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Oryza sativa
cluster # 3546 cluster # 3546       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3546#0 length = 766 sequences # 2  

consensusID : consensus_3546#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 766
fasta sequence
                              [CAGACCGGTGACCAGCTGGGTTTTGGTGAGGCCGGGTGTTGGTGGATTAGTTGGTGACTGGTAAGGTGTATGGTGGATTGGTGGATCGAAACTTAATGCTTTTTTATTGATTTTTTAAGCATTTCAATTGAACGTCAAGTAGTCCAGTGTACTAGTACTATGCTTTTGGTTGGGAAATTGGAAATGAGTCTACTGGAACACGAATGTAAATATGTCATAAGGCCTACTCTCTCCGTCTAAAAAAAATCAACCGATCCCTCTTAAGATAATGAATCTGGACATCCTCTTCTGGTTGAATTATTTTTGGGATGGAGGGAGTAACTTGCGTGGAGGCAGTTCAACTACAGTGAGACTCAAGGGGACGAGAGACTAACCGTGTCTGAAGGAAGATGCTTTCTGCTAGCAGTTGCCACTACATCGTCGTTGTTGAATCCAACAGACGGTATGGTTTAACTGCTATTACTAGCTTACAAGTATAAGCTCCACTCTACTTAGTGTCAGCTGAAAGATTAGGATGTGTTCTGGAGTGAGGGTTTAGAACCTTACTCCTTAACACGCAAAACGAAGAAGCATTTAGCATATAATTAATTAAGTATTAACTAAAATAGATTAATATAATTTTTTANAGTAACTTTCGTATAGAAAATTTTTTTAAAAACGCACAGTTTAGCAGTTTGAAAAATGTGCGCGTGGAAAATGAAGGAGGTAAGTTGGAAAACTAGAGATAAGAACTCAGCCTAAGGTAAGATGAGAAAATCATTAACAT]

[+] EMBL CB619303             [CAGACCGGTGACCAGCTGGGTTTTGGTGAGGCCGGGTGTTGGTGGATTAGTTGGTGACTGGTAAGGTGTATGGTGGATTGGTGGATCGAAACTTAATGCTTTTTTATTGATTTTTTAAGCATTTCAATTGAACGTCAAGTAGTCCAGTGTACTAGTACTATGCTTTTGGTTGGGAAATTGGAAATGAGTCTACTGGAACACGAATGTAAATATGTCATAAGGCCTACTCTCTCCGTCTAAAAAAAATCAACCGATCCCTCTTAAGATAATGAATCTGGACATCCTCTTCTGGTTGAATTATTTTTGGGATGGAGGGAGTAACTTGCGTGGAGGCAGTTCAACTACAGTGAGACTCAAGGGGACGAGAGACTAACCGTGTCTGAAGGAAGATGCTTTCTGCTAGCAGTTGCCACTACATCGTCGTTGTTGAATCCAACAGACGGTATGGTTTAACTGCTATTACTAGCTTACAAGTATAAGCTCCACTCTACTTAGTGTCAGCTGAAAGATTAGGATGTGTTCTGGAGTGAGGGTTTAGAACCTTACTCCTTAACACGCAAAACGAAGAAGCATTTAGCATATAATTAATTAAGTATTAACTAAAATAGATTAATATAATTTTTTANAGTAACTTTCGTATAGAAAATTTTTTTAAAAACGCACAGTTTAGCAGTTTGAAAAATGTGCGCGTGGAAAATGAAGGAGGTAAGTTGGAAAACTAGAGATAAGAACTCAGCCTAAGGTAAGATGAGAAAATCATTAACAT]
[+] EMBL CB619304             [CAGACTGGTGACCAGCTGGGTTTTGGTGAGGCCGGGTGTTGGTGGATTAATTGGTGACTGGTAAGGTGTATGGTGGATTGGTGGATCCAAACTTAATGCTTTTTTATTGATTTTTTAAGCATTTCAATTGAACGTCAAGTAGTCCAGTGTACTACTACTATGCTTTTGGTTGGGAAATTGGAAATGAGTCTACTGGAACACGAATGTAAATATGTCATAATGCCTACTCTCTCCGTCTAAAAAAAATCAACCGATCCCTCTTAAGATAATGAATCTGGACATCCTCTTCTGGTTGAATTATTTTTGGGATGGAGGGAGTAACTTGCCTGGAGGCAGTTCAACTACAGTGAGACTCAAGGGGACGAGAGACTAACCGTGTCTGAAGGAAGATGCTTTCTGCTATCAATTGCCACTACATCGTCGTTGTTGAATCCAACAGACGGTATGGTTTAACTGCTATTACTAGCTTACAAGTATAAGCTCCACTCTACTTAGTGTCATCTGAAAGATTACGATGTGTTCTGGAGTGAAGGTTTAGAACCTTACTCCTTAACACGCAAAACGAAAAAGCATTTAGCATATAATTAATTAAGTATTAACTAAGATAGATTAATATAATTTTTTAGAGTAACTTTCGTATAGAAAATTTTTTTACAAACACACAGTTTAGCAGTTTGAAAAATGTGCG                                                                              ]


>consensus_3546#0 CAGACCGGTGACCAGCTGGGTTTTGGTGAGGCCGGGTGTTGGTGGATTAGTTGGTGACTG GTAAGGTGTATGGTGGATTGGTGGATCGAAACTTAATGCTTTTTTATTGATTTTTTAAGC ATTTCAATTGAACGTCAAGTAGTCCAGTGTACTAGTACTATGCTTTTGGTTGGGAAATTG GAAATGAGTCTACTGGAACACGAATGTAAATATGTCATAAGGCCTACTCTCTCCGTCTAA AAAAAATCAACCGATCCCTCTTAAGATAATGAATCTGGACATCCTCTTCTGGTTGAATTA TTTTTGGGATGGAGGGAGTAACTTGCGTGGAGGCAGTTCAACTACAGTGAGACTCAAGGG GACGAGAGACTAACCGTGTCTGAAGGAAGATGCTTTCTGCTAGCAGTTGCCACTACATCG TCGTTGTTGAATCCAACAGACGGTATGGTTTAACTGCTATTACTAGCTTACAAGTATAAG CTCCACTCTACTTAGTGTCAGCTGAAAGATTAGGATGTGTTCTGGAGTGAGGGTTTAGAA CCTTACTCCTTAACACGCAAAACGAAGAAGCATTTAGCATATAATTAATTAAGTATTAAC TAAAATAGATTAATATAATTTTTTANAGTAACTTTCGTATAGAAAATTTTTTTAAAAACG CACAGTTTAGCAGTTTGAAAAATGTGCGCGTGGAAAATGAAGGAGGTAAGTTGGAAAACT AGAGATAAGAACTCAGCCTAAGGTAAGATGAGAAAATCATTAACAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)