cluster # 3679

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Oryza sativa
cluster # 3679 cluster # 3679 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3679#0 length = 822 sequences # 2

consensusID : consensus_3679#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 822
fasta sequence

                              [GCCTCCCACAAAAAGGATTCAGCAATCCTGTTCGCTCTGTGCGATCATTTTCCTTTCTTTTTTTTTTTCGATTATTGTTCTCGTCCTTCTTCGGTCTTGTGCTGCGGGGATGATTTAATCGTGGTTTTACTTCGAGTGTGCTGATTTGATACTCCATTCTTTTTTGCTAGAGCCTTGGAGTAGCTATTAGACAACAAGAATTAGGTACTTTTGTTTGATTGGTTTATTTAAGCGCATGCTGTTCTTGGATTTGATGGTATTGTTGTGGTCGACTCGCACCATTAGCCCCCTGTTCTCTTGAGATTGGATACAGGGAAAACTGCGAGAAAAGGATATATATGGGTGCTATATCCATGGATTGGACAGGGGCTCTAAACTTCTGTGGAATCCAGCGGTTTCCTCAGAATCATCTCTTCTGTCCACATTGTTACTTATATTTTGGTTGCACTTAATTCATTTTAATGCATTTGCATTTGTTGTTGTGTTCTGAAGCGAAATGAGGAGGAAAAATCATCCGAAGTTTTTCTTGTGGAAAACACGTACATGGTCTTCAAAGTTCTCTGATCGCTCCATGTTAAACTAATTTTTAGTCTCTTGATCTGTAGCTATTTGTAATGTGGGACAATTCATTTGTTGATTTGGGGGAAGTTTTTTAATCGTGTTCAAAGAACCAACATATAGGTGTG-AAGCAAAATCGGAAGTCATTGCATCTGAAATTTTAGTGCTGATCTGCTAATAACGCATAGGCAGTCACCAAAATTCTTTGGTTGCTTTTCTCAATGCAATCTTTGTTTTGTTTTCCCTGATAATTAATAAAGTTTA]

[+] EMBL CB629229             [GCCTCCCACAAAAAGGATTCAGCAATCCTGTTCGCTCTGTGCGATCATTTTCCTTTCTTTTTTTTTTTCGATTATTGTTCTCGTCCTTCTTCGGTCTTGTGCTGCGGGGATGATTTAATCGTGGTTTTACTTCGAGTGTGCTGATTTGATACTCCATTCTTTTTTGCTAGAGCCTTGGAGTAGCTATTAGACAACAAGAATTAGGTACTTTTGTTTGATTGGTTTATTTAAGCGCATGCTGTTCTTGGATTTGATGGTATTGTTGTGGTCGACTCGCACCATTAGCCCCCTGTTCTCTTGAGATTGGATACAGGGAAAACTGCGAGAAAAGGATATATATGGGTGCTATATCCATGGATTGGACAGGGGCTCTAAACTTCTGTGGAATCCAGCGGTTTCCTCAGAATCATCTCTTCTGTCCACATTGTTACTTATATTTTGGTTGCACTTAATTCATTTTAATGCATTTGCATTTGTTGTTGTGTTCTGAAGCGAAATGAGGAGGAAAAATCATCCGAAGTTTTTCTTGTGGAAAACACGTACATGGTCTTCAAAGTTCTCTGATCGCTCCATGTTAAACTAATTTTTAGTCTCTTGATCTGTAGCTATTTGTAATGTGGGACAATTCATTTGTTGATTTGGGGGAAGTTTTTTAATCGTGTTCAAAGAACCAACATATAGGTGTG AAGCAAAATCGGAAGTCATTGCATCTGAAATTTTAGTGCTGATCTGCTAATAACGCATAGGCAGTCACCAAAATTCTTTGGTTGCTTTTCTCAATGCAATCTTTGTTTTGTTTTCCCTGATAATTAATAAAGTTTA]
[+] EMBL CB629227             [GCCTCCCACAAAAAGGATTCAGCAATCCTGTTCGCTCTGTGCGATCATTTTCCTTTCTTTTTTTTTTTCGATTATTGTTCTCGTCCTTCTTCGGTCTTGTGCTGCGGGGATGATTTAATCGTGGTTTTACTTCGAGTGTGCTGATTTGATACTCCATTCTTTTTTGCTAGAGCCTTGGAGTAGCTATTAGACAACAAGAATTAGGTACTTTTGTTTGATTGGTTTATTTAAGCGCATGCTGTTCTTGGATTTGATGGTATTGTTGTGGTCGACTCGCACCATTAGCCCCCTGTTCTCTTGAGATTGGATACAGGGAAAACTGCGAGAAAAGGATATATATGGGTGCTATATCCATGGATTGGACAGGGGCTCTAAACTTCTGTGGAATCCAGCGGTTTCCTCAGAATCATCTCTTCTGTCCACATTGTTACTTATATTTTGGTTGCACTTAATTCATTTTAATGCATTTGCATTTGTTGTTGTGTTCTGAAGCGAAATGAGGAGGAAAAATCATCCGAAGTTTTTCTTGTGGAAAACACGTACATGGTCTTCAAAGTTCTCTGATCGCTCCATGTTAAACTAATTTTTAGTCTCTTGATCTGTAGCTATTTGTAATGTGGGACAATTCATTTGTTGATTTGGGGGAAGTTTTTTAATCGTGTTCAAAGAACCAACATATAGGTGTGAAAGC AAATCGGAAGTCATTGCATCTGAAATTTTAGTGCTGATCTGCTAATAACGCATAGGCAGTCACCAAAATTCTTTGGTTGCTTTTCTCAATGCAATCTTTGTTTT                           ]




>consensus_3679#0
GCCTCCCACAAAAAGGATTCAGCAATCCTGTTCGCTCTGTGCGATCATTTTCCTTTCTTT
TTTTTTTTCGATTATTGTTCTCGTCCTTCTTCGGTCTTGTGCTGCGGGGATGATTTAATC
GTGGTTTTACTTCGAGTGTGCTGATTTGATACTCCATTCTTTTTTGCTAGAGCCTTGGAG
TAGCTATTAGACAACAAGAATTAGGTACTTTTGTTTGATTGGTTTATTTAAGCGCATGCT
GTTCTTGGATTTGATGGTATTGTTGTGGTCGACTCGCACCATTAGCCCCCTGTTCTCTTG
AGATTGGATACAGGGAAAACTGCGAGAAAAGGATATATATGGGTGCTATATCCATGGATT
GGACAGGGGCTCTAAACTTCTGTGGAATCCAGCGGTTTCCTCAGAATCATCTCTTCTGTC
CACATTGTTACTTATATTTTGGTTGCACTTAATTCATTTTAATGCATTTGCATTTGTTGT
TGTGTTCTGAAGCGAAATGAGGAGGAAAAATCATCCGAAGTTTTTCTTGTGGAAAACACG
TACATGGTCTTCAAAGTTCTCTGATCGCTCCATGTTAAACTAATTTTTAGTCTCTTGATC
TGTAGCTATTTGTAATGTGGGACAATTCATTTGTTGATTTGGGGGAAGTTTTTTAATCGT
GTTCAAAGAACCAACATATAGGTGTGAAGCAAAATCGGAAGTCATTGCATCTGAAATTTT
AGTGCTGATCTGCTAATAACGCATAGGCAGTCACCAAAATTCTTTGGTTGCTTTTCTCAA
TGCAATCTTTGTTTTGTTTTCCCTGATAATTAATAAAGTTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case