cluster # 3607

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Oryza sativa
cluster # 3607 cluster # 3607 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3607#0 length = 839 sequences # 2

consensusID : consensus_3607#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 839
fasta sequence

                              [AAATCCATCAACCGCTCTGCTCGTTCCCCTCTTGCCCTAGAGAAAAGGCGATCTCGGCGGCGGCGCCGCTCGTCGACGTCGCCGGTCGTGCAGCCCCGCCGCTCGTCGACGTCGCCTGTCGTCCCGCCGGTTGAGCCCTCGTGCACCCCTCAACCCTGCTCGCGCTGCCCCTGCACTCCTCGGTACCAGGGGCGCAGCTGCTGCTCTCGTCACGATGGGGTGTGCTGCCGTTGTTCTCCTCGAAGTGAGTTGCACTTGCACCACGCCGCTCTCTCCTCCAGCGACCTCCCTTCTCCTGGTGCTCTCCAATCCCCTCATCAATCTCCCTATAGTAATGCTTCCCCTCTGTTTTTTTCTAGACATCCATGATGACCTATAGGTGTTCGATGAATTGCCAATGCAGATAAATTTTAGTTAGATTGATTCCTGATAATTGCAGACCAGTAATTTTCTGGTATCTATTAAATGGAGGCAAAAGTTCAGTGAAATGTTACCAAATGAAGCTATCAAGACAATTTGTGAGATAATAATGGATTATATTGTTTTGTTGACCTTTCCATTTATGTAGACCAGCCTGCTGATTCCTTACGGCAGCGAGACATTTTATAAATTGCATGATGCGTGTGTGTACCCTTTTAACTGAAATTTGTTAATGCACTGCTTATATAGATGAATTGTCTTTTCATTTATTGTTTAATACAATAATAATTCAAGTTGCTTCTTTCATATCGACGTAGACCGGATAAATCATCTAACTTTTGAATGAAATTGCCTAGATTTTGTTGGGATTCTAAGTCCGGCTTCTTANGAGTTTTGATGAAATGACTACAAGCCTTACA]

[+] EMBL CB625955             [AAATCCATCAACCGCTCTGCTCGTTCCCCTCTTGCCCTAGAGAAAAGGCGATCTCGGCGGCGGCGCCGCTCGTCGACGTCGCCGGTCGTGCAGCCCCGCCGCTCGTCGACGTCGCCTGTCGTCCCGCCGGTTGAGCCCTCGTGCACCCCTCAACCCTGCTCGCGCTGCCCCTGCACTCCTCGGTACCAGGGGCGCAGCTGCTGCTCTCGTCACGATGGGGTGTGCTGCCGTTGTTCTCCTCGAAGTGAGTTGCACTTGCACCACGCCGCTCTCTCCTCCAGCGACCTCCCTTCTCCTGGTGCTCTCCAATCCCCTCATCAATCTCCCTATAGTAATGCTTCCCCTCTGTTTTTTTCTAGACATCCATGATGACCTATAGGTGTTCGATGAATTGCCAATGCAGATAAATTTTAGTTAGATTGATTCCTGATAATTGCAGACCAGTAATTTTCTGGTATCTATTAAATGGAGGCAAAAGTTCAGTGAAATGTTACCAAATGAAGCTATCAAGACAATTTGTGAGATAATAATGGATTATATTGTTTTGTTGACCTTTCCATTTATGTAGACCAGCCTGCTGATTCCTTACGGCAGCGAGACATTTTATAAATTGCATGATGCGTGTGTGTACCCTTTTAACTGAAATTTGTTAATGCACTGCTTATATAGATGAATTGTCTTTTCATTTATTGTTTAATACAATAATAATTCAAGTTGCTTCTTTCATATCGACGTAGACCGGATAAATCATCTAACTTTTGAATGAAATTGCCTAGATTTTGTTGGGATTCTAAGTCCGGCTTCTTANGAGTTTTGATGAAATGACTACAAGCCTTACA]
[+] EMBL CB625954             [AAATCCATCAACCGCTCTGCTCGTTCCCCTCTTGCCCTAGAGAAAAGGCGATCTCGGCGGCGGCGCCGCTCGTCGACGTCGCCGGTCGTGCAGCCCCGCCGCTCGTCGACGTCGCCTGTCGTCCCGCCGGTTGAGCCCTCGTGCACCCCTCAACCCTGCTCGCGCTGCCCCTGCACTCCTCGGTACCAGGGGCGCAGCTGCTGCTCTCGTCACGATGGGGTGTGCTGCCGTTGTTCTCCTCGAAGTGAGTTGCACTTGCACCACGCCGCTCTCTCCTCCAGCGACCTCCCTTCTCCTGGTGCTCTCCAATCCCCTCATCAATCTCCCTATAGTAATGCTTCCCCTCTGTTTTTTTCTAGACATCCATGATGACCTATAGGTGTTCGATGAATTGCCAATGCAGATAAATTTTAGTTAGATTGATTCCTGATAATTGCAGACCAGTAATTTTCTGGTATCTATTAAATGGAGGCAAAAGTTCAGTGAAATGTTACCAAATGAAGCTATCAAGACAATTTGTGAGATAATAATGGATTATATTGTTTTGTTGACCTTTCCATTTATGTAGACCAGCCTGCTGATTCCTTACGGCAGCGAGACATTTTATAAATTGCATGATGCGTGTGTGTACCCTTTTAACTGAAATTTGTTAATGCACTGCTTATATAGATGAATTGTCTTTTCATTTATTGTTTAATACAATAATAATTCAAGTTGCTTCTTTCATATCGACGTAGACCGGATAAATCATCTAACTTTTGAATGAAATTGCCTAGATTTTGTTGGGATTCTAA                                             ]




>consensus_3607#0
AAATCCATCAACCGCTCTGCTCGTTCCCCTCTTGCCCTAGAGAAAAGGCGATCTCGGCGG
CGGCGCCGCTCGTCGACGTCGCCGGTCGTGCAGCCCCGCCGCTCGTCGACGTCGCCTGTC
GTCCCGCCGGTTGAGCCCTCGTGCACCCCTCAACCCTGCTCGCGCTGCCCCTGCACTCCT
CGGTACCAGGGGCGCAGCTGCTGCTCTCGTCACGATGGGGTGTGCTGCCGTTGTTCTCCT
CGAAGTGAGTTGCACTTGCACCACGCCGCTCTCTCCTCCAGCGACCTCCCTTCTCCTGGT
GCTCTCCAATCCCCTCATCAATCTCCCTATAGTAATGCTTCCCCTCTGTTTTTTTCTAGA
CATCCATGATGACCTATAGGTGTTCGATGAATTGCCAATGCAGATAAATTTTAGTTAGAT
TGATTCCTGATAATTGCAGACCAGTAATTTTCTGGTATCTATTAAATGGAGGCAAAAGTT
CAGTGAAATGTTACCAAATGAAGCTATCAAGACAATTTGTGAGATAATAATGGATTATAT
TGTTTTGTTGACCTTTCCATTTATGTAGACCAGCCTGCTGATTCCTTACGGCAGCGAGAC
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CTTATATAGATGAATTGTCTTTTCATTTATTGTTTAATACAATAATAATTCAAGTTGCTT
CTTTCATATCGACGTAGACCGGATAAATCATCTAACTTTTGAATGAAATTGCCTAGATTT
TGTTGGGATTCTAAGTCCGGCTTCTTANGAGTTTTGATGAAATGACTACAAGCCTTACA

clustalw multiple alignements is not computed in this case