTTGTATAATGATCGAAGAAAGGAATTCATATGTGCTTGATGCATTTTCAAAGGTCTATGGAGATGACTACTTGATCTGAAGAAAAGAAAATATCTCATTTTACACTGGAGTTAGAATGTATGGGAATACTTTTGTCTTCCTTGTGGATACAAATCTTAGATGCAAAATTTGTATTTCCTGTATACTAAGGACTATAGTA]
[+] EMBL CB618555             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cctTTAAAGGGTGCGGTGCATTGGGACGCCTGGTACATGGGAAGCAGCTGCATGGCTTAGCAGTTGTCCTTGGATTTGATAGGAATGCTACTGTTTGGAACTGCCTGATGGACATGTATGGGAAGTGTGGTGACATTGACAGTTGCAAGATGGTTTTTGAGACGATGATCGGCAGGGATCAAGTGAGTTGGAACACGCTAATCTCAAGTTATGCCCGTGTTGGTCTTTGTGAAGAGGCACTCGACATGATTGTGCAGATGCAAGAGTCTGGTTACATTGTCGATCGCTTCACCCTTGGCAGCGGAGTTACAGCTTGTGCCCGTTTGGCTGATATAGATAGCGGCCGTGCATTCCATGGTTATTTGGTTAGAAGATTGTTGGATACTGATGTCATCCAGGGCAGCGCGCTTGTTGACATGTATGGTAAATGCCACAACATGGAACTTGCACACATTGTATTCGACAGGATGGATGAGAGGAATTATGTATCATGGGATGCACTCTTGTCTGGGTATGTTGAGAATGAGCAGGTTGATTTAGCACTTGAGATTTTCCGGCAAATGGGTTGTGCAAATATAAAGTATAACCAGCATAATTTTGCTAACCTTCTTAAGCTCTGTGGCAGTCAGAGGTATAAAGAGTATGGAAGGCAAATTCACGGGCATGCCATTAAGACCATAAACAAGATGAATGTGGTTTTGGAAACAGAGCTTATTGACATGTACGCAAAGTGTGGCTGCATTGAGGTCGCTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_3532#0
GCGGAGGTCGTCGAGCTCTTCTGCCGGATGCGGAGGGGCGGCGTCCCAGTAAGCAGGTTC
GTGCTCCCGAGCGTGCTCGCGGCTTGCGCCGGCCTGCGGGACATCGGGATGCTCCGAGCC
GTGCACGCCTTGGTCATCAAGTGCGGCCTGTGCCGGCATGTCATCGTGGGCACTGCATTG
GTTGACGGGTATACTGATTTTGGATTGGTGGATGATGCGAGGAAGGCGTTCGATGAGATA
ACAGACGCCAATATAGTTTCTTGGAGTGTGCTCATTGGTGGCTATGCCCGTTCTTCTCGG
TGGGAAGAAACATTGGATGCTTTCTCCGCAATGCGGCGTGCTGGGGTGCTTCCAAATGAT
TCTGTTCTTGTAATGGCGATTCAGGCGTGCGGTGCATTGGGACGCCTGGTACATGGGAAG
CAGCTGCATGGCTTAGCAGTTGTCCTTGGATTTGATAGGAATGCTACTGTTTGGAACTGC
CTGATGGACATGTATGGGAAGTGTGGTGACATTGACAGTTGCAAGATGGTTTTTGAGACG
ATGATCGGCAGGGATCAAGTGAGTTGGAACACGCTAATCTCAAGTTATGCCCGTGTTGGT
CTTTGTGAAGAGGCACTCGACATGATTGTGCAGATGCAAGAGTCTGGTTACATTGTCGAT
CGCTTCACCCTTGGCAGCGGAGTTACAGCTTGTGCCCGTTTGGCTGATATAGATAGCGGC
CGTGCATTCCATGGTTATTTGGTTAGAAGATTGTTGGATACTGATGTCATCCAGGGCAGC
GCGCTTGTTGACATGTATGGTAAATGCCACAACATGGAACTTGCACACATTGTATTCGAC
AGGATGGATGAGAGGAATTATGTATCATGGGATGCACTCTTGTCTGGGTATGTTGAGAAT
GAGCAGGTTGATTTAGCACTTGAGATTTTCCGGCAAATGGGTTGTGCAAACATAAAGTAT
AACCAGCATAATTTTGCTAACCTTCTTAAGCTCTGTGGCAGTCAGAGGTATAAAGAGTAT
GGAAGGCAAATTCACGGGCATGCCATTAAGACCATAAACAAGATGAATGTGGTTTTGGAA
ACGGAGCTTATTGACATGTACGCAAAGTGTGGCTGCATTGGGGTCGCTCGGCTACTATTT
CTTCGGATGAATGAGAGAAACCTTATTTCCTGGAATGCCCTACTTTCAGGTTATGCAGCA
GATGGACAGCCAGTTGCAACGATAAATATTTACCGCCAAATGGAGCTGGCATGCATTAGG
CCTGACAAATACACTTTGGCAGGGCTTTTAAGCCTTTGCCGGTACCAAGGACTATTGCAT
TATGGAAGGCAGATACACGCTCATCTCATCAAGATGGGTTCTGAAATGAACGTGGTAATG
CAAACTATACTTGTTCATATGTATATCAAGTGCATGCGTCAGCAGGATGCTGAAAATGTT
TGTATAATGATCGAAGAAAGGAATTCATATGTGCTTGATGCATTTTCAAAGGTCTATGGA
GATGACTACTTGATCTGAAGAAAAGAAAATATCTCATTTTACACTGGAGTTAGAATGTAT
GGGAATACTTTTGTCTTCCTTGTGGATACAAATCTTAGATGCAAAATTTGTATTTCCTGT
ATACTAAGGACTATAGTA
clustalw multiple alignements is not computed in this case