cluster # 3585

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 3585 cluster # 3585 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3585#0 length = 941 sequences # 2

consensusID : consensus_3585#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 941
fasta sequence

                              [GGTAGTCTTAGCCCGAATATTTATGGCAGTGACCCTGCATTTGGCATTGGGGGAATGGCATATTTATCGAGTCCAACATCTACCCCTTTTATCTCATCTCCTCAGGGCCATGTTAGGCAAGGAGATAGGCTAGCTCGTATCTCATCTGTGGGTAAGACCACTACTGGAGGGCCTATGGGATCTTGGAATTCAGATAATGGTCTAATTGATAATGGTTATGGATCTTCTCTGCTGGAGGAATTTAAGACCAACAAAACCAGATCTTTTGAGCTGTTAGATATTGTAGGTCATGTGGTCGAGTTCAGCTCGGACCAGTATGGAAGTCGCTTTATACAACAGAAACTAGAAACGGCTTCTGCTGAAGAGAAGGACACCATTTTTCCAGAGATTCTTCCTCAAGCACGAACTCTGATGACTGATGTTTTTGGAAACTATGTTATACAGAAATTCTTTGAATATGGGACTGAACCACAGAAGAAACAACTGGCTAGCTTACTCAAGGGCTATGTATTGCAGCTGTCTCTTCAAATGTATGGTTGCCGGGTGATTCAGAAGGCTTTAGAAATGGTTGAGGTGGAACAACAAACCCAAATGGCTTTGGAGCTTGATGGAAATATTATGAAATGTGT-CCGTGATCAGAATGGCAACCATGTAATCCAGAAATGCATAGAATGCATCCCTCAAGAAAGGATACGGTTCATTATATCTGCCTTTTATGGACACGTGGTTGAGCTTTCCACTCATCCATATGGTTGCCGTGTTATTCAGCGTGTCTTGGAGCACTGTAACGATGAAAATACGCAGAGCACCATGATGGAAGAGATCATGCAGTCTGTGGTTCTGTTGACACTAGACCAGTATGGCAATTATGTTATCCAGCATGTCTTGCAACACGGGAAACCAGATGAACGTTCTGCTATTATTAAGCAACTGGCTGGGCA]

[+] EMBL CB671806             [GGTAGTCTTAGCCCGAATATTTATGGCAGTGACCCTGCATTTGGCATTGGGGGAATGGCATATTTATCGAGTCCAACATCTACCCCTTTTATCTCATCTCCTCAGGGCCATGTTAGGCAAGGAGATAGGCTAGCTCGTATCTCATCTGTGGGTAAGACCACTACTGGAGGGCCTATGGGATCTTGGAATTCAGATAATGGTCTAATTGATAATGGTTATGGATCTTCTCTGCTGGAGGAATTTAAGACCAACAAAACCAGATCTTTTGAGCTGTTAGATATTGTAGGTCATGTGGTCGAGTTCAGCTCGGACCAGTATGGAAGTCGCTTTATACAACAGAAACTAGAAACGGCTTCTGCTGAAGAGAAGGACACCATTTTTCCAGAGATTCTTCCTCAAGCACGAACTCTGATGACTGATGTTTTTGGAAACTATGTTATACAGAAATTCTTTGAATATGGGACTGAACCACAGAAGAAACAACTGGCTAGCTTACTCAAGGGCTATGTATTGCAGCTGTCTCTTCAAATGTATGGTTGCCGGGTGATTCAGAAGGCTTTAGAAATGGTTGAGGTGGAACAACAAACCCAAATGGCTTTGGAGCTTGATGGAAATATTATGAAATGTGT CCGTGATCAGAATGGCAACCATGTAATCCAGAAATGCATAGAATGCATCCCTCAAGAAAGGATACGGTTCATTATATCTGCCTTTTATGGACACGTGGTTGAGCTTTCCACTCATCCATATGGTTGCCGTGTTATTCAGCGTGTCTTGG                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AU174960             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTCAGAAGGCTTTAGAAATGGTTGAGGTGGAACAACAAACCCAAATGGCTTTGGAGCTTGATGGAAATATTATGAAATGTGTCCCGTGATCAGAATGGCAACCATGTAATCCAGAAATGCATAGAATGCATCCCTCAAGAAAGGATACGGTTCATTATATCTGCCTTTTATGGACACGTGGTTGAGCTTTCCACTCATCCATATGGTTGCCGTGTTATTCAGCGTGTCTTGGAGCACTGTAACGATGAAAATACGCAGAGCACCATGATGGAAGAGATCATGCAGTCTGTGGTTCTGTTGACACTAGACCAGTATGGCAATTATGTTATCCAGCATGTCTTGCAACACGGGAAACCAGATGAACGTTCTGCTATTATTAAGCAACTGGCTGGGCA]




>consensus_3585#0
GGTAGTCTTAGCCCGAATATTTATGGCAGTGACCCTGCATTTGGCATTGGGGGAATGGCA
TATTTATCGAGTCCAACATCTACCCCTTTTATCTCATCTCCTCAGGGCCATGTTAGGCAA
GGAGATAGGCTAGCTCGTATCTCATCTGTGGGTAAGACCACTACTGGAGGGCCTATGGGA
TCTTGGAATTCAGATAATGGTCTAATTGATAATGGTTATGGATCTTCTCTGCTGGAGGAA
TTTAAGACCAACAAAACCAGATCTTTTGAGCTGTTAGATATTGTAGGTCATGTGGTCGAG
TTCAGCTCGGACCAGTATGGAAGTCGCTTTATACAACAGAAACTAGAAACGGCTTCTGCT
GAAGAGAAGGACACCATTTTTCCAGAGATTCTTCCTCAAGCACGAACTCTGATGACTGAT
GTTTTTGGAAACTATGTTATACAGAAATTCTTTGAATATGGGACTGAACCACAGAAGAAA
CAACTGGCTAGCTTACTCAAGGGCTATGTATTGCAGCTGTCTCTTCAAATGTATGGTTGC
CGGGTGATTCAGAAGGCTTTAGAAATGGTTGAGGTGGAACAACAAACCCAAATGGCTTTG
GAGCTTGATGGAAATATTATGAAATGTGTCCGTGATCAGAATGGCAACCATGTAATCCAG
AAATGCATAGAATGCATCCCTCAAGAAAGGATACGGTTCATTATATCTGCCTTTTATGGA
CACGTGGTTGAGCTTTCCACTCATCCATATGGTTGCCGTGTTATTCAGCGTGTCTTGGAG
CACTGTAACGATGAAAATACGCAGAGCACCATGATGGAAGAGATCATGCAGTCTGTGGTT
CTGTTGACACTAGACCAGTATGGCAATTATGTTATCCAGCATGTCTTGCAACACGGGAAA
CCAGATGAACGTTCTGCTATTATTAAGCAACTGGCTGGGCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case