Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 3765 cluster # 3765       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3765#0 length = 1167 sequences # 2  

consensusID : consensus_3765#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1167
fasta sequence
                              [AAGTGGCCATTGGACTGTTTCATAGGATGTCTAGAGATGGTGTGTTCCCTAATACAGTGACATATAATGCTTTGATTAATATTCTGGTTGAGAACAGGAGAATCAAATATGCGTTTGTTGTTTTAAATTTGATGGGCAGAAATGGTTGTTCACCAAACATCGTGACATACAATGAAATGATTAAGGGCTATTGCATTCTTGGTGATCCTAAGAAGGCAATGTTAGTGATGAACAATATGTTGCAGAGAGGACATTCAGCTAATCTTGTAACATACAACACCATCATCAAAGGATATTGTGACTCAGGAAATACTACAAGCGCTCTTAGGATTCTAGACCTTATGAGGGATGGTGGATGTAAACCTGACGAGTGGTCTTACACCG-AACTGATATGT-GGTTTTTGCAAGATAAGCAAAATGGAGTCGGCTTTTGGATTGTTCAATGAAATGGTGGATGATGGCTTATGCCCCAATGAAGTTACCTATACTGCACTGATAGATGGGTACTGCAAGGATGAGAAACTGGACACTGCAACATCATTGTTGGAACATATGAAGAGAAGTGGTTGCAGACCAAATGTTCAGACATACAACGTTCTTATTCATGGTCTGACTAAGCAGAATAATTTTTCTGGTGCAGAGGAACTATGTAAAGTGATGATTGAAGAAGGGATATTTCCAAATGTAGTCACTTACACTGCAATGATTGATGGGCTGTGCAAAAATGGTTCCACATCTTTGGCTCTTGAAATGTTCAACAAGATGATTGAGCAGGGTTGTTTGCCTAATCTTCTTACCTACAGTTCTCTTATCCGCGCTCTAGGTCAAGAAGGCAAGGTAGAGGAAGCTGAGAATTTGTTTGCAGAATTGGAGCGGCACGGGCTCATTCCAGATGAAATTACCTATGTTAAGATGATTGAAGCATATATCATGTCAGGGAAAGTTGAGCATGCGTTTGATTTTCTTGGAAGAATGATAAAGGCTGGGTGCCAACCAACATTGTGGACATATGGTGTTTTGATTAAAGGCTTGAAAAATGAGTACCTATTAGCTGACCAGAGACTTGCTGCCTTGCCAGATGTAGTTCCAAACTGCAGTTTTGGTTATCAAACCACTGATCAAGATGCTGTGTCAGTTATGTCTGCTAAGTTAGCAGAACTGGATCCTG]

[+] EMBL CB674181             [AAGTGGCCATTGGACTGTTTCATAGGATGTCTAGAGATGGTGTGTTCCCTAATACAGTGACATATAATGCTTTGATTAATATTCTGGTTGAGAACAGGAGAATCAAATATGCGTTTGTTGTTTTAAATTTGATGGGCAGAAATGGTTGTTCACCAAACATCGTGACATACAATGAAATGATTAAGGGCTATTGCATTCTTGGTGATCCTAAGAAGGCAATGTTAGTGATGAACAATATGTTGCAGAGAGGACATTCAGCTAATCTTGTAACATACAACACCATCATCAAAGGATATTGTGACTCAGGAAATACTACAAGCGCTCTTAGGATTCTAGACCTTATGAGGGATGGTGGATGTAAACCTGACGAGTGGTCTTACACCG AACTGATATGT GGTTTTTGCAAGATAAGCAAAATGGAGTCGGCTTTTGGATTGTTCAATGAAATGGTGGATGATGGCTTATGCCCCAATGAAGTTACCTATACTGCACTGATAGATGGGTACTGCAAGGATGAGAAACTGGACACTGCAACATCATTGTTGGAACATATGAAGAGAAGTGGTTGCAGACCAAATGTTCAGACATACAACGTTCTTATTCATGGTCTGACTAAGCAGAATAATTTTTCTGGTGCAGAGGAACTATGTAAAGTGATGATTGAAGAAGGGATATTTCCAAATGTAGTCACTTACACTGCAATGATTGATGGGCTGTGCAAAAATGGTTCCACATCTTTGGCTCTTGAAATGTTCAACAAGATGATTGAGCAGGGTTGTTTGCCTAATCTTCTTACCTACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CB632348             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TACACCGTAACTGATATGTAGGTTTTTGCAAGATAAGCAAAATGGAGTCGGCTTTTGGATTGTTCAATGAAATGGTGGATGATGGCTTATGCCCCAATGAAGTTACCTATACTGCACTGATAGATGGGTACTGCAAGGATGAGAAACTGGACACTGCAACATCATTGTTGGAACATATGAAGAGAAGTGGTTGCAGACCAAATGTTCAGACATACAACGTTCTTATTCATGGTCTGACTAAGCAGAATAATTTTTCTGGTGCAGAGGAACTATGTAAAGTGATGATTGAAGAAGGGATATTTCCAAATGTAGTCACTTACACTGCAATGATTGATGGGCTGTGCAAAAATGGTTCCACATCTTTGGCTCTTGAAATGTTCAACAAGATGATTGAGCAGGGTTGTTTGCCTAATCTTCTTACCTACAGTTCTCTTATCCGCGCTCTAGGTCAAGAAGGCAAGGTAGAGGAAGCTGAGAATTTGTTTGCAGAATTGGAGCGGCACGGGCTCATTCCAGATGAAATTACCTATGTTAAGATGATTGAAGCATATATCATGTCAGGGAAAGTTGAGCATGCGTTTGATTTTCTTGGAAGAATGATAAAGGCTGGGTGCCAACCAACATTGTGGACATATGGTGTTTTGATTAAAGGCTTGAAAAATGAGTACCTATTAGCTGACCAGAGACTTGCTGCCTTGCCAGATGTAGTTCCAAACTGCAGTTTTGGTTATCAAACCACTGATCAAGATGCTGTGTCAGTTATGTCTGCTAAGTTAGCAGAACTGGATCCTG]


>consensus_3765#0 AAGTGGCCATTGGACTGTTTCATAGGATGTCTAGAGATGGTGTGTTCCCTAATACAGTGA CATATAATGCTTTGATTAATATTCTGGTTGAGAACAGGAGAATCAAATATGCGTTTGTTG TTTTAAATTTGATGGGCAGAAATGGTTGTTCACCAAACATCGTGACATACAATGAAATGA TTAAGGGCTATTGCATTCTTGGTGATCCTAAGAAGGCAATGTTAGTGATGAACAATATGT TGCAGAGAGGACATTCAGCTAATCTTGTAACATACAACACCATCATCAAAGGATATTGTG ACTCAGGAAATACTACAAGCGCTCTTAGGATTCTAGACCTTATGAGGGATGGTGGATGTA AACCTGACGAGTGGTCTTACACCGAACTGATATGTGGTTTTTGCAAGATAAGCAAAATGG AGTCGGCTTTTGGATTGTTCAATGAAATGGTGGATGATGGCTTATGCCCCAATGAAGTTA CCTATACTGCACTGATAGATGGGTACTGCAAGGATGAGAAACTGGACACTGCAACATCAT TGTTGGAACATATGAAGAGAAGTGGTTGCAGACCAAATGTTCAGACATACAACGTTCTTA TTCATGGTCTGACTAAGCAGAATAATTTTTCTGGTGCAGAGGAACTATGTAAAGTGATGA TTGAAGAAGGGATATTTCCAAATGTAGTCACTTACACTGCAATGATTGATGGGCTGTGCA AAAATGGTTCCACATCTTTGGCTCTTGAAATGTTCAACAAGATGATTGAGCAGGGTTGTT TGCCTAATCTTCTTACCTACAGTTCTCTTATCCGCGCTCTAGGTCAAGAAGGCAAGGTAG AGGAAGCTGAGAATTTGTTTGCAGAATTGGAGCGGCACGGGCTCATTCCAGATGAAATTA CCTATGTTAAGATGATTGAAGCATATATCATGTCAGGGAAAGTTGAGCATGCGTTTGATT TTCTTGGAAGAATGATAAAGGCTGGGTGCCAACCAACATTGTGGACATATGGTGTTTTGA TTAAAGGCTTGAAAAATGAGTACCTATTAGCTGACCAGAGACTTGCTGCCTTGCCAGATG TAGTTCCAAACTGCAGTTTTGGTTATCAAACCACTGATCAAGATGCTGTGTCAGTTATGT CTGCTAAGTTAGCAGAACTGGATCCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)